MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26001	NC_018533	TG	4	8	1149792	1149799	0 %	50 %	50 %	0 %	403530811
26002	NC_018533	CAG	2	6	1149841	1149846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530811
26003	NC_018533	CAA	3	9	1149871	1149879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530811
26004	NC_018533	TTC	2	6	1149921	1149926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530811
26005	NC_018533	TCT	2	6	1149979	1149984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26006	NC_018533	CA	3	6	1149994	1149999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26007	NC_018533	AATG	2	8	1150000	1150007	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26008	NC_018533	GT	3	6	1150012	1150017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26009	NC_018533	ATT	2	6	1150122	1150127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26010	NC_018533	T	6	6	1150152	1150157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26011	NC_018533	CATTA	2	10	1150158	1150167	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26012	NC_018533	A	6	6	1150207	1150212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26013	NC_018533	T	6	6	1150290	1150295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26014	NC_018533	T	6	6	1150340	1150345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26015	NC_018533	GAA	2	6	1150354	1150359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26016	NC_018533	AAC	2	6	1150401	1150406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26017	NC_018533	TA	3	6	1150439	1150444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26018	NC_018533	ATT	2	6	1150457	1150462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26019	NC_018533	AAT	2	6	1150481	1150486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26020	NC_018533	TTA	2	6	1150501	1150506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26021	NC_018533	ACAA	2	8	1150525	1150532	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26022	NC_018533	TCG	2	6	1150554	1150559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530812
26023	NC_018533	TGT	2	6	1150570	1150575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530812
26024	NC_018533	AGC	2	6	1150741	1150746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530812
26025	NC_018533	AAC	2	6	1150801	1150806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530812
26026	NC_018533	GAA	2	6	1150862	1150867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530812
26027	NC_018533	T	7	7	1150881	1150887	0 %	100 %	0 %	0 %	403530812
26028	NC_018533	CAAA	2	8	1150891	1150898	75 %	0 %	0 %	25 %	403530812
26029	NC_018533	TGA	3	9	1150903	1150911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530812
26030	NC_018533	CTT	2	6	1150943	1150948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530812
26031	NC_018533	CA	3	6	1151029	1151034	50 %	0 %	0 %	50 %	403530812
26032	NC_018533	TC	3	6	1151102	1151107	0 %	50 %	0 %	50 %	403530812
26033	NC_018533	TTG	2	6	1151199	1151204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530812
26034	NC_018533	ACAA	2	8	1151272	1151279	75 %	0 %	0 %	25 %	403530812
26035	NC_018533	ATA	2	6	1151368	1151373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530813
26036	NC_018533	AGA	2	6	1151375	1151380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530813
26037	NC_018533	GCT	2	6	1151400	1151405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530813
26038	NC_018533	CGATAT	2	12	1151420	1151431	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403530813
26039	NC_018533	A	6	6	1151444	1151449	100 %	0 %	0 %	0 %	403530813
26040	NC_018533	ATT	2	6	1151518	1151523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530813
26041	NC_018533	ATG	2	6	1151581	1151586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530813
26042	NC_018533	CCA	2	6	1151602	1151607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530813
26043	NC_018533	A	6	6	1151615	1151620	100 %	0 %	0 %	0 %	403530813
26044	NC_018533	CG	3	6	1151629	1151634	0 %	0 %	50 %	50 %	403530813
26045	NC_018533	GCT	2	6	1151637	1151642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530813
26046	NC_018533	CTT	2	6	1151643	1151648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530813
26047	NC_018533	TGC	2	6	1151810	1151815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530813
26048	NC_018533	TCT	2	6	1151856	1151861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530813
26049	NC_018533	CAA	2	6	1151879	1151884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530813
26050	NC_018533	CAAA	2	8	1151983	1151990	75 %	0 %	0 %	25 %	403530813
26051	NC_018533	GCT	2	6	1151997	1152002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530813
26052	NC_018533	GCA	2	6	1152018	1152023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530813
26053	NC_018533	GTT	2	6	1152075	1152080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530813
26054	NC_018533	ATT	2	6	1152153	1152158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530813
26055	NC_018533	GAA	2	6	1152177	1152182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530813
26056	NC_018533	CAT	2	6	1152188	1152193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530813
