MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira pilosicoli B2904 chromosome

Total Repeats: 88358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018607	T	7	7	20	26	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018607	TAA	2	6	68	73	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018607	TAA	2	6	79	84	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018607	TAA	2	6	90	95	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018607	CTAA	2	8	107	114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018607	T	6	6	128	133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018607	ATTTT	2	10	138	147	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018607	TTAA	2	8	166	173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018607	T	8	8	217	224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018607	TCT	2	6	229	234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018607	TAA	3	9	267	275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018607	AT	3	6	299	304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018607	TATCTA	2	12	318	329	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018607	TAA	2	6	364	369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018607	ATG	2	6	386	391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018607	GTT	2	6	399	404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018607	TAAA	2	8	422	429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018607	TAT	2	6	430	435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018607	TTA	2	6	443	448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018607	TATAA	2	10	454	463	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018607	TAT	2	6	469	474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018607	T	6	6	482	487	0 %	100 %	0 %	0 %	404474676
23	NC_018607	T	6	6	503	508	0 %	100 %	0 %	0 %	404474676
24	NC_018607	TAA	2	6	524	529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474676
25	NC_018607	TAA	2	6	554	559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474676
26	NC_018607	AAAAT	2	10	561	570	80 %	20 %	0 %	0 %	404474676
27	NC_018607	TA	3	6	587	592	50 %	50 %	0 %	0 %	404474676
28	NC_018607	ATA	2	6	652	657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474676
29	NC_018607	TAA	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474676
30	NC_018607	AAAAT	2	10	843	852	80 %	20 %	0 %	0 %	404474676
31	NC_018607	TAG	2	6	886	891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404474676
32	NC_018607	ATAAAA	2	12	892	903	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	404474676
33	NC_018607	TTTA	2	8	933	940	25 %	75 %	0 %	0 %	404474676
34	NC_018607	TAA	2	6	946	951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474676
35	NC_018607	GA	3	6	1002	1007	50 %	0 %	50 %	0 %	404474676
36	NC_018607	T	6	6	1014	1019	0 %	100 %	0 %	0 %	404474676
37	NC_018607	TTA	2	6	1035	1040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404474676
38	NC_018607	TAA	2	6	1085	1090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474676
39	NC_018607	TAA	2	6	1132	1137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474676
40	NC_018607	TAA	2	6	1157	1162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474676
41	NC_018607	TTA	2	6	1181	1186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404474676
42	NC_018607	TAT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404474676
43	NC_018607	AATA	2	8	1244	1251	75 %	25 %	0 %	0 %	404474676
44	NC_018607	AGT	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404474676
45	NC_018607	ATT	2	6	1295	1300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404474677
46	NC_018607	TTA	2	6	1318	1323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404474677
47	NC_018607	TATAT	2	10	1364	1373	40 %	60 %	0 %	0 %	404474677
48	NC_018607	AG	3	6	1377	1382	50 %	0 %	50 %	0 %	404474677
49	NC_018607	TA	3	6	1402	1407	50 %	50 %	0 %	0 %	404474677
50	NC_018607	TTTA	2	8	1413	1420	25 %	75 %	0 %	0 %	404474677
51	NC_018607	TAA	2	6	1457	1462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474677
52	NC_018607	CTT	2	6	1478	1483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404474677
53	NC_018607	TAA	2	6	1491	1496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474677
54	NC_018607	TA	3	6	1571	1576	50 %	50 %	0 %	0 %	404474677
55	NC_018607	AAAAT	2	10	1585	1594	80 %	20 %	0 %	0 %	404474677
56	NC_018607	TATTT	2	10	1634	1643	20 %	80 %	0 %	0 %	404474677
57	NC_018607	AT	6	12	1679	1690	50 %	50 %	0 %	0 %	404474677
58	NC_018607	TA	3	6	1708	1713	50 %	50 %	0 %	0 %	404474677
59	NC_018607	TATTT	2	10	1718	1727	20 %	80 %	0 %	0 %	404474677
60	NC_018607	TAG	3	9	1730	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404474677
61	NC_018607	AGA	2	6	1761	1766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404474677
62	NC_018607	TAA	2	6	1802	1807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474677
63	NC_018607	AATT	2	8	1838	1845	50 %	50 %	0 %	0 %	404474677
64	NC_018607	TGG	2	6	1909	1914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404474677
65	NC_018607	TAA	3	9	1968	1976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474677
66	NC_018607	ATG	2	6	2006	2011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404474677
67	NC_018607	ATA	3	9	2018	2026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474677
68	NC_018607	AGA	2	6	2034	2039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404474677
69	NC_018607	TTTAA	2	10	2059	2068	40 %	60 %	0 %	0 %	404474677
70	NC_018607	AG	3	6	2074	2079	50 %	0 %	50 %	0 %	404474677
71	NC_018607	TAA	2	6	2115	2120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474677
72	NC_018607	AT	3	6	2141	2146	50 %	50 %	0 %	0 %	404474677
