MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_018533	CAC	2	6	1372170	1372175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31002	NC_018533	TGC	2	6	1372178	1372183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31003	NC_018533	CTT	2	6	1372206	1372211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31004	NC_018533	TC	3	6	1372236	1372241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31005	NC_018533	CCA	2	6	1372257	1372262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31006	NC_018533	GATT	2	8	1372293	1372300	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31007	NC_018533	AGC	3	9	1372324	1372332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31008	NC_018533	AACCT	2	10	1372371	1372380	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
31009	NC_018533	T	6	6	1372393	1372398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31010	NC_018533	CTG	2	6	1372434	1372439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31011	NC_018533	GTTT	2	8	1372515	1372522	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31012	NC_018533	CTCTTG	2	12	1372527	1372538	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31013	NC_018533	ATC	2	6	1372553	1372558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31014	NC_018533	AAATA	2	10	1372624	1372633	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31015	NC_018533	GA	3	6	1372665	1372670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31016	NC_018533	ATC	2	6	1372680	1372685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31017	NC_018533	GGT	2	6	1372727	1372732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31018	NC_018533	CTC	2	6	1372749	1372754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31019	NC_018533	CCA	2	6	1372792	1372797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31020	NC_018533	TAT	2	6	1372832	1372837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31021	NC_018533	GAA	2	6	1372853	1372858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31022	NC_018533	T	6	6	1372888	1372893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31023	NC_018533	TAT	2	6	1372903	1372908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31024	NC_018533	GGA	2	6	1372930	1372935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31025	NC_018533	AG	3	6	1372946	1372951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31026	NC_018533	CTT	2	6	1372988	1372993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31027	NC_018533	TGA	2	6	1373128	1373133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31028	NC_018533	GAT	2	6	1373156	1373161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530951
31029	NC_018533	CAC	2	6	1373185	1373190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530951
31030	NC_018533	AAG	2	6	1373280	1373285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530951
31031	NC_018533	G	6	6	1373327	1373332	0 %	0 %	100 %	0 %	403530951
31032	NC_018533	TGGT	2	8	1373339	1373346	0 %	50 %	50 %	0 %	403530951
31033	NC_018533	T	6	6	1373477	1373482	0 %	100 %	0 %	0 %	403530951
31034	NC_018533	G	6	6	1373572	1373577	0 %	0 %	100 %	0 %	403530951
31035	NC_018533	TCT	2	6	1373588	1373593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530951
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31037	NC_018533	GAA	2	6	1373717	1373722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530951
31038	NC_018533	ATCTT	2	10	1373760	1373769	20 %	60 %	0 %	20 %	403530952
31039	NC_018533	T	7	7	1373834	1373840	0 %	100 %	0 %	0 %	403530952
31040	NC_018533	T	7	7	1373844	1373850	0 %	100 %	0 %	0 %	403530952
31041	NC_018533	GTCT	2	8	1373851	1373858	0 %	50 %	25 %	25 %	403530952
31042	NC_018533	TAT	2	6	1373940	1373945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530952
31043	NC_018533	T	6	6	1373988	1373993	0 %	100 %	0 %	0 %	403530952
31044	NC_018533	TG	3	6	1374025	1374030	0 %	50 %	50 %	0 %	403530952
31045	NC_018533	AT	3	6	1374066	1374071	50 %	50 %	0 %	0 %	403530952
31046	NC_018533	ACA	2	6	1374172	1374177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530952
31047	NC_018533	TCCT	2	8	1374185	1374192	0 %	50 %	0 %	50 %	403530952
31048	NC_018533	CTTT	2	8	1374212	1374219	0 %	75 %	0 %	25 %	403530952
31049	NC_018533	TC	3	6	1374221	1374226	0 %	50 %	0 %	50 %	403530952
31050	NC_018533	TC	3	6	1374359	1374364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31051	NC_018533	TC	3	6	1374367	1374372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31052	NC_018533	T	6	6	1374404	1374409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31053	NC_018533	CTG	2	6	1374479	1374484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530953
31054	NC_018533	A	6	6	1374509	1374514	100 %	0 %	0 %	0 %	403530953
31055	NC_018533	TCATT	2	10	1374536	1374545	20 %	60 %	0 %	20 %	403530953
31056	NC_018533	CTT	2	6	1374554	1374559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530953
