MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p03

Total Repeats: 5481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018510	ATG	2	6	44	49	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018510	TCG	2	6	57	62	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018510	TCA	2	6	144	149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018510	AAG	2	6	167	172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018510	TAG	2	6	194	199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018510	ATT	2	6	208	213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018510	AT	3	6	228	233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018510	ATG	2	6	281	286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018510	AT	3	6	287	292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018510	TAG	2	6	329	334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018510	AGA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018510	GAA	2	6	397	402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018510	ACAA	2	8	403	410	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018510	TTG	2	6	460	465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018510	ATT	2	6	520	525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018510	ATT	2	6	566	571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018510	TAT	2	6	607	612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379568
18	NC_018510	TGA	2	6	677	682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379568
19	NC_018510	ATCT	2	8	685	692	25 %	50 %	0 %	25 %	434379568
20	NC_018510	TAA	2	6	712	717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379568
21	NC_018510	TA	3	6	733	738	50 %	50 %	0 %	0 %	434379568
22	NC_018510	TGAT	2	8	818	825	25 %	50 %	25 %	0 %	434379568
23	NC_018510	CTA	2	6	834	839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379568
24	NC_018510	A	7	7	892	898	100 %	0 %	0 %	0 %	434379568
25	NC_018510	TCA	2	6	912	917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379568
26	NC_018510	T	6	6	1045	1050	0 %	100 %	0 %	0 %	434379568
27	NC_018510	TTGA	2	8	1055	1062	25 %	50 %	25 %	0 %	434379568
28	NC_018510	AAAG	2	8	1101	1108	75 %	0 %	25 %	0 %	434379568
29	NC_018510	A	6	6	1143	1148	100 %	0 %	0 %	0 %	434379568
30	NC_018510	CAC	2	6	1186	1191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379568
31	NC_018510	AGT	2	6	1211	1216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379568
32	NC_018510	T	9	9	1234	1242	0 %	100 %	0 %	0 %	434379568
33	NC_018510	TGA	2	6	1274	1279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379568
34	NC_018510	AGT	2	6	1322	1327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379568
35	NC_018510	TTCATA	2	12	1370	1381	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434379568
36	NC_018510	AT	3	6	1451	1456	50 %	50 %	0 %	0 %	434379568
37	NC_018510	ATA	2	6	1502	1507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018510	A	6	6	1557	1562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018510	GAT	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018510	TTC	2	6	1714	1719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379569
41	NC_018510	TAT	2	6	1909	1914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379569
42	NC_018510	TAA	2	6	1938	1943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379569
43	NC_018510	AGT	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379569
44	NC_018510	A	6	6	1990	1995	100 %	0 %	0 %	0 %	434379569
45	NC_018510	TAG	2	6	2005	2010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379569
46	NC_018510	CAC	2	6	2023	2028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379569
47	NC_018510	ATT	2	6	2091	2096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379569
48	NC_018510	TAT	2	6	2134	2139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379569
49	NC_018510	ACT	2	6	2189	2194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379569
50	NC_018510	ATTTTA	2	12	2257	2268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379569
51	NC_018510	GTA	2	6	2280	2285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379569
52	NC_018510	GTA	3	9	2319	2327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379569
53	NC_018510	GTA	2	6	2331	2336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379569
54	NC_018510	ACT	2	6	2343	2348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379569
55	NC_018510	TAT	2	6	2389	2394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379569
56	NC_018510	ATATT	2	10	2401	2410	40 %	60 %	0 %	0 %	434379569
57	NC_018510	AT	4	8	2489	2496	50 %	50 %	0 %	0 %	434379569
58	NC_018510	TA	3	6	2613	2618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018510	TTA	2	6	2620	2625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018510	TA	3	6	2624	2629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018510	GTATTC	2	12	2669	2680	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018510	TTTA	2	8	2683	2690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018510	ATT	2	6	2722	2727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018510	TGATA	2	10	2737	2746	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018510	ATT	2	6	2784	2789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018510	TTA	2	6	2919	2924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379570
