MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia pseudomallei BPC006 chromosome II

Total Repeats: 103529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018529	CTG	4	12	18428	18439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521317
502	NC_018529	GC	4	8	18453	18460	0 %	0 %	50 %	50 %	403521317
503	NC_018529	CGC	2	6	18467	18472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521317
504	NC_018529	GCGT	2	8	18497	18504	0 %	25 %	50 %	25 %	403521317
505	NC_018529	CGCGCT	2	12	18505	18516	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	403521317
506	NC_018529	CGC	2	6	18546	18551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521317
507	NC_018529	TCGGCA	2	12	18564	18575	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	403521317
508	NC_018529	ACG	2	6	18623	18628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521317
509	NC_018529	GGC	2	6	18643	18648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521317
510	NC_018529	CTG	2	6	18653	18658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521317
511	NC_018529	CG	5	10	18661	18670	0 %	0 %	50 %	50 %	403521317
512	NC_018529	CGG	2	6	18678	18683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521317
513	NC_018529	CGG	2	6	18705	18710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521317
514	NC_018529	GCG	2	6	18765	18770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521317
515	NC_018529	TCG	2	6	18774	18779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521317
516	NC_018529	CCG	2	6	18783	18788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521317
517	NC_018529	GC	3	6	18789	18794	0 %	0 %	50 %	50 %	403521317
518	NC_018529	CGC	2	6	18796	18801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521317
519	NC_018529	GCC	2	6	18813	18818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521317
520	NC_018529	GCT	2	6	18829	18834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521317
521	NC_018529	GCG	2	6	18952	18957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521318
522	NC_018529	TCGT	2	8	18958	18965	0 %	50 %	25 %	25 %	403521318
523	NC_018529	GCC	2	6	18987	18992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521318
524	NC_018529	GC	3	6	19023	19028	0 %	0 %	50 %	50 %	403521318
525	NC_018529	GC	3	6	19043	19048	0 %	0 %	50 %	50 %	403521318
526	NC_018529	CGA	2	6	19073	19078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521318
527	NC_018529	AGCGCG	2	12	19081	19092	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	403521318
528	NC_018529	GCG	2	6	19096	19101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521318
529	NC_018529	CGA	2	6	19115	19120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521318
530	NC_018529	GTG	2	6	19152	19157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403521318
531	NC_018529	CG	3	6	19188	19193	0 %	0 %	50 %	50 %	403521319
532	NC_018529	CG	3	6	19198	19203	0 %	0 %	50 %	50 %	403521319
533	NC_018529	TCTCGT	2	12	19205	19216	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	403521319
534	NC_018529	CGT	2	6	19243	19248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521319
535	NC_018529	CGG	2	6	19268	19273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_018529	CG	3	6	19274	19279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
537	NC_018529	GCC	2	6	19289	19294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_018529	CG	3	6	19369	19374	0 %	0 %	50 %	50 %	403521320
539	NC_018529	CG	3	6	19388	19393	0 %	0 %	50 %	50 %	403521320
540	NC_018529	CG	4	8	19419	19426	0 %	0 %	50 %	50 %	403521320
541	NC_018529	GCC	2	6	19430	19435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521320
542	NC_018529	GCG	2	6	19442	19447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521320
543	NC_018529	CGG	2	6	19453	19458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521320
544	NC_018529	CGG	2	6	19464	19469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521320
545	NC_018529	CGAA	2	8	19475	19482	50 %	0 %	25 %	25 %	403521320
546	NC_018529	GC	3	6	19495	19500	0 %	0 %	50 %	50 %	403521320
547	NC_018529	TGCGA	2	10	19519	19528	20 %	20 %	40 %	20 %	403521320
548	NC_018529	GCGCG	2	10	19536	19545	0 %	0 %	60 %	40 %	403521320
549	NC_018529	GCG	2	6	19557	19562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521320
550	NC_018529	CGG	2	6	19563	19568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521320
551	NC_018529	CGATG	2	10	19664	19673	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
552	NC_018529	CG	4	8	19685	19692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
553	NC_018529	ACGCG	2	10	19718	19727	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
554	NC_018529	GCG	3	9	19737	19745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_018529	CG	3	6	19794	19799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
556	NC_018529	TGC	2	6	19802	19807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_018529	GCCG	2	8	19810	19817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
558	NC_018529	CG	4	8	19874	19881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_018529	CG	4	8	19901	19908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
560	NC_018529	CGGC	2	8	19912	19919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_018529	CGC	2	6	20003	20008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521321
