MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34502	NC_018533	AAT	2	6	1531253	1531258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531086
34503	NC_018533	TGC	2	6	1531319	1531324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531086
34504	NC_018533	TGT	2	6	1531350	1531355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403531086
34505	NC_018533	C	9	9	1531379	1531387	0 %	0 %	0 %	100 %	403531086
34506	NC_018533	ACT	2	6	1531415	1531420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531086
34507	NC_018533	CCACA	2	10	1531507	1531516	40 %	0 %	0 %	60 %	403531086
34508	NC_018533	CA	4	8	1531513	1531520	50 %	0 %	0 %	50 %	403531086
34509	NC_018533	GCT	2	6	1531539	1531544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531086
34510	NC_018533	T	6	6	1531544	1531549	0 %	100 %	0 %	0 %	403531086
34511	NC_018533	ATTT	2	8	1531585	1531592	25 %	75 %	0 %	0 %	403531086
34512	NC_018533	T	7	7	1531612	1531618	0 %	100 %	0 %	0 %	403531086
34513	NC_018533	GTT	2	6	1531699	1531704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403531086
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34515	NC_018533	CAATG	2	10	1531798	1531807	40 %	20 %	20 %	20 %	403531086
34516	NC_018533	CAG	2	6	1531819	1531824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531086
34517	NC_018533	AGAAAG	2	12	1532039	1532050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403531086
34518	NC_018533	A	8	8	1532083	1532090	100 %	0 %	0 %	0 %	403531086
34519	NC_018533	CTT	2	6	1532163	1532168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403531087
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34522	NC_018533	A	6	6	1532244	1532249	100 %	0 %	0 %	0 %	403531087
34523	NC_018533	ATC	2	6	1532255	1532260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531087
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34527	NC_018533	T	6	6	1532361	1532366	0 %	100 %	0 %	0 %	403531087
34528	NC_018533	TGC	2	6	1532463	1532468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34529	NC_018533	T	6	6	1532526	1532531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34530	NC_018533	CAA	2	6	1532611	1532616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34531	NC_018533	GCT	2	6	1532647	1532652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34532	NC_018533	T	6	6	1532664	1532669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34533	NC_018533	CCA	2	6	1532684	1532689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403531088
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34538	NC_018533	TA	3	6	1532830	1532835	50 %	50 %	0 %	0 %	403531088
34539	NC_018533	GCAC	2	8	1532846	1532853	25 %	0 %	25 %	50 %	403531088
34540	NC_018533	GCA	2	6	1532861	1532866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531088
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34542	NC_018533	CTG	2	6	1533085	1533090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34543	NC_018533	ATTC	3	12	1533149	1533160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34544	NC_018533	CAT	2	6	1533216	1533221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34545	NC_018533	TGT	2	6	1533287	1533292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403531089
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34551	NC_018533	T	6	6	1533547	1533552	0 %	100 %	0 %	0 %	403531089
34552	NC_018533	AAT	2	6	1533569	1533574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531089
34553	NC_018533	TTG	2	6	1533622	1533627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34554	NC_018533	T	6	6	1533640	1533645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34555	NC_018533	CAT	2	6	1533721	1533726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34575	NC_018533	A	8	8	1534514	1534521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34576	NC_018533	GGTC	2	8	1534529	1534536	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34577	NC_018533	A	6	6	1534545	1534550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34578	NC_018533	AAGC	2	8	1534641	1534648	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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34591	NC_018533	CAAA	2	8	1535160	1535167	75 %	0 %	0 %	25 %	403531091
34592	NC_018533	TAC	2	6	1535174	1535179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531091
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34596	NC_018533	A	6	6	1535316	1535321	100 %	0 %	0 %	0 %	403531091
34597	NC_018533	TAA	2	6	1535363	1535368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531091
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34601	NC_018533	GCT	2	6	1535517	1535522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531091
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34604	NC_018533	T	6	6	1535635	1535640	0 %	100 %	0 %	0 %	403531091
34605	NC_018533	GCG	2	6	1535641	1535646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403531091
34606	NC_018533	AAT	2	6	1535764	1535769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531091
34607	NC_018533	CAA	2	6	1535782	1535787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531091
34608	NC_018533	AGCCT	2	10	1535938	1535947	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34609	NC_018533	A	6	6	1535958	1535963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34610	NC_018533	AC	3	6	1536016	1536021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34611	NC_018533	ACC	2	6	1536024	1536029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34612	NC_018533	CCA	2	6	1536061	1536066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34613	NC_018533	GAT	2	6	1536107	1536112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34614	NC_018533	T	6	6	1536116	1536121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34615	NC_018533	GCCA	2	8	1536135	1536142	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34616	NC_018533	AAAG	2	8	1536212	1536219	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34617	NC_018533	AGC	2	6	1536234	1536239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34618	NC_018533	T	7	7	1536251	1536257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34619	NC_018533	CA	3	6	1536325	1536330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34620	NC_018533	TC	3	6	1536376	1536381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34621	NC_018533	A	6	6	1536410	1536415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34622	NC_018533	A	6	6	1536453	1536458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34992	NC_018533	A	6	6	1553467	1553472	100 %	0 %	0 %	0 %	403531109
34993	NC_018533	CAT	2	6	1553501	1553506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531109
34994	NC_018533	TTCA	2	8	1553509	1553516	25 %	50 %	0 %	25 %	403531109
34995	NC_018533	AAT	2	6	1553579	1553584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531110
34996	NC_018533	GTT	2	6	1553607	1553612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403531110
34997	NC_018533	TA	3	6	1553654	1553659	50 %	50 %	0 %	0 %	403531110
34998	NC_018533	CGATC	2	10	1553677	1553686	20 %	20 %	20 %	40 %	403531110
34999	NC_018533	ATC	2	6	1553727	1553732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531110
35000	NC_018533	A	8	8	1553742	1553749	100 %	0 %	0 %	0 %	403531110

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