73	NC_018607	TAA	2	6	2160	2165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474677
74	NC_018607	AT	4	8	2177	2184	50 %	50 %	0 %	0 %	404474677
75	NC_018607	A	6	6	2199	2204	100 %	0 %	0 %	0 %	404474677
76	NC_018607	TAA	2	6	2220	2225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474677
77	NC_018607	ATTA	2	8	2237	2244	50 %	50 %	0 %	0 %	404474677
78	NC_018607	A	6	6	2262	2267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018607	TAA	2	6	2293	2298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018607	TAAT	2	8	2303	2310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018607	TAT	2	6	2319	2324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404474678
82	NC_018607	CTT	2	6	2377	2382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404474678
83	NC_018607	T	7	7	2419	2425	0 %	100 %	0 %	0 %	404474678
84	NC_018607	TCT	2	6	2442	2447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404474678
85	NC_018607	T	6	6	2483	2488	0 %	100 %	0 %	0 %	404474678
86	NC_018607	AT	3	6	2518	2523	50 %	50 %	0 %	0 %	404474678
87	NC_018607	TG	3	6	2592	2597	0 %	50 %	50 %	0 %	404474678
88	NC_018607	ATA	2	6	2636	2641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474679
89	NC_018607	TAT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404474679
90	NC_018607	AAT	2	6	2685	2690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474679
91	NC_018607	TAT	2	6	2720	2725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404474679
92	NC_018607	A	7	7	2730	2736	100 %	0 %	0 %	0 %	404474679
93	NC_018607	T	6	6	2778	2783	0 %	100 %	0 %	0 %	404474679
94	NC_018607	TCT	2	6	2839	2844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404474679
95	NC_018607	ATGC	2	8	2845	2852	25 %	25 %	25 %	25 %	404474679
96	NC_018607	ATA	2	6	2876	2881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474679
97	NC_018607	T	7	7	2890	2896	0 %	100 %	0 %	0 %	404474679
98	NC_018607	T	6	6	2923	2928	0 %	100 %	0 %	0 %	404474679
99	NC_018607	TTTG	2	8	2940	2947	0 %	75 %	25 %	0 %	404474679
100	NC_018607	ACAA	2	8	2959	2966	75 %	0 %	0 %	25 %	404474679
101	NC_018607	AGT	2	6	3000	3005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404474679
102	NC_018607	AAT	2	6	3030	3035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474679
103	NC_018607	ATT	2	6	3042	3047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404474679
104	NC_018607	TTA	2	6	3058	3063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404474679
105	NC_018607	T	6	6	3142	3147	0 %	100 %	0 %	0 %	404474679
106	NC_018607	TCA	2	6	3154	3159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404474679
107	NC_018607	T	7	7	3163	3169	0 %	100 %	0 %	0 %	404474679
108	NC_018607	TATGA	2	10	3182	3191	40 %	40 %	20 %	0 %	404474679
109	NC_018607	T	7	7	3200	3206	0 %	100 %	0 %	0 %	404474679
110	NC_018607	TCT	2	6	3247	3252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404474679
111	NC_018607	CCA	2	6	3329	3334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404474679
112	NC_018607	AT	3	6	3336	3341	50 %	50 %	0 %	0 %	404474679
113	NC_018607	TATGTT	2	12	3354	3365	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	404474679
114	NC_018607	AT	3	6	3388	3393	50 %	50 %	0 %	0 %	404474679
115	NC_018607	TAA	2	6	3405	3410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018607	T	6	6	3460	3465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018607	TA	3	6	3485	3490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018607	TA	4	8	3497	3504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018607	ATTA	2	8	3528	3535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018607	GAT	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018607	ATA	2	6	3682	3687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474680
122	NC_018607	ATA	2	6	3715	3720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474680
123	NC_018607	ATA	2	6	3727	3732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474680
124	NC_018607	TCTAT	2	10	3733	3742	20 %	60 %	0 %	20 %	404474680
125	NC_018607	A	6	6	3748	3753	100 %	0 %	0 %	0 %	404474680
126	NC_018607	GAA	2	6	3789	3794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404474680
127	NC_018607	AGA	3	9	3833	3841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404474680
128	NC_018607	AGT	2	6	3842	3847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404474680
129	NC_018607	AGA	2	6	3854	3859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404474680
130	NC_018607	AGA	2	6	3914	3919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404474680
131	NC_018607	TTA	2	6	3936	3941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404474680
132	NC_018607	TCT	2	6	3969	3974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404474681
133	NC_018607	TTGT	2	8	3978	3985	0 %	75 %	25 %	0 %	404474681
134	NC_018607	GT	3	6	4022	4027	0 %	50 %	50 %	0 %	404474681
135	NC_018607	TAT	2	6	4070	4075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404474681
136	NC_018607	TA	3	6	4094	4099	50 %	50 %	0 %	0 %	404474681
137	NC_018607	ATA	2	6	4154	4159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474681
138	NC_018607	TC	4	8	4229	4236	0 %	50 %	0 %	50 %	404474681
139	NC_018607	TAT	2	6	4243	4248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404474681
140	NC_018607	ATA	2	6	4262	4267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474681
141	NC_018607	CAG	2	6	4306	4311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404474681
142	NC_018607	ATA	2	6	4339	4344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474681
143	NC_018607	TA	3	6	4343	4348	50 %	50 %	0 %	0 %	404474681
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