MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica MO149

Total Repeats: 148431

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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148003	NC_018829	GC	3	6	5074071	5074076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148004	NC_018829	CTG	2	6	5074083	5074088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410422425
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148116	NC_018829	TTC	2	6	5078033	5078038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410422429
148117	NC_018829	TGGTC	2	10	5078061	5078070	0 %	40 %	40 %	20 %	410422429
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148119	NC_018829	GCA	2	6	5078133	5078138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410422429
148120	NC_018829	GTC	2	6	5078146	5078151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410422429
148121	NC_018829	GCA	2	6	5078175	5078180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410422429
148122	NC_018829	GC	3	6	5078186	5078191	0 %	0 %	50 %	50 %	410422429
148123	NC_018829	CAG	2	6	5078302	5078307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410422429
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148127	NC_018829	CGT	2	6	5078478	5078483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410422429
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148132	NC_018829	GCCG	2	8	5078635	5078642	0 %	0 %	50 %	50 %	410422429
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148200	NC_018829	GGCATA	2	12	5081404	5081415	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410422431
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148219	NC_018829	CG	3	6	5082322	5082327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148220	NC_018829	GCTT	2	8	5082355	5082362	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148221	NC_018829	CAT	2	6	5082443	5082448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148222	NC_018829	CG	4	8	5082460	5082467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148223	NC_018829	CAG	2	6	5082504	5082509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148224	NC_018829	GCTT	2	8	5082634	5082641	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148225	NC_018829	TGT	2	6	5082660	5082665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148226	NC_018829	TTA	2	6	5082771	5082776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148227	NC_018829	TA	3	6	5082789	5082794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148228	NC_018829	GCC	2	6	5082829	5082834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148229	NC_018829	CTG	2	6	5082963	5082968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410422432
148230	NC_018829	CGC	2	6	5082975	5082980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410422432
148231	NC_018829	CAT	2	6	5083004	5083009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410422432
148232	NC_018829	CGA	2	6	5083070	5083075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410422432
148233	NC_018829	GGTCCT	2	12	5083085	5083096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410422432
148234	NC_018829	CG	4	8	5083100	5083107	0 %	0 %	50 %	50 %	410422432
148235	NC_018829	CGA	2	6	5083148	5083153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410422432
148236	NC_018829	GGA	2	6	5083178	5083183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410422432
148237	NC_018829	CCG	2	6	5083211	5083216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410422432
148238	NC_018829	TGC	2	6	5083333	5083338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410422432
148239	NC_018829	GC	3	6	5083337	5083342	0 %	0 %	50 %	50 %	410422432
148240	NC_018829	CAGCG	2	10	5083350	5083359	20 %	0 %	40 %	40 %	410422432
148241	NC_018829	TCCAG	2	10	5083396	5083405	20 %	20 %	20 %	40 %	410422432
148242	NC_018829	AAG	2	6	5083458	5083463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410422432
148243	NC_018829	A	6	6	5083547	5083552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148244	NC_018829	TGG	2	6	5083585	5083590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410422433
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148249	NC_018829	TAC	2	6	5083801	5083806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410422433
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148274	NC_018829	TGC	2	6	5084958	5084963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410422433
148275	NC_018829	CCAT	2	8	5085063	5085070	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
148276	NC_018829	CAA	2	6	5085086	5085091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148277	NC_018829	CG	3	6	5085133	5085138	0 %	0 %	50 %	50 %	410422434
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148285	NC_018829	GC	3	6	5085299	5085304	0 %	0 %	50 %	50 %	410422434
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148311	NC_018829	CGG	2	6	5086131	5086136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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148337	NC_018829	GC	3	6	5086964	5086969	0 %	0 %	50 %	50 %	410422436
148338	NC_018829	GCTGTC	2	12	5086990	5087001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410422436
148339	NC_018829	CTG	2	6	5087051	5087056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410422436
148340	NC_018829	GCT	2	6	5087062	5087067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410422436
148341	NC_018829	GCCG	2	8	5087092	5087099	0 %	0 %	50 %	50 %	410422436
148342	NC_018829	TGC	2	6	5087129	5087134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410422436
148343	NC_018829	GCAA	2	8	5087151	5087158	50 %	0 %	25 %	25 %	410422436
148344	NC_018829	GGC	2	6	5087176	5087181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410422436
148345	NC_018829	GAT	2	6	5087182	5087187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410422436
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.