MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella parapertussis Bpp5

Total Repeats: 139326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_018828	GCT	2	6	549223	549228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471289
15002	NC_018828	TGC	2	6	549237	549242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471289
15003	NC_018828	TCC	2	6	549245	549250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410471289
15004	NC_018828	CGCA	2	8	549308	549315	25 %	0 %	25 %	50 %	410471289
15005	NC_018828	ATCG	2	8	549448	549455	25 %	25 %	25 %	25 %	410471289
15006	NC_018828	CG	3	6	549547	549552	0 %	0 %	50 %	50 %	410471289
15007	NC_018828	TGC	2	6	549636	549641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471289
15008	NC_018828	TCG	2	6	549665	549670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471289
15009	NC_018828	GCA	2	6	549804	549809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471289
15010	NC_018828	CTG	2	6	549820	549825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471289
15011	NC_018828	GC	3	6	549882	549887	0 %	0 %	50 %	50 %	410471289
15012	NC_018828	CGCA	2	8	549919	549926	25 %	0 %	25 %	50 %	410471289
15013	NC_018828	TGC	2	6	549947	549952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471289
15014	NC_018828	TTG	2	6	549953	549958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410471289
15015	NC_018828	GC	3	6	549966	549971	0 %	0 %	50 %	50 %	410471289
15016	NC_018828	CCA	2	6	550005	550010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410471289
15017	NC_018828	CG	3	6	550026	550031	0 %	0 %	50 %	50 %	410471289
15018	NC_018828	GCC	2	6	550108	550113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471289
15019	NC_018828	GC	3	6	550116	550121	0 %	0 %	50 %	50 %	410471289
15020	NC_018828	CGA	2	6	550140	550145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471289
15021	NC_018828	CAG	3	9	550150	550158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471289
15022	NC_018828	CAG	2	6	550171	550176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471289
15023	NC_018828	CG	3	6	550204	550209	0 %	0 %	50 %	50 %	410471290
15024	NC_018828	CTC	2	6	550210	550215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410471290
15025	NC_018828	GCCG	2	8	550223	550230	0 %	0 %	50 %	50 %	410471290
15026	NC_018828	CGG	2	6	550231	550236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471290
15027	NC_018828	CGG	2	6	550238	550243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471290
15028	NC_018828	GCA	2	6	550279	550284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471290
15029	NC_018828	CG	3	6	550306	550311	0 %	0 %	50 %	50 %	410471290
15030	NC_018828	GTG	2	6	550329	550334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410471290
15031	NC_018828	GCCG	2	8	550346	550353	0 %	0 %	50 %	50 %	410471290
15032	NC_018828	CGC	2	6	550379	550384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471290
15033	NC_018828	GC	3	6	550404	550409	0 %	0 %	50 %	50 %	410471290
15034	NC_018828	GTCGAG	2	12	550412	550423	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410471290
15035	NC_018828	GC	3	6	550427	550432	0 %	0 %	50 %	50 %	410471290
15036	NC_018828	CG	3	6	550497	550502	0 %	0 %	50 %	50 %	410471290
15037	NC_018828	GCA	2	6	550519	550524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471290
15038	NC_018828	GCG	2	6	550594	550599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471290
15039	NC_018828	CGC	2	6	550699	550704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471290
15040	NC_018828	TGC	2	6	550706	550711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471290
15041	NC_018828	CCG	3	9	550713	550721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471290
15042	NC_018828	GCG	2	6	550768	550773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471290
15043	NC_018828	CGG	2	6	550795	550800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471290
15044	NC_018828	GC	3	6	550819	550824	0 %	0 %	50 %	50 %	410471290
15045	NC_018828	CTCG	2	8	550868	550875	0 %	25 %	25 %	50 %	410471290
15046	NC_018828	AGAT	2	8	550881	550888	50 %	25 %	25 %	0 %	410471290
15047	NC_018828	CGC	2	6	550891	550896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471290
15048	NC_018828	GGT	2	6	550915	550920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410471290
15049	NC_018828	ACC	2	6	550986	550991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410471290
15050	NC_018828	CTGG	2	8	551039	551046	0 %	25 %	50 %	25 %	410471290
15051	NC_018828	CAG	2	6	551066	551071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471290
15052	NC_018828	GGCG	2	8	551140	551147	0 %	0 %	75 %	25 %	410471290
15053	NC_018828	CGG	2	6	551167	551172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471290
15054	NC_018828	GAC	2	6	551254	551259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471290
15055	NC_018828	GC	3	6	551282	551287	0 %	0 %	50 %	50 %	410471290
15056	NC_018828	GTA	2	6	551305	551310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410471290
15057	NC_018828	ACC	2	6	551357	551362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410471291
15058	NC_018828	CG	3	6	551367	551372	0 %	0 %	50 %	50 %	410471291
15059	NC_018828	ATC	2	6	551380	551385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410471291
