MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica MO149

Total Repeats: 148431

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_018829	AGC	2	6	448294	448299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418232
12502	NC_018829	GCGATG	2	12	448447	448458	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410418232
12503	NC_018829	CG	3	6	448499	448504	0 %	0 %	50 %	50 %	410418232
12504	NC_018829	ACC	2	6	448543	448548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410418232
12505	NC_018829	CGT	2	6	448556	448561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418232
12506	NC_018829	CCA	2	6	448562	448567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410418232
12507	NC_018829	CAG	3	9	448629	448637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418232
12508	NC_018829	CAG	2	6	448671	448676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418232
12509	NC_018829	GAT	2	6	448680	448685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410418232
12510	NC_018829	GC	3	6	448690	448695	0 %	0 %	50 %	50 %	410418232
12511	NC_018829	CAC	2	6	448716	448721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410418232
12512	NC_018829	CAC	2	6	448725	448730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410418232
12513	NC_018829	CAC	2	6	448758	448763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410418232
12514	NC_018829	GC	3	6	448777	448782	0 %	0 %	50 %	50 %	410418232
12515	NC_018829	TGG	2	6	448853	448858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410418232
12516	NC_018829	ATG	2	6	448906	448911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410418232
12517	NC_018829	CAG	2	6	448938	448943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418232
12518	NC_018829	CG	3	6	448979	448984	0 %	0 %	50 %	50 %	410418232
12519	NC_018829	AGGT	2	8	448996	449003	25 %	25 %	50 %	0 %	410418232
12520	NC_018829	CGC	2	6	449006	449011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418232
12521	NC_018829	GAT	2	6	449031	449036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410418232
12522	NC_018829	GGC	2	6	449063	449068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418232
12523	NC_018829	CG	3	6	449069	449074	0 %	0 %	50 %	50 %	410418232
12524	NC_018829	CGG	2	6	449132	449137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418232
12525	NC_018829	GC	3	6	449280	449285	0 %	0 %	50 %	50 %	410418232
12526	NC_018829	TGA	2	6	449303	449308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410418232
12527	NC_018829	CAC	2	6	449364	449369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410418232
12528	NC_018829	AGCGTG	2	12	449371	449382	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410418232
12529	NC_018829	TGG	2	6	449396	449401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410418232
12530	NC_018829	CGG	2	6	449424	449429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418232
12531	NC_018829	GCT	2	6	449468	449473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418232
12532	NC_018829	CGTCAG	2	12	449511	449522	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410418232
12533	NC_018829	CTT	2	6	449582	449587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410418232
12534	NC_018829	GCG	2	6	449591	449596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418232
12535	NC_018829	GC	3	6	449644	449649	0 %	0 %	50 %	50 %	410418232
12536	NC_018829	ACC	3	9	449650	449658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410418232
12537	NC_018829	GGC	2	6	449662	449667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418232
12538	NC_018829	CAG	2	6	449709	449714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418232
12539	NC_018829	ACC	3	9	449728	449736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410418232
12540	NC_018829	CGAT	2	8	449761	449768	25 %	25 %	25 %	25 %	410418232
12541	NC_018829	GAA	2	6	449769	449774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410418232
12542	NC_018829	CAGCG	2	10	449807	449816	20 %	0 %	40 %	40 %	410418233
12543	NC_018829	GCC	2	6	449819	449824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418233
12544	NC_018829	CTGG	2	8	449863	449870	0 %	25 %	50 %	25 %	410418233
12545	NC_018829	GAC	2	6	449911	449916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418233
12546	NC_018829	CAG	2	6	449977	449982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418233
12547	NC_018829	GCGGT	2	10	449996	450005	0 %	20 %	60 %	20 %	410418233
12548	NC_018829	CTC	2	6	450010	450015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410418233
12549	NC_018829	CAGCAC	2	12	450016	450027	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	410418233
12550	NC_018829	TCG	2	6	450062	450067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418233
12551	NC_018829	CG	3	6	450081	450086	0 %	0 %	50 %	50 %	410418233
12552	NC_018829	GC	3	6	450087	450092	0 %	0 %	50 %	50 %	410418233
12553	NC_018829	CGC	3	9	450090	450098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418233
12554	NC_018829	GC	3	6	450158	450163	0 %	0 %	50 %	50 %	410418233
12555	NC_018829	CG	3	6	450222	450227	0 %	0 %	50 %	50 %	410418233
12556	NC_018829	GCACCG	2	12	450258	450269	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	410418233
12557	NC_018829	GC	3	6	450277	450282	0 %	0 %	50 %	50 %	410418233
12558	NC_018829	GGC	2	6	450373	450378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418233
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12560	NC_018829	ACG	2	6	450389	450394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418233
12561	NC_018829	GC	3	6	450413	450418	0 %	0 %	50 %	50 %	410418233
12562	NC_018829	CGGCG	2	10	450436	450445	0 %	0 %	60 %	40 %	410418233
12563	NC_018829	GGC	2	6	450484	450489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418233
12564	NC_018829	GGC	3	9	450508	450516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418233
12565	NC_018829	GCG	2	6	450524	450529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418233
12566	NC_018829	CAG	2	6	450574	450579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418233
12567	NC_018829	CG	3	6	450588	450593	0 %	0 %	50 %	50 %	410418233
12568	NC_018829	CGG	3	9	450600	450608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418233
12569	NC_018829	GC	4	8	450623	450630	0 %	0 %	50 %	50 %	410418233
12570	NC_018829	CGC	3	9	450628	450636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418233
