MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 151443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10123	NC_019382	CGC	3	9	356064	356072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337680
10124	NC_019382	CAG	2	6	356094	356099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337680
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10127	NC_019382	AGC	2	6	356155	356160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337680
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10131	NC_019382	CGC	2	6	356348	356353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337680
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10142	NC_019382	GCA	2	6	356735	356740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337680
10143	NC_019382	TTC	2	6	356742	356747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412337680
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10170	NC_019382	GACG	2	8	357588	357595	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10201	NC_019382	TGA	2	6	358873	358878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337682
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10212	NC_019382	ACC	2	6	359360	359365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337683
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10217	NC_019382	CGA	2	6	359583	359588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337683
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10230	NC_019382	CG	3	6	359907	359912	0 %	0 %	50 %	50 %	412337683
10231	NC_019382	CGG	2	6	359930	359935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337683
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10235	NC_019382	TCG	2	6	360047	360052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337683
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10237	NC_019382	CAG	2	6	360103	360108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337683
10238	NC_019382	CGT	2	6	360117	360122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337683
10239	NC_019382	CGG	2	6	360129	360134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337683
10240	NC_019382	CGT	2	6	360147	360152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337683
10241	NC_019382	GCG	2	6	360188	360193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337683
10242	NC_019382	GC	3	6	360295	360300	0 %	0 %	50 %	50 %	412337683
10243	NC_019382	GCT	2	6	360346	360351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337683
10244	NC_019382	GTGCTG	2	12	360385	360396	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	412337683
10245	NC_019382	GGC	2	6	360402	360407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337683
10246	NC_019382	GGGC	2	8	360427	360434	0 %	0 %	75 %	25 %	412337683
10247	NC_019382	CG	3	6	360553	360558	0 %	0 %	50 %	50 %	412337683
10248	NC_019382	CGGCCT	2	12	360585	360596	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	412337683
10249	NC_019382	CAG	2	6	360628	360633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337683
10250	NC_019382	CAC	2	6	360664	360669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337683
10251	NC_019382	GCT	2	6	360681	360686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337683
10252	NC_019382	GTC	2	6	360724	360729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337683
10253	NC_019382	AGA	2	6	360747	360752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337683
10254	NC_019382	CA	3	6	360763	360768	50 %	0 %	0 %	50 %	412337683
10255	NC_019382	TA	3	6	360769	360774	50 %	50 %	0 %	0 %	412337683
10256	NC_019382	ACGAGC	2	12	360779	360790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337683
10257	NC_019382	ACGCC	2	10	360809	360818	20 %	0 %	20 %	60 %	412337683
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10259	NC_019382	GGGC	2	8	360865	360872	0 %	0 %	75 %	25 %	412337683
10260	NC_019382	CTT	2	6	360883	360888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10261	NC_019382	TTG	2	6	360924	360929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10262	NC_019382	TAT	2	6	360980	360985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10263	NC_019382	AC	3	6	361165	361170	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10264	NC_019382	GCC	2	6	361205	361210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337684
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10266	NC_019382	GC	4	8	361285	361292	0 %	0 %	50 %	50 %	412337684
10267	NC_019382	CTG	2	6	361298	361303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337684
10268	NC_019382	CGA	2	6	361315	361320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337684
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10270	NC_019382	CCG	2	6	361382	361387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337684
10271	NC_019382	TGG	2	6	361467	361472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337684
10272	NC_019382	GC	3	6	361474	361479	0 %	0 %	50 %	50 %	412337684
10273	NC_019382	CAA	2	6	361480	361485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337684
10274	NC_019382	CCCG	2	8	361492	361499	0 %	0 %	25 %	75 %	412337684
10275	NC_019382	CGG	2	6	361501	361506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337684
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10280	NC_019382	TGGGCC	2	12	361785	361796	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	412337684
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10282	NC_019382	CG	4	8	361939	361946	0 %	0 %	50 %	50 %	412337684
10283	NC_019382	TCA	2	6	361971	361976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337684
10284	NC_019382	CGGCAA	2	12	362011	362022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337684
10285	NC_019382	ATC	2	6	362024	362029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337684
10286	NC_019382	TCA	2	6	362070	362075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337684
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10290	NC_019382	CAT	2	6	362140	362145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337684
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10293	NC_019382	GCT	2	6	362233	362238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337684
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10295	NC_019382	CGA	2	6	362260	362265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337684
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10299	NC_019382	GGCCA	2	10	362402	362411	20 %	0 %	40 %	40 %	412337684
10300	NC_019382	CACC	2	8	362419	362426	25 %	0 %	0 %	75 %	412337684
10301	NC_019382	AGA	2	6	362430	362435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337684
10302	NC_019382	CTCGA	2	10	362444	362453	20 %	20 %	20 %	40 %	412337684
10303	NC_019382	CGA	2	6	362491	362496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337684
10304	NC_019382	TAC	2	6	362516	362521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337684
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10306	NC_019382	GGC	2	6	362579	362584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337684
10307	NC_019382	GCGCC	2	10	362596	362605	0 %	0 %	40 %	60 %	412337684
10308	NC_019382	CGA	2	6	362611	362616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337684
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10311	NC_019382	CGA	2	6	362770	362775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337684
10312	NC_019382	TAC	2	6	362873	362878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337684
10313	NC_019382	GCT	2	6	362899	362904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337684
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10316	NC_019382	CGT	2	6	362958	362963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337684
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10320	NC_019382	CGGC	2	8	363048	363055	0 %	0 %	50 %	50 %	412337684
