MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella parapertussis Bpp5

Total Repeats: 139326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_018828	CGGC	2	8	401787	401794	0 %	0 %	50 %	50 %	410471174
11002	NC_018828	TC	3	6	401931	401936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11003	NC_018828	CGC	2	6	401971	401976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11004	NC_018828	CCA	2	6	401986	401991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11005	NC_018828	GGCC	2	8	402020	402027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11006	NC_018828	GCA	2	6	402049	402054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11007	NC_018828	GC	3	6	402059	402064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11008	NC_018828	GCC	2	6	402126	402131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11009	NC_018828	CGG	3	9	402136	402144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_018828	GGC	2	6	402205	402210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_018828	GCA	2	6	402213	402218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_018828	GC	4	8	402223	402230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11013	NC_018828	TGA	2	6	402261	402266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_018828	GCG	3	9	402281	402289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_018828	GCC	2	6	402290	402295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11016	NC_018828	TCG	2	6	402296	402301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_018828	CGG	2	6	402315	402320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_018828	GGCG	2	8	402334	402341	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11019	NC_018828	GGCA	2	8	402361	402368	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11020	NC_018828	GCA	2	6	402384	402389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11021	NC_018828	CGG	2	6	402418	402423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_018828	CGGGC	2	10	402430	402439	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11023	NC_018828	GGC	2	6	402448	402453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_018828	TGG	2	6	402482	402487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_018828	GCC	2	6	402542	402547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11026	NC_018828	GGC	2	6	402562	402567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11027	NC_018828	GCG	2	6	402576	402581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_018828	TCAGCG	2	12	402582	402593	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_018828	CGCC	2	8	402642	402649	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11030	NC_018828	CTT	2	6	402711	402716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11031	NC_018828	GC	3	6	402740	402745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11032	NC_018828	CAG	2	6	402811	402816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11033	NC_018828	CG	3	6	402825	402830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11034	NC_018828	CAG	2	6	402865	402870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_018828	GC	3	6	402916	402921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11036	NC_018828	CAG	2	6	402934	402939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11037	NC_018828	CAG	2	6	402979	402984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_018828	CAG	2	6	403008	403013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_018828	GAC	2	6	403016	403021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11040	NC_018828	GGC	2	6	403064	403069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11041	NC_018828	TAA	2	6	403078	403083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_018828	CTT	2	6	403173	403178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_018828	TCG	2	6	403207	403212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471175
11044	NC_018828	GGC	2	6	403331	403336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471175
11045	NC_018828	GC	3	6	403464	403469	0 %	0 %	50 %	50 %	410471175
11046	NC_018828	GGT	2	6	403499	403504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410471175
11047	NC_018828	GCA	2	6	403505	403510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471175
11048	NC_018828	CGACC	2	10	403583	403592	20 %	0 %	20 %	60 %	410471175
11049	NC_018828	GC	5	10	403597	403606	0 %	0 %	50 %	50 %	410471175
11050	NC_018828	CTG	2	6	403608	403613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471175
11051	NC_018828	GGC	2	6	403622	403627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471175
11052	NC_018828	CGT	2	6	403666	403671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471175
11053	NC_018828	CGC	2	6	403682	403687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471175
11054	NC_018828	GGC	2	6	403721	403726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471175
11055	NC_018828	CGG	2	6	403762	403767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471175
11056	NC_018828	CCGG	2	8	403788	403795	0 %	0 %	50 %	50 %	410471175
11057	NC_018828	GC	3	6	403806	403811	0 %	0 %	50 %	50 %	410471175
11058	NC_018828	GTG	3	9	403851	403859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410471175
11059	NC_018828	CGC	2	6	403862	403867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471175
11060	NC_018828	ACA	2	6	403876	403881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410471175
11061	NC_018828	CG	3	6	403898	403903	0 %	0 %	50 %	50 %	410471175
11062	NC_018828	CGT	2	6	403975	403980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471175
11063	NC_018828	AAGC	2	8	403984	403991	50 %	0 %	25 %	25 %	410471175
