MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_018533	AAAC	2	8	1510100	1510107	75 %	0 %	0 %	25 %	403531074
34002	NC_018533	TCA	2	6	1510110	1510115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531074
34003	NC_018533	CGG	2	6	1510123	1510128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403531074
34004	NC_018533	T	6	6	1510137	1510142	0 %	100 %	0 %	0 %	403531074
34005	NC_018533	GCA	2	6	1510159	1510164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531074
34006	NC_018533	GCC	2	6	1510175	1510180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403531074
34007	NC_018533	T	6	6	1510193	1510198	0 %	100 %	0 %	0 %	403531074
34008	NC_018533	T	8	8	1510252	1510259	0 %	100 %	0 %	0 %	403531074
34009	NC_018533	CAG	2	6	1510294	1510299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531074
34010	NC_018533	CCA	2	6	1510306	1510311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403531074
34011	NC_018533	TTC	2	6	1510367	1510372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403531074
34012	NC_018533	T	6	6	1510384	1510389	0 %	100 %	0 %	0 %	403531074
34013	NC_018533	CAC	2	6	1510447	1510452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403531074
34014	NC_018533	TCA	2	6	1510506	1510511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531074
34015	NC_018533	CAAC	2	8	1510558	1510565	50 %	0 %	0 %	50 %	403531074
34016	NC_018533	AAGG	2	8	1510576	1510583	50 %	0 %	50 %	0 %	403531074
34017	NC_018533	CTG	2	6	1510642	1510647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531074
34018	NC_018533	AAG	2	6	1510652	1510657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403531074
34019	NC_018533	CAT	2	6	1510663	1510668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531074
34020	NC_018533	GCT	2	6	1510683	1510688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531074
34021	NC_018533	AAT	2	6	1510730	1510735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531074
34022	NC_018533	GAC	2	6	1510795	1510800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531074
34023	NC_018533	T	6	6	1510826	1510831	0 %	100 %	0 %	0 %	403531074
34024	NC_018533	TGT	2	6	1510868	1510873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403531074
34025	NC_018533	GTT	2	6	1510875	1510880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403531074
34026	NC_018533	ATC	2	6	1510902	1510907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531074
34027	NC_018533	AAC	2	6	1510913	1510918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531074
34028	NC_018533	AAC	2	6	1510994	1510999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531074
34029	NC_018533	CG	3	6	1511073	1511078	0 %	0 %	50 %	50 %	403531074
34030	NC_018533	CGA	2	6	1511112	1511117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531074
34031	NC_018533	CAC	2	6	1511158	1511163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403531074
34032	NC_018533	TGC	2	6	1511231	1511236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34033	NC_018533	AACA	2	8	1511239	1511246	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34034	NC_018533	TGG	2	6	1511331	1511336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34035	NC_018533	ACCC	2	8	1511383	1511390	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
34036	NC_018533	A	6	6	1511430	1511435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34037	NC_018533	CAA	2	6	1511437	1511442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34038	NC_018533	AACC	2	8	1511530	1511537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34039	NC_018533	CTG	2	6	1511639	1511644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34040	NC_018533	AAC	2	6	1511672	1511677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34041	NC_018533	TGC	2	6	1511684	1511689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34042	NC_018533	GCTCA	2	10	1511765	1511774	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34043	NC_018533	ACA	2	6	1511804	1511809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34044	NC_018533	GCT	2	6	1511849	1511854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34045	NC_018533	A	6	6	1511883	1511888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34046	NC_018533	ACA	2	6	1511975	1511980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34047	NC_018533	T	6	6	1512057	1512062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34048	NC_018533	TA	3	6	1512112	1512117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34049	NC_018533	ATT	3	9	1512199	1512207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34050	NC_018533	GAA	2	6	1512216	1512221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34051	NC_018533	TTATC	2	10	1512228	1512237	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34052	NC_018533	AGG	2	6	1512255	1512260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34053	NC_018533	GAA	2	6	1512279	1512284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34054	NC_018533	ATA	2	6	1512308	1512313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34055	NC_018533	A	6	6	1512346	1512351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34056	NC_018533	ATT	2	6	1512358	1512363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34057	NC_018533	A	6	6	1512374	1512379	100 %	0 %	0 %	0 %	403531075
