MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC54

Total Repeats: 1293

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018694	CAT	2	6	42612	42617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708736
1002	NC_018694	GAA	2	6	42618	42623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708736
1003	NC_018694	CGTG	2	8	42685	42692	0 %	25 %	50 %	25 %	407708736
1004	NC_018694	TTC	2	6	42751	42756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708736
1005	NC_018694	AGG	2	6	42862	42867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_018694	ATT	2	6	42893	42898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708737
1007	NC_018694	TAG	2	6	42942	42947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708737
1008	NC_018694	AAG	2	6	43046	43051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708737
1009	NC_018694	A	6	6	43057	43062	100 %	0 %	0 %	0 %	407708737
1010	NC_018694	GGTT	2	8	43068	43075	0 %	50 %	50 %	0 %	407708737
1011	NC_018694	ATC	2	6	43088	43093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708737
1012	NC_018694	AG	3	6	43100	43105	50 %	0 %	50 %	0 %	407708737
1013	NC_018694	GCT	2	6	43123	43128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708737
1014	NC_018694	AGGA	2	8	43167	43174	50 %	0 %	50 %	0 %	407708737
1015	NC_018694	AGCACA	2	12	43176	43187	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407708737
1016	NC_018694	TATAGA	2	12	43258	43269	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407708737
1017	NC_018694	TGGA	2	8	43275	43282	25 %	25 %	50 %	0 %	407708737
1018	NC_018694	AGA	2	6	43287	43292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708737
1019	NC_018694	GA	3	6	43341	43346	50 %	0 %	50 %	0 %	407708737
1020	NC_018694	ATTTTA	2	12	43449	43460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_018694	TTG	2	6	43533	43538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407708738
1022	NC_018694	TGA	2	6	43567	43572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708738
1023	NC_018694	GAA	2	6	43589	43594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708738
1024	NC_018694	AGG	2	6	43723	43728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_018694	ACA	2	6	44001	44006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708739
1026	NC_018694	TAT	2	6	44015	44020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708739
1027	NC_018694	TACT	2	8	44039	44046	25 %	50 %	0 %	25 %	407708739
1028	NC_018694	ATG	3	9	44074	44082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708739
1029	NC_018694	CAT	2	6	44085	44090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708739
1030	NC_018694	AAGA	2	8	44121	44128	75 %	0 %	25 %	0 %	407708739
1031	NC_018694	AGA	2	6	44138	44143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708739
1032	NC_018694	GAT	2	6	44157	44162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708739
1033	NC_018694	GAA	2	6	44189	44194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_018694	GGAAG	2	10	44292	44301	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_018694	ATC	2	6	44320	44325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_018694	GGA	2	6	44351	44356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_018694	A	6	6	44372	44377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_018694	AGA	2	6	44427	44432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_018694	ATT	2	6	44461	44466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_018694	ATATG	2	10	44498	44507	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_018694	A	6	6	44509	44514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_018694	GAA	2	6	44532	44537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_018694	TTG	2	6	44587	44592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407708740
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1045	NC_018694	AAAG	2	8	44656	44663	75 %	0 %	25 %	0 %	407708740
1046	NC_018694	TGAA	2	8	44687	44694	50 %	25 %	25 %	0 %	407708740
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1048	NC_018694	TAT	2	6	44905	44910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_018694	TAA	2	6	44942	44947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_018694	TAT	2	6	45083	45088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708741
1051	NC_018694	TCA	2	6	45095	45100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708741
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1053	NC_018694	AGAA	2	8	45125	45132	75 %	0 %	25 %	0 %	407708741
1054	NC_018694	ATT	2	6	45141	45146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708741
1055	NC_018694	AGA	2	6	45163	45168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708741
1056	NC_018694	ATC	2	6	45216	45221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_018694	AGG	2	6	45301	45306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1060	NC_018694	TTA	2	6	45403	45408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_018694	AGC	2	6	45424	45429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1069	NC_018694	TAG	2	6	45800	45805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708742
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1093	NC_018694	AGA	2	6	46760	46765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708744
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1102	NC_018694	TA	3	6	47132	47137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_018694	AT	3	6	47147	47152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_018694	A	6	6	47187	47192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_018694	ATAA	2	8	47195	47202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_018694	TTTG	2	8	47272	47279	0 %	75 %	25 %	0 %	407708745
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1110	NC_018694	GCT	2	6	47351	47356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708745
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1116	NC_018694	AGAA	2	8	47557	47564	75 %	0 %	25 %	0 %	407708745
1117	NC_018694	T	6	6	47602	47607	0 %	100 %	0 %	0 %	407708745
1118	NC_018694	TAT	2	6	47614	47619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708745
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1124	NC_018694	A	6	6	47779	47784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1128	NC_018694	CAT	2	6	47831	47836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_018694	A	6	6	47843	47848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_018694	ACT	2	6	47850	47855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1264	NC_018694	AT	3	6	53120	53125	50 %	50 %	0 %	0 %	407708753
1265	NC_018694	GCC	2	6	53146	53151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407708753
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1267	NC_018694	TGAT	2	8	53169	53176	25 %	50 %	25 %	0 %	407708753
1268	NC_018694	ATTC	2	8	53195	53202	25 %	50 %	0 %	25 %	407708753
1269	NC_018694	GAT	2	6	53225	53230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708753
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1272	NC_018694	GGA	2	6	53371	53376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407708753
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1293	NC_018694	T	7	7	54454	54460	0 %	100 %	0 %	0 %	407708753

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