MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_018533	TCT	2	6	717421	717426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16002	NC_018533	ATGAA	2	10	717445	717454	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_018533	TG	3	6	717568	717573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_018533	ATG	2	6	717577	717582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_018533	AT	5	10	717628	717637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_018533	T	8	8	717715	717722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_018533	AAT	2	6	717885	717890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_018533	GAA	2	6	717893	717898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_018533	T	6	6	717913	717918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_018533	TTGG	2	8	717980	717987	0 %	50 %	50 %	0 %	403530493
16011	NC_018533	ATAA	2	8	718040	718047	75 %	25 %	0 %	0 %	403530493
16012	NC_018533	TAA	2	6	718072	718077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530493
16013	NC_018533	ATA	2	6	718097	718102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530493
16014	NC_018533	AT	3	6	718167	718172	50 %	50 %	0 %	0 %	403530493
16015	NC_018533	TTG	2	6	718232	718237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530493
16016	NC_018533	AGG	2	6	718300	718305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530493
16017	NC_018533	GCT	2	6	718316	718321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530493
16018	NC_018533	GGC	2	6	718345	718350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530493
16019	NC_018533	T	8	8	718455	718462	0 %	100 %	0 %	0 %	403530493
16020	NC_018533	TTC	2	6	718480	718485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530493
16021	NC_018533	AAC	2	6	718501	718506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530493
16022	NC_018533	TG	3	6	718564	718569	0 %	50 %	50 %	0 %	403530493
16023	NC_018533	AT	3	6	718581	718586	50 %	50 %	0 %	0 %	403530493
16024	NC_018533	AG	3	6	718679	718684	50 %	0 %	50 %	0 %	403530493
16025	NC_018533	CAG	2	6	718695	718700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530493
16026	NC_018533	GAA	2	6	718719	718724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530493
16027	NC_018533	TGA	2	6	718766	718771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530493
16028	NC_018533	GAA	2	6	718784	718789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530493
16029	NC_018533	A	7	7	718788	718794	100 %	0 %	0 %	0 %	403530493
16030	NC_018533	TAA	2	6	718818	718823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530493
16031	NC_018533	GCAC	2	8	718916	718923	25 %	0 %	25 %	50 %	403530493
16032	NC_018533	GCA	2	6	718967	718972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530493
16033	NC_018533	TTC	2	6	719170	719175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530493
16034	NC_018533	ACT	2	6	719186	719191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16035	NC_018533	TAT	2	6	719245	719250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_018533	TAA	2	6	719257	719262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_018533	A	6	6	719275	719280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_018533	GATG	2	8	719304	719311	25 %	25 %	50 %	0 %	403530494
16039	NC_018533	A	8	8	719358	719365	100 %	0 %	0 %	0 %	403530494
16040	NC_018533	A	6	6	719395	719400	100 %	0 %	0 %	0 %	403530494
16041	NC_018533	TTTC	2	8	719467	719474	0 %	75 %	0 %	25 %	403530494
16042	NC_018533	TTG	2	6	719514	719519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530494
16043	NC_018533	GC	3	6	719563	719568	0 %	0 %	50 %	50 %	403530494
16044	NC_018533	ATA	2	6	719618	719623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530494
16045	NC_018533	TTA	2	6	719704	719709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530494
16046	NC_018533	TCA	2	6	719728	719733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530494
16047	NC_018533	TATT	2	8	719736	719743	25 %	75 %	0 %	0 %	403530494
16048	NC_018533	T	6	6	719776	719781	0 %	100 %	0 %	0 %	403530494
16049	NC_018533	ATG	2	6	719806	719811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530494
16050	NC_018533	GTA	2	6	719827	719832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530494
16051	NC_018533	ATT	2	6	719860	719865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530494
16052	NC_018533	T	6	6	719886	719891	0 %	100 %	0 %	0 %	403530494
16053	NC_018533	ATTT	2	8	719896	719903	25 %	75 %	0 %	0 %	403530494
16054	NC_018533	TGTAT	2	10	720050	720059	20 %	60 %	20 %	0 %	403530494
16055	NC_018533	A	6	6	720097	720102	100 %	0 %	0 %	0 %	403530494
16056	NC_018533	TAA	2	6	720103	720108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530494
