MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 chromosome

Total Repeats: 141345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
125001	NC_018500	ACA	2	6	5202129	5202134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402564029
125002	NC_018500	ATT	2	6	5202138	5202143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402564029
125003	NC_018500	TAAATT	2	12	5202191	5202202	50 %	50 %	0 %	0 %	402564030
125004	NC_018500	TGA	2	6	5202203	5202208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402564030
125005	NC_018500	ATT	2	6	5202264	5202269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402564030
125006	NC_018500	CTG	2	6	5202271	5202276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402564030
125007	NC_018500	TA	3	6	5202367	5202372	50 %	50 %	0 %	0 %	402564030
125008	NC_018500	ACT	2	6	5202387	5202392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402564030
125009	NC_018500	AGA	2	6	5202423	5202428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402564030
125010	NC_018500	TGT	3	9	5202485	5202493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402564030
125011	NC_018500	A	6	6	5202553	5202558	100 %	0 %	0 %	0 %	402564030
125012	NC_018500	CGC	2	6	5202598	5202603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	402564030
125013	NC_018500	ACC	2	6	5202617	5202622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402564030
125014	NC_018500	GAT	3	9	5202636	5202644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402564030
125015	NC_018500	AG	3	6	5202667	5202672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125016	NC_018500	T	6	6	5202693	5202698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125017	NC_018500	GAAA	2	8	5202785	5202792	75 %	0 %	25 %	0 %	402564031
125018	NC_018500	TAA	2	6	5202833	5202838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402564031
125019	NC_018500	TCC	2	6	5202839	5202844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	402564031
125020	NC_018500	ACA	2	6	5202875	5202880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402564031
125021	NC_018500	ATT	2	6	5202961	5202966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402564031
125022	NC_018500	AGA	2	6	5202968	5202973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402564031
125023	NC_018500	AAT	2	6	5202980	5202985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125024	NC_018500	CAG	2	6	5203221	5203226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402564032
125025	NC_018500	GT	3	6	5203260	5203265	0 %	50 %	50 %	0 %	402564032
125026	NC_018500	TGGA	2	8	5203268	5203275	25 %	25 %	50 %	0 %	402564032
125027	NC_018500	CAT	2	6	5203356	5203361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402564032
125028	NC_018500	GGT	2	6	5203369	5203374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402564032
125029	NC_018500	CTT	2	6	5203446	5203451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402564032
125030	NC_018500	ATG	2	6	5203481	5203486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402564032
125031	NC_018500	TGA	2	6	5203533	5203538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402564032
125032	NC_018500	TGA	2	6	5203641	5203646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402564032
125033	NC_018500	TAA	2	6	5203673	5203678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402564032
125034	NC_018500	ATG	2	6	5203679	5203684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402564032
125035	NC_018500	AACA	2	8	5203888	5203895	75 %	0 %	0 %	25 %	402564032
125036	NC_018500	GAA	2	6	5203903	5203908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402564032
125037	NC_018500	ATGA	2	8	5203924	5203931	50 %	25 %	25 %	0 %	402564032
125038	NC_018500	GGA	2	6	5203950	5203955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402564032
125039	NC_018500	A	6	6	5204092	5204097	100 %	0 %	0 %	0 %	402564032
125040	NC_018500	AGA	2	6	5204145	5204150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402564032
125041	NC_018500	TG	3	6	5204177	5204182	0 %	50 %	50 %	0 %	402564032
125042	NC_018500	GCA	2	6	5204316	5204321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402564032
125043	NC_018500	TGA	2	6	5204367	5204372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402564032
125044	NC_018500	ATG	2	6	5204497	5204502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402564032
125045	NC_018500	TGG	3	9	5204511	5204519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402564032
125046	NC_018500	ACTT	2	8	5204558	5204565	25 %	50 %	0 %	25 %	402564032
125047	NC_018500	AGCA	2	8	5204579	5204586	50 %	0 %	25 %	25 %	402564032
125048	NC_018500	CATT	2	8	5204597	5204604	25 %	50 %	0 %	25 %	402564032
125049	NC_018500	A	6	6	5204608	5204613	100 %	0 %	0 %	0 %	402564032
125050	NC_018500	AAT	2	6	5204626	5204631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402564032
125051	NC_018500	TTG	2	6	5204645	5204650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402564032
125052	NC_018500	GAA	2	6	5204680	5204685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402564032
125053	NC_018500	TTC	2	6	5204794	5204799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402564032
125054	NC_018500	TGG	2	6	5204823	5204828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402564032
125055	NC_018500	TGA	2	6	5204832	5204837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402564032
125056	NC_018500	AATT	2	8	5204858	5204865	50 %	50 %	0 %	0 %	402564032
125057	NC_018500	GCA	2	6	5204976	5204981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402564032
