MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica MO149

Total Repeats: 148431

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16114	NC_018829	CATT	3	12	587314	587325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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16117	NC_018829	CT	3	6	587573	587578	0 %	50 %	0 %	50 %	410418350
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16231	NC_018829	GCC	3	9	591682	591690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418355
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16239	NC_018829	GCC	2	6	592031	592036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418355
16240	NC_018829	CGTT	2	8	592046	592053	0 %	50 %	25 %	25 %	410418355
16241	NC_018829	TTC	2	6	592061	592066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410418355
16242	NC_018829	CGGTT	2	10	592085	592094	0 %	40 %	40 %	20 %	410418355
16243	NC_018829	CGG	2	6	592110	592115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418355
16244	NC_018829	GGC	2	6	592179	592184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418355
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16250	NC_018829	ATGGCG	2	12	592403	592414	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410418355
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16252	NC_018829	GC	3	6	592450	592455	0 %	0 %	50 %	50 %	410418355
16253	NC_018829	CTG	2	6	592459	592464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418355
16254	NC_018829	GCG	2	6	592488	592493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418355
16255	NC_018829	GCC	2	6	592531	592536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418355
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16264	NC_018829	CCG	2	6	592825	592830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418356
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16268	NC_018829	CGG	2	6	592946	592951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418356
16269	NC_018829	GGTC	2	8	592988	592995	0 %	25 %	50 %	25 %	410418356
16270	NC_018829	GCA	2	6	593072	593077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418356
16271	NC_018829	GCC	2	6	593079	593084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418356
16272	NC_018829	TGT	2	6	593105	593110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410418356
16273	NC_018829	GC	3	6	593114	593119	0 %	0 %	50 %	50 %	410418356
16274	NC_018829	GAC	2	6	593137	593142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418356
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16276	NC_018829	TGC	2	6	593153	593158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418356
16277	NC_018829	GCCG	2	8	593180	593187	0 %	0 %	50 %	50 %	410418356
16278	NC_018829	TGC	2	6	593245	593250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418356
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16280	NC_018829	GCA	2	6	593273	593278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418356
16281	NC_018829	GAC	2	6	593295	593300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418356
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16285	NC_018829	CG	3	6	593420	593425	0 %	0 %	50 %	50 %	410418356
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16287	NC_018829	CGCC	2	8	593471	593478	0 %	0 %	25 %	75 %	410418356
16288	NC_018829	AACAA	2	10	593557	593566	80 %	0 %	0 %	20 %	410418356
16289	NC_018829	TGG	2	6	593620	593625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410418357
16290	NC_018829	GC	3	6	593637	593642	0 %	0 %	50 %	50 %	410418357
16291	NC_018829	TCA	2	6	593653	593658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410418357
16292	NC_018829	TTG	2	6	593661	593666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410418357
16293	NC_018829	CGA	2	6	593689	593694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418357
16294	NC_018829	CG	3	6	593730	593735	0 %	0 %	50 %	50 %	410418357
16295	NC_018829	GC	3	6	593770	593775	0 %	0 %	50 %	50 %	410418357
16296	NC_018829	CACGAC	2	12	593783	593794	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	410418357
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16298	NC_018829	CGC	2	6	593809	593814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418357
16299	NC_018829	GCACG	2	10	593822	593831	20 %	0 %	40 %	40 %	410418357
16300	NC_018829	CGC	2	6	593837	593842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418357
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16302	NC_018829	CGC	2	6	594020	594025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418357
16303	NC_018829	CGT	2	6	594034	594039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418357
16304	NC_018829	CGG	2	6	594064	594069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418357
16305	NC_018829	CGG	2	6	594097	594102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418357
16306	NC_018829	TCG	2	6	594120	594125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418357
16307	NC_018829	GCGCG	2	10	594148	594157	0 %	0 %	60 %	40 %	410418357
16308	NC_018829	CAG	2	6	594266	594271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418357
16309	NC_018829	GTC	2	6	594272	594277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418357
16310	NC_018829	CGC	2	6	594278	594283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418357
16311	NC_018829	GCC	2	6	594284	594289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418357
16312	NC_018829	GTA	2	6	594374	594379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410418357
16313	NC_018829	AGT	2	6	594517	594522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410418357
16314	NC_018829	GTA	2	6	594524	594529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410418357
16315	NC_018829	CGT	2	6	594532	594537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418357
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16318	NC_018829	CAG	2	6	594599	594604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418357
16319	NC_018829	CGC	2	6	594661	594666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418357
16320	NC_018829	GGC	2	6	594701	594706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418357
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16322	NC_018829	CAG	2	6	594773	594778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418357
16323	NC_018829	GGC	2	6	594784	594789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418357
16324	NC_018829	GCA	2	6	594823	594828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418357
16325	NC_018829	GCC	2	6	594831	594836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418357
16326	NC_018829	CGG	3	9	595012	595020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418357
16327	NC_018829	GGC	2	6	595031	595036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418357
16328	NC_018829	GC	3	6	595044	595049	0 %	0 %	50 %	50 %	410418357
16329	NC_018829	CGGCCT	2	12	595111	595122	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410418357
