MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_018533	TCA	2	6	1040753	1040758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530738
23502	NC_018533	CTG	2	6	1040811	1040816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530738
23503	NC_018533	CAA	3	9	1040877	1040885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530738
23504	NC_018533	ATT	2	6	1040917	1040922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530738
23505	NC_018533	CCA	2	6	1040936	1040941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530738
23506	NC_018533	TTTTC	2	10	1041012	1041021	0 %	80 %	0 %	20 %	403530738
23507	NC_018533	ACTT	2	8	1041078	1041085	25 %	50 %	0 %	25 %	403530739
23508	NC_018533	AC	3	6	1041112	1041117	50 %	0 %	0 %	50 %	403530739
23509	NC_018533	T	6	6	1041170	1041175	0 %	100 %	0 %	0 %	403530739
23510	NC_018533	CAG	2	6	1041215	1041220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530739
23511	NC_018533	CGC	2	6	1041228	1041233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403530739
23512	NC_018533	GAAG	2	8	1041247	1041254	50 %	0 %	50 %	0 %	403530739
23513	NC_018533	GCC	2	6	1041272	1041277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403530739
23514	NC_018533	TTC	2	6	1041290	1041295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530739
23515	NC_018533	CTC	2	6	1041341	1041346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530739
23516	NC_018533	ATG	2	6	1041370	1041375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530739
23517	NC_018533	TTC	2	6	1041423	1041428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530739
23518	NC_018533	TTG	2	6	1041487	1041492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530739
23519	NC_018533	TCA	2	6	1041523	1041528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530739
23520	NC_018533	TGT	3	9	1041684	1041692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530739
23521	NC_018533	CCA	3	9	1041694	1041702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530739
23522	NC_018533	GCT	2	6	1041715	1041720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530739
23523	NC_018533	TCA	2	6	1041733	1041738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530739
23524	NC_018533	TCA	2	6	1041740	1041745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530739
23525	NC_018533	ACA	2	6	1041853	1041858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530739
23526	NC_018533	AAT	2	6	1041874	1041879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530739
23527	NC_018533	CCA	3	9	1042106	1042114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530739
23528	NC_018533	T	6	6	1042124	1042129	0 %	100 %	0 %	0 %	403530739
23529	NC_018533	GCA	2	6	1042132	1042137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530739
23530	NC_018533	ATTG	2	8	1042153	1042160	25 %	50 %	25 %	0 %	403530739
23531	NC_018533	CTG	2	6	1042163	1042168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530739
23532	NC_018533	A	6	6	1042336	1042341	100 %	0 %	0 %	0 %	403530739
23533	NC_018533	C	6	6	1042353	1042358	0 %	0 %	0 %	100 %	403530739
23534	NC_018533	ATG	2	6	1042362	1042367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530739
23535	NC_018533	AAC	2	6	1042375	1042380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530739
23536	NC_018533	CCA	2	6	1042426	1042431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530740
23537	NC_018533	CAG	2	6	1042432	1042437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530740
23538	NC_018533	TCA	2	6	1042458	1042463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530740
23539	NC_018533	A	6	6	1042522	1042527	100 %	0 %	0 %	0 %	403530740
23540	NC_018533	AGATC	2	10	1042615	1042624	40 %	20 %	20 %	20 %	403530740
23541	NC_018533	GC	3	6	1042653	1042658	0 %	0 %	50 %	50 %	403530740
23542	NC_018533	GCA	2	6	1042710	1042715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530740
23543	NC_018533	ACCA	2	8	1042730	1042737	50 %	0 %	0 %	50 %	403530740
23544	NC_018533	C	6	6	1042759	1042764	0 %	0 %	0 %	100 %	403530740
23545	NC_018533	CAT	2	6	1042808	1042813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530740
23546	NC_018533	CAT	2	6	1042816	1042821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530740
23547	NC_018533	TCT	2	6	1042882	1042887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530740
23548	NC_018533	CTG	2	6	1042913	1042918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530740
23549	NC_018533	GCA	2	6	1042968	1042973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530740
23550	NC_018533	CAC	2	6	1043006	1043011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530740
23551	NC_018533	ATATCG	2	12	1043028	1043039	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403530740
23552	NC_018533	TGA	2	6	1043099	1043104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530740
23553	NC_018533	A	8	8	1043130	1043137	100 %	0 %	0 %	0 %	403530740
23554	NC_018533	CGA	2	6	1043214	1043219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530740
