MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29001	NC_018533	CAT	2	6	1284227	1284232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29002	NC_018533	A	7	7	1284236	1284242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29003	NC_018533	ATG	2	6	1284268	1284273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29004	NC_018533	C	6	6	1284274	1284279	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29005	NC_018533	CT	3	6	1284304	1284309	0 %	50 %	0 %	50 %	403530892
29006	NC_018533	TGT	2	6	1284345	1284350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530892
29007	NC_018533	GGA	2	6	1284388	1284393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530892
29008	NC_018533	GTCCCT	2	12	1284471	1284482	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	403530892
29009	NC_018533	CAC	2	6	1284491	1284496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530892
29010	NC_018533	A	8	8	1284515	1284522	100 %	0 %	0 %	0 %	403530892
29011	NC_018533	ATC	2	6	1284578	1284583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530892
29012	NC_018533	TGCC	2	8	1284616	1284623	0 %	25 %	25 %	50 %	403530892
29013	NC_018533	CG	3	6	1284633	1284638	0 %	0 %	50 %	50 %	403530892
29014	NC_018533	TCATAA	2	12	1284684	1284695	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	403530892
29015	NC_018533	ATG	2	6	1284821	1284826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530892
29016	NC_018533	CAC	2	6	1284850	1284855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530892
29017	NC_018533	A	6	6	1284890	1284895	100 %	0 %	0 %	0 %	403530892
29018	NC_018533	A	6	6	1284917	1284922	100 %	0 %	0 %	0 %	403530892
29019	NC_018533	T	8	8	1284932	1284939	0 %	100 %	0 %	0 %	403530892
29020	NC_018533	AGA	2	6	1285052	1285057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530892
29021	NC_018533	AAT	2	6	1285079	1285084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530892
29022	NC_018533	CCATCA	2	12	1285098	1285109	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	403530892
29023	NC_018533	CGC	2	6	1285112	1285117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403530892
29024	NC_018533	CAA	2	6	1285145	1285150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530892
29025	NC_018533	ACT	2	6	1285227	1285232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530892
29026	NC_018533	TGCA	2	8	1285292	1285299	25 %	25 %	25 %	25 %	403530892
29027	NC_018533	TCAAAA	2	12	1285350	1285361	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	403530892
29028	NC_018533	CAA	2	6	1285468	1285473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530892
29029	NC_018533	AAAG	2	8	1285482	1285489	75 %	0 %	25 %	0 %	403530892
29030	NC_018533	CA	3	6	1285516	1285521	50 %	0 %	0 %	50 %	403530892
29031	NC_018533	AAG	2	6	1285522	1285527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530892
29032	NC_018533	ACC	2	6	1285583	1285588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530892
29033	NC_018533	GA	3	6	1285605	1285610	50 %	0 %	50 %	0 %	403530892
29034	NC_018533	ATA	2	6	1285611	1285616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530892
29035	NC_018533	CCA	2	6	1285617	1285622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530892
29036	NC_018533	CAG	2	6	1285654	1285659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530892
29037	NC_018533	AG	3	6	1285664	1285669	50 %	0 %	50 %	0 %	403530892
29038	NC_018533	AC	3	6	1285692	1285697	50 %	0 %	0 %	50 %	403530892
29039	NC_018533	AGC	3	9	1285709	1285717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530892
29040	NC_018533	GAA	2	6	1285735	1285740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530892
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29042	NC_018533	CAG	2	6	1285778	1285783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530892
29043	NC_018533	TTA	2	6	1285806	1285811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530892
29044	NC_018533	T	6	6	1285865	1285870	0 %	100 %	0 %	0 %	403530892
29045	NC_018533	TTGTT	2	10	1285952	1285961	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29046	NC_018533	CAA	2	6	1286012	1286017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29047	NC_018533	AGA	2	6	1286044	1286049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29048	NC_018533	AT	3	6	1286071	1286076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29049	NC_018533	T	6	6	1286091	1286096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29050	NC_018533	A	8	8	1286139	1286146	100 %	0 %	0 %	0 %	403530893
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29053	NC_018533	ATG	2	6	1286333	1286338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530893
29054	NC_018533	A	6	6	1286344	1286349	100 %	0 %	0 %	0 %	403530893
29055	NC_018533	TGA	2	6	1286358	1286363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530893
29056	NC_018533	ATG	2	6	1286384	1286389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530893
29057	NC_018533	GAA	2	6	1286409	1286414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530893
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29059	NC_018533	TGC	2	6	1286532	1286537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530893
29060	NC_018533	ATG	2	6	1286546	1286551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530893
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29064	NC_018533	T	7	7	1286739	1286745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29065	NC_018533	ATT	2	6	1286825	1286830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29066	NC_018533	AATC	2	8	1286877	1286884	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29067	NC_018533	AAAG	2	8	1286939	1286946	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29068	NC_018533	ATG	2	6	1287016	1287021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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29072	NC_018533	AGA	2	6	1287243	1287248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29073	NC_018533	T	6	6	1287252	1287257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29074	NC_018533	GAG	2	6	1287268	1287273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29075	NC_018533	GAA	2	6	1287300	1287305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29076	NC_018533	AAG	2	6	1287312	1287317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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29080	NC_018533	GCTT	2	8	1287588	1287595	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29081	NC_018533	CA	3	6	1287635	1287640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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29086	NC_018533	GA	3	6	1287899	1287904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29087	NC_018533	TAA	2	6	1287913	1287918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29088	NC_018533	ACC	2	6	1288000	1288005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29089	NC_018533	CTTA	2	8	1288027	1288034	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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29093	NC_018533	CT	3	6	1288411	1288416	0 %	50 %	0 %	50 %	403530894
29094	NC_018533	CAT	2	6	1288420	1288425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530894
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29103	NC_018533	CTG	2	6	1288818	1288823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530894
29104	NC_018533	AGCAA	2	10	1288841	1288850	60 %	0 %	20 %	20 %	403530894
29105	NC_018533	CAC	2	6	1288899	1288904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530894
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29108	NC_018533	ATG	2	6	1289083	1289088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530894
29109	NC_018533	CTG	2	6	1289115	1289120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530894
29110	NC_018533	CAT	2	6	1289122	1289127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530894
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29114	NC_018533	TCATCT	2	12	1289339	1289350	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	403530894
29115	NC_018533	A	6	6	1289358	1289363	100 %	0 %	0 %	0 %	403530894
29116	NC_018533	TCA	2	6	1289384	1289389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530894
29117	NC_018533	T	6	6	1289553	1289558	0 %	100 %	0 %	0 %	403530894
29118	NC_018533	CAA	2	6	1289587	1289592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29119	NC_018533	AAAC	2	8	1289628	1289635	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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29121	NC_018533	CATT	2	8	1289783	1289790	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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29496	NC_018533	GCT	2	6	1308946	1308951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530904
29497	NC_018533	CGA	2	6	1308983	1308988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530904
29498	NC_018533	TTA	4	12	1308989	1309000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530904
29499	NC_018533	TTA	4	12	1309007	1309018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530904
29500	NC_018533	TGT	2	6	1309040	1309045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530904

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