562	NC_018529	CGC	2	6	20033	20038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521321
563	NC_018529	GCC	2	6	20047	20052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521321
564	NC_018529	CGCC	2	8	20054	20061	0 %	0 %	25 %	75 %	403521321
565	NC_018529	CGCC	2	8	20078	20085	0 %	0 %	25 %	75 %	403521321
566	NC_018529	CGCGC	2	10	20124	20133	0 %	0 %	40 %	60 %	403521321
567	NC_018529	CGC	2	6	20135	20140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521321
568	NC_018529	CGC	2	6	20142	20147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521321
569	NC_018529	CGC	2	6	20150	20155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521321
570	NC_018529	CCG	2	6	20231	20236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521321
571	NC_018529	CG	3	6	20240	20245	0 %	0 %	50 %	50 %	403521321
572	NC_018529	GCCG	2	8	20247	20254	0 %	0 %	50 %	50 %	403521321
573	NC_018529	GC	3	6	20271	20276	0 %	0 %	50 %	50 %	403521321
574	NC_018529	CGG	2	6	20279	20284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521321
575	NC_018529	GTC	2	6	20295	20300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521321
576	NC_018529	CAG	2	6	20307	20312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521321
577	NC_018529	ACGA	2	8	20338	20345	50 %	0 %	25 %	25 %	403521321
578	NC_018529	CG	3	6	20348	20353	0 %	0 %	50 %	50 %	403521321
579	NC_018529	CCG	2	6	20356	20361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521321
580	NC_018529	CG	3	6	20381	20386	0 %	0 %	50 %	50 %	403521321
581	NC_018529	GAT	2	6	20417	20422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403521321
582	NC_018529	GCA	2	6	20423	20428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521321
583	NC_018529	ATCGAG	2	12	20433	20444	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403521321
584	NC_018529	CG	4	8	20447	20454	0 %	0 %	50 %	50 %	403521321
585	NC_018529	GCG	2	6	20466	20471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521321
586	NC_018529	GC	3	6	20544	20549	0 %	0 %	50 %	50 %	403521321
587	NC_018529	GCG	2	6	20567	20572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521321
588	NC_018529	GAA	2	6	20574	20579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403521321
589	NC_018529	TCG	2	6	20593	20598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521321
590	NC_018529	ACG	2	6	20600	20605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521321
591	NC_018529	TCG	2	6	20617	20622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521321
592	NC_018529	TCG	2	6	20626	20631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521321
593	NC_018529	GCG	2	6	20657	20662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521321
594	NC_018529	CGA	2	6	20669	20674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521321
595	NC_018529	GCA	2	6	20687	20692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521321
596	NC_018529	ACGC	2	8	20712	20719	25 %	0 %	25 %	50 %	403521321
597	NC_018529	CG	3	6	20727	20732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
598	NC_018529	TGA	2	6	20770	20775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_018529	GC	3	6	20801	20806	0 %	0 %	50 %	50 %	403521322
600	NC_018529	GC	3	6	20827	20832	0 %	0 %	50 %	50 %	403521322
601	NC_018529	GCG	2	6	20850	20855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521322
602	NC_018529	TCG	2	6	20860	20865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521322
603	NC_018529	GCTT	2	8	20893	20900	0 %	50 %	25 %	25 %	403521322
604	NC_018529	CGA	2	6	20918	20923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521322
605	NC_018529	CAGC	2	8	20931	20938	25 %	0 %	25 %	50 %	403521322
606	NC_018529	CG	3	6	20939	20944	0 %	0 %	50 %	50 %	403521322
607	NC_018529	GTC	2	6	20946	20951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521322
608	NC_018529	GCG	2	6	20959	20964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521322
609	NC_018529	CG	3	6	20982	20987	0 %	0 %	50 %	50 %	403521322
610	NC_018529	GC	3	6	21068	21073	0 %	0 %	50 %	50 %	403521322
611	NC_018529	TTC	2	6	21138	21143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403521322
612	NC_018529	GCT	2	6	21242	21247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521322
613	NC_018529	AGC	2	6	21253	21258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521322
614	NC_018529	AGC	3	9	21262	21270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521322
615	NC_018529	TCG	2	6	21280	21285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521322
616	NC_018529	CG	3	6	21302	21307	0 %	0 %	50 %	50 %	403521322
617	NC_018529	CGT	2	6	21314	21319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521322
618	NC_018529	GCC	2	6	21327	21332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521322
619	NC_018529	GCC	3	9	21345	21353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521322
620	NC_018529	GCC	2	6	21357	21362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521322
621	NC_018529	GCCG	2	8	21380	21387	0 %	0 %	50 %	50 %	403521322
622	NC_018529	CCG	3	9	21385	21393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521322
623	NC_018529	GCC	2	6	21402	21407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521322
624	NC_018529	CGAA	2	8	21443	21450	50 %	0 %	25 %	25 %	403521322
625	NC_018529	CCT	2	6	21503	21508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_018529	AT	4	8	21531	21538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_018529	CCCG	2	8	21612	21619	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