67	NC_018510	A	6	6	2944	2949	100 %	0 %	0 %	0 %	434379570
68	NC_018510	TAC	2	6	2996	3001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379570
69	NC_018510	A	6	6	3004	3009	100 %	0 %	0 %	0 %	434379570
70	NC_018510	TGG	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018510	ATG	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379571
72	NC_018510	GAA	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379571
73	NC_018510	ACC	2	6	3165	3170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379571
74	NC_018510	ACGA	2	8	3233	3240	50 %	0 %	25 %	25 %	434379571
75	NC_018510	ATCAAA	2	12	3270	3281	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434379571
76	NC_018510	AAAG	2	8	3383	3390	75 %	0 %	25 %	0 %	434379571
77	NC_018510	CTT	2	6	3397	3402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379571
78	NC_018510	TAA	2	6	3440	3445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379571
79	NC_018510	A	6	6	3473	3478	100 %	0 %	0 %	0 %	434379571
80	NC_018510	A	6	6	3481	3486	100 %	0 %	0 %	0 %	434379571
81	NC_018510	A	6	6	3516	3521	100 %	0 %	0 %	0 %	434379571
82	NC_018510	ACA	2	6	3529	3534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379571
83	NC_018510	A	7	7	3560	3566	100 %	0 %	0 %	0 %	434379571
84	NC_018510	A	6	6	3648	3653	100 %	0 %	0 %	0 %	434379571
85	NC_018510	TCA	2	6	3704	3709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379571
86	NC_018510	T	6	6	3759	3764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018510	ATT	2	6	3775	3780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018510	T	6	6	3796	3801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018510	AT	3	6	3841	3846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018510	ACT	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379572
91	NC_018510	T	6	6	3912	3917	0 %	100 %	0 %	0 %	434379572
92	NC_018510	CTT	2	6	3935	3940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379572
93	NC_018510	TTTCTG	2	12	3985	3996	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	434379572
94	NC_018510	TCA	2	6	4004	4009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379572
95	NC_018510	CAAT	2	8	4011	4018	50 %	25 %	0 %	25 %	434379572
96	NC_018510	TCA	2	6	4155	4160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379572
97	NC_018510	TAT	2	6	4191	4196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018510	TCA	2	6	4288	4293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018510	A	6	6	4367	4372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018510	AAG	2	6	4387	4392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018510	CTTC	2	8	4413	4420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018510	TGA	3	9	4422	4430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018510	TTA	2	6	4456	4461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018510	ATA	2	6	4529	4534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018510	TC	3	6	4562	4567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018510	TCA	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018510	ACAA	2	8	4579	4586	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018510	T	6	6	4591	4596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018510	T	6	6	4622	4627	0 %	100 %	0 %	0 %	434379573
110	NC_018510	CATC	2	8	4735	4742	25 %	25 %	0 %	50 %	434379573
111	NC_018510	GAA	2	6	4777	4782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379573
112	NC_018510	CATT	2	8	4802	4809	25 %	50 %	0 %	25 %	434379573
113	NC_018510	AAGG	2	8	4817	4824	50 %	0 %	50 %	0 %	434379573
114	NC_018510	TCC	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434379573
115	NC_018510	ATT	2	6	4893	4898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379573
116	NC_018510	CCCA	2	8	4917	4924	25 %	0 %	0 %	75 %	434379573
117	NC_018510	AAG	2	6	4952	4957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379573
118	NC_018510	CTG	2	6	4976	4981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379573
119	NC_018510	CTA	2	6	5006	5011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379573
120	NC_018510	CTG	2	6	5012	5017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379573
121	NC_018510	GAT	2	6	5029	5034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379573
122	NC_018510	T	7	7	5049	5055	0 %	100 %	0 %	0 %	434379573
123	NC_018510	TTTAT	2	10	5073	5082	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018510	ACAT	2	8	5104	5111	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_018510	TAA	2	6	5115	5120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018510	ATTG	2	8	5179	5186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018510	CTG	2	6	5204	5209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018510	TAA	2	6	5223	5228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018510	TAAT	2	8	5263	5270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018510	TCC	2	6	5414	5419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_018510	CTA	2	6	5493	5498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379574