16057	NC_018533	A	7	7	720107	720113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_018533	AGAT	2	8	720119	720126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_018533	TAT	2	6	720205	720210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_018533	GAT	2	6	720248	720253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_018533	AG	3	6	720275	720280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_018533	TAG	2	6	720310	720315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_018533	ACCT	2	8	720318	720325	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16064	NC_018533	TTTC	2	8	720404	720411	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16065	NC_018533	TGG	2	6	720424	720429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_018533	GAG	3	9	720430	720438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16067	NC_018533	T	6	6	720516	720521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_018533	TCT	2	6	720528	720533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16069	NC_018533	TGGC	2	8	720561	720568	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16070	NC_018533	TGCA	2	8	720698	720705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16071	NC_018533	TGAT	2	8	720737	720744	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16072	NC_018533	ATT	2	6	720771	720776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_018533	ACA	2	6	720865	720870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16074	NC_018533	AAC	2	6	720961	720966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16075	NC_018533	T	6	6	720967	720972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_018533	ATCT	2	8	720986	720993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16077	NC_018533	GTC	2	6	720994	720999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16078	NC_018533	ATT	2	6	721009	721014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16079	NC_018533	CTT	2	6	721051	721056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16080	NC_018533	A	7	7	721058	721064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16081	NC_018533	T	6	6	721084	721089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16082	NC_018533	T	6	6	721121	721126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16083	NC_018533	CCA	2	6	721149	721154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16084	NC_018533	ATA	2	6	721193	721198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16085	NC_018533	ATG	2	6	721199	721204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16086	NC_018533	CTA	2	6	721223	721228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16087	NC_018533	A	6	6	721256	721261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16088	NC_018533	ATA	2	6	721266	721271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16089	NC_018533	TA	3	6	721270	721275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16090	NC_018533	ATA	2	6	721283	721288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_018533	TTAA	2	8	721362	721369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16092	NC_018533	TA	3	6	721405	721410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16093	NC_018533	ATTAAA	2	12	721441	721452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16094	NC_018533	AAT	2	6	721453	721458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16095	NC_018533	TAA	2	6	721465	721470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_018533	TAA	3	9	721484	721492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_018533	TTTC	2	8	721499	721506	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16098	NC_018533	A	7	7	721526	721532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_018533	AC	3	6	721544	721549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16100	NC_018533	TTG	2	6	721557	721562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16101	NC_018533	AGC	2	6	721567	721572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16102	NC_018533	AT	3	6	721595	721600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_018533	ATT	2	6	721610	721615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530495
16104	NC_018533	AAGT	2	8	721635	721642	50 %	25 %	25 %	0 %	403530495
16105	NC_018533	AGGC	2	8	721650	721657	25 %	0 %	50 %	25 %	403530495
16106	NC_018533	AAT	2	6	721813	721818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530495
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16108	NC_018533	T	6	6	722069	722074	0 %	100 %	0 %	0 %	403530495
16109	NC_018533	ATC	2	6	722146	722151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530495
16110	NC_018533	GCA	2	6	722192	722197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530495
16111	NC_018533	GAT	2	6	722202	722207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530495
16112	NC_018533	T	8	8	722268	722275	0 %	100 %	0 %	0 %	403530495
16113	NC_018533	TAA	2	6	722299	722304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530495
16114	NC_018533	GTTT	2	8	722319	722326	0 %	75 %	25 %	0 %	403530495
16115	NC_018533	TTA	2	6	722333	722338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530495
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16118	NC_018533	TGT	2	6	722474	722479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530496
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16121	NC_018533	TCAA	2	8	722607	722614	50 %	25 %	0 %	25 %	403530496
16122	NC_018533	ACC	2	6	722699	722704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530496
16123	NC_018533	CTT	2	6	722773	722778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530496
16124	NC_018533	ATA	2	6	722865	722870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530496
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16126	NC_018533	TTC	2	6	723002	723007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530496
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16128	NC_018533	CAT	2	6	723151	723156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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