MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p06

Total Repeats: 150

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018512	A	6	6	11	16	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018512	T	6	6	48	53	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018512	CATT	2	8	162	169	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018512	AAAT	2	8	176	183	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018512	AGATA	2	10	194	203	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018512	A	7	7	208	214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018512	CAA	2	6	243	248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018512	T	6	6	264	269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018512	ATT	2	6	285	290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018512	TA	3	6	318	323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018512	ATA	2	6	325	330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018512	GAG	2	6	372	377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018512	AAGA	2	8	462	469	75 %	0 %	25 %	0 %	434379817
14	NC_018512	A	7	7	555	561	100 %	0 %	0 %	0 %	434379817
15	NC_018512	AAGGGA	2	12	617	628	50 %	0 %	50 %	0 %	434379817
16	NC_018512	A	6	6	646	651	100 %	0 %	0 %	0 %	434379817
17	NC_018512	TTC	2	6	671	676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379817
18	NC_018512	TTG	2	6	700	705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379817
19	NC_018512	ATG	2	6	706	711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379817
20	NC_018512	A	6	6	719	724	100 %	0 %	0 %	0 %	434379817
21	NC_018512	A	8	8	755	762	100 %	0 %	0 %	0 %	434379817
22	NC_018512	AAT	2	6	852	857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379817
23	NC_018512	ATT	2	6	872	877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379817
24	NC_018512	CA	3	6	886	891	50 %	0 %	0 %	50 %	434379817
25	NC_018512	TTAT	2	8	892	899	25 %	75 %	0 %	0 %	434379817
26	NC_018512	ATGAAA	2	12	954	965	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434379817
27	NC_018512	ATT	2	6	989	994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379817
28	NC_018512	T	7	7	1021	1027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018512	GT	3	6	1038	1043	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018512	AC	3	6	1078	1083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018512	CAT	2	6	1090	1095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018512	CT	4	8	1136	1143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018512	TA	4	8	1152	1159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018512	GTA	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018512	T	6	6	1254	1259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018512	GTT	2	6	1310	1315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018512	TTC	2	6	1353	1358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018512	TTC	2	6	1486	1491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018512	CAA	2	6	1506	1511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018512	TATAT	2	10	1516	1525	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018512	T	7	7	1621	1627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018512	AAT	2	6	1685	1690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018512	CAA	2	6	1705	1710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018512	CTT	2	6	1739	1744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018512	TAT	2	6	1878	1883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018512	T	7	7	1894	1900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018512	TGTA	2	8	1911	1918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018512	TTC	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018512	T	7	7	1931	1937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018512	TA	3	6	1963	1968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018512	T	6	6	2011	2016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018512	T	7	7	2019	2025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018512	A	6	6	2062	2067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018512	TTCAT	2	10	2097	2106	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018512	GTAT	2	8	2118	2125	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018512	AATT	2	8	2132	2139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018512	AATT	2	8	2142	2149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018512	A	7	7	2152	2158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018512	TAA	2	6	2182	2187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379818
60	NC_018512	TTCCC	2	10	2208	2217	0 %	40 %	0 %	60 %	434379818
61	NC_018512	TCC	2	6	2227	2232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434379818
62	NC_018512	AAG	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379818
63	NC_018512	ACC	2	6	2320	2325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379818
64	NC_018512	CAG	2	6	2349	2354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379818
65	NC_018512	TGG	3	9	2683	2691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379818
66	NC_018512	TGG	3	9	2722	2730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379818
67	NC_018512	GCC	2	6	2767	2772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434379818
68	NC_018512	TAA	2	6	3052	3057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379818
69	NC_018512	TGT	2	6	3091	3096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379818
70	NC_018512	TCCTAT	2	12	3118	3129	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434379818
71	NC_018512	ACT	3	9	3131	3139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379818
72	NC_018512	CAA	2	6	3192	3197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379818
73	NC_018512	TAT	2	6	3206	3211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379818
74	NC_018512	TAA	2	6	3390	3395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379818
75	NC_018512	ATG	2	6	3408	3413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379818
