MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_018533	AAT	2	6	1465329	1465334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531027
33003	NC_018533	AG	3	6	1465394	1465399	50 %	0 %	50 %	0 %	403531027
33004	NC_018533	TGC	2	6	1465422	1465427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531027
33005	NC_018533	TGG	2	6	1465428	1465433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403531027
33006	NC_018533	GAA	3	9	1465460	1465468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403531027
33007	NC_018533	GAA	2	6	1465480	1465485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403531027
33008	NC_018533	GAA	2	6	1465519	1465524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403531027
33009	NC_018533	ATCTT	2	10	1465531	1465540	20 %	60 %	0 %	20 %	403531027
33010	NC_018533	ATTTT	2	10	1465553	1465562	20 %	80 %	0 %	0 %	403531027
33011	NC_018533	T	6	6	1465559	1465564	0 %	100 %	0 %	0 %	403531027
33012	NC_018533	T	6	6	1465608	1465613	0 %	100 %	0 %	0 %	403531027
33013	NC_018533	AGA	2	6	1465628	1465633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403531027
33014	NC_018533	A	6	6	1465641	1465646	100 %	0 %	0 %	0 %	403531027
33015	NC_018533	A	6	6	1465657	1465662	100 %	0 %	0 %	0 %	403531027
33016	NC_018533	A	6	6	1465664	1465669	100 %	0 %	0 %	0 %	403531027
33017	NC_018533	A	7	7	1465698	1465704	100 %	0 %	0 %	0 %	403531027
33018	NC_018533	GCA	2	6	1465723	1465728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531027
33019	NC_018533	T	6	6	1465786	1465791	0 %	100 %	0 %	0 %	403531027
33020	NC_018533	CGC	2	6	1465813	1465818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403531027
33021	NC_018533	CA	3	6	1465819	1465824	50 %	0 %	0 %	50 %	403531027
33022	NC_018533	AGC	2	6	1465839	1465844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531027
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33024	NC_018533	AAG	2	6	1465902	1465907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403531027
33025	NC_018533	AGC	2	6	1465926	1465931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403531027
33026	NC_018533	ACAAA	2	10	1466026	1466035	80 %	0 %	0 %	20 %	403531027
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33032	NC_018533	A	7	7	1466163	1466169	100 %	0 %	0 %	0 %	403531027
33033	NC_018533	TTTA	2	8	1466211	1466218	25 %	75 %	0 %	0 %	403531027
33034	NC_018533	A	6	6	1466276	1466281	100 %	0 %	0 %	0 %	403531027
33035	NC_018533	AAGCCC	2	12	1466295	1466306	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	403531027
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33038	NC_018533	CATC	2	8	1466403	1466410	25 %	25 %	0 %	50 %	403531027
33039	NC_018533	ATCATA	2	12	1466484	1466495	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33040	NC_018533	TAA	2	6	1466508	1466513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33041	NC_018533	GAA	2	6	1466524	1466529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33042	NC_018533	GAAG	2	8	1466572	1466579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33043	NC_018533	TGT	2	6	1466580	1466585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403531028
33044	NC_018533	A	9	9	1466620	1466628	100 %	0 %	0 %	0 %	403531028
33045	NC_018533	TCG	2	6	1466723	1466728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531028
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33050	NC_018533	TGC	2	6	1466946	1466951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531028
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33052	NC_018533	AG	3	6	1466965	1466970	50 %	0 %	50 %	0 %	403531028
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33054	NC_018533	A	6	6	1466985	1466990	100 %	0 %	0 %	0 %	403531028
33055	NC_018533	TTC	2	6	1467016	1467021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403531028
33056	NC_018533	TAT	2	6	1467033	1467038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403531028
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33060	NC_018533	ATC	2	6	1467193	1467198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531028
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33067	NC_018533	CTTT	2	8	1467445	1467452	0 %	75 %	0 %	25 %	403531028
33068	NC_018533	TGC	2	6	1467495	1467500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403531028
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33072	NC_018533	TCAA	2	8	1467752	1467759	50 %	25 %	0 %	25 %	403531028
33073	NC_018533	A	6	6	1467772	1467777	100 %	0 %	0 %	0 %	403531028
33074	NC_018533	AAG	2	6	1467788	1467793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403531028