11064	NC_018828	GC	3	6	403990	403995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11065	NC_018828	GCC	2	6	403997	404002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11066	NC_018828	GCG	2	6	404011	404016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_018828	GCC	2	6	404029	404034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471176
11068	NC_018828	G	6	6	404036	404041	0 %	0 %	100 %	0 %	410471176
11069	NC_018828	GGC	2	6	404082	404087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471176
11070	NC_018828	CG	3	6	404141	404146	0 %	0 %	50 %	50 %	410471176
11071	NC_018828	GC	3	6	404185	404190	0 %	0 %	50 %	50 %	410471176
11072	NC_018828	GCG	3	9	404211	404219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471176
11073	NC_018828	CGG	2	6	404343	404348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471176
11074	NC_018828	GC	3	6	404373	404378	0 %	0 %	50 %	50 %	410471176
11075	NC_018828	CGG	3	9	404390	404398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471176
11076	NC_018828	CCAG	2	8	404420	404427	25 %	0 %	25 %	50 %	410471176
11077	NC_018828	TCG	2	6	404434	404439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471176
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11080	NC_018828	GC	3	6	404484	404489	0 %	0 %	50 %	50 %	410471176
11081	NC_018828	GTC	2	6	404490	404495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471176
11082	NC_018828	GGC	2	6	404504	404509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471176
11083	NC_018828	GGT	2	6	404522	404527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410471176
11084	NC_018828	TGGC	2	8	404533	404540	0 %	25 %	50 %	25 %	410471176
11085	NC_018828	AGGT	2	8	404678	404685	25 %	25 %	50 %	0 %	410471177
11086	NC_018828	CGAT	2	8	404696	404703	25 %	25 %	25 %	25 %	410471177
11087	NC_018828	TGCG	3	12	404717	404728	0 %	25 %	50 %	25 %	410471177
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11089	NC_018828	GAT	2	6	404740	404745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410471177
11090	NC_018828	GCCGC	2	10	404756	404765	0 %	0 %	40 %	60 %	410471177
11091	NC_018828	CGC	4	12	404760	404771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471177
11092	NC_018828	GCG	2	6	404772	404777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471177
11093	NC_018828	GGC	2	6	404814	404819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471177
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11095	NC_018828	GTG	2	6	404887	404892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410471177
11096	NC_018828	TCG	2	6	404963	404968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471177
11097	NC_018828	GCG	2	6	404971	404976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471177
11098	NC_018828	TGGA	2	8	404978	404985	25 %	25 %	50 %	0 %	410471177
11099	NC_018828	CGC	2	6	405030	405035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471177
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11104	NC_018828	GGC	2	6	405242	405247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471177
11105	NC_018828	GC	4	8	405300	405307	0 %	0 %	50 %	50 %	410471177
11106	NC_018828	CAGC	2	8	405319	405326	25 %	0 %	25 %	50 %	410471177
11107	NC_018828	GC	3	6	405325	405330	0 %	0 %	50 %	50 %	410471177
11108	NC_018828	CG	4	8	405492	405499	0 %	0 %	50 %	50 %	410471177
11109	NC_018828	TTG	2	6	405551	405556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410471177
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11112	NC_018828	TGC	2	6	405614	405619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471177
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11114	NC_018828	GCGT	2	8	405657	405664	0 %	25 %	50 %	25 %	410471177
11115	NC_018828	CGC	2	6	405672	405677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471177
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11123	NC_018828	GTGC	2	8	406055	406062	0 %	25 %	50 %	25 %	410471177
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11125	NC_018828	GCA	2	6	406122	406127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471177
11126	NC_018828	CGTACA	2	12	406272	406283	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410471177
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11129	NC_018828	TAA	2	6	406400	406405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11130	NC_018828	GCG	3	9	406413	406421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11131	NC_018828	GT	3	6	406450	406455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11132	NC_018828	G	6	6	406492	406497	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11133	NC_018828	CG	3	6	406529	406534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11245	NC_018828	TGA	2	6	409884	409889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410471182
11246	NC_018828	GCC	2	6	409942	409947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471182
11247	NC_018828	GCC	2	6	409967	409972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471182
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11264	NC_018828	CTG	2	6	410587	410592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471182
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11362	NC_018828	ATGC	2	8	414024	414031	25 %	25 %	25 %	25 %	410471185
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11486	NC_018828	GCCC	2	8	418185	418192	0 %	0 %	25 %	75 %	410471190
11487	NC_018828	GCAG	2	8	418196	418203	25 %	0 %	50 %	25 %	410471190
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11490	NC_018828	CG	3	6	418321	418326	0 %	0 %	50 %	50 %	410471191
11491	NC_018828	GCC	3	9	418349	418357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471191
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