MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_018533	ATT	2	6	629735	629740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530420
14002	NC_018533	AAT	2	6	629749	629754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530420
14003	NC_018533	T	6	6	629766	629771	0 %	100 %	0 %	0 %	403530420
14004	NC_018533	TTG	2	6	629815	629820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530420
14005	NC_018533	TCAT	2	8	629844	629851	25 %	50 %	0 %	25 %	403530420
14006	NC_018533	TTC	2	6	629864	629869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530420
14007	NC_018533	TTA	2	6	630066	630071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_018533	GA	3	6	630089	630094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_018533	ATG	3	9	630110	630118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_018533	TGT	2	6	630138	630143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_018533	TGA	2	6	630156	630161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_018533	A	6	6	630170	630175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_018533	AGG	2	6	630297	630302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_018533	ATC	2	6	630360	630365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530421
14015	NC_018533	GAT	2	6	630398	630403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530421
14016	NC_018533	TCT	2	6	630407	630412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530421
14017	NC_018533	GA	3	6	630536	630541	50 %	0 %	50 %	0 %	403530421
14018	NC_018533	GAA	2	6	630560	630565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530421
14019	NC_018533	GCG	2	6	630607	630612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530421
14020	NC_018533	CTT	2	6	630665	630670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530421
14021	NC_018533	GTT	2	6	630722	630727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530421
14022	NC_018533	CGT	2	6	630732	630737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530421
14023	NC_018533	A	6	6	630757	630762	100 %	0 %	0 %	0 %	403530421
14024	NC_018533	AAAT	2	8	630786	630793	75 %	25 %	0 %	0 %	403530421
14025	NC_018533	AAT	2	6	630813	630818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530421
14026	NC_018533	T	6	6	630826	630831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_018533	ACAAT	2	10	630998	631007	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14028	NC_018533	A	6	6	631042	631047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_018533	GCG	2	6	631056	631061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14030	NC_018533	A	7	7	631209	631215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_018533	TTG	2	6	631258	631263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_018533	ATT	2	6	631300	631305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_018533	T	6	6	631304	631309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_018533	AT	3	6	631331	631336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_018533	GA	3	6	631366	631371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_018533	GA	3	6	631420	631425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_018533	ATA	2	6	631429	631434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_018533	T	8	8	631526	631533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_018533	T	7	7	631544	631550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_018533	AG	3	6	631552	631557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_018533	A	6	6	631626	631631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_018533	TGTTT	2	10	631658	631667	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_018533	T	6	6	631665	631670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_018533	ATA	2	6	631680	631685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_018533	TAC	2	6	631703	631708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14046	NC_018533	TAA	2	6	631719	631724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_018533	GTA	2	6	631754	631759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_018533	GGC	2	6	631844	631849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530422
14049	NC_018533	GGAAT	2	10	631856	631865	40 %	20 %	40 %	0 %	403530422
14050	NC_018533	AGA	2	6	631885	631890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530422
14051	NC_018533	TGT	2	6	631906	631911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530422
14052	NC_018533	ATG	2	6	631944	631949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530422
14053	NC_018533	TTA	2	6	631961	631966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530422
14054	NC_018533	AGAT	2	8	631974	631981	50 %	25 %	25 %	0 %	403530422
14055	NC_018533	ACA	2	6	631991	631996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530422
14056	NC_018533	ATGCGG	2	12	632041	632052	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	403530422
14057	NC_018533	GA	3	6	632096	632101	50 %	0 %	50 %	0 %	403530422
14058	NC_018533	TTGA	2	8	632110	632117	25 %	50 %	25 %	0 %	403530422
14059	NC_018533	T	6	6	632159	632164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_018533	T	6	6	632254	632259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_018533	TTC	2	6	632278	632283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14062	NC_018533	T	7	7	632320	632326	0 %	100 %	0 %	0 %	403530423
14063	NC_018533	TTC	3	9	632396	632404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530423
14064	NC_018533	GCTG	2	8	632554	632561	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14065	NC_018533	CTT	2	6	632615	632620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14066	NC_018533	T	6	6	632628	632633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_018533	T	7	7	632649	632655	0 %	100 %	0 %	0 %	403530424
14068	NC_018533	TCT	2	6	632671	632676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530424
14069	NC_018533	A	6	6	632677	632682	100 %	0 %	0 %	0 %	403530424
14070	NC_018533	T	6	6	632688	632693	0 %	100 %	0 %	0 %	403530424