26057	NC_018533	ATGA	2	8	1152267	1152274	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26058	NC_018533	GTT	2	6	1152438	1152443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530814
26059	NC_018533	ATC	2	6	1152493	1152498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530814
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26061	NC_018533	A	6	6	1152645	1152650	100 %	0 %	0 %	0 %	403530814
26062	NC_018533	TGC	2	6	1152686	1152691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530814
26063	NC_018533	TAT	2	6	1152722	1152727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530814
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26069	NC_018533	A	7	7	1153030	1153036	100 %	0 %	0 %	0 %	403530814
26070	NC_018533	TC	4	8	1153085	1153092	0 %	50 %	0 %	50 %	403530814
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26080	NC_018533	CAG	2	6	1153570	1153575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530814
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26084	NC_018533	CAAT	2	8	1153964	1153971	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26085	NC_018533	ATAC	2	8	1154014	1154021	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26086	NC_018533	CAT	2	6	1154060	1154065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26087	NC_018533	A	8	8	1154104	1154111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26088	NC_018533	AGA	2	6	1154140	1154145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26089	NC_018533	T	6	6	1154148	1154153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26090	NC_018533	TAAA	2	8	1154196	1154203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26091	NC_018533	TTC	2	6	1154243	1154248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26092	NC_018533	GTT	2	6	1154252	1154257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26093	NC_018533	AGGA	2	8	1154275	1154282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26094	NC_018533	CCT	2	6	1154365	1154370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26095	NC_018533	GCT	2	6	1154383	1154388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26096	NC_018533	AAG	2	6	1154419	1154424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26098	NC_018533	TCT	2	6	1154513	1154518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26099	NC_018533	CTG	2	6	1154526	1154531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26100	NC_018533	GCA	2	6	1154547	1154552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26101	NC_018533	CAT	2	6	1154598	1154603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26102	NC_018533	ACC	2	6	1154702	1154707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26103	NC_018533	CAG	2	6	1154753	1154758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26104	NC_018533	A	7	7	1154792	1154798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26105	NC_018533	CT	3	6	1154812	1154817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26106	NC_018533	A	6	6	1154826	1154831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26107	NC_018533	T	6	6	1154877	1154882	0 %	100 %	0 %	0 %	403530815
26108	NC_018533	GTT	2	6	1154903	1154908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530815
26109	NC_018533	CTT	2	6	1154915	1154920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530815
26110	NC_018533	TCA	2	6	1155044	1155049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530815
26111	NC_018533	CAT	2	6	1155064	1155069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530815
26112	NC_018533	CTG	2	6	1155088	1155093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530815
26113	NC_018533	T	7	7	1155094	1155100	0 %	100 %	0 %	0 %	403530815
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26116	NC_018533	CTTCCA	2	12	1155195	1155206	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	403530815
26117	NC_018533	GCC	2	6	1155217	1155222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403530815
26118	NC_018533	AAAT	2	8	1155232	1155239	75 %	25 %	0 %	0 %	403530815
26119	NC_018533	GAT	2	6	1155252	1155257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530815
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26121	NC_018533	CTG	2	6	1155348	1155353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530815
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26491	NC_018533	ATG	2	6	1170933	1170938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26492	NC_018533	A	6	6	1170964	1170969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26493	NC_018533	T	6	6	1171006	1171011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26494	NC_018533	CATT	2	8	1171022	1171029	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26495	NC_018533	TCT	2	6	1171066	1171071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26496	NC_018533	TC	3	6	1171073	1171078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26497	NC_018533	A	6	6	1171104	1171109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26498	NC_018533	ATTC	2	8	1171174	1171181	25 %	50 %	0 %	25 %	403530827
26499	NC_018533	GCT	2	6	1171218	1171223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530827
26500	NC_018533	CAT	2	6	1171243	1171248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530827

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