MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 151443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11123	NC_019382	GC	4	8	388720	388727	0 %	0 %	50 %	50 %	412337707
11124	NC_019382	TCC	2	6	388745	388750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	412337707
11125	NC_019382	GC	3	6	388784	388789	0 %	0 %	50 %	50 %	412337707
11126	NC_019382	GCC	2	6	388805	388810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337707
11127	NC_019382	GC	3	6	388818	388823	0 %	0 %	50 %	50 %	412337707
11128	NC_019382	AGC	2	6	388827	388832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337707
11129	NC_019382	GC	3	6	388871	388876	0 %	0 %	50 %	50 %	412337707
11130	NC_019382	GCCG	2	8	388906	388913	0 %	0 %	50 %	50 %	412337707
11131	NC_019382	GCCT	2	8	388926	388933	0 %	25 %	25 %	50 %	412337707
11132	NC_019382	CCAGC	2	10	388936	388945	20 %	0 %	20 %	60 %	412337707
11133	NC_019382	AGCG	2	8	388973	388980	25 %	0 %	50 %	25 %	412337707
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11137	NC_019382	GGCC	2	8	389188	389195	0 %	0 %	50 %	50 %	412337708
11138	NC_019382	GCCA	2	8	389202	389209	25 %	0 %	25 %	50 %	412337708
11139	NC_019382	GC	3	6	389216	389221	0 %	0 %	50 %	50 %	412337708
11140	NC_019382	GGT	2	6	389224	389229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337708
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11143	NC_019382	CGC	2	6	389416	389421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337708
11144	NC_019382	AGC	2	6	389466	389471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337708
11145	NC_019382	GC	3	6	389510	389515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11146	NC_019382	ACC	2	6	389557	389562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337709
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11148	NC_019382	GCC	2	6	389620	389625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337709
11149	NC_019382	GCT	2	6	389652	389657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337709
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11154	NC_019382	GTG	2	6	389977	389982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337709
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11158	NC_019382	GCCG	2	8	390270	390277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11159	NC_019382	CG	3	6	390276	390281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11160	NC_019382	CGC	2	6	390357	390362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337710
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11162	NC_019382	AT	3	6	390518	390523	50 %	50 %	0 %	0 %	412337710
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11193	NC_019382	ATC	2	6	391794	391799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337711
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11196	NC_019382	ATG	2	6	391998	392003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337711
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11200	NC_019382	CAA	2	6	392246	392251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337711
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11212	NC_019382	GATGCA	2	12	392474	392485	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	412337711
11213	NC_019382	GC	3	6	392516	392521	0 %	0 %	50 %	50 %	412337711
11214	NC_019382	CG	4	8	392557	392564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11215	NC_019382	GCGCC	2	10	392570	392579	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11216	NC_019382	TCA	2	6	392588	392593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337712
11217	NC_019382	CGTT	2	8	392599	392606	0 %	50 %	25 %	25 %	412337712
11218	NC_019382	CAG	2	6	392635	392640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337712
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11220	NC_019382	CG	3	6	392704	392709	0 %	0 %	50 %	50 %	412337712
11221	NC_019382	GC	3	6	392750	392755	0 %	0 %	50 %	50 %	412337712
11222	NC_019382	CGC	2	6	392814	392819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337712
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11224	NC_019382	CGG	2	6	392859	392864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337712
11225	NC_019382	CGG	2	6	392985	392990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337712
11226	NC_019382	GCC	2	6	393003	393008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337712
11227	NC_019382	CGGC	2	8	393083	393090	0 %	0 %	50 %	50 %	412337712
11228	NC_019382	TCA	2	6	393128	393133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337712
11229	NC_019382	TCG	2	6	393184	393189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337712
11230	NC_019382	CTG	2	6	393202	393207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337712
11231	NC_019382	GCA	2	6	393240	393245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337712
11232	NC_019382	CAACGT	2	12	393261	393272	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	412337712
11233	NC_019382	CAC	2	6	393297	393302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337712
11234	NC_019382	GC	3	6	393306	393311	0 %	0 %	50 %	50 %	412337712
11235	NC_019382	CGA	2	6	393345	393350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337712
11236	NC_019382	GCT	2	6	393416	393421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337713
11237	NC_019382	GAT	2	6	393443	393448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337713
11238	NC_019382	GGT	2	6	393461	393466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337713
11239	NC_019382	CGC	2	6	393484	393489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337713
11240	NC_019382	CCG	4	12	393492	393503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337713
11241	NC_019382	CCG	2	6	393575	393580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337713