23555	NC_018533	GAA	2	6	1043254	1043259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530740
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23557	NC_018533	TCC	2	6	1043297	1043302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530741
23558	NC_018533	TGC	2	6	1043479	1043484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530741
23559	NC_018533	AG	3	6	1043546	1043551	50 %	0 %	50 %	0 %	403530741
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23562	NC_018533	CAA	2	6	1043679	1043684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530741
23563	NC_018533	CA	3	6	1043781	1043786	50 %	0 %	0 %	50 %	403530741
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23566	NC_018533	ATA	2	6	1043846	1043851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530741
23567	NC_018533	AAG	2	6	1043853	1043858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530741
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23569	NC_018533	GC	3	6	1043897	1043902	0 %	0 %	50 %	50 %	403530741
23570	NC_018533	ATCCAC	2	12	1044067	1044078	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	403530741
23571	NC_018533	TTC	2	6	1044100	1044105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530741
23572	NC_018533	C	9	9	1044161	1044169	0 %	0 %	0 %	100 %	403530741
23573	NC_018533	TA	4	8	1044223	1044230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23574	NC_018533	ACA	2	6	1044232	1044237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23575	NC_018533	AAGATT	2	12	1044265	1044276	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23576	NC_018533	TCAGAC	2	12	1044317	1044328	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23577	NC_018533	T	8	8	1044374	1044381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23578	NC_018533	T	6	6	1044405	1044410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23579	NC_018533	T	7	7	1044418	1044424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23580	NC_018533	AAG	2	6	1044457	1044462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530742
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23582	NC_018533	TTGC	2	8	1044583	1044590	0 %	50 %	25 %	25 %	403530742
23583	NC_018533	CCA	2	6	1044636	1044641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530742
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23585	NC_018533	AGC	2	6	1044821	1044826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530742
23586	NC_018533	AAT	2	6	1044868	1044873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530742
23587	NC_018533	ATG	2	6	1044896	1044901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530742
23588	NC_018533	CAA	2	6	1044931	1044936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530742
23589	NC_018533	CATT	2	8	1044970	1044977	25 %	50 %	0 %	25 %	403530742
23590	NC_018533	CTC	2	6	1044985	1044990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530742
23591	NC_018533	ACC	2	6	1044995	1045000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530742
23592	NC_018533	GCT	2	6	1045053	1045058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530742
23593	NC_018533	AGC	2	6	1045076	1045081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530742
23594	NC_018533	ACCA	2	8	1045082	1045089	50 %	0 %	0 %	50 %	403530742
23595	NC_018533	CTG	2	6	1045109	1045114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530742
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23599	NC_018533	AAAT	2	8	1045213	1045220	75 %	25 %	0 %	0 %	403530742
23600	NC_018533	AAGA	2	8	1045235	1045242	75 %	0 %	25 %	0 %	403530742
23601	NC_018533	TCA	2	6	1045257	1045262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530742
23602	NC_018533	A	6	6	1045273	1045278	100 %	0 %	0 %	0 %	403530742
23603	NC_018533	ACC	2	6	1045289	1045294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530742
23604	NC_018533	ATCA	2	8	1045394	1045401	50 %	25 %	0 %	25 %	403530742
23605	NC_018533	TCA	2	6	1045411	1045416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530743
23606	NC_018533	AGC	3	9	1045449	1045457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530743
23607	NC_018533	TG	3	6	1045462	1045467	0 %	50 %	50 %	0 %	403530743
23608	NC_018533	ACA	2	6	1045489	1045494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530743
23609	NC_018533	ATC	2	6	1045497	1045502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530743
23610	NC_018533	ACA	2	6	1045531	1045536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530743
23611	NC_018533	CAT	2	6	1045670	1045675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530743
23612	NC_018533	AGC	2	6	1045683	1045688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530743
23613	NC_018533	ATC	2	6	1045692	1045697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530743
23614	NC_018533	TGC	2	6	1045770	1045775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530743
23615	NC_018533	GAT	2	6	1045802	1045807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530743
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