628	NC_018529	CGA	2	6	21640	21645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_018529	GGC	2	6	21685	21690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_018529	CGTT	2	8	21713	21720	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
631	NC_018529	CCGG	2	8	21793	21800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
632	NC_018529	GC	3	6	21892	21897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
633	NC_018529	CCTC	2	8	21908	21915	0 %	25 %	0 %	75 %	403521323
634	NC_018529	CGCT	2	8	21961	21968	0 %	25 %	25 %	50 %	403521323
635	NC_018529	GC	4	8	21981	21988	0 %	0 %	50 %	50 %	403521323
636	NC_018529	GCG	2	6	21994	21999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521323
637	NC_018529	TGC	2	6	22009	22014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521323
638	NC_018529	T	6	6	22030	22035	0 %	100 %	0 %	0 %	403521323
639	NC_018529	CG	3	6	22038	22043	0 %	0 %	50 %	50 %	403521323
640	NC_018529	GCG	2	6	22054	22059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521323
641	NC_018529	GCG	3	9	22134	22142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521323
642	NC_018529	GAA	2	6	22157	22162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403521323
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652	NC_018529	CGG	2	6	22551	22556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521323
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666	NC_018529	GC	3	6	22977	22982	0 %	0 %	50 %	50 %	403521323
667	NC_018529	GCAT	2	8	22985	22992	25 %	25 %	25 %	25 %	403521323
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671	NC_018529	CGA	2	6	23225	23230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521323
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674	NC_018529	GCGTC	2	10	23423	23432	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
675	NC_018529	CAA	2	6	23440	23445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
676	NC_018529	A	7	7	23471	23477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
677	NC_018529	CGTTTC	2	12	23485	23496	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
678	NC_018529	CGG	2	6	23620	23625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521324
679	NC_018529	CGG	2	6	23661	23666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
680	NC_018529	CG	4	8	23667	23674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
681	NC_018529	GCCG	2	8	23681	23688	0 %	0 %	50 %	50 %	403521325
682	NC_018529	CGC	2	6	23689	23694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521325
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685	NC_018529	GGCG	2	8	23775	23782	0 %	0 %	75 %	25 %	403521325
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701	NC_018529	CG	3	6	24583	24588	0 %	0 %	50 %	50 %	403521326
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760	NC_018529	GGC	2	6	26613	26618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521328
761	NC_018529	CCTG	2	8	26622	26629	0 %	25 %	25 %	50 %	403521328
762	NC_018529	CGC	2	6	26664	26669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521328
763	NC_018529	CGA	2	6	26674	26679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521328
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765	NC_018529	ACA	2	6	26721	26726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403521328
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767	NC_018529	CTA	2	6	26788	26793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403521328
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776	NC_018529	CGG	2	6	27078	27083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521328
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782	NC_018529	GCCGC	2	10	27345	27354	0 %	0 %	40 %	60 %	403521328
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871	NC_018529	CGGA	2	8	30132	30139	25 %	0 %	50 %	25 %	403521331
872	NC_018529	CATCGA	2	12	30145	30156	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	403521331
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875	NC_018529	GCG	2	6	30209	30214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521331
876	NC_018529	G	6	6	30256	30261	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
877	NC_018529	GACG	2	8	30285	30292	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
878	NC_018529	GGGC	2	8	30293	30300	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
879	NC_018529	CG	3	6	30303	30308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
880	NC_018529	CGA	2	6	30340	30345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521332
881	NC_018529	CG	3	6	30451	30456	0 %	0 %	50 %	50 %	403521332
882	NC_018529	TTCG	2	8	30473	30480	0 %	50 %	25 %	25 %	403521332
883	NC_018529	CGA	2	6	30506	30511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521332
884	NC_018529	CGC	2	6	30527	30532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521332
885	NC_018529	TTC	2	6	30539	30544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403521332
886	NC_018529	CGAGC	2	10	30554	30563	20 %	0 %	40 %	40 %	403521332
887	NC_018529	GCTC	2	8	30595	30602	0 %	25 %	25 %	50 %	403521332
888	NC_018529	GC	3	6	30658	30663	0 %	0 %	50 %	50 %	403521332
889	NC_018529	CGT	2	6	30721	30726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521332
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