14071	NC_018533	CGA	2	6	632725	632730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530424
14072	NC_018533	T	6	6	632735	632740	0 %	100 %	0 %	0 %	403530424
14073	NC_018533	ACA	2	6	632755	632760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530424
14074	NC_018533	TCA	2	6	632761	632766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530424
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14076	NC_018533	CTT	2	6	632780	632785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530424
14077	NC_018533	AGA	2	6	632818	632823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530424
14078	NC_018533	CTT	2	6	632891	632896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530424
14079	NC_018533	GTTT	2	8	632926	632933	0 %	75 %	25 %	0 %	403530424
14080	NC_018533	TGC	2	6	632970	632975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530424
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14082	NC_018533	CTC	2	6	633024	633029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14083	NC_018533	CAA	2	6	633111	633116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530425
14084	NC_018533	AGC	2	6	633139	633144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530425
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14086	NC_018533	TGC	2	6	633228	633233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530425
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14088	NC_018533	GTTT	2	8	633286	633293	0 %	75 %	25 %	0 %	403530425
14089	NC_018533	CAA	2	6	633345	633350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530425
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14092	NC_018533	A	7	7	633566	633572	100 %	0 %	0 %	0 %	403530425
14093	NC_018533	T	8	8	633580	633587	0 %	100 %	0 %	0 %	403530425
14094	NC_018533	T	6	6	633590	633595	0 %	100 %	0 %	0 %	403530425
14095	NC_018533	TC	3	6	633598	633603	0 %	50 %	0 %	50 %	403530425
14096	NC_018533	AT	3	6	633683	633688	50 %	50 %	0 %	0 %	403530425
14097	NC_018533	ATTGCA	2	12	633725	633736	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403530425
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14099	NC_018533	TGC	2	6	633766	633771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530425
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14102	NC_018533	A	8	8	633837	633844	100 %	0 %	0 %	0 %	403530425
14103	NC_018533	TGA	2	6	633891	633896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530425
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14105	NC_018533	AAT	2	6	634000	634005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530426
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14107	NC_018533	T	6	6	634130	634135	0 %	100 %	0 %	0 %	403530426
14108	NC_018533	TTG	3	9	634168	634176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530426
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14111	NC_018533	GC	3	6	634237	634242	0 %	0 %	50 %	50 %	403530426
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14113	NC_018533	ACA	2	6	634301	634306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530426
14114	NC_018533	T	6	6	634318	634323	0 %	100 %	0 %	0 %	403530426
14115	NC_018533	TACG	2	8	634332	634339	25 %	25 %	25 %	25 %	403530426
14116	NC_018533	TAAT	2	8	634364	634371	50 %	50 %	0 %	0 %	403530426
14117	NC_018533	TTTTGC	2	12	634393	634404	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	403530426
14118	NC_018533	T	6	6	634407	634412	0 %	100 %	0 %	0 %	403530426
14119	NC_018533	ACC	2	6	634489	634494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530426
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14122	NC_018533	GT	3	6	634745	634750	0 %	50 %	50 %	0 %	403530426
14123	NC_018533	AAC	2	6	634810	634815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530426
14124	NC_018533	GTG	3	9	634947	634955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530426
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14126	NC_018533	AAT	2	6	634994	634999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530426
14127	NC_018533	ATC	2	6	635015	635020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14128	NC_018533	ATGTT	2	10	635030	635039	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14129	NC_018533	GTT	2	6	635065	635070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14130	NC_018533	TAA	2	6	635097	635102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530427
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14146	NC_018533	TGC	2	6	635890	635895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530427
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14186	NC_018533	A	9	9	637912	637920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14187	NC_018533	ATT	2	6	637978	637983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14242	NC_018533	TGA	2	6	640491	640496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14243	NC_018533	ATT	2	6	640542	640547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14244	NC_018533	T	7	7	640549	640555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14245	NC_018533	CTT	2	6	640556	640561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14246	NC_018533	TAC	2	6	640610	640615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14248	NC_018533	GAAAG	2	10	640657	640666	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14249	NC_018533	AGA	2	6	640670	640675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14250	NC_018533	CT	3	6	640716	640721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14251	NC_018533	ATA	2	6	640756	640761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14252	NC_018533	CT	3	6	640788	640793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14495	NC_018533	TAG	2	6	650418	650423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530435
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14497	NC_018533	GAA	2	6	650519	650524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530435
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