MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella parapertussis Bpp5

Total Repeats: 139326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6504	NC_018828	CGC	2	6	245120	245125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471040
6505	NC_018828	GC	3	6	245137	245142	0 %	0 %	50 %	50 %	410471040
6506	NC_018828	CGC	2	6	245146	245151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471040
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6513	NC_018828	GAC	2	6	245400	245405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471041
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6551	NC_018828	CATA	2	8	246721	246728	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6624	NC_018828	GATGC	2	10	248889	248898	20 %	20 %	40 %	20 %	410471044
6625	NC_018828	AGG	2	6	248929	248934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410471045
6626	NC_018828	CGG	2	6	248953	248958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471045
6627	NC_018828	GC	3	6	249000	249005	0 %	0 %	50 %	50 %	410471045
6628	NC_018828	GC	3	6	249062	249067	0 %	0 %	50 %	50 %	410471045
6629	NC_018828	TCG	2	6	249087	249092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471045
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6631	NC_018828	GTC	2	6	249188	249193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471045
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6633	NC_018828	CGAG	2	8	249238	249245	25 %	0 %	50 %	25 %	410471045
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6639	NC_018828	TGC	2	6	249421	249426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471045
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6641	NC_018828	CAGGG	2	10	249510	249519	20 %	0 %	60 %	20 %	410471045
6642	NC_018828	ATCGAA	2	12	249536	249547	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410471045
6643	NC_018828	CATGC	2	10	249566	249575	20 %	20 %	20 %	40 %	410471045
6644	NC_018828	CGGCG	2	10	249588	249597	0 %	0 %	60 %	40 %	410471046
6645	NC_018828	GCG	2	6	249645	249650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471046
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6648	NC_018828	GCCG	2	8	249718	249725	0 %	0 %	50 %	50 %	410471046
6649	NC_018828	CGG	2	6	249729	249734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471046
6650	NC_018828	TCGAT	2	10	249747	249756	20 %	40 %	20 %	20 %	410471046
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6693	NC_018828	GC	3	6	251884	251889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6694	NC_018828	GC	3	6	252073	252078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6698	NC_018828	GCC	2	6	252254	252259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6700	NC_018828	CGC	2	6	252401	252406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6701	NC_018828	ATG	2	6	252418	252423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6702	NC_018828	GCG	2	6	252479	252484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6703	NC_018828	GCG	2	6	252500	252505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6704	NC_018828	CCAGGT	2	12	252509	252520	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6708	NC_018828	CTG	2	6	252582	252587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6709	NC_018828	CGGTC	2	10	252588	252597	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6710	NC_018828	TTC	2	6	252636	252641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6711	NC_018828	ACC	2	6	252748	252753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6712	NC_018828	CGT	2	6	252764	252769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6720	NC_018828	ACGTAT	2	12	253323	253334	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6721	NC_018828	CAT	2	6	253398	253403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6722	NC_018828	GCG	2	6	253469	253474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471050
6723	NC_018828	CGAC	2	8	253505	253512	25 %	0 %	25 %	50 %	410471050
6724	NC_018828	GGC	2	6	253550	253555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471050
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6733	NC_018828	CGA	2	6	253856	253861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471050
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6737	NC_018828	CGTGG	2	10	253965	253974	0 %	20 %	60 %	20 %	410471050
6738	NC_018828	CGA	2	6	253994	253999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471050
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6745	NC_018828	GC	3	6	254094	254099	0 %	0 %	50 %	50 %	410471050
6746	NC_018828	CGA	2	6	254119	254124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471050
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6997	NC_018828	GC	3	6	262594	262599	0 %	0 %	50 %	50 %	410471057
6998	NC_018828	TGG	2	6	262640	262645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410471057
6999	NC_018828	CGA	2	6	262650	262655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471057
7000	NC_018828	ACCGT	2	10	262679	262688	20 %	20 %	20 %	40 %	410471057

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