31057	NC_018533	TTGA	2	8	1374569	1374576	25 %	50 %	25 %	0 %	403530953
31058	NC_018533	GAA	2	6	1374622	1374627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530953
31059	NC_018533	T	6	6	1374672	1374677	0 %	100 %	0 %	0 %	403530953
31060	NC_018533	ATG	2	6	1374728	1374733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31061	NC_018533	CAT	2	6	1374764	1374769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31062	NC_018533	GCC	2	6	1374804	1374809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31063	NC_018533	CCAT	2	8	1374820	1374827	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31064	NC_018533	CAC	2	6	1374836	1374841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31065	NC_018533	T	6	6	1374854	1374859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31066	NC_018533	ATG	2	6	1374875	1374880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31067	NC_018533	AAG	2	6	1374926	1374931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31069	NC_018533	TCT	2	6	1375013	1375018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31072	NC_018533	AGA	2	6	1375113	1375118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31073	NC_018533	ATG	2	6	1375216	1375221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31074	NC_018533	GCT	2	6	1375222	1375227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31075	NC_018533	AAG	2	6	1375307	1375312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31076	NC_018533	CTG	2	6	1375362	1375367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31077	NC_018533	CAA	2	6	1375399	1375404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31078	NC_018533	T	7	7	1375434	1375440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31079	NC_018533	TAA	2	6	1375495	1375500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31080	NC_018533	CCTT	2	8	1375582	1375589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31081	NC_018533	CCAC	2	8	1375596	1375603	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31082	NC_018533	ATG	2	6	1375677	1375682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31083	NC_018533	GATT	2	8	1375694	1375701	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31084	NC_018533	T	6	6	1375717	1375722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31085	NC_018533	CTTC	2	8	1375732	1375739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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31088	NC_018533	T	6	6	1375875	1375880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31089	NC_018533	T	7	7	1375888	1375894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31090	NC_018533	T	7	7	1375896	1375902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31092	NC_018533	T	7	7	1375917	1375923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31093	NC_018533	CAC	2	6	1375924	1375929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31094	NC_018533	T	6	6	1375968	1375973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31095	NC_018533	ATT	2	6	1375990	1375995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31098	NC_018533	CT	3	6	1376121	1376126	0 %	50 %	0 %	50 %	403530954
31099	NC_018533	TTC	2	6	1376158	1376163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530954
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31101	NC_018533	CTT	2	6	1376222	1376227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530954
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31104	NC_018533	CAAG	2	8	1376307	1376314	50 %	0 %	25 %	25 %	403530954
31105	NC_018533	CCA	2	6	1376317	1376322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530954
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31108	NC_018533	AAAC	2	8	1376381	1376388	75 %	0 %	0 %	25 %	403530954
31109	NC_018533	AGC	2	6	1376554	1376559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530954
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31113	NC_018533	TGG	2	6	1376794	1376799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530954
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31115	NC_018533	TGTC	2	8	1376914	1376921	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31116	NC_018533	TGG	2	6	1376957	1376962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31117	NC_018533	AAAT	2	8	1377057	1377064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31118	NC_018533	TGTC	2	8	1377077	1377084	0 %	50 %	25 %	25 %	403530955
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31121	NC_018533	TTA	2	6	1377198	1377203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530955
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31123	NC_018533	T	6	6	1377238	1377243	0 %	100 %	0 %	0 %	403530955
31124	NC_018533	AG	3	6	1377302	1377307	50 %	0 %	50 %	0 %	403530955
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