34058	NC_018533	AAC	2	6	1512394	1512399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531075
34059	NC_018533	AGA	2	6	1512441	1512446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403531075
34060	NC_018533	CCG	2	6	1512491	1512496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403531075
34061	NC_018533	ATC	2	6	1512532	1512537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531075
34062	NC_018533	TAA	2	6	1512561	1512566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531075
34063	NC_018533	ACA	2	6	1512599	1512604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531075
34064	NC_018533	CTTC	2	8	1512609	1512616	0 %	50 %	0 %	50 %	403531075
34065	NC_018533	AT	3	6	1512632	1512637	50 %	50 %	0 %	0 %	403531075
34066	NC_018533	ATC	2	6	1512641	1512646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531075
34067	NC_018533	ATTT	2	8	1512658	1512665	25 %	75 %	0 %	0 %	403531075
34068	NC_018533	AGC	2	6	1512743	1512748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531075
34069	NC_018533	TGC	2	6	1512798	1512803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531075
34070	NC_018533	CAAA	2	8	1512859	1512866	75 %	0 %	0 %	25 %	403531075
34071	NC_018533	ACAA	2	8	1512881	1512888	75 %	0 %	0 %	25 %	403531075
34072	NC_018533	A	6	6	1512895	1512900	100 %	0 %	0 %	0 %	403531075
34073	NC_018533	AAT	2	6	1512931	1512936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531075
34074	NC_018533	TCTT	2	8	1512941	1512948	0 %	75 %	0 %	25 %	403531075
34075	NC_018533	TCA	2	6	1512968	1512973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531075
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34078	NC_018533	CCA	2	6	1513133	1513138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403531075
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34087	NC_018533	T	7	7	1513593	1513599	0 %	100 %	0 %	0 %	403531075
34088	NC_018533	TAT	2	6	1513642	1513647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403531075
34089	NC_018533	GTGA	2	8	1513663	1513670	25 %	25 %	50 %	0 %	403531075
34090	NC_018533	CTC	2	6	1513676	1513681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403531075
34091	NC_018533	AAC	2	6	1513703	1513708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531075
34092	NC_018533	GAA	2	6	1513735	1513740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403531075
34093	NC_018533	CAA	2	6	1513780	1513785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531075
34094	NC_018533	AGCC	2	8	1513794	1513801	25 %	0 %	25 %	50 %	403531075
34095	NC_018533	A	6	6	1513882	1513887	100 %	0 %	0 %	0 %	403531075
34096	NC_018533	CA	3	6	1513913	1513918	50 %	0 %	0 %	50 %	403531075
34097	NC_018533	A	9	9	1513925	1513933	100 %	0 %	0 %	0 %	403531075
34098	NC_018533	TC	3	6	1513939	1513944	0 %	50 %	0 %	50 %	403531075
34099	NC_018533	CCT	2	6	1513992	1513997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403531075
34100	NC_018533	AACA	2	8	1514027	1514034	75 %	0 %	0 %	25 %	403531075
34101	NC_018533	CT	3	6	1514104	1514109	0 %	50 %	0 %	50 %	403531075
34102	NC_018533	ATG	2	6	1514180	1514185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403531075
34103	NC_018533	CAA	2	6	1514263	1514268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531075
34104	NC_018533	TCA	2	6	1514364	1514369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531075
34105	NC_018533	GAA	2	6	1514391	1514396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403531075
34106	NC_018533	CAA	2	6	1514401	1514406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531075
34107	NC_018533	CAA	2	6	1514413	1514418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531075
34108	NC_018533	GAA	2	6	1514425	1514430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403531075
34109	NC_018533	GAT	3	9	1514455	1514463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403531075
34110	NC_018533	GTG	2	6	1514675	1514680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403531075
34111	NC_018533	CAA	2	6	1514743	1514748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531075
34112	NC_018533	GCTTT	2	10	1514875	1514884	0 %	60 %	20 %	20 %	403531075
34113	NC_018533	ATG	2	6	1514942	1514947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403531075