11242	NC_019382	GGA	2	6	393617	393622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	412337713
11243	NC_019382	CGC	2	6	393632	393637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337713
11244	NC_019382	CCA	2	6	393649	393654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337713
11245	NC_019382	GGC	2	6	393689	393694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337713
11246	NC_019382	CGCGC	2	10	393695	393704	0 %	0 %	40 %	60 %	412337713
11247	NC_019382	CAT	2	6	393716	393721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337713
11248	NC_019382	GGC	2	6	393750	393755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337713
11249	NC_019382	AGC	2	6	393780	393785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337713
11250	NC_019382	CAA	2	6	393788	393793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337713
11251	NC_019382	ACC	2	6	393816	393821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337713
11252	NC_019382	TGC	2	6	393832	393837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337713
11253	NC_019382	GCA	2	6	393940	393945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337713
11254	NC_019382	GTC	2	6	393953	393958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337713
11255	NC_019382	CG	3	6	393974	393979	0 %	0 %	50 %	50 %	412337713
11256	NC_019382	GCA	2	6	393991	393996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337713
11257	NC_019382	GCTG	2	8	394027	394034	0 %	25 %	50 %	25 %	412337713
11258	NC_019382	GC	4	8	394112	394119	0 %	0 %	50 %	50 %	412337714
11259	NC_019382	CCTGGC	2	12	394123	394134	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	412337714
11260	NC_019382	GCT	2	6	394135	394140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337714
11261	NC_019382	GGGCGC	2	12	394141	394152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337714
11262	NC_019382	GCG	2	6	394248	394253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337714
11263	NC_019382	GCA	2	6	394279	394284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337714
11264	NC_019382	GCA	2	6	394332	394337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337714
11265	NC_019382	GAA	2	6	394348	394353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337714
11266	NC_019382	GCC	2	6	394358	394363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337714
11267	NC_019382	CGT	2	6	394386	394391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337714
11268	NC_019382	CG	3	6	394393	394398	0 %	0 %	50 %	50 %	412337714
11269	NC_019382	GTG	2	6	394418	394423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337714
11270	NC_019382	TCG	2	6	394427	394432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337714
11271	NC_019382	GCG	2	6	394455	394460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337714
11272	NC_019382	GCT	2	6	394465	394470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337714
11273	NC_019382	CGC	2	6	394476	394481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337714
11274	NC_019382	CCT	2	6	394525	394530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	412337714
11275	NC_019382	CGGGGC	2	12	394537	394548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337714
11276	NC_019382	CGG	2	6	394588	394593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337714
11277	NC_019382	TCG	2	6	394614	394619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337714
11278	NC_019382	GC	3	6	394621	394626	0 %	0 %	50 %	50 %	412337714
11279	NC_019382	AAC	2	6	394673	394678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337714
11280	NC_019382	CAC	2	6	394690	394695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337714
11281	NC_019382	CGC	3	9	394702	394710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337714
11282	NC_019382	ATG	2	6	394796	394801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337714
11283	NC_019382	CG	5	10	394837	394846	0 %	0 %	50 %	50 %	412337714
11284	NC_019382	CGGCCA	2	12	394848	394859	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	412337714
11285	NC_019382	TCA	3	9	394863	394871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337714
11286	NC_019382	CG	3	6	394873	394878	0 %	0 %	50 %	50 %	412337714
11287	NC_019382	GGT	2	6	394888	394893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337714
11288	NC_019382	GAG	2	6	394916	394921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	412337714
11289	NC_019382	ATC	2	6	394952	394957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337714
11290	NC_019382	CGG	2	6	395050	395055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337714
11291	NC_019382	ACC	2	6	395072	395077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337714
11292	NC_019382	CGC	2	6	395127	395132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337714
11293	NC_019382	CTG	2	6	395138	395143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337714
11294	NC_019382	CCG	2	6	395166	395171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337714
11295	NC_019382	GC	3	6	395179	395184	0 %	0 %	50 %	50 %	412337714
11296	NC_019382	ATC	2	6	395195	395200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337714
11297	NC_019382	C	6	6	395240	395245	0 %	0 %	0 %	100 %	412337715
11298	NC_019382	GCC	2	6	395279	395284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337715
11299	NC_019382	GCCAGC	2	12	395324	395335	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	412337715
11300	NC_019382	GAT	2	6	395376	395381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337715
11301	NC_019382	AGG	2	6	395411	395416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	412337715
11302	NC_019382	GCA	2	6	395430	395435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337715
