MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC95

Total Repeats: 2210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_018685	ATTT	2	8	86464	86471	25 %	75 %	0 %	0 %	407702122
2002	NC_018685	TTACTT	2	12	86479	86490	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407702122
2003	NC_018685	CAT	2	6	86501	86506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702122
2004	NC_018685	ACCTGC	2	12	86511	86522	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407702122
2005	NC_018685	CAA	2	6	86525	86530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702122
2006	NC_018685	ACC	2	6	86538	86543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702122
2007	NC_018685	ACC	2	6	86565	86570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702122
2008	NC_018685	TTTTCA	2	12	86584	86595	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407702122
2009	NC_018685	TCC	2	6	86641	86646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2010	NC_018685	T	6	6	86647	86652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_018685	ATT	2	6	86655	86660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_018685	ACC	2	6	86705	86710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702123
2013	NC_018685	ACA	2	6	86727	86732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702123
2014	NC_018685	GTT	2	6	86742	86747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702123
2015	NC_018685	CTG	2	6	86755	86760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702123
2016	NC_018685	CTA	2	6	86761	86766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702123
2017	NC_018685	ACC	2	6	86780	86785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702123
2018	NC_018685	T	6	6	86791	86796	0 %	100 %	0 %	0 %	407702123
2019	NC_018685	CTT	2	6	86800	86805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702123
2020	NC_018685	AAAG	2	8	86808	86815	75 %	0 %	25 %	0 %	407702123
2021	NC_018685	CCT	2	6	86875	86880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2022	NC_018685	AATTT	2	10	86896	86905	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_018685	TTA	2	6	86924	86929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_018685	AAAT	2	8	86957	86964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_018685	TAT	2	6	86974	86979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2027	NC_018685	TA	3	6	87017	87022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2032	NC_018685	TATT	2	8	87199	87206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_018685	T	6	6	87262	87267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_018685	TA	3	6	87334	87339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_018685	T	7	7	87491	87497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_018685	TAA	2	6	87501	87506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2037	NC_018685	T	7	7	87584	87590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2043	NC_018685	GAA	2	6	87759	87764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702124
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2045	NC_018685	A	6	6	87910	87915	100 %	0 %	0 %	0 %	407702124
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2049	NC_018685	TAT	2	6	88140	88145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702124
2050	NC_018685	A	7	7	88146	88152	100 %	0 %	0 %	0 %	407702124
2051	NC_018685	TAT	2	6	88164	88169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702124
2052	NC_018685	TGA	2	6	88171	88176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702124
2053	NC_018685	TGA	2	6	88232	88237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702124
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2063	NC_018685	TA	3	6	88935	88940	50 %	50 %	0 %	0 %	407702126
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2065	NC_018685	A	7	7	88996	89002	100 %	0 %	0 %	0 %	407702126
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2101	NC_018685	AATTG	2	10	90598	90607	40 %	40 %	20 %	0 %	407702128
2102	NC_018685	TTG	2	6	90612	90617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702128
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2111	NC_018685	ATAA	2	8	90876	90883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2112	NC_018685	TAAAA	2	10	90913	90922	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2113	NC_018685	A	6	6	91007	91012	100 %	0 %	0 %	0 %	407702129
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2116	NC_018685	A	7	7	91108	91114	100 %	0 %	0 %	0 %	407702129
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2125	NC_018685	GA	3	6	91652	91657	50 %	0 %	50 %	0 %	407702131
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.