MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p01

Total Repeats: 4139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018486	A	6	6	56	61	100 %	0 %	0 %	0 %	402558637
2	NC_018486	GTTT	2	8	100	107	0 %	75 %	25 %	0 %	402558637
3	NC_018486	AT	3	6	127	132	50 %	50 %	0 %	0 %	402558637
4	NC_018486	TAC	2	6	154	159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558637
5	NC_018486	ATC	2	6	161	166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558637
6	NC_018486	TGA	2	6	170	175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558637
7	NC_018486	GAT	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558637
8	NC_018486	AG	3	6	216	221	50 %	0 %	50 %	0 %	402558637
9	NC_018486	GAT	2	6	228	233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558637
10	NC_018486	A	6	6	309	314	100 %	0 %	0 %	0 %	402558637
11	NC_018486	GTAT	2	8	349	356	25 %	50 %	25 %	0 %	402558637
12	NC_018486	TAG	2	6	418	423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558637
13	NC_018486	AGA	2	6	440	445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558637
14	NC_018486	TGA	2	6	472	477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558637
15	NC_018486	CAT	2	6	494	499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558637
16	NC_018486	TAC	2	6	601	606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558637
17	NC_018486	GA	3	6	627	632	50 %	0 %	50 %	0 %	402558637
18	NC_018486	AAC	2	6	635	640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558637
19	NC_018486	A	6	6	681	686	100 %	0 %	0 %	0 %	402558637
20	NC_018486	AGA	2	6	791	796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558637
21	NC_018486	AAG	2	6	808	813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558637
22	NC_018486	GCT	2	6	876	881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558637
23	NC_018486	T	7	7	977	983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018486	T	6	6	987	992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018486	AAG	2	6	1012	1017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018486	TA	3	6	1022	1027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018486	AT	7	14	1048	1061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018486	TTA	2	6	1083	1088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018486	CAAC	2	8	1115	1122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018486	AAAT	2	8	1165	1172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018486	GAG	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018486	AAAT	3	12	1278	1289	75 %	25 %	0 %	0 %	402558638
33	NC_018486	ATG	2	6	1332	1337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558638
34	NC_018486	AAAG	2	8	1361	1368	75 %	0 %	25 %	0 %	402558638
35	NC_018486	ATT	2	6	1426	1431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558638
36	NC_018486	GAA	2	6	1469	1474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558638
37	NC_018486	ACA	2	6	1528	1533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558638
38	NC_018486	A	6	6	1533	1538	100 %	0 %	0 %	0 %	402558638
39	NC_018486	AT	3	6	1600	1605	50 %	50 %	0 %	0 %	402558638
40	NC_018486	A	8	8	1626	1633	100 %	0 %	0 %	0 %	402558638
41	NC_018486	T	7	7	1655	1661	0 %	100 %	0 %	0 %	402558638
42	NC_018486	AGA	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558638
43	NC_018486	GCT	2	6	1721	1726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558638
44	NC_018486	TAG	2	6	1743	1748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558638
45	NC_018486	GAAAA	2	10	1848	1857	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018486	GAA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018486	TAA	2	6	1929	1934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018486	T	6	6	1972	1977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018486	CTTT	2	8	1994	2001	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018486	TAATA	2	10	2016	2025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018486	ACTTA	2	10	2027	2036	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018486	ACC	2	6	2058	2063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_018486	GT	3	6	2069	2074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018486	TACT	2	8	2085	2092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018486	ATT	2	6	2119	2124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018486	TAATA	2	10	2130	2139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018486	A	6	6	2151	2156	100 %	0 %	0 %	0 %	402558639
58	NC_018486	AGA	2	6	2237	2242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558639
59	NC_018486	AATG	2	8	2243	2250	50 %	25 %	25 %	0 %	402558639
60	NC_018486	CAAATG	2	12	2280	2291	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402558639
61	NC_018486	TAA	2	6	2325	2330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558639
62	NC_018486	TAAA	2	8	2336	2343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018486	TATAA	2	10	2370	2379	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018486	TAA	2	6	2383	2388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018486	AATAA	2	10	2397	2406	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018486	A	6	6	2405	2410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018486	AGA	2	6	2431	2436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018486	CAA	2	6	2502	2507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018486	ACA	2	6	2558	2563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558640
70	NC_018486	TGG	2	6	2611	2616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558640
71	NC_018486	GTG	2	6	2625	2630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558640
72	NC_018486	A	6	6	2649	2654	100 %	0 %	0 %	0 %	402558640
73	NC_018486	GAA	2	6	2752	2757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558640
74	NC_018486	GCA	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558640
75	NC_018486	GCT	2	6	2840	2845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558640
76	NC_018486	ACA	2	6	2852	2857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558640