15060	NC_018828	CAC	2	6	551439	551444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410471291
15061	NC_018828	GC	3	6	551447	551452	0 %	0 %	50 %	50 %	410471291
15062	NC_018828	GC	4	8	551511	551518	0 %	0 %	50 %	50 %	410471291
15063	NC_018828	CTG	2	6	551566	551571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471291
15064	NC_018828	GGC	2	6	551606	551611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471291
15065	NC_018828	CAC	2	6	551618	551623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410471291
15066	NC_018828	TGC	2	6	551631	551636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471291
15067	NC_018828	CGG	2	6	551650	551655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471291
15068	NC_018828	ATGG	2	8	551659	551666	25 %	25 %	50 %	0 %	410471291
15069	NC_018828	CCA	2	6	551686	551691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410471291
15070	NC_018828	AGC	3	9	551702	551710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471291
15071	NC_018828	CCA	2	6	551712	551717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410471291
15072	NC_018828	AAC	2	6	551720	551725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410471291
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15076	NC_018828	GGCC	2	8	551935	551942	0 %	0 %	50 %	50 %	410471291
15077	NC_018828	GC	4	8	551951	551958	0 %	0 %	50 %	50 %	410471291
15078	NC_018828	GCC	3	9	551964	551972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471291
15079	NC_018828	CGA	2	6	551999	552004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471291
15080	NC_018828	GCCAG	2	10	552038	552047	20 %	0 %	40 %	40 %	410471291
15081	NC_018828	TCG	2	6	552103	552108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15082	NC_018828	ACC	2	6	552127	552132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15083	NC_018828	CG	3	6	552176	552181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15084	NC_018828	AGC	2	6	552241	552246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471292
15085	NC_018828	ACC	2	6	552256	552261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410471292
15086	NC_018828	GT	3	6	552338	552343	0 %	50 %	50 %	0 %	410471292
15087	NC_018828	CGA	2	6	552362	552367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471292
15088	NC_018828	CAG	2	6	552396	552401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471292
15089	NC_018828	CG	3	6	552455	552460	0 %	0 %	50 %	50 %	410471292
15090	NC_018828	GCA	2	6	552527	552532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471292
15091	NC_018828	GCG	2	6	552538	552543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471292
15092	NC_018828	AGGAG	2	10	552609	552618	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15093	NC_018828	GAA	2	6	552619	552624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15094	NC_018828	ACG	3	9	552656	552664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15095	NC_018828	CAG	2	6	552739	552744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15096	NC_018828	CAC	2	6	552769	552774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15097	NC_018828	GCC	2	6	552799	552804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15098	NC_018828	GGC	2	6	552817	552822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15099	NC_018828	CTC	2	6	552855	552860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15100	NC_018828	GTC	2	6	552861	552866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15101	NC_018828	CGG	2	6	552877	552882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15102	NC_018828	CGGGA	2	10	552900	552909	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15103	NC_018828	CG	3	6	552911	552916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15104	NC_018828	GC	3	6	552922	552927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15105	NC_018828	GCG	2	6	553019	553024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471293
15106	NC_018828	GGC	2	6	553032	553037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471293
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15108	NC_018828	GCCG	2	8	553113	553120	0 %	0 %	50 %	50 %	410471293
15109	NC_018828	GAT	2	6	553146	553151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410471293
15110	NC_018828	CGG	2	6	553177	553182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471293
15111	NC_018828	GTC	2	6	553189	553194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471293
15112	NC_018828	TCA	2	6	553211	553216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410471293
15113	NC_018828	GTC	2	6	553229	553234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471293
15114	NC_018828	TGC	2	6	553247	553252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471293
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15116	NC_018828	GTG	2	6	553336	553341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_018828	GGC	2	6	553344	553349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15118	NC_018828	CCTG	2	8	553374	553381	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15119	NC_018828	GAG	2	6	553595	553600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_018828	CGCAT	2	10	553715	553724	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15121	NC_018828	GCC	2	6	553727	553732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15122	NC_018828	AAG	2	6	553744	553749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15123	NC_018828	ATCTTG	2	12	553898	553909	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410471294
