MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_6p

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018883	CT	3	6	34	39	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018883	AGT	2	6	63	68	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018883	ATT	2	6	210	215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403583
4	NC_018883	TTG	2	6	239	244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403583
5	NC_018883	A	6	6	252	257	100 %	0 %	0 %	0 %	514403583
6	NC_018883	GTA	2	6	344	349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403583
7	NC_018883	CATT	2	8	371	378	25 %	50 %	0 %	25 %	514403583
8	NC_018883	AGA	2	6	520	525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403583
9	NC_018883	ACA	2	6	577	582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403583
10	NC_018883	A	6	6	644	649	100 %	0 %	0 %	0 %	514403583
11	NC_018883	AGT	2	6	739	744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403583
12	NC_018883	ACA	2	6	763	768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403583
13	NC_018883	A	6	6	807	812	100 %	0 %	0 %	0 %	514403583
14	NC_018883	CAA	2	6	818	823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403583
15	NC_018883	A	7	7	839	845	100 %	0 %	0 %	0 %	514403583
16	NC_018883	AAAAG	2	10	847	856	80 %	0 %	20 %	0 %	514403583
17	NC_018883	GAA	2	6	923	928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403583
18	NC_018883	AAC	2	6	943	948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403583
19	NC_018883	A	7	7	980	986	100 %	0 %	0 %	0 %	514403583
20	NC_018883	GA	3	6	1018	1023	50 %	0 %	50 %	0 %	514403583
21	NC_018883	TTA	2	6	1050	1055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403583
22	NC_018883	A	6	6	1080	1085	100 %	0 %	0 %	0 %	514403583
23	NC_018883	ACAA	2	8	1104	1111	75 %	0 %	0 %	25 %	514403583
24	NC_018883	ACAA	2	8	1188	1195	75 %	0 %	0 %	25 %	514403583
25	NC_018883	A	6	6	1274	1279	100 %	0 %	0 %	0 %	514403583
26	NC_018883	TTA	2	6	1314	1319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403583
27	NC_018883	TGT	2	6	1427	1432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018883	A	6	6	1433	1438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018883	GTG	2	6	1475	1480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018883	GTC	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018883	TGG	2	6	1593	1598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018883	AATA	2	8	1645	1652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018883	A	6	6	1686	1691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018883	TA	4	8	1706	1713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018883	T	6	6	1720	1725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018883	A	7	7	1811	1817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018883	T	7	7	1842	1848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018883	AGAA	2	8	1922	1929	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018883	AGT	2	6	2006	2011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018883	TAGA	2	8	2065	2072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018883	T	6	6	2081	2086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018883	T	6	6	2088	2093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018883	GATT	2	8	2123	2130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018883	AT	3	6	2182	2187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018883	TAT	2	6	2195	2200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018883	ATG	2	6	2242	2247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018883	ATT	2	6	2293	2298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403584
48	NC_018883	ATGAAA	2	12	2328	2339	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514403584
49	NC_018883	A	6	6	2337	2342	100 %	0 %	0 %	0 %	514403584
50	NC_018883	TAT	2	6	2371	2376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403584
51	NC_018883	GTT	2	6	2394	2399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403584
52	NC_018883	AGA	2	6	2408	2413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403584
53	NC_018883	ACA	2	6	2451	2456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403584
54	NC_018883	A	7	7	2456	2462	100 %	0 %	0 %	0 %	514403584
55	NC_018883	ATT	2	6	2520	2525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403584
56	NC_018883	AT	3	6	2549	2554	50 %	50 %	0 %	0 %	514403584
57	NC_018883	AATTAG	2	12	2575	2586	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	514403584
58	NC_018883	ATA	2	6	2698	2703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403584
59	NC_018883	AAT	2	6	2739	2744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403584
60	NC_018883	TGG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514403584
61	NC_018883	CAA	2	6	2838	2843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403584
62	NC_018883	AAT	2	6	2850	2855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403584
63	NC_018883	ATT	2	6	2903	2908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403584
64	NC_018883	CAG	2	6	2926	2931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514403584
65	NC_018883	CAG	2	6	2941	2946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514403584
66	NC_018883	CA	3	6	3000	3005	50 %	0 %	0 %	50 %	514403584
67	NC_018883	GTTG	2	8	3034	3041	0 %	50 %	50 %	0 %	514403584
68	NC_018883	TAA	2	6	3059	3064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403584
69	NC_018883	T	6	6	3075	3080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018883	GATT	2	8	3153	3160	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018883	A	6	6	3176	3181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018883	GTAT	2	8	3198	3205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018883	T	6	6	3205	3210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018883	T	6	6	3224	3229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018883	TAT	2	6	3234	3239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018883	TAA	2	6	3333	3338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018883	A	8	8	3352	3359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018883	TAAA	2	8	3376	3383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018883	ATT	2	6	3460	3465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018883	T	6	6	3464	3469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018883	TAAAG	2	10	3519	3528	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018883	TAA	2	6	3533	3538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018883	T	7	7	3560	3566	0 %	100 %	0 %	0 %	514403585
