MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_018533	TAA	2	6	1218774	1218779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27502	NC_018533	ATGAA	2	10	1218825	1218834	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27503	NC_018533	A	6	6	1218833	1218838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27504	NC_018533	A	6	6	1219012	1219017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27505	NC_018533	GAA	2	6	1219052	1219057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27506	NC_018533	A	6	6	1219089	1219094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27507	NC_018533	GCA	2	6	1219096	1219101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27508	NC_018533	TGC	2	6	1219107	1219112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27509	NC_018533	TA	3	6	1219140	1219145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27510	NC_018533	C	6	6	1219172	1219177	0 %	0 %	0 %	100 %	403530852
27511	NC_018533	AGA	2	6	1219291	1219296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530852
27512	NC_018533	ACA	2	6	1219388	1219393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530852
27513	NC_018533	CCAC	2	8	1219433	1219440	25 %	0 %	0 %	75 %	403530852
27514	NC_018533	AAC	2	6	1219525	1219530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530852
27515	NC_018533	TGAC	2	8	1219576	1219583	25 %	25 %	25 %	25 %	403530852
27516	NC_018533	AAAC	2	8	1219663	1219670	75 %	0 %	0 %	25 %	403530852
27517	NC_018533	AG	3	6	1219675	1219680	50 %	0 %	50 %	0 %	403530852
27518	NC_018533	CAT	2	6	1219704	1219709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530852
27519	NC_018533	AAAG	2	8	1219787	1219794	75 %	0 %	25 %	0 %	403530852
27520	NC_018533	TC	3	6	1219795	1219800	0 %	50 %	0 %	50 %	403530852
27521	NC_018533	A	6	6	1219819	1219824	100 %	0 %	0 %	0 %	403530852
27522	NC_018533	CCA	2	6	1219997	1220002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530852
27523	NC_018533	TC	3	6	1220017	1220022	0 %	50 %	0 %	50 %	403530852
27524	NC_018533	AAC	2	6	1220107	1220112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530852
27525	NC_018533	ACTT	2	8	1220173	1220180	25 %	50 %	0 %	25 %	403530852
27526	NC_018533	CCA	2	6	1220219	1220224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530852
27527	NC_018533	TCA	2	6	1220240	1220245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530852
27528	NC_018533	AAT	2	6	1220374	1220379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530852
27529	NC_018533	GTT	2	6	1220410	1220415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530852
27530	NC_018533	CGGT	2	8	1220489	1220496	0 %	25 %	50 %	25 %	403530852
27531	NC_018533	AAAT	2	8	1220540	1220547	75 %	25 %	0 %	0 %	403530852
27532	NC_018533	AAAG	2	8	1220642	1220649	75 %	0 %	25 %	0 %	403530852
27533	NC_018533	TAA	2	6	1220658	1220663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530852
27534	NC_018533	TGA	2	6	1220680	1220685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530852
27535	NC_018533	ATT	2	6	1220749	1220754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530852
27536	NC_018533	TCA	2	6	1220783	1220788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530852
27537	NC_018533	AT	3	6	1220832	1220837	50 %	50 %	0 %	0 %	403530852
27538	NC_018533	TAA	3	9	1220857	1220865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530852
27539	NC_018533	AG	3	6	1220872	1220877	50 %	0 %	50 %	0 %	403530852
27540	NC_018533	ACC	2	6	1220905	1220910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530852
27541	NC_018533	ATT	2	6	1220914	1220919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530852
27542	NC_018533	T	7	7	1220958	1220964	0 %	100 %	0 %	0 %	403530852
27543	NC_018533	AT	3	6	1221112	1221117	50 %	50 %	0 %	0 %	403530852
27544	NC_018533	AGA	2	6	1221151	1221156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530852
27545	NC_018533	AGA	2	6	1221193	1221198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530852
27546	NC_018533	TCT	3	9	1221199	1221207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530852
27547	NC_018533	AAC	2	6	1221271	1221276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530852
27548	NC_018533	CAA	2	6	1221313	1221318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530852
27549	NC_018533	A	6	6	1221317	1221322	100 %	0 %	0 %	0 %	403530852
27550	NC_018533	T	7	7	1221367	1221373	0 %	100 %	0 %	0 %	403530852
27551	NC_018533	C	6	6	1221407	1221412	0 %	0 %	0 %	100 %	403530852
27552	NC_018533	CTGAC	2	10	1221417	1221426	20 %	20 %	20 %	40 %	403530852
27553	NC_018533	GTA	2	6	1221527	1221532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530852
27554	NC_018533	CCA	2	6	1221614	1221619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530852
27555	NC_018533	AGCAC	2	10	1221698	1221707	40 %	0 %	20 %	40 %	403530852
27556	NC_018533	AGA	2	6	1221751	1221756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530852
27557	NC_018533	AAT	2	6	1221766	1221771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530852
27558	NC_018533	TCT	2	6	1221798	1221803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530852