15124	NC_018828	ACTT	2	8	553949	553956	25 %	50 %	0 %	25 %	410471294
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15233	NC_018828	CGA	2	6	559626	559631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15242	NC_018828	GTC	2	6	560187	560192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15243	NC_018828	TGAG	2	8	560219	560226	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15244	NC_018828	CATC	2	8	560228	560235	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15245	NC_018828	A	6	6	560302	560307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15246	NC_018828	GGT	2	6	560308	560313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15247	NC_018828	G	6	6	560327	560332	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15248	NC_018828	ACA	2	6	560369	560374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15249	NC_018828	TCC	2	6	560388	560393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15250	NC_018828	GCT	2	6	560416	560421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15251	NC_018828	GCA	2	6	560434	560439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471297
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15272	NC_018828	CTG	2	6	561393	561398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471297
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15332	NC_018828	CTG	2	6	564737	564742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471300
15333	NC_018828	CTG	2	6	564818	564823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471300
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15343	NC_018828	CTG	2	6	565132	565137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471300
15344	NC_018828	CTC	2	6	565195	565200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410471300
15345	NC_018828	CGAG	2	8	565209	565216	25 %	0 %	50 %	25 %	410471300
15346	NC_018828	CTG	2	6	565253	565258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471300
15347	NC_018828	TCCC	2	8	565343	565350	0 %	25 %	0 %	75 %	410471300
15348	NC_018828	AGC	2	6	565422	565427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471300
15349	NC_018828	GAC	2	6	565442	565447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471300
15350	NC_018828	GAC	2	6	565529	565534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471300
15351	NC_018828	GCA	2	6	565537	565542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471300
15352	NC_018828	TGA	4	12	565573	565584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410471300
15353	NC_018828	AAGCC	2	10	565589	565598	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15354	NC_018828	T	6	6	565628	565633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15355	NC_018828	ACG	2	6	565945	565950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15356	NC_018828	T	7	7	566117	566123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15357	NC_018828	A	7	7	566135	566141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15358	NC_018828	TCA	2	6	566169	566174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15359	NC_018828	AGCG	2	8	566287	566294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15360	NC_018828	CCT	2	6	566332	566337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15361	NC_018828	CCG	2	6	566352	566357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15362	NC_018828	CAGC	2	8	566375	566382	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15363	NC_018828	GAA	2	6	566390	566395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15364	NC_018828	G	6	6	566422	566427	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15365	NC_018828	CGG	2	6	566564	566569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15366	NC_018828	GCT	2	6	566597	566602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15367	NC_018828	GAC	2	6	566757	566762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15368	NC_018828	GAC	2	6	566784	566789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15369	NC_018828	CGA	2	6	566798	566803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15370	NC_018828	GC	3	6	566831	566836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15371	NC_018828	ACT	2	6	566926	566931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15373	NC_018828	GTG	2	6	567063	567068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15374	NC_018828	CAGCGC	2	12	567140	567151	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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15377	NC_018828	CGA	2	6	567278	567283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15379	NC_018828	TCG	2	6	567331	567336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15392	NC_018828	CTG	2	6	567861	567866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471301
15393	NC_018828	GCT	2	6	567952	567957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471301
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