MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 151443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_019382	CGA	3	9	451961	451969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337768
13002	NC_019382	GC	3	6	451983	451988	0 %	0 %	50 %	50 %	412337768
13003	NC_019382	TCA	2	6	451996	452001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337768
13004	NC_019382	GCA	2	6	452102	452107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337768
13005	NC_019382	GCA	2	6	452123	452128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337768
13006	NC_019382	AGA	2	6	452185	452190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337768
13007	NC_019382	GTG	2	6	452211	452216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337768
13008	NC_019382	GC	3	6	452303	452308	0 %	0 %	50 %	50 %	412337768
13009	NC_019382	ATC	2	6	452316	452321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337768
13010	NC_019382	CGG	2	6	452330	452335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337768
13011	NC_019382	CAT	2	6	452354	452359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337768
13012	NC_019382	CG	4	8	452360	452367	0 %	0 %	50 %	50 %	412337768
13013	NC_019382	CGG	2	6	452380	452385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337768
13014	NC_019382	GCG	2	6	452395	452400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337768
13015	NC_019382	CGAC	2	8	452404	452411	25 %	0 %	25 %	50 %	412337768
13016	NC_019382	CGA	2	6	452456	452461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337768
13017	NC_019382	ACG	2	6	452473	452478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337768
13018	NC_019382	ATG	2	6	452544	452549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337768
13019	NC_019382	TCA	3	9	452626	452634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337768
13020	NC_019382	ACA	3	9	452635	452643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337768
13021	NC_019382	GAA	2	6	452696	452701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337768
13022	NC_019382	GCC	2	6	452715	452720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337768
13023	NC_019382	CG	3	6	452737	452742	0 %	0 %	50 %	50 %	412337768
13024	NC_019382	CTT	2	6	452744	452749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412337768
13025	NC_019382	TGG	2	6	452854	452859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337768
13026	NC_019382	CGC	2	6	452927	452932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337768
13027	NC_019382	CGA	2	6	452939	452944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337768
13028	NC_019382	CGA	2	6	452984	452989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337768
13029	NC_019382	GCCAG	2	10	453040	453049	20 %	0 %	40 %	40 %	412337768
13030	NC_019382	CTG	2	6	453063	453068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337768
13031	NC_019382	GCC	2	6	453069	453074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337768
13032	NC_019382	GC	3	6	453084	453089	0 %	0 %	50 %	50 %	412337768
13033	NC_019382	ATG	2	6	453114	453119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337768
13034	NC_019382	GCT	2	6	453242	453247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337768
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13039	NC_019382	CG	3	6	453297	453302	0 %	0 %	50 %	50 %	412337768
13040	NC_019382	GGC	2	6	453317	453322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337768
13041	NC_019382	CAA	2	6	453323	453328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337768
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13043	NC_019382	GCA	2	6	453443	453448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337768
13044	NC_019382	AAAG	2	8	453475	453482	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_019382	GCG	2	6	453493	453498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_019382	T	7	7	453503	453509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_019382	GCG	2	6	453516	453521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_019382	CGG	2	6	453523	453528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13049	NC_019382	GCA	2	6	453535	453540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337769
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13053	NC_019382	GCCG	2	8	453583	453590	0 %	0 %	50 %	50 %	412337769
13054	NC_019382	CG	4	8	453589	453596	0 %	0 %	50 %	50 %	412337769
13055	NC_019382	CGG	2	6	453621	453626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337769
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13060	NC_019382	GCA	2	6	453720	453725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337769
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13075	NC_019382	CGGT	2	8	454031	454038	0 %	25 %	50 %	25 %	412337769
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13082	NC_019382	GCGCG	2	10	454182	454191	0 %	0 %	60 %	40 %	412337769
13083	NC_019382	GCG	3	9	454196	454204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337769
13084	NC_019382	GCG	2	6	454238	454243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337769
13085	NC_019382	CGG	3	9	454264	454272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13086	NC_019382	AT	3	6	454345	454350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_019382	GCC	2	6	454393	454398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337770
13088	NC_019382	CTG	3	9	454438	454446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337770
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13090	NC_019382	CTGG	2	8	454482	454489	0 %	25 %	50 %	25 %	412337770
13091	NC_019382	TGG	2	6	454511	454516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337770
13092	NC_019382	TGG	2	6	454526	454531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337770
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13094	NC_019382	GCT	2	6	454542	454547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337770
13095	NC_019382	TGC	2	6	454550	454555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337770
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13098	NC_019382	TGG	2	6	454637	454642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337770