27559	NC_018533	CAC	2	6	1221852	1221857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530852
27560	NC_018533	TCT	2	6	1221919	1221924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530852
27561	NC_018533	CCA	2	6	1221974	1221979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530852
27562	NC_018533	AG	3	6	1222039	1222044	50 %	0 %	50 %	0 %	403530852
27563	NC_018533	AGT	2	6	1222063	1222068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530852
27564	NC_018533	CAG	2	6	1222149	1222154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530852
27565	NC_018533	GGA	2	6	1222174	1222179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530852
27566	NC_018533	CAC	2	6	1222233	1222238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530852
27567	NC_018533	ACA	2	6	1222262	1222267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530852
27568	NC_018533	TAA	2	6	1222287	1222292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530852
27569	NC_018533	TCT	3	9	1222409	1222417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530852
27570	NC_018533	GAG	2	6	1222443	1222448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530852
27571	NC_018533	AGCTCC	2	12	1222498	1222509	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	403530852
27572	NC_018533	TCT	2	6	1222556	1222561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530852
27573	NC_018533	TAA	2	6	1222573	1222578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530852
27574	NC_018533	ACA	2	6	1222598	1222603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530852
27575	NC_018533	GACT	2	8	1222676	1222683	25 %	25 %	25 %	25 %	403530852
27576	NC_018533	CT	3	6	1222682	1222687	0 %	50 %	0 %	50 %	403530852
27577	NC_018533	GAA	2	6	1222757	1222762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530852
27578	NC_018533	TGA	2	6	1222769	1222774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530852
27579	NC_018533	AAT	2	6	1222882	1222887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530852
27580	NC_018533	TGA	2	6	1222918	1222923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530852
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27585	NC_018533	CT	3	6	1223156	1223161	0 %	50 %	0 %	50 %	403530852
27586	NC_018533	GAA	2	6	1223171	1223176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530852
27587	NC_018533	A	6	6	1223179	1223184	100 %	0 %	0 %	0 %	403530852
27588	NC_018533	GCT	2	6	1223260	1223265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530852
27589	NC_018533	A	7	7	1223306	1223312	100 %	0 %	0 %	0 %	403530852
27590	NC_018533	TCA	2	6	1223330	1223335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530852
27591	NC_018533	AGC	2	6	1223341	1223346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530852
27592	NC_018533	CAGCTT	2	12	1223391	1223402	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403530852
27593	NC_018533	AAC	2	6	1223405	1223410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530852
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27595	NC_018533	ACC	2	6	1223452	1223457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530852
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27597	NC_018533	CGTA	2	8	1223521	1223528	25 %	25 %	25 %	25 %	403530852
27598	NC_018533	CTT	2	6	1223553	1223558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530852
27599	NC_018533	TAC	2	6	1223565	1223570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530852
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27601	NC_018533	TCT	2	6	1223593	1223598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530852
27602	NC_018533	TCTGAA	2	12	1223618	1223629	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403530852
27603	NC_018533	AT	3	6	1223638	1223643	50 %	50 %	0 %	0 %	403530852
27604	NC_018533	AAC	2	6	1223671	1223676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530852
27605	NC_018533	C	6	6	1223717	1223722	0 %	0 %	0 %	100 %	403530852
27606	NC_018533	AAG	2	6	1223766	1223771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530852
27607	NC_018533	GAA	2	6	1223806	1223811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530852
27608	NC_018533	TCA	2	6	1223825	1223830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530852
27609	NC_018533	TCA	2	6	1223834	1223839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530852
27610	NC_018533	CTGA	2	8	1223891	1223898	25 %	25 %	25 %	25 %	403530852
27611	NC_018533	TCT	2	6	1223909	1223914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530852
27612	NC_018533	CTT	3	9	1223919	1223927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530852
27613	NC_018533	ATT	2	6	1223941	1223946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530852
27614	NC_018533	CAAC	2	8	1224003	1224010	50 %	0 %	0 %	50 %	403530852
27615	NC_018533	CAG	2	6	1224015	1224020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530852
27616	NC_018533	ATATTG	2	12	1224029	1224040	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	403530852
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