11303	NC_019382	TGC	2	6	395444	395449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337715
11304	NC_019382	CGA	2	6	395460	395465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337715
11305	NC_019382	GCT	2	6	395514	395519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337715
11306	NC_019382	GCA	2	6	395529	395534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337715
11307	NC_019382	GCC	2	6	395541	395546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337715
11308	NC_019382	GCC	2	6	395554	395559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337715
11309	NC_019382	CGG	2	6	395568	395573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337715
11310	NC_019382	CGC	2	6	395577	395582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337715
11311	NC_019382	GGC	2	6	395583	395588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337715
11312	NC_019382	CG	3	6	395590	395595	0 %	0 %	50 %	50 %	412337715
11313	NC_019382	CCG	2	6	395606	395611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337715
11314	NC_019382	CGC	2	6	395618	395623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337715
11315	NC_019382	GCT	2	6	395688	395693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337715
11316	NC_019382	GCA	2	6	395705	395710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337715
11317	NC_019382	GC	3	6	395716	395721	0 %	0 %	50 %	50 %	412337715
11318	NC_019382	GGC	3	9	395733	395741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337715
11319	NC_019382	GC	3	6	395747	395752	0 %	0 %	50 %	50 %	412337715
11320	NC_019382	CG	4	8	395786	395793	0 %	0 %	50 %	50 %	412337715
11321	NC_019382	GCA	2	6	395808	395813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337715
11322	NC_019382	GCG	2	6	395816	395821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337715
11323	NC_019382	GC	3	6	395827	395832	0 %	0 %	50 %	50 %	412337715
11324	NC_019382	GGC	2	6	395847	395852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337715
11325	NC_019382	GCA	2	6	395897	395902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337715
11326	NC_019382	GGCG	2	8	395928	395935	0 %	0 %	75 %	25 %	412337715
11327	NC_019382	GTC	2	6	395953	395958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337715
11328	NC_019382	TGA	2	6	395963	395968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337715
11329	NC_019382	CGCC	2	8	396054	396061	0 %	0 %	25 %	75 %	412337715
11330	NC_019382	GGC	2	6	396117	396122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337715
11331	NC_019382	GCG	2	6	396123	396128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337715
11332	NC_019382	AGG	2	6	396134	396139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	412337715
11333	NC_019382	CAT	2	6	396183	396188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337715
11334	NC_019382	GC	4	8	396211	396218	0 %	0 %	50 %	50 %	412337715
11335	NC_019382	CGG	2	6	396228	396233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337715
11336	NC_019382	GGC	2	6	396246	396251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11337	NC_019382	GAC	2	6	396366	396371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337716
11338	NC_019382	CAA	2	6	396384	396389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337716
11339	NC_019382	ACG	2	6	396394	396399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337716
11340	NC_019382	GCC	2	6	396410	396415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337716
11341	NC_019382	TCA	2	6	396422	396427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337716
11342	NC_019382	CCG	2	6	396434	396439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337716
11343	NC_019382	GC	3	6	396536	396541	0 %	0 %	50 %	50 %	412337716
11344	NC_019382	GCA	2	6	396545	396550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337716
11345	NC_019382	CACC	2	8	396564	396571	25 %	0 %	0 %	75 %	412337716
11346	NC_019382	CGG	2	6	396662	396667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337716
11347	NC_019382	CCA	2	6	396668	396673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337716
11348	NC_019382	GCCG	2	8	396675	396682	0 %	0 %	50 %	50 %	412337716
11349	NC_019382	GC	3	6	396693	396698	0 %	0 %	50 %	50 %	412337716
11350	NC_019382	CG	4	8	396861	396868	0 %	0 %	50 %	50 %	412337716
11351	NC_019382	CTG	2	6	396895	396900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337716
11352	NC_019382	TGT	2	6	397004	397009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412337716
11353	NC_019382	CCGGG	2	10	397091	397100	0 %	0 %	60 %	40 %	412337716
11354	NC_019382	CAC	2	6	397101	397106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337716
11355	NC_019382	CGG	2	6	397140	397145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337716
11356	NC_019382	CTG	2	6	397159	397164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337716
11357	NC_019382	GCG	2	6	397283	397288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337716
11358	NC_019382	CGG	2	6	397310	397315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337716
11359	NC_019382	CCGACG	2	12	397367	397378	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	412337716
11360	NC_019382	ACG	2	6	397409	397414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337716
11361	NC_019382	GCA	2	6	397448	397453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337716
11362	NC_019382	CGC	2	6	397478	397483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337716
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11485	NC_019382	TGC	2	6	401735	401740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337719
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11499	NC_019382	CGC	2	6	402039	402044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337719
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