MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_018533	ATG	2	6	1487618	1487623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403531052
33502	NC_018533	ACA	2	6	1487628	1487633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531052
33503	NC_018533	T	6	6	1487666	1487671	0 %	100 %	0 %	0 %	403531052
33504	NC_018533	GA	3	6	1487714	1487719	50 %	0 %	50 %	0 %	403531052
33505	NC_018533	CAT	2	6	1487837	1487842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531052
33506	NC_018533	ATAA	2	8	1487959	1487966	75 %	25 %	0 %	0 %	403531052
33507	NC_018533	TCA	3	9	1488037	1488045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531052
33508	NC_018533	T	6	6	1488182	1488187	0 %	100 %	0 %	0 %	403531053
33509	NC_018533	CCA	2	6	1488213	1488218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403531053
33510	NC_018533	TCA	2	6	1488321	1488326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531053
33511	NC_018533	CTC	2	6	1488355	1488360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403531053
33512	NC_018533	CTG	2	6	1488379	1488384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531053
33513	NC_018533	TGC	2	6	1488525	1488530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531053
33514	NC_018533	CTG	2	6	1488538	1488543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531053
33515	NC_018533	TCT	2	6	1488561	1488566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403531053
33516	NC_018533	T	6	6	1488583	1488588	0 %	100 %	0 %	0 %	403531053
33517	NC_018533	TCA	2	6	1488654	1488659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531053
33518	NC_018533	CTT	2	6	1488664	1488669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403531053
33519	NC_018533	ATCA	2	8	1488698	1488705	50 %	25 %	0 %	25 %	403531053
33520	NC_018533	GAC	2	6	1488740	1488745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531053
33521	NC_018533	TGG	2	6	1488883	1488888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403531053
33522	NC_018533	ACC	2	6	1488893	1488898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403531053
33523	NC_018533	CTT	2	6	1489046	1489051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403531053
33524	NC_018533	CGC	2	6	1489060	1489065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403531053
33525	NC_018533	AAGG	2	8	1489128	1489135	50 %	0 %	50 %	0 %	403531053
33526	NC_018533	CCT	2	6	1489182	1489187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403531053
33527	NC_018533	CAC	2	6	1489189	1489194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403531053
33528	NC_018533	CCA	3	9	1489296	1489304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403531053
33529	NC_018533	ACC	2	6	1489355	1489360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403531053
33530	NC_018533	CAT	2	6	1489405	1489410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531053
33531	NC_018533	AC	3	6	1489436	1489441	50 %	0 %	0 %	50 %	403531053
33532	NC_018533	ATC	2	6	1489442	1489447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531053
33533	NC_018533	AATCA	2	10	1489454	1489463	60 %	20 %	0 %	20 %	403531053
33534	NC_018533	A	6	6	1489481	1489486	100 %	0 %	0 %	0 %	403531053
33535	NC_018533	GCC	2	6	1489551	1489556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403531053
33536	NC_018533	TGG	2	6	1489574	1489579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403531053
33537	NC_018533	C	6	6	1489604	1489609	0 %	0 %	0 %	100 %	403531053
33538	NC_018533	CTT	2	6	1489633	1489638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403531053
33539	NC_018533	CAG	3	9	1489681	1489689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531053
33540	NC_018533	CGTAT	2	10	1489751	1489760	20 %	40 %	20 %	20 %	403531053
33541	NC_018533	TGC	2	6	1489820	1489825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531053
33542	NC_018533	TG	3	6	1489829	1489834	0 %	50 %	50 %	0 %	403531053
33543	NC_018533	TTG	2	6	1489840	1489845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403531053
33544	NC_018533	CGCA	2	8	1489901	1489908	25 %	0 %	25 %	50 %	403531053
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33547	NC_018533	AAC	2	6	1490140	1490145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531054
33548	NC_018533	TGCA	2	8	1490227	1490234	25 %	25 %	25 %	25 %	403531054
33549	NC_018533	GA	3	6	1490261	1490266	50 %	0 %	50 %	0 %	403531054
33550	NC_018533	A	6	6	1490278	1490283	100 %	0 %	0 %	0 %	403531054
33551	NC_018533	T	6	6	1490395	1490400	0 %	100 %	0 %	0 %	403531054
33552	NC_018533	CTAG	2	8	1490418	1490425	25 %	25 %	25 %	25 %	403531055
33553	NC_018533	TGC	2	6	1490430	1490435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531055
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33555	NC_018533	T	8	8	1490507	1490514	0 %	100 %	0 %	0 %	403531055
33556	NC_018533	TGA	2	6	1490570	1490575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403531055
33557	NC_018533	A	7	7	1490592	1490598	100 %	0 %	0 %	0 %	403531055
33558	NC_018533	GAA	2	6	1490689	1490694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403531055
33559	NC_018533	CAT	2	6	1490856	1490861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33560	NC_018533	TAT	2	6	1490895	1490900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33561	NC_018533	ATTT	2	8	1490908	1490915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33562	NC_018533	ATG	2	6	1490924	1490929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33563	NC_018533	A	8	8	1490980	1490987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33564	NC_018533	ATT	2	6	1490991	1490996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33565	NC_018533	TTTA	2	8	1491023	1491030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33569	NC_018533	CA	3	6	1491258	1491263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33570	NC_018533	A	7	7	1491263	1491269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33571	NC_018533	AGT	2	6	1491310	1491315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403531056
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33575	NC_018533	CT	3	6	1491401	1491406	0 %	50 %	0 %	50 %	403531056
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33579	NC_018533	ATA	2	6	1491745	1491750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531056
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33583	NC_018533	CT	3	6	1491917	1491922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33584	NC_018533	AG	3	6	1491927	1491932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33585	NC_018533	ACA	2	6	1491953	1491958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33588	NC_018533	CTT	2	6	1492277	1492282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403531057
33589	NC_018533	TAT	2	6	1492299	1492304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403531057
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33591	NC_018533	TTG	2	6	1492418	1492423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403531057
33592	NC_018533	CCGC	2	8	1492463	1492470	0 %	0 %	25 %	75 %	403531057
33593	NC_018533	C	7	7	1492484	1492490	0 %	0 %	0 %	100 %	403531057
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33597	NC_018533	T	7	7	1492710	1492716	0 %	100 %	0 %	0 %	403531058
33598	NC_018533	TTG	2	6	1492719	1492724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403531058
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33601	NC_018533	GTT	2	6	1492818	1492823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403531058
33602	NC_018533	A	7	7	1492871	1492877	100 %	0 %	0 %	0 %	403531058
33603	NC_018533	CACT	2	8	1492879	1492886	25 %	25 %	0 %	50 %	403531058
33604	NC_018533	ATC	2	6	1492964	1492969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531058
33605	NC_018533	CG	3	6	1492981	1492986	0 %	0 %	50 %	50 %	403531058
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33609	NC_018533	ATC	2	6	1493108	1493113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531058
33610	NC_018533	AAT	2	6	1493201	1493206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531058
33611	NC_018533	T	6	6	1493232	1493237	0 %	100 %	0 %	0 %	403531058
33612	NC_018533	CTA	2	6	1493238	1493243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531058
33613	NC_018533	TC	3	6	1493279	1493284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33614	NC_018533	TTG	2	6	1493309	1493314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33615	NC_018533	AACAAA	2	12	1493351	1493362	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33616	NC_018533	TAA	2	6	1493364	1493369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33617	NC_018533	CAA	2	6	1493424	1493429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531059
33618	NC_018533	CTC	2	6	1493456	1493461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403531059
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