13099	NC_019382	GC	3	6	454685	454690	0 %	0 %	50 %	50 %	412337770
13100	NC_019382	GCC	2	6	454733	454738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337770
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13102	NC_019382	GCGCCC	2	12	454777	454788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337770
13103	NC_019382	TGCC	2	8	454807	454814	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13104	NC_019382	GTCATC	2	12	454881	454892	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	412337771
13105	NC_019382	TGA	2	6	454900	454905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337771
13106	NC_019382	GCCATC	2	12	454917	454928	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	412337771
13107	NC_019382	GCA	3	9	454934	454942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337771
13108	NC_019382	GTG	2	6	454950	454955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337771
13109	NC_019382	CG	3	6	455086	455091	0 %	0 %	50 %	50 %	412337771
13110	NC_019382	ACA	2	6	455092	455097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337771
13111	NC_019382	CCGAT	2	10	455137	455146	20 %	20 %	20 %	40 %	412337771
13112	NC_019382	GC	3	6	455147	455152	0 %	0 %	50 %	50 %	412337771
13113	NC_019382	TCG	2	6	455163	455168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337771
13114	NC_019382	GAC	2	6	455201	455206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337771
13115	NC_019382	AGCTGG	2	12	455227	455238	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	412337771
13116	NC_019382	GAG	2	6	455250	455255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	412337771
13117	NC_019382	TCA	2	6	455263	455268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337771
13118	NC_019382	TCG	2	6	455278	455283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337771
13119	NC_019382	TGC	2	6	455323	455328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337771
13120	NC_019382	CGC	2	6	455350	455355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337771
13121	NC_019382	GC	3	6	455369	455374	0 %	0 %	50 %	50 %	412337771
13122	NC_019382	CCG	2	6	455392	455397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337771
13123	NC_019382	GC	3	6	455408	455413	0 %	0 %	50 %	50 %	412337771
13124	NC_019382	GCC	2	6	455437	455442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337771
13125	NC_019382	CG	3	6	455486	455491	0 %	0 %	50 %	50 %	412337771
13126	NC_019382	CGG	2	6	455542	455547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337771
13127	NC_019382	CGG	2	6	455612	455617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337771
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13130	NC_019382	GCCG	2	8	455794	455801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13131	NC_019382	CTG	2	6	455863	455868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337772
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13133	NC_019382	GCT	2	6	455916	455921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337772
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13166	NC_019382	GCTG	2	8	456994	457001	0 %	25 %	50 %	25 %	412337772
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13182	NC_019382	TGG	3	9	457865	457873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337774
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13220	NC_019382	GC	3	6	459264	459269	0 %	0 %	50 %	50 %	412337776
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13227	NC_019382	TCG	2	6	459601	459606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337776
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13231	NC_019382	CG	3	6	459763	459768	0 %	0 %	50 %	50 %	412337777
13232	NC_019382	CG	3	6	459773	459778	0 %	0 %	50 %	50 %	412337777
13233	NC_019382	GGGC	2	8	459819	459826	0 %	0 %	75 %	25 %	412337777
13234	NC_019382	CGG	2	6	459844	459849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337777
13235	NC_019382	GCA	2	6	459870	459875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337777
13236	NC_019382	GCG	2	6	459891	459896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337777
13237	NC_019382	GC	3	6	459917	459922	0 %	0 %	50 %	50 %	412337777
13238	NC_019382	CTT	2	6	459925	459930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412337777
13239	NC_019382	GTGCT	2	10	459980	459989	0 %	40 %	40 %	20 %	412337777
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13241	NC_019382	GCCA	2	8	460037	460044	25 %	0 %	25 %	50 %	412337777
13242	NC_019382	GCTG	2	8	460119	460126	0 %	25 %	50 %	25 %	412337777
13243	NC_019382	GC	3	6	460173	460178	0 %	0 %	50 %	50 %	412337777
13244	NC_019382	CTT	2	6	460198	460203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412337777
13245	NC_019382	CTG	2	6	460262	460267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337777
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13483	NC_019382	CAT	2	6	467973	467978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337786
13484	NC_019382	GCGG	2	8	467979	467986	0 %	0 %	75 %	25 %	412337786
13485	NC_019382	GCC	2	6	468022	468027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337786
13486	NC_019382	CCG	2	6	468030	468035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337786
13487	NC_019382	TGGCGG	2	12	468086	468097	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	412337786
13488	NC_019382	CG	3	6	468109	468114	0 %	0 %	50 %	50 %	412337786
13489	NC_019382	CG	4	8	468126	468133	0 %	0 %	50 %	50 %	412337786
13490	NC_019382	GC	3	6	468134	468139	0 %	0 %	50 %	50 %	412337786
13491	NC_019382	GGCTG	2	10	468149	468158	0 %	20 %	60 %	20 %	412337786
13492	NC_019382	CGC	2	6	468161	468166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337786
13493	NC_019382	CG	3	6	468201	468206	0 %	0 %	50 %	50 %	412337786
13494	NC_019382	TGC	2	6	468209	468214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337786
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13500	NC_019382	GCC	2	6	468373	468378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337786

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