16330	NC_018829	CGC	2	6	595139	595144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418357
16331	NC_018829	GGC	2	6	595181	595186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418357
16332	NC_018829	T	6	6	595224	595229	0 %	100 %	0 %	0 %	410418357
16333	NC_018829	CG	3	6	595303	595308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16334	NC_018829	GTC	2	6	595318	595323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418358
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16337	NC_018829	CGCCGG	2	12	595482	595493	0 %	0 %	50 %	50 %	410418358
16338	NC_018829	GCTG	2	8	595515	595522	0 %	25 %	50 %	25 %	410418358
16339	NC_018829	GC	3	6	595547	595552	0 %	0 %	50 %	50 %	410418358
16340	NC_018829	TCG	2	6	595556	595561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418358
16341	NC_018829	GGC	2	6	595570	595575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418358
16342	NC_018829	CGC	2	6	595590	595595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418358
16343	NC_018829	GCA	4	12	595602	595613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418358
16344	NC_018829	GGCGC	2	10	595614	595623	0 %	0 %	60 %	40 %	410418358
16345	NC_018829	GC	4	8	595631	595638	0 %	0 %	50 %	50 %	410418358
16346	NC_018829	CGCC	2	8	595725	595732	0 %	0 %	25 %	75 %	410418358
16347	NC_018829	GCC	2	6	595784	595789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418358
16348	NC_018829	CG	3	6	595852	595857	0 %	0 %	50 %	50 %	410418358
16349	NC_018829	TCC	2	6	595898	595903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410418358
16350	NC_018829	CCG	2	6	595971	595976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16351	NC_018829	GAAT	2	8	596003	596010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16352	NC_018829	ACG	2	6	596090	596095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418359
16353	NC_018829	CCG	2	6	596118	596123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418359
16354	NC_018829	TGC	2	6	596135	596140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418359
16355	NC_018829	CCA	2	6	596174	596179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410418359
16356	NC_018829	CG	3	6	596181	596186	0 %	0 %	50 %	50 %	410418359
16357	NC_018829	GAC	2	6	596227	596232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418359
16358	NC_018829	GGT	4	12	596244	596255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410418359
16359	NC_018829	CCGGCG	2	12	596258	596269	0 %	0 %	50 %	50 %	410418359
16360	NC_018829	CGGC	2	8	596282	596289	0 %	0 %	50 %	50 %	410418359
16361	NC_018829	GGT	2	6	596331	596336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410418359
16362	NC_018829	GAAG	2	8	596349	596356	50 %	0 %	50 %	0 %	410418359
16363	NC_018829	ACA	2	6	596372	596377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410418359
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16373	NC_018829	GCCTGG	2	12	596624	596635	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	410418359
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16382	NC_018829	GGCGC	2	10	596890	596899	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16383	NC_018829	GC	3	6	596943	596948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16399	NC_018829	GTG	2	6	597632	597637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410418360
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16461	NC_018829	CG	3	6	600329	600334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16462	NC_018829	GTG	2	6	600357	600362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16463	NC_018829	ACG	2	6	600385	600390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16465	NC_018829	CGGC	2	8	600493	600500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16466	NC_018829	GTG	2	6	600504	600509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16467	NC_018829	GCC	2	6	600531	600536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16468	NC_018829	G	7	7	600567	600573	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16469	NC_018829	GGC	3	9	600575	600583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16470	NC_018829	GATC	2	8	600596	600603	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16472	NC_018829	CCG	2	6	600734	600739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16473	NC_018829	CG	3	6	600738	600743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16474	NC_018829	GC	3	6	600907	600912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16475	NC_018829	CG	3	6	600913	600918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16476	NC_018829	CGA	2	6	600923	600928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16477	NC_018829	CGG	2	6	600974	600979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16478	NC_018829	GC	3	6	601015	601020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16479	NC_018829	GCT	2	6	601037	601042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16480	NC_018829	CGAC	2	8	601075	601082	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16481	NC_018829	GC	3	6	601085	601090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16482	NC_018829	CGC	2	6	601133	601138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16483	NC_018829	CAT	2	6	601157	601162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16484	NC_018829	GGC	2	6	601164	601169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16485	NC_018829	CGC	2	6	601223	601228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16486	NC_018829	GCC	3	9	601233	601241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16487	NC_018829	CGGCG	2	10	601265	601274	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16488	NC_018829	CGCC	2	8	601275	601282	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16489	NC_018829	CA	3	6	601313	601318	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16490	NC_018829	GC	3	6	601342	601347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16491	NC_018829	TCG	2	6	601352	601357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16492	NC_018829	ACTA	2	8	601362	601369	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16493	NC_018829	TGT	2	6	601372	601377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16494	NC_018829	C	6	6	601430	601435	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16495	NC_018829	GAC	2	6	601451	601456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418362
16496	NC_018829	CTTT	2	8	601478	601485	0 %	75 %	0 %	25 %	410418362
16497	NC_018829	CAA	2	6	601496	601501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410418362
16498	NC_018829	TCTCGA	2	12	601550	601561	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410418362
16499	NC_018829	GCC	2	6	601571	601576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418362
16500	NC_018829	CG	4	8	601592	601599	0 %	0 %	50 %	50 %	410418362

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