MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_018533	ACA	2	6	520887	520892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530325
11502	NC_018533	GAA	2	6	520917	520922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530325
11503	NC_018533	TGT	2	6	520973	520978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530325
11504	NC_018533	TAT	2	6	521073	521078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530325
11505	NC_018533	AC	3	6	521104	521109	50 %	0 %	0 %	50 %	403530325
11506	NC_018533	TTC	2	6	521114	521119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530325
11507	NC_018533	GA	3	6	521201	521206	50 %	0 %	50 %	0 %	403530325
11508	NC_018533	AAC	2	6	521275	521280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530325
11509	NC_018533	TGA	2	6	521318	521323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530325
11510	NC_018533	TGC	2	6	521414	521419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530325
11511	NC_018533	GTG	2	6	521428	521433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530325
11512	NC_018533	ATTAAA	2	12	521447	521458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530325
11513	NC_018533	TCT	2	6	521462	521467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530325
11514	NC_018533	TGC	3	9	521522	521530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530325
11515	NC_018533	GTTC	2	8	521556	521563	0 %	50 %	25 %	25 %	403530325
11516	NC_018533	AGA	2	6	521593	521598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530325
11517	NC_018533	CAT	2	6	521616	521621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530325
11518	NC_018533	TCT	2	6	521627	521632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530325
11519	NC_018533	AT	3	6	521644	521649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_018533	A	7	7	521666	521672	100 %	0 %	0 %	0 %	403530326
11521	NC_018533	AAT	2	6	521692	521697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530326
11522	NC_018533	GAAGT	2	10	521774	521783	40 %	20 %	40 %	0 %	403530326
11523	NC_018533	CGT	2	6	521906	521911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530326
11524	NC_018533	ATT	2	6	521920	521925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530326
11525	NC_018533	T	7	7	521950	521956	0 %	100 %	0 %	0 %	403530326
11526	NC_018533	GC	3	6	522019	522024	0 %	0 %	50 %	50 %	403530326
11527	NC_018533	A	8	8	522081	522088	100 %	0 %	0 %	0 %	403530326
11528	NC_018533	GCT	2	6	522169	522174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_018533	TGA	2	6	522224	522229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530327
11530	NC_018533	CGTC	2	8	522237	522244	0 %	25 %	25 %	50 %	403530327
11531	NC_018533	TAT	2	6	522261	522266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530327
11532	NC_018533	A	6	6	522288	522293	100 %	0 %	0 %	0 %	403530327
11533	NC_018533	CTC	2	6	522318	522323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530327
11534	NC_018533	ATG	2	6	522376	522381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530327
11535	NC_018533	TGG	2	6	522490	522495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530327
11536	NC_018533	TTC	2	6	522556	522561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530327
11537	NC_018533	T	7	7	522586	522592	0 %	100 %	0 %	0 %	403530327
11538	NC_018533	GGT	2	6	522815	522820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530327
11539	NC_018533	ATTA	2	8	522863	522870	50 %	50 %	0 %	0 %	403530327
11540	NC_018533	T	6	6	522871	522876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_018533	T	8	8	522889	522896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_018533	GTT	2	6	522899	522904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_018533	TGT	2	6	522932	522937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_018533	ATG	2	6	522947	522952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_018533	ATT	2	6	522992	522997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_018533	AAAG	2	8	523012	523019	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_018533	TGT	2	6	523113	523118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_018533	TAT	2	6	523119	523124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_018533	AAT	2	6	523135	523140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_018533	AAT	2	6	523185	523190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_018533	GTAT	2	8	523201	523208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_018533	TTTG	2	8	523213	523220	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_018533	TGT	2	6	523325	523330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_018533	ATT	2	6	523351	523356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_018533	TA	3	6	523358	523363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_018533	T	8	8	523383	523390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_018533	AAGA	2	8	523398	523405	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_018533	AGA	2	6	523430	523435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530328
11559	NC_018533	TGATAA	2	12	523532	523543	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	403530328
11560	NC_018533	GTT	2	6	523551	523556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530328
11561	NC_018533	AGA	2	6	523574	523579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530328
11562	NC_018533	AGA	2	6	523604	523609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530328
11563	NC_018533	ATTC	2	8	523614	523621	25 %	50 %	0 %	25 %	403530328
11564	NC_018533	TTTC	2	8	523668	523675	0 %	75 %	0 %	25 %	403530328
11565	NC_018533	ACA	2	6	523707	523712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530328
