MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_018533	T	6	6	319498	319503	0 %	100 %	0 %	0 %	403530170
7002	NC_018533	AGA	2	6	319521	319526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530170
7003	NC_018533	A	6	6	319537	319542	100 %	0 %	0 %	0 %	403530170
7004	NC_018533	TCA	2	6	319560	319565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530170
7005	NC_018533	TGCA	2	8	319595	319602	25 %	25 %	25 %	25 %	403530170
7006	NC_018533	ATTA	2	8	319639	319646	50 %	50 %	0 %	0 %	403530170
7007	NC_018533	TAT	2	6	319670	319675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530170
7008	NC_018533	TCT	2	6	319696	319701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530170
7009	NC_018533	TGA	2	6	319722	319727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530170
7010	NC_018533	TCA	2	6	319737	319742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530170
7011	NC_018533	GATTTA	2	12	319756	319767	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	403530170
7012	NC_018533	TTA	2	6	319781	319786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530170
7013	NC_018533	A	6	6	319922	319927	100 %	0 %	0 %	0 %	403530170
7014	NC_018533	TAC	2	6	319999	320004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530170
7015	NC_018533	T	6	6	320057	320062	0 %	100 %	0 %	0 %	403530170
7016	NC_018533	TTGC	2	8	320080	320087	0 %	50 %	25 %	25 %	403530170
7017	NC_018533	TAT	2	6	320089	320094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530170
7018	NC_018533	TGC	2	6	320097	320102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530170
7019	NC_018533	ATT	2	6	320189	320194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530170
7020	NC_018533	AGA	2	6	320241	320246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530170
7021	NC_018533	A	6	6	320254	320259	100 %	0 %	0 %	0 %	403530170
7022	NC_018533	ATA	2	6	320264	320269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530170
7023	NC_018533	CAA	2	6	320295	320300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530170
7024	NC_018533	TTC	2	6	320363	320368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530170
7025	NC_018533	TTTC	2	8	320381	320388	0 %	75 %	0 %	25 %	403530170
7026	NC_018533	TGG	2	6	320412	320417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530170
7027	NC_018533	GCA	2	6	320518	320523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530170
7028	NC_018533	TTA	2	6	320730	320735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530170
7029	NC_018533	TGG	2	6	320750	320755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_018533	T	6	6	320767	320772	0 %	100 %	0 %	0 %	403530171
7031	NC_018533	T	6	6	320776	320781	0 %	100 %	0 %	0 %	403530171
7032	NC_018533	TGG	2	6	320887	320892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530171
7033	NC_018533	TGT	2	6	320908	320913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530171
7034	NC_018533	TGG	2	6	320977	320982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530171
7035	NC_018533	TTG	2	6	321072	321077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530171
7036	NC_018533	ATC	2	6	321082	321087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530171
7037	NC_018533	GCG	2	6	321098	321103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530171
7038	NC_018533	GAA	2	6	321119	321124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530171
7039	NC_018533	GAT	2	6	321146	321151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530171
7040	NC_018533	GTC	3	9	321162	321170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530171
7041	NC_018533	TTG	2	6	321192	321197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530171
7042	NC_018533	CAG	2	6	321237	321242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530171
7043	NC_018533	ATTG	2	8	321295	321302	25 %	50 %	25 %	0 %	403530171
7044	NC_018533	CAT	2	6	321362	321367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530171
7045	NC_018533	TGA	2	6	321391	321396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530171
7046	NC_018533	AAAT	2	8	321442	321449	75 %	25 %	0 %	0 %	403530171
7047	NC_018533	T	6	6	321449	321454	0 %	100 %	0 %	0 %	403530171
7048	NC_018533	TGT	2	6	321481	321486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530171
7049	NC_018533	ATT	2	6	321510	321515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530171
7050	NC_018533	T	7	7	321514	321520	0 %	100 %	0 %	0 %	403530171
7051	NC_018533	A	6	6	321535	321540	100 %	0 %	0 %	0 %	403530171
7052	NC_018533	ACA	2	6	321581	321586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530171
7053	NC_018533	A	6	6	321634	321639	100 %	0 %	0 %	0 %	403530171
7054	NC_018533	AAG	2	6	321675	321680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530171
7055	NC_018533	CT	3	6	321735	321740	0 %	50 %	0 %	50 %	403530171
7056	NC_018533	T	6	6	321793	321798	0 %	100 %	0 %	0 %	403530172
7057	NC_018533	GAT	2	6	321846	321851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530172
7058	NC_018533	CTT	2	6	321876	321881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530172
7059	NC_018533	TGA	2	6	321887	321892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530172
7060	NC_018533	ATC	2	6	321907	321912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530172
7061	NC_018533	T	6	6	321921	321926	0 %	100 %	0 %	0 %	403530172
7062	NC_018533	ATT	2	6	321979	321984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530172