132	NC_018510	TCT	2	6	5529	5534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379574
133	NC_018510	TTCC	2	8	5561	5568	0 %	50 %	0 %	50 %	434379574
134	NC_018510	TGT	2	6	5592	5597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379574
135	NC_018510	TGT	2	6	5631	5636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379574
136	NC_018510	ACTCCA	2	12	5647	5658	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	434379574
137	NC_018510	T	7	7	5665	5671	0 %	100 %	0 %	0 %	434379574
138	NC_018510	CATA	2	8	5672	5679	50 %	25 %	0 %	25 %	434379574
139	NC_018510	AAT	2	6	5680	5685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379574
140	NC_018510	AAT	2	6	5734	5739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379574
141	NC_018510	TAA	2	6	5792	5797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379574
142	NC_018510	A	7	7	5843	5849	100 %	0 %	0 %	0 %	434379574
143	NC_018510	T	6	6	5854	5859	0 %	100 %	0 %	0 %	434379574
144	NC_018510	CAA	2	6	5881	5886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379574
145	NC_018510	ATC	2	6	5888	5893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379574
146	NC_018510	TAA	2	6	5896	5901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379574
147	NC_018510	TCC	2	6	5910	5915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434379574
148	NC_018510	GAA	2	6	5941	5946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379574
149	NC_018510	CAA	2	6	5971	5976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379574
150	NC_018510	A	9	9	6124	6132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018510	TAA	2	6	6150	6155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018510	GGA	2	6	6180	6185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018510	GA	3	6	6222	6227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018510	GAG	2	6	6253	6258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018510	A	6	6	6294	6299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018510	ATT	2	6	6303	6308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018510	CTA	2	6	6323	6328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_018510	TTC	2	6	6338	6343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_018510	ACA	2	6	6399	6404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_018510	GAA	3	9	6452	6460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018510	TAAAAG	2	12	6505	6516	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018510	ATC	2	6	6592	6597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_018510	AAG	2	6	6615	6620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018510	CTT	2	6	6651	6656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_018510	A	6	6	6693	6698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018510	ATA	2	6	6754	6759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_018510	ACAA	2	8	6874	6881	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
168	NC_018510	ACTATA	2	12	6954	6965	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
169	NC_018510	GTT	2	6	6979	6984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_018510	T	8	8	6983	6990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_018510	TATT	2	8	7067	7074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_018510	TCT	2	6	7099	7104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379575
173	NC_018510	TGAT	2	8	7155	7162	25 %	50 %	25 %	0 %	434379575
174	NC_018510	GCAA	2	8	7165	7172	50 %	0 %	25 %	25 %	434379575
175	NC_018510	AATA	2	8	7226	7233	75 %	25 %	0 %	0 %	434379575
176	NC_018510	GCA	2	6	7256	7261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379575
177	NC_018510	AGC	2	6	7340	7345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379575
178	NC_018510	CCAGC	2	10	7346	7355	20 %	0 %	20 %	60 %	434379575
179	NC_018510	CCT	2	6	7361	7366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434379575
180	NC_018510	TAGCAT	2	12	7411	7422	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434379575
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182	NC_018510	TTG	2	6	7464	7469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379575
183	NC_018510	GAA	2	6	7475	7480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379575
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187	NC_018510	TTA	2	6	7670	7675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379575
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255	NC_018510	TAA	2	6	10979	10984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_018510	ACAT	2	8	11007	11014	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
257	NC_018510	TACA	2	8	11041	11048	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
258	NC_018510	ATA	2	6	11049	11054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_018510	CAT	2	6	11099	11104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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273	NC_018510	A	6	6	11647	11652	100 %	0 %	0 %	0 %	434379579
274	NC_018510	AGA	2	6	11667	11672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379579
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