11566	NC_018533	GAA	2	6	523716	523721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530328
11567	NC_018533	GTTC	2	8	523729	523736	0 %	50 %	25 %	25 %	403530328
11568	NC_018533	GAA	2	6	523749	523754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530328
11569	NC_018533	ATT	2	6	523804	523809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530328
11570	NC_018533	TAT	2	6	523825	523830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_018533	GTT	2	6	523845	523850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_018533	T	7	7	523866	523872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_018533	TTAA	2	8	523899	523906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_018533	ATG	2	6	523942	523947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530329
11575	NC_018533	TTG	2	6	523961	523966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530329
11576	NC_018533	TAAA	2	8	524009	524016	75 %	25 %	0 %	0 %	403530329
11577	NC_018533	TCA	2	6	524046	524051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530329
11578	NC_018533	GCT	2	6	524098	524103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530329
11579	NC_018533	CAA	2	6	524132	524137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530329
11580	NC_018533	GTTG	2	8	524226	524233	0 %	50 %	50 %	0 %	403530329
11581	NC_018533	TAA	2	6	524250	524255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530329
11582	NC_018533	GAA	2	6	524271	524276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530329
11583	NC_018533	CTT	2	6	524305	524310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530329
11584	NC_018533	TGA	2	6	524322	524327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530329
11585	NC_018533	ATA	2	6	524366	524371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530329
11586	NC_018533	TGA	2	6	524394	524399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530329
11587	NC_018533	GAG	2	6	524419	524424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530329
11588	NC_018533	AGA	2	6	524487	524492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530329
11589	NC_018533	TC	3	6	524493	524498	0 %	50 %	0 %	50 %	403530329
11590	NC_018533	TTTA	2	8	524504	524511	25 %	75 %	0 %	0 %	403530329
11591	NC_018533	ATT	2	6	524553	524558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530329
11592	NC_018533	T	7	7	524609	524615	0 %	100 %	0 %	0 %	403530329
11593	NC_018533	TTG	2	6	524738	524743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530329
11594	NC_018533	AATG	2	8	524748	524755	50 %	25 %	25 %	0 %	403530329
11595	NC_018533	TAC	2	6	524784	524789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530329
11596	NC_018533	ACA	2	6	524863	524868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530329
11597	NC_018533	CTG	2	6	524912	524917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530329
11598	NC_018533	ATT	2	6	524981	524986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530329
11599	NC_018533	AAACG	2	10	525003	525012	60 %	0 %	20 %	20 %	403530329
11600	NC_018533	AC	3	6	525084	525089	50 %	0 %	0 %	50 %	403530329
11601	NC_018533	GATT	2	8	525140	525147	25 %	50 %	25 %	0 %	403530329
11602	NC_018533	TG	3	6	525214	525219	0 %	50 %	50 %	0 %	403530329
11603	NC_018533	TAT	2	6	525240	525245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530329
11604	NC_018533	A	6	6	525264	525269	100 %	0 %	0 %	0 %	403530329
11605	NC_018533	TGA	2	6	525273	525278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530329
11606	NC_018533	CAG	2	6	525314	525319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530329
11607	NC_018533	TTG	2	6	525332	525337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530329
11608	NC_018533	TCG	2	6	525363	525368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530329
11609	NC_018533	CGTT	2	8	525427	525434	0 %	50 %	25 %	25 %	403530329
11610	NC_018533	AT	3	6	525438	525443	50 %	50 %	0 %	0 %	403530329
11611	NC_018533	GCT	2	6	525520	525525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530329
11612	NC_018533	GTG	2	6	525533	525538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530329
11613	NC_018533	CTT	2	6	525545	525550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530329
11614	NC_018533	GAA	2	6	525625	525630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530329
11615	NC_018533	GGTT	2	8	525631	525638	0 %	50 %	50 %	0 %	403530329
11616	NC_018533	GAT	2	6	525660	525665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530329
11617	NC_018533	TTG	2	6	525800	525805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530329
11618	NC_018533	TTAT	2	8	525833	525840	25 %	75 %	0 %	0 %	403530329
11619	NC_018533	GAT	2	6	525871	525876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530329
11620	NC_018533	TGT	2	6	525957	525962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530329
11621	NC_018533	TGAT	2	8	526070	526077	25 %	50 %	25 %	0 %	403530329
11622	NC_018533	T	6	6	526112	526117	0 %	100 %	0 %	0 %	403530329
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11991	NC_018533	AGA	2	6	542375	542380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11992	NC_018533	CGT	2	6	542411	542416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11995	NC_018533	T	6	6	542518	542523	0 %	100 %	0 %	0 %	403530346
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11997	NC_018533	GTT	2	6	542559	542564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530346
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11999	NC_018533	TTC	2	6	542602	542607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530346
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