77	NC_018486	CTC	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_018486	GGA	2	6	2918	2923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018486	A	6	6	2970	2975	100 %	0 %	0 %	0 %	402558641
80	NC_018486	ATTT	2	8	3008	3015	25 %	75 %	0 %	0 %	402558641
81	NC_018486	GGC	2	6	3020	3025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402558641
82	NC_018486	TTTA	2	8	3036	3043	25 %	75 %	0 %	0 %	402558641
83	NC_018486	GGC	2	6	3060	3065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402558641
84	NC_018486	GTA	2	6	3086	3091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558641
85	NC_018486	T	6	6	3095	3100	0 %	100 %	0 %	0 %	402558641
86	NC_018486	GCGTTT	2	12	3143	3154	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	402558641
87	NC_018486	AT	3	6	3155	3160	50 %	50 %	0 %	0 %	402558641
88	NC_018486	ACA	2	6	3169	3174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558641
89	NC_018486	ATT	2	6	3197	3202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558641
90	NC_018486	AT	3	6	3293	3298	50 %	50 %	0 %	0 %	402558642
91	NC_018486	AATG	2	8	3340	3347	50 %	25 %	25 %	0 %	402558642
92	NC_018486	A	6	6	3371	3376	100 %	0 %	0 %	0 %	402558642
93	NC_018486	A	6	6	3379	3384	100 %	0 %	0 %	0 %	402558642
94	NC_018486	TAC	2	6	3406	3411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558642
95	NC_018486	GAAA	2	8	3423	3430	75 %	0 %	25 %	0 %	402558642
96	NC_018486	A	8	8	3434	3441	100 %	0 %	0 %	0 %	402558642
97	NC_018486	CTG	2	6	3447	3452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558642
98	NC_018486	TGA	2	6	3463	3468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558642
99	NC_018486	CTT	2	6	3481	3486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558642
100	NC_018486	AGA	2	6	3499	3504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558642
101	NC_018486	ATG	2	6	3540	3545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558642
102	NC_018486	TTAC	2	8	3586	3593	25 %	50 %	0 %	25 %	402558642
103	NC_018486	AAG	2	6	3609	3614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558642
104	NC_018486	TA	3	6	3669	3674	50 %	50 %	0 %	0 %	402558642
105	NC_018486	AAGT	2	8	3679	3686	50 %	25 %	25 %	0 %	402558642
106	NC_018486	AAG	2	6	3774	3779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558642
107	NC_018486	ATTTA	2	10	3837	3846	40 %	60 %	0 %	0 %	402558642
108	NC_018486	CTG	2	6	3876	3881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558642
109	NC_018486	GAA	2	6	3899	3904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558642
110	NC_018486	TCG	2	6	3937	3942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558642
111	NC_018486	CTA	2	6	3962	3967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558642
112	NC_018486	CGT	2	6	4040	4045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558642
113	NC_018486	TTGA	2	8	4073	4080	25 %	50 %	25 %	0 %	402558642
114	NC_018486	GAAA	2	8	4121	4128	75 %	0 %	25 %	0 %	402558642
115	NC_018486	GAA	2	6	4141	4146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558642
116	NC_018486	GAA	2	6	4157	4162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558642
117	NC_018486	AAC	2	6	4178	4183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558642
118	NC_018486	AAAAAG	2	12	4213	4224	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558643
119	NC_018486	GAAAA	2	10	4225	4234	80 %	0 %	20 %	0 %	402558643
120	NC_018486	AGA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558643
121	NC_018486	AGG	2	6	4271	4276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558643
122	NC_018486	GAA	2	6	4282	4287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558643
123	NC_018486	ACA	2	6	4318	4323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558643
124	NC_018486	AGA	2	6	4365	4370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558643
125	NC_018486	TTC	2	6	4408	4413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558643
126	NC_018486	ATG	2	6	4450	4455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558643
127	NC_018486	ATCT	2	8	4580	4587	25 %	50 %	0 %	25 %	402558643
128	NC_018486	AAT	2	6	4651	4656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558643
129	NC_018486	AAGA	2	8	4732	4739	75 %	0 %	25 %	0 %	402558643
130	NC_018486	CTA	2	6	4835	4840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558643
131	NC_018486	CGG	2	6	4944	4949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402558643
132	NC_018486	ATTC	2	8	4997	5004	25 %	50 %	0 %	25 %	402558643
133	NC_018486	TCC	2	6	5022	5027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	402558643
134	NC_018486	ACA	2	6	5033	5038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558643
135	NC_018486	ATT	2	6	5215	5220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558643
136	NC_018486	GAA	2	6	5269	5274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558643
137	NC_018486	AAGA	2	8	5299	5306	75 %	0 %	25 %	0 %	402558643
138	NC_018486	ATT	2	6	5389	5394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558643
139	NC_018486	AGA	2	6	5451	5456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558643
140	NC_018486	CTT	3	9	5501	5509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558643
141	NC_018486	TA	3	6	5510	5515	50 %	50 %	0 %	0 %	402558643
142	NC_018486	TGAAG	2	10	5520	5529	40 %	20 %	40 %	0 %	402558643
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260	NC_018486	ACA	2	6	10992	10997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558645
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265	NC_018486	TG	3	6	11143	11148	0 %	50 %	50 %	0 %	402558645
266	NC_018486	ATG	2	6	11277	11282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558645
267	NC_018486	AGA	2	6	11540	11545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558645
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269	NC_018486	CAG	2	6	11587	11592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558645
270	NC_018486	TCCGA	2	10	11598	11607	20 %	20 %	20 %	40 %	402558645
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272	NC_018486	GT	3	6	11690	11695	0 %	50 %	50 %	0 %	402558645
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