84	NC_018883	TTA	2	6	3582	3587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403585
85	NC_018883	T	7	7	3593	3599	0 %	100 %	0 %	0 %	514403585
86	NC_018883	ATT	2	6	3741	3746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403585
87	NC_018883	TTC	2	6	3812	3817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403585
88	NC_018883	TTA	2	6	3828	3833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403585
89	NC_018883	TTTGTT	2	12	3869	3880	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	514403585
90	NC_018883	TTTTG	2	10	3984	3993	0 %	80 %	20 %	0 %	514403585
91	NC_018883	CATA	2	8	3994	4001	50 %	25 %	0 %	25 %	514403585
92	NC_018883	TTC	2	6	4037	4042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403585
93	NC_018883	AT	3	6	4057	4062	50 %	50 %	0 %	0 %	514403585
94	NC_018883	TTC	2	6	4082	4087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403585
95	NC_018883	TG	3	6	4110	4115	0 %	50 %	50 %	0 %	514403585
96	NC_018883	TTA	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403585
97	NC_018883	TTG	2	6	4223	4228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403585
98	NC_018883	TAA	2	6	4257	4262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403585
99	NC_018883	A	6	6	4373	4378	100 %	0 %	0 %	0 %	514403585
100	NC_018883	ATA	2	6	4382	4387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403585
101	NC_018883	GA	3	6	4392	4397	50 %	0 %	50 %	0 %	514403585
102	NC_018883	GT	3	6	4411	4416	0 %	50 %	50 %	0 %	514403585
103	NC_018883	TGG	2	6	4476	4481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514403585
104	NC_018883	TCT	3	9	4521	4529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403585
105	NC_018883	T	7	7	4540	4546	0 %	100 %	0 %	0 %	514403585
106	NC_018883	TTTG	2	8	4644	4651	0 %	75 %	25 %	0 %	514403585
107	NC_018883	T	6	6	4673	4678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018883	TAT	2	6	4688	4693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018883	AT	3	6	4720	4725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018883	TTA	2	6	4731	4736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018883	AT	3	6	4747	4752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018883	A	6	6	4798	4803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018883	T	6	6	4821	4826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018883	TAA	2	6	4838	4843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018883	A	7	7	4884	4890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018883	TA	3	6	4893	4898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018883	ACA	2	6	4933	4938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018883	A	7	7	4938	4944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018883	GTT	2	6	4965	4970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018883	AAC	2	6	4975	4980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018883	AGA	2	6	4984	4989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018883	T	7	7	4995	5001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018883	AATT	2	8	5012	5019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018883	AATT	2	8	5036	5043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018883	ATA	2	6	5055	5060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018883	GAG	2	6	5102	5107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018883	TAGAAA	2	12	5169	5180	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514403586
128	NC_018883	ATC	2	6	5199	5204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514403586
129	NC_018883	A	7	7	5285	5291	100 %	0 %	0 %	0 %	514403586
130	NC_018883	TAAA	2	8	5346	5353	75 %	25 %	0 %	0 %	514403586
131	NC_018883	TAA	2	6	5368	5373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403586
132	NC_018883	TA	3	6	5405	5410	50 %	50 %	0 %	0 %	514403586
133	NC_018883	ATTGT	2	10	5424	5433	20 %	60 %	20 %	0 %	514403586
134	NC_018883	AATT	2	8	5487	5494	50 %	50 %	0 %	0 %	514403586
135	NC_018883	AAT	2	6	5582	5587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403586
136	NC_018883	CA	3	6	5616	5621	50 %	0 %	0 %	50 %	514403586
137	NC_018883	TGAA	2	8	5649	5656	50 %	25 %	25 %	0 %	514403586
138	NC_018883	ATGAAA	2	12	5684	5695	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514403586
139	NC_018883	ATT	2	6	5719	5724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403586
140	NC_018883	T	8	8	5751	5758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018883	GT	3	6	5767	5772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018883	AC	3	6	5807	5812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018883	AT	3	6	5833	5838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018883	T	8	8	5844	5851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018883	CT	5	10	5862	5871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_018883	TA	4	8	5880	5887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018883	TTC	2	6	5967	5972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403587
148	NC_018883	T	6	6	5983	5988	0 %	100 %	0 %	0 %	514403587
149	NC_018883	ACA	2	6	6280	6285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_018883	AT	3	6	6346	6351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018883	AAG	3	9	6438	6446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018883	GA	3	6	6473	6478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018883	TA	3	6	6494	6499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018883	AAC	2	6	6531	6536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_018883	TGG	2	6	6757	6762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018883	CAA	2	6	6844	6849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.