MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183

Total Repeats: 4415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018686	TTA	2	6	4	9	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018686	ACA	2	6	50	55	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702138
3	NC_018686	CTT	2	6	129	134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702138
4	NC_018686	ATG	2	6	283	288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702138
5	NC_018686	GGA	2	6	313	318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407702138
6	NC_018686	TGA	2	6	455	460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702138
7	NC_018686	AGA	2	6	463	468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702138
8	NC_018686	T	6	6	487	492	0 %	100 %	0 %	0 %	407702138
9	NC_018686	TTGG	2	8	507	514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018686	TTAA	2	8	535	542	50 %	50 %	0 %	0 %	407702139
11	NC_018686	TAAA	2	8	548	555	75 %	25 %	0 %	0 %	407702139
12	NC_018686	GAA	2	6	559	564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702139
13	NC_018686	GAA	2	6	609	614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702139
14	NC_018686	A	6	6	613	618	100 %	0 %	0 %	0 %	407702139
15	NC_018686	TGG	2	6	637	642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702139
16	NC_018686	GAT	2	6	668	673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702139
17	NC_018686	TTA	2	6	713	718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018686	ATT	2	6	720	725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018686	TAA	2	6	742	747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018686	TAA	2	6	749	754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018686	TA	3	6	768	773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018686	GAAT	2	8	782	789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018686	GAA	2	6	818	823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702140
24	NC_018686	A	6	6	830	835	100 %	0 %	0 %	0 %	407702140
25	NC_018686	A	7	7	840	846	100 %	0 %	0 %	0 %	407702140
26	NC_018686	TAG	2	6	945	950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702140
27	NC_018686	A	6	6	953	958	100 %	0 %	0 %	0 %	407702140
28	NC_018686	GATA	2	8	1092	1099	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018686	AGGA	2	8	1125	1132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018686	GAAT	2	8	1133	1140	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018686	TCAA	2	8	1164	1171	50 %	25 %	0 %	25 %	407702141
32	NC_018686	AAG	2	6	1197	1202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702141
33	NC_018686	GAA	2	6	1286	1291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702141
34	NC_018686	GAA	2	6	1307	1312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702141
35	NC_018686	ATGA	2	8	1316	1323	50 %	25 %	25 %	0 %	407702141
36	NC_018686	TAG	2	6	1377	1382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702141
37	NC_018686	TAA	2	6	1404	1409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702141
38	NC_018686	AGA	2	6	1420	1425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702141
39	NC_018686	GAGC	2	8	1454	1461	25 %	0 %	50 %	25 %	407702141
40	NC_018686	AAT	2	6	1467	1472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702141
41	NC_018686	AGG	2	6	1524	1529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018686	GAAA	2	8	1537	1544	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018686	CTA	2	6	1641	1646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702142
44	NC_018686	GGC	2	6	1685	1690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407702142
45	NC_018686	ATA	2	6	1704	1709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702142
46	NC_018686	GTT	2	6	1746	1751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702142
47	NC_018686	TAC	2	6	1811	1816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702142
48	NC_018686	TGA	2	6	1985	1990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702142
49	NC_018686	TGT	2	6	2114	2119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702142
50	NC_018686	AAT	3	9	2280	2288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702142
51	NC_018686	CTAAC	2	10	2359	2368	40 %	20 %	0 %	40 %	407702142
52	NC_018686	CTA	2	6	2440	2445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702142
53	NC_018686	TTC	2	6	2484	2489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702142
54	NC_018686	TGA	2	6	2555	2560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702142
55	NC_018686	ATT	2	6	2650	2655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702142
56	NC_018686	GAA	2	6	2724	2729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702142
57	NC_018686	TTC	2	6	2748	2753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702142
58	NC_018686	TAA	2	6	2756	2761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702142
59	NC_018686	AGT	2	6	2763	2768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702142
60	NC_018686	TAG	2	6	2810	2815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702142
61	NC_018686	GAA	2	6	2827	2832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702142
62	NC_018686	TGT	2	6	2852	2857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702142
63	NC_018686	GTT	2	6	2943	2948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702142
64	NC_018686	TA	3	6	2977	2982	50 %	50 %	0 %	0 %	407702142
65	NC_018686	TAA	2	6	3017	3022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702142
66	NC_018686	GTATTC	2	12	3068	3079	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407702142
67	NC_018686	A	6	6	3096	3101	100 %	0 %	0 %	0 %	407702142
68	NC_018686	CCAGTT	2	12	3120	3131	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407702142
69	NC_018686	A	7	7	3137	3143	100 %	0 %	0 %	0 %	407702142
70	NC_018686	T	6	6	3194	3199	0 %	100 %	0 %	0 %	407702142
71	NC_018686	A	6	6	3243	3248	100 %	0 %	0 %	0 %	407702142
72	NC_018686	TCT	2	6	3312	3317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702142
73	NC_018686	A	6	6	3318	3323	100 %	0 %	0 %	0 %	407702142
74	NC_018686	A	6	6	3342	3347	100 %	0 %	0 %	0 %	407702142
75	NC_018686	GACTG	2	10	3411	3420	20 %	20 %	40 %	20 %	407702142
76	NC_018686	ATA	2	6	3451	3456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702142
77	NC_018686	CTT	2	6	3535	3540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702142
78	NC_018686	GAA	2	6	3543	3548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702142
79	NC_018686	TTA	2	6	3598	3603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702142