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33077	NC_018533	CT	3	6	1467889	1467894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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33079	NC_018533	A	6	6	1468038	1468043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33080	NC_018533	TAAT	2	8	1468097	1468104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33081	NC_018533	TGA	2	6	1468105	1468110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33083	NC_018533	AT	3	6	1468150	1468155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33084	NC_018533	CAAAAT	2	12	1468156	1468167	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33085	NC_018533	A	6	6	1468240	1468245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33086	NC_018533	TCAGC	2	10	1468425	1468434	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33087	NC_018533	A	6	6	1468456	1468461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33088	NC_018533	CTC	2	6	1468469	1468474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33089	NC_018533	TTC	2	6	1468569	1468574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403531029
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33091	NC_018533	TAA	2	6	1468666	1468671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531029
33092	NC_018533	T	7	7	1468767	1468773	0 %	100 %	0 %	0 %	403531029
33093	NC_018533	TCA	2	6	1468810	1468815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531029
33094	NC_018533	TTA	2	6	1468843	1468848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403531030
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33096	NC_018533	TATT	2	8	1468913	1468920	25 %	75 %	0 %	0 %	403531030
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33102	NC_018533	TAA	2	6	1469193	1469198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403531030
33103	NC_018533	ATG	2	6	1469275	1469280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403531030
33104	NC_018533	CTT	2	6	1469325	1469330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403531030
33105	NC_018533	GTTTC	2	10	1469381	1469390	0 %	60 %	20 %	20 %	403531030
33106	NC_018533	AT	4	8	1469409	1469416	50 %	50 %	0 %	0 %	403531030
33107	NC_018533	A	6	6	1469442	1469447	100 %	0 %	0 %	0 %	403531030
33108	NC_018533	A	6	6	1469464	1469469	100 %	0 %	0 %	0 %	403531030
33109	NC_018533	A	6	6	1469534	1469539	100 %	0 %	0 %	0 %	403531030
33110	NC_018533	CAT	2	6	1469575	1469580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403531030
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33112	NC_018533	GAA	2	6	1469682	1469687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403531031
33113	NC_018533	T	7	7	1469807	1469813	0 %	100 %	0 %	0 %	403531031
33114	NC_018533	AC	3	6	1469853	1469858	50 %	0 %	0 %	50 %	403531031
33115	NC_018533	ACA	2	6	1469884	1469889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403531031
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33118	NC_018533	AACA	2	8	1470064	1470071	75 %	0 %	0 %	25 %	403531031
33119	NC_018533	CTTC	2	8	1470087	1470094	0 %	50 %	0 %	50 %	403531031
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33121	NC_018533	GGA	2	6	1470110	1470115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403531031
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33484	NC_018533	C	6	6	1486915	1486920	0 %	0 %	0 %	100 %	403531051
33485	NC_018533	TCTG	2	8	1487052	1487059	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33486	NC_018533	AAATG	2	10	1487080	1487089	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33487	NC_018533	CTTA	2	8	1487120	1487127	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33488	NC_018533	CTT	2	6	1487162	1487167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33489	NC_018533	T	7	7	1487185	1487191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33490	NC_018533	CT	4	8	1487200	1487207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33491	NC_018533	T	6	6	1487207	1487212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33492	NC_018533	CAA	2	6	1487271	1487276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33493	NC_018533	TCT	2	6	1487341	1487346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33494	NC_018533	TCG	2	6	1487357	1487362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33495	NC_018533	T	6	6	1487372	1487377	0 %	100 %	0 %	0 %	403531052
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33497	NC_018533	T	6	6	1487400	1487405	0 %	100 %	0 %	0 %	403531052
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