10321	NC_019382	GC	3	6	363065	363070	0 %	0 %	50 %	50 %	412337684
10322	NC_019382	CTG	2	6	363077	363082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337684
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10325	NC_019382	CAC	2	6	363100	363105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337684
10326	NC_019382	GCA	2	6	363124	363129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337684
10327	NC_019382	CTG	2	6	363149	363154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337684
10328	NC_019382	TCA	2	6	363213	363218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337684
10329	NC_019382	TGG	2	6	363240	363245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337684
10330	NC_019382	CTA	3	9	363262	363270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337684
10331	NC_019382	TGA	2	6	363279	363284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337684
10332	NC_019382	CCG	2	6	363312	363317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337684
10333	NC_019382	CGA	2	6	363319	363324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337684
10334	NC_019382	CAT	2	6	363331	363336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337684
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10336	NC_019382	GGC	2	6	363424	363429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337684
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10338	NC_019382	GGCGT	2	10	363455	363464	0 %	20 %	60 %	20 %	412337684
10339	NC_019382	CTG	2	6	363533	363538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337684
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10344	NC_019382	GC	4	8	363775	363782	0 %	0 %	50 %	50 %	412337684
10345	NC_019382	CGA	2	6	363787	363792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337684
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10351	NC_019382	GGTCAA	2	12	364066	364077	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	412337685
10352	NC_019382	GGC	2	6	364123	364128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337685
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10355	NC_019382	CGC	2	6	364195	364200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337685
10356	NC_019382	GCCG	2	8	364228	364235	0 %	0 %	50 %	50 %	412337685
10357	NC_019382	CCG	3	9	364233	364241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337685
10358	NC_019382	CGG	2	6	364389	364394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337685
10359	NC_019382	GCG	2	6	364395	364400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337685
10360	NC_019382	TCAAGG	2	12	364413	364424	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	412337685
10361	NC_019382	GTG	2	6	364460	364465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337685
10362	NC_019382	CAGGGC	2	12	364466	364477	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	412337685
10363	NC_019382	GCC	2	6	364481	364486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337685
10364	NC_019382	GCC	2	6	364490	364495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337685
10365	NC_019382	CGG	2	6	364509	364514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337685
10366	NC_019382	CGGCTT	2	12	364539	364550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337685
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10373	NC_019382	CGGC	2	8	364779	364786	0 %	0 %	50 %	50 %	412337685
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10380	NC_019382	CGA	2	6	364963	364968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337685
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10389	NC_019382	GCT	2	6	365301	365306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337685
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10398	NC_019382	GAAGTC	2	12	365618	365629	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	412337686
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10400	NC_019382	TCG	2	6	365723	365728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337686
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10431	NC_019382	GTG	2	6	366515	366520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337686
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10451	NC_019382	TCG	2	6	367149	367154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337686
10452	NC_019382	GCAC	2	8	367155	367162	25 %	0 %	25 %	50 %	412337686
10453	NC_019382	TCA	2	6	367173	367178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337686
10454	NC_019382	CACCCG	2	12	367238	367249	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	412337686
10455	NC_019382	TCGG	2	8	367262	367269	0 %	25 %	50 %	25 %	412337686
10456	NC_019382	GCC	2	6	367274	367279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337686
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10459	NC_019382	GC	3	6	367332	367337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10460	NC_019382	GCA	2	6	367344	367349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10461	NC_019382	GGCGC	2	10	367380	367389	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10462	NC_019382	GGGCG	2	10	367406	367415	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
10463	NC_019382	GC	4	8	367453	367460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10464	NC_019382	GGC	2	6	367488	367493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10465	NC_019382	CGTA	2	8	367498	367505	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10466	NC_019382	CGGG	2	8	367518	367525	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10467	NC_019382	GCCC	2	8	367530	367537	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10468	NC_019382	GCA	2	6	367558	367563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337687
10469	NC_019382	TTGG	2	8	367586	367593	0 %	50 %	50 %	0 %	412337687
10470	NC_019382	GGC	2	6	367691	367696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337687
10471	NC_019382	GTT	2	6	367715	367720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412337687
10472	NC_019382	CGT	2	6	367798	367803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337687
10473	NC_019382	CGG	2	6	367822	367827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337687
10474	NC_019382	CGC	2	6	367828	367833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337687
10475	NC_019382	CGT	2	6	367864	367869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337687
10476	NC_019382	CGG	2	6	367879	367884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337687
10477	NC_019382	GGC	2	6	367928	367933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337687
10478	NC_019382	GAC	2	6	368030	368035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337687
10479	NC_019382	CGG	2	6	368050	368055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337687
10480	NC_019382	GCC	2	6	368076	368081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337687
10481	NC_019382	CGG	2	6	368083	368088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337687
10482	NC_019382	TGG	2	6	368116	368121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337687
10483	NC_019382	GCC	2	6	368186	368191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337687
10484	NC_019382	CGAT	2	8	368235	368242	25 %	25 %	25 %	25 %	412337687
10485	NC_019382	ATCG	2	8	368249	368256	25 %	25 %	25 %	25 %	412337687
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10490	NC_019382	GTC	2	6	368496	368501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337687
10491	NC_019382	CGT	2	6	368518	368523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337687
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10499	NC_019382	CTT	2	6	368753	368758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10500	NC_019382	GCC	2	6	368775	368780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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