MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 151443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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143099	NC_019382	GCGG	2	8	4955651	4955658	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143100	NC_019382	CCG	2	6	4955673	4955678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341868
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143114	NC_019382	CGC	2	6	4956278	4956283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341868
143115	NC_019382	TCG	2	6	4956288	4956293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341868
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143213	NC_019382	GGC	2	6	4960336	4960341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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143216	NC_019382	GAT	2	6	4960597	4960602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412341872
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143218	NC_019382	CAG	2	6	4960798	4960803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341872
143219	NC_019382	GCCG	2	8	4960813	4960820	0 %	0 %	50 %	50 %	412341872
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143221	NC_019382	GCG	2	6	4960892	4960897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341872
143222	NC_019382	GC	3	6	4960902	4960907	0 %	0 %	50 %	50 %	412341872
143223	NC_019382	CGG	2	6	4960925	4960930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341872
143224	NC_019382	CGC	2	6	4960959	4960964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341872
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143226	NC_019382	TCG	2	6	4961024	4961029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341872
143227	NC_019382	GTCCAT	2	12	4961056	4961067	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	412341872
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143229	NC_019382	GC	3	6	4961156	4961161	0 %	0 %	50 %	50 %	412341872
143230	NC_019382	CTG	2	6	4961173	4961178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341872
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143331	NC_019382	GTG	2	6	4964749	4964754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412341873
143332	NC_019382	CGG	2	6	4964774	4964779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341873
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143335	NC_019382	GGC	2	6	4964896	4964901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341874
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143343	NC_019382	GAC	2	6	4965131	4965136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341874
143344	NC_019382	ACG	2	6	4965150	4965155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341874
143345	NC_019382	CCGG	2	8	4965160	4965167	0 %	0 %	50 %	50 %	412341874
143346	NC_019382	GCCG	2	8	4965172	4965179	0 %	0 %	50 %	50 %	412341874
143347	NC_019382	GC	3	6	4965188	4965193	0 %	0 %	50 %	50 %	412341874
143348	NC_019382	GCCT	2	8	4965203	4965210	0 %	25 %	25 %	50 %	412341874
143349	NC_019382	CTG	2	6	4965230	4965235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341874
143350	NC_019382	TGGC	2	8	4965308	4965315	0 %	25 %	50 %	25 %	412341874
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143352	NC_019382	TGC	2	6	4965345	4965350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341874
143353	NC_019382	GC	5	10	4965362	4965371	0 %	0 %	50 %	50 %	412341874
143354	NC_019382	CGA	2	6	4965394	4965399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341874
143355	NC_019382	CGG	2	6	4965405	4965410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341874
143356	NC_019382	GGC	2	6	4965415	4965420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341874
143357	NC_019382	TGG	2	6	4965438	4965443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412341874
143358	NC_019382	GAT	2	6	4965479	4965484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412341874
143359	NC_019382	AGGGC	2	10	4965528	4965537	20 %	0 %	60 %	20 %	412341875
143360	NC_019382	GGCC	2	8	4965562	4965569	0 %	0 %	50 %	50 %	412341875
143361	NC_019382	ATC	2	6	4965574	4965579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412341875
143362	NC_019382	CACG	2	8	4965600	4965607	25 %	0 %	25 %	50 %	412341875
143363	NC_019382	CTG	2	6	4965610	4965615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341875
143364	NC_019382	CCGATG	2	12	4965623	4965634	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	412341875
143365	NC_019382	CTG	2	6	4965661	4965666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341875
143366	NC_019382	GGCC	2	8	4965672	4965679	0 %	0 %	50 %	50 %	412341875
143367	NC_019382	GCC	2	6	4965692	4965697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341875
143368	NC_019382	TGC	3	9	4965743	4965751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341875
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143370	NC_019382	CG	3	6	4965772	4965777	0 %	0 %	50 %	50 %	412341875
143371	NC_019382	CCAT	2	8	4965809	4965816	25 %	25 %	0 %	50 %	412341875
143372	NC_019382	GCC	2	6	4965847	4965852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341875
143373	NC_019382	TGG	2	6	4965854	4965859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412341875
143374	NC_019382	GCC	2	6	4965868	4965873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341875
143375	NC_019382	AAGG	2	8	4965946	4965953	50 %	0 %	50 %	0 %	412341875
143376	NC_019382	GCC	2	6	4965958	4965963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341875
143377	NC_019382	GTG	3	9	4965967	4965975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412341875
143378	NC_019382	CTG	2	6	4965976	4965981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341875
143379	NC_019382	GC	4	8	4965982	4965989	0 %	0 %	50 %	50 %	412341875
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143381	NC_019382	GGC	2	6	4966008	4966013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341876
143382	NC_019382	CGCT	2	8	4966036	4966043	0 %	25 %	25 %	50 %	412341876
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143384	NC_019382	TGG	2	6	4966061	4966066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412341876