76	NC_018512	A	7	7	3469	3475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018512	T	7	7	3496	3502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018512	TAA	2	6	3512	3517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018512	ATT	2	6	3530	3535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018512	ACA	3	9	3550	3558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018512	TATG	2	8	3568	3575	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018512	CGC	2	6	3618	3623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_018512	AATA	2	8	3833	3840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018512	T	6	6	3986	3991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018512	AC	3	6	4052	4057	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018512	ATT	2	6	4092	4097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018512	AACAT	2	10	4119	4128	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_018512	GTC	2	6	4167	4172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018512	AAC	2	6	4251	4256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018512	GAA	2	6	4277	4282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018512	TCA	2	6	4401	4406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018512	TGG	2	6	4477	4482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018512	CAA	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379819
94	NC_018512	TAG	2	6	4605	4610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379819
95	NC_018512	CT	3	6	4634	4639	0 %	50 %	0 %	50 %	434379819
96	NC_018512	TAA	2	6	4650	4655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379819
97	NC_018512	AGT	2	6	4663	4668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379819
98	NC_018512	ATT	2	6	4810	4815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379820
99	NC_018512	TTG	2	6	4839	4844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379820
100	NC_018512	CAA	2	6	4848	4853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379820
101	NC_018512	A	6	6	4852	4857	100 %	0 %	0 %	0 %	434379820
102	NC_018512	TGT	2	6	4925	4930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379820
103	NC_018512	GTA	2	6	4944	4949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379820
104	NC_018512	CATT	2	8	4971	4978	25 %	50 %	0 %	25 %	434379820
105	NC_018512	AGA	2	6	4985	4990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
106	NC_018512	CAAA	2	8	5042	5049	75 %	0 %	0 %	25 %	434379820
107	NC_018512	AGA	2	6	5120	5125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
108	NC_018512	ACA	2	6	5177	5182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379820
109	NC_018512	A	6	6	5244	5249	100 %	0 %	0 %	0 %	434379820
110	NC_018512	TAGAAG	2	12	5287	5298	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434379820
111	NC_018512	AGT	2	6	5339	5344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379820
112	NC_018512	ACA	2	6	5363	5368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379820
113	NC_018512	A	6	6	5407	5412	100 %	0 %	0 %	0 %	434379820
114	NC_018512	CAA	2	6	5418	5423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379820
115	NC_018512	A	7	7	5439	5445	100 %	0 %	0 %	0 %	434379820
116	NC_018512	AAAAG	2	10	5447	5456	80 %	0 %	20 %	0 %	434379820
117	NC_018512	GAA	2	6	5523	5528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
118	NC_018512	AAC	2	6	5543	5548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379820
119	NC_018512	GAA	2	6	5579	5584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
120	NC_018512	GA	3	6	5618	5623	50 %	0 %	50 %	0 %	434379820
121	NC_018512	A	6	6	5658	5663	100 %	0 %	0 %	0 %	434379820
122	NC_018512	AGA	2	6	5680	5685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
123	NC_018512	ATA	2	6	5722	5727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379820
124	NC_018512	AGA	2	6	5735	5740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
125	NC_018512	AAT	2	6	5754	5759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379820
126	NC_018512	AGA	2	6	5798	5803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
127	NC_018512	TAAA	2	8	5806	5813	75 %	25 %	0 %	0 %	434379820
128	NC_018512	A	6	6	5895	5900	100 %	0 %	0 %	0 %	434379820
129	NC_018512	TTA	2	6	5935	5940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379820
130	NC_018512	AAG	2	6	6002	6007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
131	NC_018512	ATT	2	6	6061	6066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018512	ACTA	2	8	6071	6078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_018512	TG	3	6	6115	6120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018512	T	6	6	6133	6138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018512	ATTG	2	8	6209	6216	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018512	A	7	7	6225	6231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018512	T	7	7	6256	6262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018512	TAC	2	6	6318	6323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018512	A	6	6	6341	6346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018512	TAA	2	6	6408	6413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018512	GTG	2	6	6414	6419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018512	TGT	2	6	6458	6463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018512	T	8	8	6494	6501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018512	GTC	2	6	6634	6639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018512	TGG	2	6	6640	6645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018512	A	8	8	6714	6721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018512	AAT	2	6	6735	6740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018512	T	8	8	6758	6765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018512	AAAT	2	8	6794	6801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018512	TAG	2	6	6818	6823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.