12571	NC_018829	CG	4	8	450643	450650	0 %	0 %	50 %	50 %	410418233
12572	NC_018829	GGC	2	6	450795	450800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418233
12573	NC_018829	GCC	2	6	450863	450868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418233
12574	NC_018829	GGCCTG	2	12	450874	450885	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	410418233
12575	NC_018829	GCC	2	6	450892	450897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418233
12576	NC_018829	GCC	2	6	450922	450927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418233
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12578	NC_018829	CGA	2	6	450945	450950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410418233
12579	NC_018829	GCCG	2	8	451031	451038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12580	NC_018829	AGCGC	2	10	451047	451056	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12581	NC_018829	GACG	2	8	451068	451075	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12582	NC_018829	CGG	2	6	451086	451091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12583	NC_018829	TGGC	2	8	451141	451148	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12584	NC_018829	TGTT	2	8	451158	451165	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_018829	CA	3	6	451207	451212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12586	NC_018829	CGC	2	6	451224	451229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12587	NC_018829	GCC	2	6	451294	451299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418234
12588	NC_018829	TGC	2	6	451310	451315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418234
12589	NC_018829	CAC	2	6	451320	451325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410418234
12590	NC_018829	CAC	2	6	451329	451334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410418234
12591	NC_018829	CAC	2	6	451383	451388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410418234
12592	NC_018829	CTA	2	6	451422	451427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410418234
12593	NC_018829	CGC	2	6	451485	451490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418234
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12595	NC_018829	C	6	6	451525	451530	0 %	0 %	0 %	100 %	410418234
12596	NC_018829	CGGC	2	8	451536	451543	0 %	0 %	50 %	50 %	410418234
12597	NC_018829	CCG	2	6	451617	451622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418234
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12599	NC_018829	GGA	2	6	451674	451679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410418234
12600	NC_018829	TGG	2	6	451688	451693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410418234
12601	NC_018829	CGC	2	6	451696	451701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418234
12602	NC_018829	GCG	2	6	451729	451734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418234
12603	NC_018829	CGT	2	6	451736	451741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418234
12604	NC_018829	GC	3	6	451747	451752	0 %	0 %	50 %	50 %	410418234
12605	NC_018829	ATT	2	6	451802	451807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410418234
12606	NC_018829	TCG	2	6	451841	451846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418234
12607	NC_018829	GTG	2	6	451882	451887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410418234
12608	NC_018829	GC	3	6	451951	451956	0 %	0 %	50 %	50 %	410418234
12609	NC_018829	TGC	2	6	452000	452005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418234
12610	NC_018829	GCT	2	6	452037	452042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418234
12611	NC_018829	GCC	2	6	452054	452059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418234
12612	NC_018829	GCT	2	6	452121	452126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410418234
12613	NC_018829	CGAG	2	8	452139	452146	25 %	0 %	50 %	25 %	410418234
12614	NC_018829	CGG	3	9	452192	452200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418234
12615	NC_018829	CCG	3	9	452201	452209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410418234
12616	NC_018829	GC	3	6	452344	452349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12617	NC_018829	AG	3	6	452444	452449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_018829	GCTG	2	8	452500	452507	0 %	25 %	50 %	25 %	410418235
12619	NC_018829	ATTT	2	8	452532	452539	25 %	75 %	0 %	0 %	410418235
12620	NC_018829	GGC	2	6	452567	452572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418235
12621	NC_018829	ATC	2	6	452577	452582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410418235
12622	NC_018829	GC	3	6	452618	452623	0 %	0 %	50 %	50 %	410418235
12623	NC_018829	CGG	2	6	452627	452632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418235
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12686	NC_018829	CGG	2	6	454481	454486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12687	NC_018829	GCTAC	2	10	454493	454502	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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12729	NC_018829	GC	3	6	455815	455820	0 %	0 %	50 %	50 %	410418238
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12731	NC_018829	GGCC	2	8	455854	455861	0 %	0 %	50 %	50 %	410418238
12732	NC_018829	GCCG	2	8	455917	455924	0 %	0 %	50 %	50 %	410418238
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12738	NC_018829	CGG	2	6	456185	456190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12739	NC_018829	GGCG	2	8	456230	456237	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12740	NC_018829	GCGCC	2	10	456251	456260	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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12865	NC_018829	TGGCG	2	10	460494	460503	0 %	20 %	60 %	20 %	410418243
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12986	NC_018829	GGC	2	6	464588	464593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418248
12987	NC_018829	CGG	2	6	464605	464610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418248
12988	NC_018829	GCG	2	6	464664	464669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418248
12989	NC_018829	G	6	6	464725	464730	0 %	0 %	100 %	0 %	410418248
12990	NC_018829	GAA	2	6	464810	464815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410418248
12991	NC_018829	GGC	2	6	464886	464891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410418248
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