80	NC_018686	AAC	2	6	3667	3672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702142
81	NC_018686	A	6	6	3682	3687	100 %	0 %	0 %	0 %	407702142
82	NC_018686	TTGAA	2	10	3700	3709	40 %	40 %	20 %	0 %	407702142
83	NC_018686	GAA	2	6	3809	3814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702142
84	NC_018686	ACGAA	2	10	3841	3850	60 %	0 %	20 %	20 %	407702142
85	NC_018686	A	7	7	3849	3855	100 %	0 %	0 %	0 %	407702142
86	NC_018686	TTTA	2	8	3932	3939	25 %	75 %	0 %	0 %	407702142
87	NC_018686	CAG	2	6	3945	3950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702142
88	NC_018686	TAAAGA	2	12	3953	3964	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407702142
89	NC_018686	TTTA	2	8	4045	4052	25 %	75 %	0 %	0 %	407702142
90	NC_018686	AT	3	6	4121	4126	50 %	50 %	0 %	0 %	407702142
91	NC_018686	GAT	2	6	4158	4163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702142
92	NC_018686	GAT	3	9	4230	4238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702142
93	NC_018686	A	6	6	4306	4311	100 %	0 %	0 %	0 %	407702143
94	NC_018686	ATG	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702143
95	NC_018686	ATA	2	6	4654	4659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018686	T	6	6	4700	4705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018686	ACAAAA	2	12	4710	4721	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018686	TGG	2	6	4769	4774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702144
99	NC_018686	TTTA	2	8	4858	4865	25 %	75 %	0 %	0 %	407702144
100	NC_018686	GCA	2	6	4880	4885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702144
101	NC_018686	CAA	2	6	4926	4931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702145
102	NC_018686	GAAG	2	8	4975	4982	50 %	0 %	50 %	0 %	407702145
103	NC_018686	ATA	2	6	5009	5014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702145
104	NC_018686	GGT	2	6	5042	5047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702145
105	NC_018686	AG	3	6	5057	5062	50 %	0 %	50 %	0 %	407702145
106	NC_018686	CGAG	2	8	5108	5115	25 %	0 %	50 %	25 %	407702145
107	NC_018686	ATA	2	6	5133	5138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702145
108	NC_018686	A	6	6	5198	5203	100 %	0 %	0 %	0 %	407702145
109	NC_018686	ATA	2	6	5268	5273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702145
110	NC_018686	CTA	2	6	5283	5288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702145
111	NC_018686	AGTA	2	8	5344	5351	50 %	25 %	25 %	0 %	407702145
112	NC_018686	TGC	2	6	5353	5358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702145
113	NC_018686	AAAG	2	8	5365	5372	75 %	0 %	25 %	0 %	407702145
114	NC_018686	ATGT	2	8	5378	5385	25 %	50 %	25 %	0 %	407702146
115	NC_018686	A	6	6	5411	5416	100 %	0 %	0 %	0 %	407702146
116	NC_018686	A	6	6	5418	5423	100 %	0 %	0 %	0 %	407702146
117	NC_018686	AGA	2	6	5534	5539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702146
118	NC_018686	A	6	6	5548	5553	100 %	0 %	0 %	0 %	407702146
119	NC_018686	ATT	2	6	5562	5567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702146
120	NC_018686	AGA	2	6	5603	5608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702146
121	NC_018686	TTG	2	6	5647	5652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702146
122	NC_018686	TTAA	2	8	5673	5680	50 %	50 %	0 %	0 %	407702146
123	NC_018686	AT	3	6	5701	5706	50 %	50 %	0 %	0 %	407702146
124	NC_018686	AAG	2	6	5749	5754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702146
125	NC_018686	ATC	2	6	5770	5775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702146
126	NC_018686	TA	3	6	5790	5795	50 %	50 %	0 %	0 %	407702146
127	NC_018686	TCA	2	6	5897	5902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702146
128	NC_018686	ACA	2	6	5910	5915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702146
129	NC_018686	ACAGGG	2	12	6060	6071	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407702146
130	NC_018686	AT	3	6	6101	6106	50 %	50 %	0 %	0 %	407702146
131	NC_018686	A	6	6	6159	6164	100 %	0 %	0 %	0 %	407702146
132	NC_018686	AAT	2	6	6246	6251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702146
133	NC_018686	AAG	2	6	6286	6291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702146
134	NC_018686	GAT	2	6	6299	6304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702146
135	NC_018686	CAT	2	6	6324	6329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702146
136	NC_018686	CTT	2	6	6337	6342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702146
137	NC_018686	TGA	2	6	6410	6415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702146
138	NC_018686	AGA	2	6	6425	6430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702146
139	NC_018686	GTA	2	6	6477	6482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702146
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267	NC_018686	A	6	6	11464	11469	100 %	0 %	0 %	0 %	407702153
268	NC_018686	TAA	2	6	11515	11520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_018686	TCA	2	6	11571	11576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702154
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402	NC_018686	AAT	2	6	17320	17325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702155
403	NC_018686	AGC	2	6	17367	17372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702155
404	NC_018686	AGC	2	6	17448	17453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702155
405	NC_018686	AGC	2	6	17529	17534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702155
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409	NC_018686	GTA	2	6	17731	17736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702155
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440	NC_018686	AG	3	6	18996	19001	50 %	0 %	50 %	0 %	407702158
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451	NC_018686	T	6	6	19414	19419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_018686	GAAAG	2	10	19429	19438	60 %	0 %	40 %	0 %	407702160
453	NC_018686	A	6	6	19469	19474	100 %	0 %	0 %	0 %	407702160
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480	NC_018686	ATTT	2	8	20828	20835	25 %	75 %	0 %	0 %	407702161
481	NC_018686	TACAAG	2	12	20852	20863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407702161
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497	NC_018686	GAA	2	6	21624	21629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702161
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500	NC_018686	GTT	2	6	21668	21673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702161

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