34114	NC_018533	TGT	2	6	1514964	1514969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403531075
34115	NC_018533	TGC	2	6	1514970	1514975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531075
34116	NC_018533	GAT	2	6	1515043	1515048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403531075
34117	NC_018533	GGA	2	6	1515061	1515066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403531075
34118	NC_018533	CAG	2	6	1515068	1515073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531075
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34241	NC_018533	TTTCT	2	10	1520244	1520253	0 %	80 %	0 %	20 %	403531078
34242	NC_018533	ATT	2	6	1520287	1520292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403531078
34243	NC_018533	CTTG	2	8	1520337	1520344	0 %	50 %	25 %	25 %	403531078
34244	NC_018533	ACA	2	6	1520360	1520365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531078
34245	NC_018533	T	7	7	1520376	1520382	0 %	100 %	0 %	0 %	403531078
34246	NC_018533	AAT	2	6	1520466	1520471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531078
34247	NC_018533	A	6	6	1520493	1520498	100 %	0 %	0 %	0 %	403531078
34248	NC_018533	GACA	2	8	1520500	1520507	50 %	0 %	25 %	25 %	403531078
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34252	NC_018533	ACAT	2	8	1520652	1520659	50 %	25 %	0 %	25 %	403531078
34253	NC_018533	TTG	2	6	1520711	1520716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34254	NC_018533	TTG	2	6	1520730	1520735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34255	NC_018533	GAA	2	6	1520756	1520761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34256	NC_018533	GAT	2	6	1520762	1520767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34257	NC_018533	TGC	2	6	1520896	1520901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531079
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34281	NC_018533	ATTT	2	8	1521979	1521986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34345	NC_018533	TTTG	2	8	1524388	1524395	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34346	NC_018533	ACCA	2	8	1524517	1524524	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34347	NC_018533	TAAAA	2	10	1524647	1524656	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34348	NC_018533	A	6	6	1524670	1524675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34349	NC_018533	TGC	2	6	1524748	1524753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34350	NC_018533	A	6	6	1524809	1524814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34351	NC_018533	A	6	6	1524817	1524822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34352	NC_018533	GAT	2	6	1524829	1524834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34353	NC_018533	TA	3	6	1524882	1524887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34354	NC_018533	AAT	2	6	1524907	1524912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34355	NC_018533	A	6	6	1524918	1524923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34356	NC_018533	CAA	2	6	1525043	1525048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531082
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34358	NC_018533	T	8	8	1525079	1525086	0 %	100 %	0 %	0 %	403531082
34359	NC_018533	TG	3	6	1525179	1525184	0 %	50 %	50 %	0 %	403531082
34360	NC_018533	GA	3	6	1525316	1525321	50 %	0 %	50 %	0 %	403531082
34361	NC_018533	ATA	3	9	1525365	1525373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34487	NC_018533	TAT	2	6	1530674	1530679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403531085
34488	NC_018533	GTG	2	6	1530735	1530740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34489	NC_018533	TCA	2	6	1530792	1530797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34490	NC_018533	CAATC	2	10	1530832	1530841	40 %	20 %	0 %	40 %	403531086
34491	NC_018533	TAT	2	6	1530943	1530948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403531086
34492	NC_018533	CACTG	2	10	1530962	1530971	20 %	20 %	20 %	40 %	403531086
34493	NC_018533	GCC	2	6	1531008	1531013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403531086
34494	NC_018533	AAT	2	6	1531042	1531047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531086
34495	NC_018533	CAA	2	6	1531069	1531074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531086
34496	NC_018533	ATG	2	6	1531090	1531095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403531086
34497	NC_018533	CAT	2	6	1531138	1531143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531086
34498	NC_018533	TCAT	2	8	1531164	1531171	25 %	50 %	0 %	25 %	403531086
34499	NC_018533	GCA	2	6	1531173	1531178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531086
34500	NC_018533	CAA	3	9	1531183	1531191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531086

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