MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_018533	GCGA	2	8	608310	608317	25 %	0 %	50 %	25 %	403530407
13502	NC_018533	TGAT	2	8	608407	608414	25 %	50 %	25 %	0 %	403530407
13503	NC_018533	ATT	2	6	608450	608455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530407
13504	NC_018533	TGG	2	6	608531	608536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530407
13505	NC_018533	ATG	2	6	608551	608556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530407
13506	NC_018533	GAT	2	6	608588	608593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530407
13507	NC_018533	CGG	2	6	608608	608613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530407
13508	NC_018533	AGT	2	6	608628	608633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530407
13509	NC_018533	TTG	2	6	608690	608695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530408
13510	NC_018533	ATG	2	6	608696	608701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530408
13511	NC_018533	TTG	2	6	608720	608725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530408
13512	NC_018533	GAT	2	6	608737	608742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530408
13513	NC_018533	TGA	2	6	608775	608780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530408
13514	NC_018533	T	7	7	608819	608825	0 %	100 %	0 %	0 %	403530408
13515	NC_018533	GTC	2	6	608846	608851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530408
13516	NC_018533	GCT	2	6	608865	608870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530408
13517	NC_018533	TGA	2	6	608871	608876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530408
13518	NC_018533	GGT	2	6	608904	608909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530408
13519	NC_018533	GAG	2	6	608960	608965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530408
13520	NC_018533	GTTG	2	8	609009	609016	0 %	50 %	50 %	0 %	403530408
13521	NC_018533	TAT	2	6	609111	609116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530408
13522	NC_018533	GCA	2	6	609265	609270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530408
13523	NC_018533	G	6	6	609321	609326	0 %	0 %	100 %	0 %	403530408
13524	NC_018533	TGG	2	6	609360	609365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530408
13525	NC_018533	TGA	2	6	609378	609383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530408
13526	NC_018533	TTC	2	6	609419	609424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530408
13527	NC_018533	GACAG	2	10	609432	609441	40 %	0 %	40 %	20 %	403530408
13528	NC_018533	TGG	2	6	609456	609461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530408
13529	NC_018533	AGA	2	6	609546	609551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530408
13530	NC_018533	GTT	2	6	609571	609576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530408
13531	NC_018533	CCA	2	6	609589	609594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530408
13532	NC_018533	CGT	2	6	609604	609609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530408
13533	NC_018533	GCA	2	6	609654	609659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530408
13534	NC_018533	TGA	2	6	609687	609692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530408
13535	NC_018533	AAT	2	6	609748	609753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530408
13536	NC_018533	TCT	2	6	609762	609767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530408
13537	NC_018533	GTGATG	2	12	609779	609790	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	403530408
13538	NC_018533	AAC	2	6	609798	609803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530408
13539	NC_018533	CTT	2	6	609808	609813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530408
13540	NC_018533	AT	3	6	609950	609955	50 %	50 %	0 %	0 %	403530408
13541	NC_018533	TTA	2	6	610040	610045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530409
13542	NC_018533	GCGGG	2	10	610049	610058	0 %	0 %	80 %	20 %	403530409
13543	NC_018533	GGTT	2	8	610062	610069	0 %	50 %	50 %	0 %	403530409
13544	NC_018533	TGC	2	6	610089	610094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530409
13545	NC_018533	TATTGA	2	12	610116	610127	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	403530409
13546	NC_018533	GATT	2	8	610133	610140	25 %	50 %	25 %	0 %	403530409
13547	NC_018533	A	6	6	610142	610147	100 %	0 %	0 %	0 %	403530409
13548	NC_018533	TTG	2	6	610175	610180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530409
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13550	NC_018533	TGA	2	6	610257	610262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530409
13551	NC_018533	TGG	2	6	610271	610276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530409
13552	NC_018533	CTCA	2	8	610289	610296	25 %	25 %	0 %	50 %	403530409
13553	NC_018533	CAA	2	6	610310	610315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530409
13554	NC_018533	GA	3	6	610376	610381	50 %	0 %	50 %	0 %	403530409
13555	NC_018533	GAAGTT	2	12	610411	610422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530409
