MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_018533	T	6	6	542756	542761	0 %	100 %	0 %	0 %	403530346
12003	NC_018533	CAGT	2	8	542853	542860	25 %	25 %	25 %	25 %	403530346
12004	NC_018533	AATGG	2	10	542872	542881	40 %	20 %	40 %	0 %	403530346
12005	NC_018533	TCG	2	6	542937	542942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530346
12006	NC_018533	TTGT	2	8	542945	542952	0 %	75 %	25 %	0 %	403530346
12007	NC_018533	TTA	2	6	542975	542980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530346
12008	NC_018533	TA	3	6	543028	543033	50 %	50 %	0 %	0 %	403530346
12009	NC_018533	AGT	2	6	543115	543120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530346
12010	NC_018533	TTC	2	6	543176	543181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530347
12011	NC_018533	GCA	2	6	543197	543202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530347
12012	NC_018533	TGA	2	6	543203	543208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530347
12013	NC_018533	GCT	2	6	543330	543335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530347
12014	NC_018533	AGC	2	6	543353	543358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530347
12015	NC_018533	GATG	2	8	543395	543402	25 %	25 %	50 %	0 %	403530347
12016	NC_018533	TGT	2	6	543443	543448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530347
12017	NC_018533	GTTG	2	8	543510	543517	0 %	50 %	50 %	0 %	403530347
12018	NC_018533	GCA	2	6	543522	543527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530347
12019	NC_018533	TTG	2	6	543545	543550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530347
12020	NC_018533	GGCAG	2	10	543604	543613	20 %	0 %	60 %	20 %	403530347
12021	NC_018533	TTATT	2	10	543614	543623	20 %	80 %	0 %	0 %	403530347
12022	NC_018533	CAG	2	6	543637	543642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530347
12023	NC_018533	TTGGT	2	10	543682	543691	0 %	60 %	40 %	0 %	403530347
12024	NC_018533	ATT	2	6	543710	543715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530347
12025	NC_018533	T	6	6	543714	543719	0 %	100 %	0 %	0 %	403530347
12026	NC_018533	ATT	2	6	543735	543740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530347
12027	NC_018533	CTTTT	2	10	543742	543751	0 %	80 %	0 %	20 %	403530347
12028	NC_018533	TTAT	2	8	543838	543845	25 %	75 %	0 %	0 %	403530347
12029	NC_018533	T	6	6	543851	543856	0 %	100 %	0 %	0 %	403530347
12030	NC_018533	TAA	2	6	543935	543940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530347
12031	NC_018533	GCT	2	6	543945	543950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530347
12032	NC_018533	GAA	2	6	543954	543959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530347
12033	NC_018533	A	7	7	543958	543964	100 %	0 %	0 %	0 %	403530347
12034	NC_018533	ATCA	2	8	544067	544074	50 %	25 %	0 %	25 %	403530348
12035	NC_018533	ATA	2	6	544145	544150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530348
12036	NC_018533	CTT	2	6	544172	544177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530348
12037	NC_018533	GAAG	2	8	544183	544190	50 %	0 %	50 %	0 %	403530348
12038	NC_018533	TCA	2	6	544204	544209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530348
12039	NC_018533	TTC	2	6	544287	544292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530348
12040	NC_018533	AGC	2	6	544320	544325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530348
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12042	NC_018533	TTA	2	6	544436	544441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530348
12043	NC_018533	ATTT	2	8	544461	544468	25 %	75 %	0 %	0 %	403530348
12044	NC_018533	TGC	2	6	544530	544535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530348
12045	NC_018533	ATA	2	6	544546	544551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530348
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12047	NC_018533	TCGT	2	8	544688	544695	0 %	50 %	25 %	25 %	403530348
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12049	NC_018533	CG	3	6	544718	544723	0 %	0 %	50 %	50 %	403530348
12050	NC_018533	TCA	2	6	544814	544819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530348
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12052	NC_018533	TGA	2	6	544849	544854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530349
12053	NC_018533	AAT	2	6	544907	544912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530349
12054	NC_018533	GAAA	2	8	544981	544988	75 %	0 %	25 %	0 %	403530349
12055	NC_018533	CAA	2	6	545006	545011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530349
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12057	NC_018533	TGT	2	6	545175	545180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530349
12058	NC_018533	TCA	2	6	545197	545202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530349
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12060	NC_018533	CTT	2	6	545426	545431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530349
12061	NC_018533	GC	3	6	545499	545504	0 %	0 %	50 %	50 %	403530349
12062	NC_018533	CT	3	6	545548	545553	0 %	50 %	0 %	50 %	403530349
12063	NC_018533	T	7	7	545564	545570	0 %	100 %	0 %	0 %	403530349
12064	NC_018533	T	7	7	545584	545590	0 %	100 %	0 %	0 %	403530349