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143386	NC_019382	GCCT	2	8	4966113	4966120	0 %	25 %	25 %	50 %	412341876
143387	NC_019382	ACC	2	6	4966126	4966131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412341876
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143389	NC_019382	CG	3	6	4966196	4966201	0 %	0 %	50 %	50 %	412341876
143390	NC_019382	GTC	2	6	4966212	4966217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341876
143391	NC_019382	ATC	2	6	4966231	4966236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412341876
143392	NC_019382	CAG	2	6	4966281	4966286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341876
143393	NC_019382	GCC	2	6	4966318	4966323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341876
143394	NC_019382	CAG	2	6	4966329	4966334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341876
143395	NC_019382	CAC	3	9	4966401	4966409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412341876
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143397	NC_019382	CGA	2	6	4966472	4966477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341876
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143399	NC_019382	CAG	2	6	4966533	4966538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341876
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143402	NC_019382	AGC	2	6	4966600	4966605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341876
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143404	NC_019382	CGG	2	6	4966632	4966637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341876
143405	NC_019382	CGG	2	6	4966646	4966651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341876
143406	NC_019382	CAG	2	6	4966668	4966673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341876
143407	NC_019382	CAG	2	6	4966689	4966694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341876
143408	NC_019382	GCC	2	6	4966711	4966716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341876
143409	NC_019382	GCC	2	6	4966756	4966761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341876
143410	NC_019382	TGC	2	6	4966825	4966830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341876
143411	NC_019382	GGC	2	6	4966863	4966868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341876
143412	NC_019382	GC	3	6	4966922	4966927	0 %	0 %	50 %	50 %	412341876
143413	NC_019382	CAG	2	6	4966929	4966934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341876
143414	NC_019382	GAA	3	9	4966953	4966961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412341876
143415	NC_019382	CAG	2	6	4966962	4966967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341876
143416	NC_019382	CAT	2	6	4966968	4966973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412341876
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143420	NC_019382	GAA	2	6	4967034	4967039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412341876
143421	NC_019382	GCC	2	6	4967041	4967046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341876
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143423	NC_019382	GC	3	6	4967073	4967078	0 %	0 %	50 %	50 %	412341876
143424	NC_019382	CCG	2	6	4967108	4967113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341876
143425	NC_019382	CAG	2	6	4967124	4967129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341876
143426	NC_019382	GGC	2	6	4967187	4967192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341876
143427	NC_019382	TGCT	2	8	4967207	4967214	0 %	50 %	25 %	25 %	412341876
143428	NC_019382	CGT	2	6	4967237	4967242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341876
143429	NC_019382	ATGC	2	8	4967250	4967257	25 %	25 %	25 %	25 %	412341876
143430	NC_019382	GCTG	2	8	4967266	4967273	0 %	25 %	50 %	25 %	412341876
143431	NC_019382	CTT	2	6	4967286	4967291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412341876
143432	NC_019382	CGC	2	6	4967327	4967332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341876
143433	NC_019382	TGCG	2	8	4967354	4967361	0 %	25 %	50 %	25 %	412341876
143434	NC_019382	GTC	2	6	4967370	4967375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341876
143435	NC_019382	CG	3	6	4967430	4967435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143436	NC_019382	TCG	2	6	4967451	4967456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143437	NC_019382	GTG	2	6	4967493	4967498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143438	NC_019382	CCG	2	6	4967499	4967504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143439	NC_019382	GC	3	6	4967507	4967512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143440	NC_019382	GC	3	6	4967526	4967531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143441	NC_019382	AGC	2	6	4967553	4967558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143442	NC_019382	CGA	2	6	4967612	4967617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341877
143443	NC_019382	TGG	2	6	4967656	4967661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412341877
143444	NC_019382	GC	3	6	4967663	4967668	0 %	0 %	50 %	50 %	412341877
143445	NC_019382	GC	3	6	4967725	4967730	0 %	0 %	50 %	50 %	412341877
143446	NC_019382	TGG	2	6	4967764	4967769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412341877
143447	NC_019382	GCG	2	6	4967777	4967782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341877
143448	NC_019382	GCG	2	6	4967823	4967828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341877
143449	NC_019382	CAGGCG	2	12	4967883	4967894	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	412341877
143450	NC_019382	GC	4	8	4967911	4967918	0 %	0 %	50 %	50 %	412341877
143451	NC_019382	CGA	2	6	4967939	4967944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341877
143452	NC_019382	CG	3	6	4967960	4967965	0 %	0 %	50 %	50 %	412341877
143453	NC_019382	CAG	2	6	4967973	4967978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341877
143454	NC_019382	CTG	2	6	4967985	4967990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341877
143455	NC_019382	GCG	2	6	4967999	4968004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341877
143456	NC_019382	GCT	2	6	4968097	4968102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341877
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