MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26502	NC_018533	TCA	3	9	1171413	1171421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530827
26503	NC_018533	TTC	2	6	1171486	1171491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530827
26504	NC_018533	ATA	2	6	1171530	1171535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530827
26505	NC_018533	GAA	2	6	1171549	1171554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530827
26506	NC_018533	AGG	2	6	1171601	1171606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530827
26507	NC_018533	ATT	2	6	1171622	1171627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530827
26508	NC_018533	TTA	2	6	1171677	1171682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530827
26509	NC_018533	C	7	7	1171717	1171723	0 %	0 %	0 %	100 %	403530827
26510	NC_018533	ATT	2	6	1171850	1171855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530827
26511	NC_018533	GCCCA	2	10	1171858	1171867	20 %	0 %	20 %	60 %	403530827
26512	NC_018533	TCA	2	6	1171902	1171907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530827
26513	NC_018533	ACG	2	6	1172066	1172071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530827
26514	NC_018533	TGT	2	6	1172098	1172103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530827
26515	NC_018533	AATC	2	8	1172104	1172111	50 %	25 %	0 %	25 %	403530827
26516	NC_018533	CTTT	2	8	1172131	1172138	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26517	NC_018533	ACC	2	6	1172152	1172157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26518	NC_018533	ACA	2	6	1172206	1172211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26519	NC_018533	TCG	2	6	1172219	1172224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26520	NC_018533	CAA	2	6	1172288	1172293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26521	NC_018533	A	6	6	1172394	1172399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26522	NC_018533	CTT	2	6	1172441	1172446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26523	NC_018533	CA	3	6	1172506	1172511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26524	NC_018533	TGA	2	6	1172589	1172594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26525	NC_018533	ACATA	2	10	1172670	1172679	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26526	NC_018533	T	7	7	1172701	1172707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26527	NC_018533	TTC	2	6	1172717	1172722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26528	NC_018533	T	7	7	1172778	1172784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26529	NC_018533	TAAA	2	8	1172786	1172793	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26530	NC_018533	TCA	2	6	1172820	1172825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26531	NC_018533	TCA	2	6	1172850	1172855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26532	NC_018533	TGT	2	6	1172892	1172897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26533	NC_018533	AGG	2	6	1172901	1172906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26534	NC_018533	AATT	2	8	1173012	1173019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26535	NC_018533	AAT	2	6	1173034	1173039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26536	NC_018533	TAA	2	6	1173042	1173047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26537	NC_018533	CAG	2	6	1173051	1173056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26538	NC_018533	A	6	6	1173217	1173222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26539	NC_018533	GCC	2	6	1173388	1173393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26540	NC_018533	CATT	2	8	1173464	1173471	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26541	NC_018533	GAG	3	9	1173482	1173490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26542	NC_018533	ACTC	2	8	1173578	1173585	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26543	NC_018533	T	6	6	1173589	1173594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26544	NC_018533	CCTCAT	2	12	1173712	1173723	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
26545	NC_018533	A	7	7	1173785	1173791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26546	NC_018533	ATC	2	6	1173796	1173801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26547	NC_018533	GTA	2	6	1173837	1173842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26548	NC_018533	ACTT	2	8	1173851	1173858	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26549	NC_018533	AAG	2	6	1173880	1173885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26550	NC_018533	AACCTC	2	12	1173896	1173907	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
26551	NC_018533	ATCAA	2	10	1173974	1173983	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26552	NC_018533	ATC	2	6	1173996	1174001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26553	NC_018533	T	6	6	1174009	1174014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26554	NC_018533	ATTT	2	8	1174134	1174141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26555	NC_018533	CAAGA	2	10	1174202	1174211	60 %	0 %	20 %	20 %	403530828
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26558	NC_018533	CAA	2	6	1174260	1174265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530828
26559	NC_018533	ATCG	2	8	1174286	1174293	25 %	25 %	25 %	25 %	403530828
26560	NC_018533	T	6	6	1174400	1174405	0 %	100 %	0 %	0 %	403530828
26561	NC_018533	TAT	2	6	1174500	1174505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530828
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26570	NC_018533	A	6	6	1175027	1175032	100 %	0 %	0 %	0 %	403530828
26571	NC_018533	AACA	2	8	1175178	1175185	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26572	NC_018533	ATATT	2	10	1175190	1175199	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26595	NC_018533	TTGT	2	8	1176136	1176143	0 %	75 %	25 %	0 %	403530829
26596	NC_018533	CTG	2	6	1176157	1176162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530829
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26598	NC_018533	GTC	2	6	1176233	1176238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530829
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26603	NC_018533	A	6	6	1176501	1176506	100 %	0 %	0 %	0 %	403530829
26604	NC_018533	GAAA	2	8	1176534	1176541	75 %	0 %	25 %	0 %	403530829
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26610	NC_018533	AG	3	6	1176934	1176939	50 %	0 %	50 %	0 %	403530829
26611	NC_018533	CTC	2	6	1176947	1176952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530829
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26614	NC_018533	GGAAA	2	10	1177099	1177108	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
26615	NC_018533	AAAC	2	8	1177115	1177122	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26616	NC_018533	ATG	2	6	1177237	1177242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26618	NC_018533	T	7	7	1177372	1177378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26619	NC_018533	CTTG	2	8	1177408	1177415	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26620	NC_018533	GTT	2	6	1177473	1177478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26621	NC_018533	T	6	6	1177477	1177482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26622	NC_018533	ATG	3	9	1177598	1177606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26623	NC_018533	AGA	2	6	1177612	1177617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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