125058	NC_018500	TGA	2	6	5205063	5205068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402564032
125059	NC_018500	AATC	2	8	5205098	5205105	50 %	25 %	0 %	25 %	402564032
125060	NC_018500	TAA	2	6	5205354	5205359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125061	NC_018500	TAA	2	6	5205374	5205379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125062	NC_018500	TA	3	6	5205456	5205461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125063	NC_018500	A	7	7	5205465	5205471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125064	NC_018500	A	6	6	5205473	5205478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125065	NC_018500	AT	5	10	5205484	5205493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125066	NC_018500	TAA	2	6	5205526	5205531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125067	NC_018500	TTA	2	6	5205574	5205579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125068	NC_018500	T	6	6	5205626	5205631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125069	NC_018500	TTC	2	6	5205649	5205654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125070	NC_018500	TAC	2	6	5205667	5205672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402564033
125071	NC_018500	ATCT	2	8	5205708	5205715	25 %	50 %	0 %	25 %	402564033
125072	NC_018500	TGA	2	6	5205716	5205721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402564033
125073	NC_018500	A	7	7	5205743	5205749	100 %	0 %	0 %	0 %	402564033
125074	NC_018500	TCA	2	6	5205869	5205874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402564033
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125077	NC_018500	ATC	2	6	5206000	5206005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402564033
125078	NC_018500	ATG	2	6	5206018	5206023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402564033
125079	NC_018500	AT	3	6	5206047	5206052	50 %	50 %	0 %	0 %	402564033
125080	NC_018500	TA	3	6	5206064	5206069	50 %	50 %	0 %	0 %	402564033
125081	NC_018500	AAGGA	2	10	5206073	5206082	60 %	0 %	40 %	0 %	402564033
125082	NC_018500	TAC	2	6	5206311	5206316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402564034
125083	NC_018500	GCT	2	6	5206319	5206324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402564034
125084	NC_018500	ATC	2	6	5206349	5206354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402564034
125085	NC_018500	GGC	2	6	5206369	5206374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402564034
125086	NC_018500	CTAT	2	8	5206393	5206400	25 %	50 %	0 %	25 %	402564034
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125089	NC_018500	TGAT	2	8	5206550	5206557	25 %	50 %	25 %	0 %	402564035
125090	NC_018500	AG	3	6	5206561	5206566	50 %	0 %	50 %	0 %	402564035
125091	NC_018500	ATT	2	6	5206589	5206594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402564035
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125093	NC_018500	AGAA	2	8	5206713	5206720	75 %	0 %	25 %	0 %	402564035
125094	NC_018500	A	6	6	5206844	5206849	100 %	0 %	0 %	0 %	402564035
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125097	NC_018500	AT	3	6	5206972	5206977	50 %	50 %	0 %	0 %	402564035
125098	NC_018500	TAT	2	6	5206987	5206992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402564035
125099	NC_018500	ATT	2	6	5207003	5207008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402564035
125100	NC_018500	A	6	6	5207052	5207057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125101	NC_018500	ATT	2	6	5207060	5207065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125102	NC_018500	AAC	2	6	5207112	5207117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402564036
125103	NC_018500	GAA	2	6	5207135	5207140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402564036
125104	NC_018500	GGA	2	6	5207143	5207148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402564036
125105	NC_018500	ATT	2	6	5207150	5207155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402564036
125106	NC_018500	T	6	6	5207227	5207232	0 %	100 %	0 %	0 %	402564036
125107	NC_018500	GATT	2	8	5207233	5207240	25 %	50 %	25 %	0 %	402564036
125108	NC_018500	AAG	2	6	5207265	5207270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402564036
125109	NC_018500	GTC	2	6	5207280	5207285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402564036
125110	NC_018500	ATG	3	9	5207292	5207300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402564036
125111	NC_018500	AAC	2	6	5207368	5207373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402564036
125112	NC_018500	ATA	2	6	5207436	5207441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125113	NC_018500	AGGT	2	8	5207478	5207485	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125114	NC_018500	A	6	6	5207504	5207509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125115	NC_018500	TGTA	2	8	5207554	5207561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125116	NC_018500	A	6	6	5207593	5207598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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125118	NC_018500	A	6	6	5207641	5207646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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125380	NC_018500	GCA	2	6	5219327	5219332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402564057
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125470	NC_018500	TTA	2	6	5224193	5224198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402564059
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125499	NC_018500	GAT	2	6	5225941	5225946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402564060
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