12065	NC_018533	ATG	2	6	545602	545607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530349
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12067	NC_018533	A	6	6	545675	545680	100 %	0 %	0 %	0 %	403530349
12068	NC_018533	CAA	2	6	545804	545809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530349
12069	NC_018533	GAT	3	9	545818	545826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530349
12070	NC_018533	GAA	2	6	545852	545857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530349
12071	NC_018533	GCAATA	2	12	545950	545961	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403530349
12072	NC_018533	GTT	2	6	546019	546024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530349
12073	NC_018533	CAA	2	6	546098	546103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530349
12074	NC_018533	TGA	2	6	546121	546126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530349
12075	NC_018533	GCT	2	6	546157	546162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530349
12076	NC_018533	TTC	2	6	546249	546254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530349
12077	NC_018533	ATG	2	6	546327	546332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12079	NC_018533	CAT	2	6	546446	546451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530350
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12081	NC_018533	TTG	2	6	546576	546581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530350
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12084	NC_018533	AAT	2	6	546696	546701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530351
12085	NC_018533	ATG	2	6	546724	546729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530351
12086	NC_018533	AGT	2	6	546732	546737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530351
12087	NC_018533	ATA	2	6	546748	546753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530351
12088	NC_018533	CAAT	2	8	546761	546768	50 %	25 %	0 %	25 %	403530351
12089	NC_018533	GTG	2	6	546769	546774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530351
12090	NC_018533	AT	3	6	546799	546804	50 %	50 %	0 %	0 %	403530351
12091	NC_018533	AAAG	2	8	546810	546817	75 %	0 %	25 %	0 %	403530351
12092	NC_018533	TA	4	8	546984	546991	50 %	50 %	0 %	0 %	403530351
12093	NC_018533	T	6	6	547041	547046	0 %	100 %	0 %	0 %	403530351
12094	NC_018533	T	6	6	547082	547087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12095	NC_018533	TAT	2	6	547091	547096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530352
12096	NC_018533	T	6	6	547117	547122	0 %	100 %	0 %	0 %	403530352
12097	NC_018533	AGC	2	6	547135	547140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530352
12098	NC_018533	AACT	2	8	547141	547148	50 %	25 %	0 %	25 %	403530352
12099	NC_018533	T	6	6	547167	547172	0 %	100 %	0 %	0 %	403530352
12100	NC_018533	GTT	2	6	547202	547207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530352
12101	NC_018533	GTG	2	6	547208	547213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530352
12102	NC_018533	T	6	6	547240	547245	0 %	100 %	0 %	0 %	403530352
12103	NC_018533	GA	3	6	547348	547353	50 %	0 %	50 %	0 %	403530352
12104	NC_018533	GCT	2	6	547364	547369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530352
12105	NC_018533	GCT	2	6	547385	547390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530352
12106	NC_018533	GCC	2	6	547408	547413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403530352
12107	NC_018533	CAT	2	6	547431	547436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530352
12108	NC_018533	CAA	2	6	547509	547514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530352
12109	NC_018533	CGT	2	6	547520	547525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530352
12110	NC_018533	AG	4	8	547540	547547	50 %	0 %	50 %	0 %	403530352
12111	NC_018533	CAA	2	6	547548	547553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530352
12112	NC_018533	CTA	2	6	547566	547571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530352
12113	NC_018533	CGGG	2	8	547576	547583	0 %	0 %	75 %	25 %	403530352
12114	NC_018533	TTCC	2	8	547584	547591	0 %	50 %	0 %	50 %	403530352
12115	NC_018533	CAG	2	6	547605	547610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530352
12116	NC_018533	T	6	6	547620	547625	0 %	100 %	0 %	0 %	403530352
12117	NC_018533	A	7	7	547640	547646	100 %	0 %	0 %	0 %	403530352
12118	NC_018533	TCA	2	6	547706	547711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530352
12119	NC_018533	T	6	6	547727	547732	0 %	100 %	0 %	0 %	403530352
12120	NC_018533	TGG	2	6	547754	547759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530352
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12122	NC_018533	GCT	2	6	547862	547867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530352
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12244	NC_018533	TTAT	2	8	553332	553339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12491	NC_018533	CAT	2	6	564650	564655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530368
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12493	NC_018533	AG	3	6	564731	564736	50 %	0 %	50 %	0 %	403530368
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