MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella parapertussis Bpp5

Total Repeats: 139326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018828	GGC	2	6	210999	211004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471006
5502	NC_018828	GCG	2	6	211010	211015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471006
5503	NC_018828	GCCG	2	8	211041	211048	0 %	0 %	50 %	50 %	410471006
5504	NC_018828	CGG	2	6	211070	211075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471006
5505	NC_018828	TGG	2	6	211088	211093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410471006
5506	NC_018828	TAA	2	6	211105	211110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410471006
5507	NC_018828	GCG	2	6	211132	211137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471006
5508	NC_018828	CAGC	2	8	211158	211165	25 %	0 %	25 %	50 %	410471006
5509	NC_018828	GCG	2	6	211174	211179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471006
5510	NC_018828	CGCA	2	8	211185	211192	25 %	0 %	25 %	50 %	410471006
5511	NC_018828	GC	3	6	211217	211222	0 %	0 %	50 %	50 %	410471006
5512	NC_018828	GGC	2	6	211224	211229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471006
5513	NC_018828	GCT	2	6	211273	211278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471006
5514	NC_018828	GCG	2	6	211315	211320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471006
5515	NC_018828	CGC	2	6	211333	211338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471006
5516	NC_018828	CGG	2	6	211367	211372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471007
5517	NC_018828	CGGC	2	8	211377	211384	0 %	0 %	50 %	50 %	410471007
5518	NC_018828	CCG	2	6	211406	211411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471007
5519	NC_018828	CGAA	2	8	211422	211429	50 %	0 %	25 %	25 %	410471007
5520	NC_018828	CG	3	6	211437	211442	0 %	0 %	50 %	50 %	410471007
5521	NC_018828	GCC	2	6	211456	211461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471007
5522	NC_018828	GCTGC	2	10	211654	211663	0 %	20 %	40 %	40 %	410471007
5523	NC_018828	CG	3	6	211728	211733	0 %	0 %	50 %	50 %	410471007
5524	NC_018828	GC	3	6	211734	211739	0 %	0 %	50 %	50 %	410471007
5525	NC_018828	GCC	2	6	211744	211749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471007
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5528	NC_018828	GCG	2	6	211780	211785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471007
5529	NC_018828	GCC	2	6	211789	211794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471007
5530	NC_018828	GCG	2	6	211876	211881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471007
5531	NC_018828	GCGT	2	8	211898	211905	0 %	25 %	50 %	25 %	410471007
5532	NC_018828	CGGC	2	8	211931	211938	0 %	0 %	50 %	50 %	410471007
5533	NC_018828	CG	4	8	212031	212038	0 %	0 %	50 %	50 %	410471007
5534	NC_018828	GTCG	2	8	212044	212051	0 %	25 %	50 %	25 %	410471007
5535	NC_018828	CCA	2	6	212052	212057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410471007
5536	NC_018828	GCGCTG	2	12	212101	212112	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	410471007
5537	NC_018828	GCG	4	12	212132	212143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471007
5538	NC_018828	GTC	2	6	212173	212178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471007
5539	NC_018828	TGG	2	6	212190	212195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410471007
5540	NC_018828	GC	3	6	212221	212226	0 %	0 %	50 %	50 %	410471007
5541	NC_018828	GCA	2	6	212232	212237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471007
5542	NC_018828	CAG	2	6	212245	212250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471007
5543	NC_018828	GCG	2	6	212264	212269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471007
5544	NC_018828	TCG	2	6	212270	212275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471007
5545	NC_018828	CAG	2	6	212281	212286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471007
5546	NC_018828	CAT	2	6	212350	212355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410471007
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5548	NC_018828	CAG	2	6	212401	212406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471007
5549	NC_018828	GAT	2	6	212434	212439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410471007
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5551	NC_018828	GGT	2	6	212538	212543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410471007
5552	NC_018828	GGC	2	6	212550	212555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471007
5553	NC_018828	CCA	2	6	212565	212570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410471007
5554	NC_018828	GC	3	6	212604	212609	0 %	0 %	50 %	50 %	410471007
5555	NC_018828	GCC	2	6	212620	212625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471007
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5557	NC_018828	ACG	2	6	212667	212672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471007
5558	NC_018828	CG	3	6	212703	212708	0 %	0 %	50 %	50 %	410471007
5559	NC_018828	CAGCAC	2	12	212716	212727	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	410471007
5560	NC_018828	TTG	2	6	212744	212749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410471007
5561	NC_018828	TGG	2	6	212756	212761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410471007
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5564	NC_018828	GA	3	6	212912	212917	50 %	0 %	50 %	0 %	410471007
5565	NC_018828	GCG	2	6	212974	212979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471007
5566	NC_018828	ATGC	2	8	212983	212990	25 %	25 %	25 %	25 %	410471007
5567	NC_018828	CCGA	2	8	213047	213054	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5568	NC_018828	GAAAG	2	10	213098	213107	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_018828	GC	3	6	213188	213193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5570	NC_018828	TGCAG	2	10	213213	213222	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5571	NC_018828	ATT	2	6	213256	213261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410471008
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5573	NC_018828	GTT	2	6	213297	213302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410471008
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5577	NC_018828	GCTT	2	8	213428	213435	0 %	50 %	25 %	25 %	410471008
5578	NC_018828	GC	3	6	213447	213452	0 %	0 %	50 %	50 %	410471008
5579	NC_018828	CG	3	6	213483	213488	0 %	0 %	50 %	50 %	410471008
5580	NC_018828	AGC	3	9	213581	213589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471008
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5582	NC_018828	AGGCC	2	10	213708	213717	20 %	0 %	40 %	40 %	410471008
5583	NC_018828	ACG	2	6	213761	213766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471008
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5591	NC_018828	GCG	2	6	213947	213952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471008
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5594	NC_018828	GCCT	2	8	214117	214124	0 %	25 %	25 %	50 %	410471009
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5601	NC_018828	GC	3	6	214425	214430	0 %	0 %	50 %	50 %	410471009
5602	NC_018828	GCG	2	6	214468	214473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410471009
5603	NC_018828	CGTC	2	8	214497	214504	0 %	25 %	25 %	50 %	410471009
5604	NC_018828	GC	3	6	214519	214524	0 %	0 %	50 %	50 %	410471009
5605	NC_018828	TCG	2	6	214541	214546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471009
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5613	NC_018828	CG	3	6	215137	215142	0 %	0 %	50 %	50 %	410471010
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5615	NC_018828	TGGC	2	8	215153	215160	0 %	25 %	50 %	25 %	410471010
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5895	NC_018828	GC	3	6	224640	224645	0 %	0 %	50 %	50 %	410471021
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5928	NC_018828	GCT	2	6	225681	225686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410471023
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5981	NC_018828	CAG	2	6	227337	227342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471025
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5995	NC_018828	CGC	2	6	227756	227761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410471025
5996	NC_018828	CG	3	6	227787	227792	0 %	0 %	50 %	50 %	410471025
5997	NC_018828	GTG	2	6	227797	227802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410471025
5998	NC_018828	CAG	2	6	227826	227831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471025
5999	NC_018828	CGA	2	6	227834	227839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471025
6000	NC_018828	AGC	2	6	227923	227928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410471025

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