MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella parapertussis Bpp5

Total Repeats: 139326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_018828	AGA	2	6	595442	595447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410471320
16003	NC_018828	GTC	3	9	595524	595532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471320
16004	NC_018828	CAG	2	6	595545	595550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471320
16005	NC_018828	TCC	2	6	595613	595618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16006	NC_018828	CAG	2	6	595689	595694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16007	NC_018828	GCC	2	6	595708	595713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16008	NC_018828	TGG	2	6	595715	595720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_018828	AGG	2	6	595780	595785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_018828	GTGGG	2	10	595818	595827	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_018828	GCC	2	6	595918	595923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471321
16012	NC_018828	CTC	2	6	595936	595941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410471321
16013	NC_018828	CGC	2	6	595965	595970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471321
16014	NC_018828	GCT	2	6	596023	596028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471321
16015	NC_018828	CGT	2	6	596043	596048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471321
16016	NC_018828	GC	3	6	596145	596150	0 %	0 %	50 %	50 %	410471321
16017	NC_018828	GAA	2	6	596167	596172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410471321
16018	NC_018828	GA	3	6	596251	596256	50 %	0 %	50 %	0 %	410471321
16019	NC_018828	GC	3	6	596286	596291	0 %	0 %	50 %	50 %	410471321
16020	NC_018828	TGC	2	6	596324	596329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471321
16021	NC_018828	TCG	2	6	596376	596381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471321
16022	NC_018828	GGCC	2	8	596401	596408	0 %	0 %	50 %	50 %	410471321
16023	NC_018828	GCA	2	6	596416	596421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471321
16024	NC_018828	GCCAGC	2	12	596451	596462	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	410471321
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16028	NC_018828	GGT	2	6	596571	596576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_018828	TCG	2	6	596590	596595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16030	NC_018828	GAC	2	6	596702	596707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_018828	CAAGG	2	10	596811	596820	40 %	0 %	40 %	20 %	410471322
16032	NC_018828	AGGA	2	8	596859	596866	50 %	0 %	50 %	0 %	410471322
16033	NC_018828	ACC	2	6	596869	596874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410471322
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16035	NC_018828	CA	4	8	596977	596984	50 %	0 %	0 %	50 %	410471322
16036	NC_018828	GTT	2	6	596995	597000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410471322
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16038	NC_018828	CCT	2	6	597043	597048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410471322
16039	NC_018828	CG	3	6	597056	597061	0 %	0 %	50 %	50 %	410471322
16040	NC_018828	AGGCA	2	10	597094	597103	40 %	0 %	40 %	20 %	410471322
16041	NC_018828	GGC	2	6	597120	597125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471322
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16043	NC_018828	CG	3	6	597210	597215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16044	NC_018828	CG	3	6	597227	597232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16045	NC_018828	CGC	2	6	597250	597255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16046	NC_018828	GC	3	6	597311	597316	0 %	0 %	50 %	50 %	410471323
16047	NC_018828	TGCGC	2	10	597328	597337	0 %	20 %	40 %	40 %	410471323
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16052	NC_018828	CTG	2	6	597499	597504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471323
16053	NC_018828	GACC	2	8	597513	597520	25 %	0 %	25 %	50 %	410471323
16054	NC_018828	GGCC	2	8	597561	597568	0 %	0 %	50 %	50 %	410471323
16055	NC_018828	CCG	2	6	597597	597602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471323
16056	NC_018828	TGA	2	6	597717	597722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410471323
16057	NC_018828	GGT	2	6	597754	597759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410471323
16058	NC_018828	GGTC	2	8	597786	597793	0 %	25 %	50 %	25 %	410471323
16059	NC_018828	GGC	2	6	597851	597856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471323
16060	NC_018828	GCA	2	6	597921	597926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471323
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16062	NC_018828	GCC	2	6	598022	598027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471323
16063	NC_018828	GACT	2	8	598031	598038	25 %	25 %	25 %	25 %	410471323
16064	NC_018828	GGA	2	6	598083	598088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410471323
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16074	NC_018828	CTG	2	6	598546	598551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471323
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16078	NC_018828	AGC	2	6	598643	598648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471323
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16086	NC_018828	CGCC	2	8	599025	599032	0 %	0 %	25 %	75 %	410471323
16087	NC_018828	CGA	2	6	599037	599042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471323
16088	NC_018828	GCT	2	6	599043	599048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471323
16089	NC_018828	CGC	2	6	599074	599079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471323
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16094	NC_018828	GTA	2	6	599221	599226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410471323
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16096	NC_018828	GCA	2	6	599373	599378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16099	NC_018828	GAC	2	6	599505	599510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16100	NC_018828	GCC	2	6	599572	599577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16101	NC_018828	GCG	2	6	599587	599592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16102	NC_018828	ACT	2	6	599601	599606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410471324
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16118	NC_018828	ACGCC	2	10	600212	600221	20 %	0 %	20 %	60 %	410471324
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16121	NC_018828	CTG	2	6	600279	600284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471324
16122	NC_018828	GC	4	8	600319	600326	0 %	0 %	50 %	50 %	410471324
16123	NC_018828	GCA	2	6	600332	600337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471324
16124	NC_018828	CGC	2	6	600340	600345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471324
16125	NC_018828	CGT	2	6	600362	600367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471324
16126	NC_018828	CTGG	2	8	600384	600391	0 %	25 %	50 %	25 %	410471324
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16157	NC_018828	TG	4	8	601425	601432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16229	NC_018828	GCG	2	6	604165	604170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16232	NC_018828	GC	3	6	604256	604261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16242	NC_018828	GCA	2	6	604462	604467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471328
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16350	NC_018828	CGTG	2	8	608200	608207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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16354	NC_018828	TCAC	2	8	608321	608328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16355	NC_018828	CG	3	6	608488	608493	0 %	0 %	50 %	50 %	410471331
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16359	NC_018828	AGGT	2	8	608770	608777	25 %	25 %	50 %	0 %	410471332
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16361	NC_018828	GCCG	2	8	608874	608881	0 %	0 %	50 %	50 %	410471332
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16363	NC_018828	GTC	2	6	608908	608913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471332
16364	NC_018828	CGG	2	6	608931	608936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471332
16365	NC_018828	CCA	2	6	608942	608947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410471332
16366	NC_018828	GCA	2	6	608951	608956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471332
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16369	NC_018828	CCA	3	9	609080	609088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410471332
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16383	NC_018828	CGC	2	6	609419	609424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471332
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16393	NC_018828	AAT	3	9	609772	609780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16403	NC_018828	GTC	3	9	610122	610130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471333
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16430	NC_018828	GATG	2	8	611368	611375	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16432	NC_018828	TAA	2	6	611483	611488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16433	NC_018828	TCTT	2	8	611583	611590	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16434	NC_018828	CGG	2	6	611620	611625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16435	NC_018828	CGA	2	6	611668	611673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16482	NC_018828	CGG	2	6	613721	613726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471336
16483	NC_018828	GCG	2	6	613830	613835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471336
16484	NC_018828	GC	3	6	613853	613858	0 %	0 %	50 %	50 %	410471336
16485	NC_018828	TCA	2	6	613884	613889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410471336
16486	NC_018828	GCG	2	6	613892	613897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471336
16487	NC_018828	TCG	2	6	613913	613918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471336
16488	NC_018828	CG	3	6	614000	614005	0 %	0 %	50 %	50 %	410471337
16489	NC_018828	TGC	2	6	614006	614011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471337
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16491	NC_018828	GGCCG	2	10	614066	614075	0 %	0 %	60 %	40 %	410471337
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