13556	NC_018533	CGT	2	6	610438	610443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530409
13557	NC_018533	GAT	2	6	610486	610491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530409
13558	NC_018533	TTG	2	6	610493	610498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530409
13559	NC_018533	TTA	2	6	610532	610537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530409
13560	NC_018533	GAC	2	6	610581	610586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530409
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13563	NC_018533	ATT	2	6	610741	610746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530409
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13565	NC_018533	AGAA	2	8	610832	610839	75 %	0 %	25 %	0 %	403530409
13566	NC_018533	AAC	2	6	610872	610877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530409
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13571	NC_018533	CGT	2	6	611131	611136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530409
13572	NC_018533	ATT	2	6	611182	611187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530409
13573	NC_018533	TTGG	2	8	611215	611222	0 %	50 %	50 %	0 %	403530409
13574	NC_018533	AAT	2	6	611289	611294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530409
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13578	NC_018533	AT	3	6	611409	611414	50 %	50 %	0 %	0 %	403530409
13579	NC_018533	AAG	2	6	611529	611534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530410
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13581	NC_018533	CAG	2	6	611690	611695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530410
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13583	NC_018533	GTTTG	2	10	611756	611765	0 %	60 %	40 %	0 %	403530410
13584	NC_018533	AGGT	2	8	611784	611791	25 %	25 %	50 %	0 %	403530410
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13586	NC_018533	TAT	2	6	611824	611829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530410
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13588	NC_018533	GGCA	2	8	611851	611858	25 %	0 %	50 %	25 %	403530410
13589	NC_018533	CGT	2	6	611891	611896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530410
13590	NC_018533	A	7	7	611924	611930	100 %	0 %	0 %	0 %	403530410
13591	NC_018533	ATG	2	6	611973	611978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530410
13592	NC_018533	T	7	7	612007	612013	0 %	100 %	0 %	0 %	403530410
13593	NC_018533	AAGCA	2	10	612018	612027	60 %	0 %	20 %	20 %	403530410
13594	NC_018533	TAT	2	6	612041	612046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530410
13595	NC_018533	AT	3	6	612067	612072	50 %	50 %	0 %	0 %	403530410
13596	NC_018533	TCCATA	2	12	612126	612137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530410
13597	NC_018533	ACT	2	6	612149	612154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530410
13598	NC_018533	AGGA	2	8	612165	612172	50 %	0 %	50 %	0 %	403530410
13599	NC_018533	GAA	2	6	612338	612343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13600	NC_018533	T	6	6	612454	612459	0 %	100 %	0 %	0 %	403530411
13601	NC_018533	TTA	2	6	612487	612492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530411
13602	NC_018533	TTGT	2	8	612523	612530	0 %	75 %	25 %	0 %	403530411
13603	NC_018533	AAGA	2	8	612564	612571	75 %	0 %	25 %	0 %	403530411
13604	NC_018533	TA	3	6	612582	612587	50 %	50 %	0 %	0 %	403530411
13605	NC_018533	GGT	2	6	612597	612602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530411
13606	NC_018533	GTA	2	6	612603	612608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530411
13607	NC_018533	TCC	2	6	612650	612655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530411
13608	NC_018533	GCAG	2	8	612677	612684	25 %	0 %	50 %	25 %	403530411
13609	NC_018533	TAT	2	6	612752	612757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530411
13610	NC_018533	TGG	2	6	612773	612778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530411
13611	NC_018533	CAG	2	6	612922	612927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530411
13612	NC_018533	AAG	2	6	612928	612933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530411
13613	NC_018533	TGA	2	6	612953	612958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530411
13614	NC_018533	AGA	2	6	612989	612994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530411
13615	NC_018533	A	6	6	613017	613022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13616	NC_018533	TAAA	2	8	613032	613039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13617	NC_018533	A	6	6	613047	613052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13618	NC_018533	GAT	2	6	613083	613088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13619	NC_018533	AC	3	6	613095	613100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13621	NC_018533	CCT	2	6	613140	613145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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