7063	NC_018533	AAT	2	6	321987	321992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530172
7064	NC_018533	TCA	2	6	322010	322015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530172
7065	NC_018533	T	6	6	322026	322031	0 %	100 %	0 %	0 %	403530172
7066	NC_018533	T	6	6	322039	322044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_018533	GA	3	6	322053	322058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_018533	TAAA	2	8	322064	322071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_018533	A	6	6	322108	322113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_018533	ACG	2	6	322131	322136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7071	NC_018533	CATT	2	8	322255	322262	25 %	50 %	0 %	25 %	403530173
7072	NC_018533	TGC	2	6	322316	322321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530173
7073	NC_018533	TTGT	2	8	322347	322354	0 %	75 %	25 %	0 %	403530173
7074	NC_018533	GCT	2	6	322368	322373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530173
7075	NC_018533	ACA	2	6	322440	322445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530173
7076	NC_018533	TCT	2	6	322524	322529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530173
7077	NC_018533	CAA	2	6	322559	322564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530173
7078	NC_018533	GAAG	2	8	322569	322576	50 %	0 %	50 %	0 %	403530173
7079	NC_018533	AGC	2	6	322628	322633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530173
7080	NC_018533	CAA	2	6	322642	322647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530173
7081	NC_018533	ATA	2	6	322674	322679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530173
7082	NC_018533	TTC	2	6	322727	322732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530173
7083	NC_018533	GTGTT	2	10	322741	322750	0 %	60 %	40 %	0 %	403530173
7084	NC_018533	TGCAG	2	10	322751	322760	20 %	20 %	40 %	20 %	403530173
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7086	NC_018533	CT	3	6	322808	322813	0 %	50 %	0 %	50 %	403530173
7087	NC_018533	GTG	2	6	322852	322857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530173
7088	NC_018533	GCT	2	6	322863	322868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530173
7089	NC_018533	GATA	2	8	323123	323130	50 %	25 %	25 %	0 %	403530173
7090	NC_018533	CTC	2	6	323167	323172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530173
7091	NC_018533	TGA	2	6	323229	323234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530173
7092	NC_018533	TAC	2	6	323242	323247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530173
7093	NC_018533	GATT	2	8	323285	323292	25 %	50 %	25 %	0 %	403530173
7094	NC_018533	TAT	2	6	323374	323379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530173
7095	NC_018533	AGA	2	6	323536	323541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530173
7096	NC_018533	TTC	2	6	323599	323604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530173
7097	NC_018533	CTG	2	6	323605	323610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530173
7098	NC_018533	CAT	2	6	323731	323736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530173
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7101	NC_018533	ACA	2	6	323901	323906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530173
7102	NC_018533	TAA	2	6	323947	323952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530173
7103	NC_018533	ATA	2	6	323979	323984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530173
7104	NC_018533	CAT	2	6	324034	324039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7105	NC_018533	ATC	2	6	324076	324081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7106	NC_018533	ACCA	2	8	324120	324127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7107	NC_018533	TTGT	2	8	324136	324143	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_018533	AAT	2	6	324194	324199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_018533	A	8	8	324212	324219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_018533	CAAT	2	8	324226	324233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7111	NC_018533	A	6	6	324244	324249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_018533	AAGGC	2	10	324268	324277	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7113	NC_018533	ATTTG	2	10	324495	324504	20 %	60 %	20 %	0 %	403530174
7114	NC_018533	AGG	2	6	324818	324823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530174
7115	NC_018533	GAT	2	6	324838	324843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530174
7116	NC_018533	TGG	2	6	324861	324866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530174
7117	NC_018533	TGG	2	6	324908	324913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530174
7118	NC_018533	TATTGA	2	12	324942	324953	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	403530174
7119	NC_018533	GC	3	6	324957	324962	0 %	0 %	50 %	50 %	403530174
7120	NC_018533	TGA	2	6	325032	325037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530174
7121	NC_018533	T	7	7	325146	325152	0 %	100 %	0 %	0 %	403530174
7122	NC_018533	TTG	2	6	325253	325258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530174
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7124	NC_018533	ATG	2	6	325310	325315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530174
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