MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Blattabacterium sp. (Blaberus giganteus) plasmid pBGIBA

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017925	TA	3	6	3	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017925	T	7	7	36	42	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017925	GTGTG	2	10	63	72	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017925	A	6	6	175	180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017925	T	7	7	207	213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017925	AGT	2	6	238	243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017925	GTG	2	6	244	249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017925	GATAA	2	10	272	281	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017925	TAATA	2	10	282	291	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017925	ATA	4	12	286	297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017925	A	9	9	306	314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017925	CTTTTT	2	12	347	358	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017925	CTTTTT	2	12	362	373	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017925	GCTTTT	2	12	376	387	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017925	CTTTTT	2	12	392	403	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017925	TTC	2	6	417	422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017925	AAT	2	6	423	428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017925	T	8	8	428	435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017925	TTC	2	6	459	464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017925	GAAA	2	8	508	515	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017925	A	7	7	513	519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017925	AGT	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017925	AGG	3	9	540	548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017925	TAG	2	6	566	571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017925	T	6	6	581	586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017925	TTC	2	6	591	596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017925	TGG	2	6	597	602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017925	ATC	2	6	621	626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017925	ATG	2	6	632	637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017925	A	6	6	639	644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017925	CAT	2	6	645	650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017925	GATAA	2	10	652	661	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017925	A	9	9	660	668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017925	T	6	6	672	677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017925	T	8	8	691	698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017925	T	9	9	709	717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017925	ATT	2	6	723	728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017925	CATA	2	8	729	736	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017925	CAT	2	6	796	801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907364
40	NC_017925	AGC	2	6	828	833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387907364
41	NC_017925	ATT	3	9	868	876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387907364
42	NC_017925	GAAA	2	8	886	893	75 %	0 %	25 %	0 %	387907364
43	NC_017925	AAT	2	6	994	999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907364
44	NC_017925	GAG	2	6	1025	1030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387907364
45	NC_017925	ATA	2	6	1102	1107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907364
46	NC_017925	A	6	6	1143	1148	100 %	0 %	0 %	0 %	387907364
47	NC_017925	AAAT	2	8	1150	1157	75 %	25 %	0 %	0 %	387907364
48	NC_017925	AT	3	6	1204	1209	50 %	50 %	0 %	0 %	387907365
49	NC_017925	TA	3	6	1211	1216	50 %	50 %	0 %	0 %	387907365
50	NC_017925	T	6	6	1288	1293	0 %	100 %	0 %	0 %	387907365
51	NC_017925	AGA	2	6	1313	1318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387907365
52	NC_017925	AT	3	6	1326	1331	50 %	50 %	0 %	0 %	387907365
53	NC_017925	CTT	2	6	1339	1344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907365
54	NC_017925	T	10	10	1356	1365	0 %	100 %	0 %	0 %	387907365
55	NC_017925	T	6	6	1383	1388	0 %	100 %	0 %	0 %	387907365
56	NC_017925	AT	3	6	1389	1394	50 %	50 %	0 %	0 %	387907365
57	NC_017925	TAT	3	9	1409	1417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387907365
58	NC_017925	CAGAAA	2	12	1423	1434	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387907365
59	NC_017925	T	9	9	1447	1455	0 %	100 %	0 %	0 %	387907365
60	NC_017925	AAT	2	6	1483	1488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907365
61	NC_017925	ATT	2	6	1505	1510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387907365
62	NC_017925	T	8	8	1563	1570	0 %	100 %	0 %	0 %	387907365
63	NC_017925	A	6	6	1572	1577	100 %	0 %	0 %	0 %	387907365
64	NC_017925	CATT	2	8	1587	1594	25 %	50 %	0 %	25 %	387907365
65	NC_017925	CAT	2	6	1603	1608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907365
66	NC_017925	T	8	8	1651	1658	0 %	100 %	0 %	0 %	387907366
67	NC_017925	TA	3	6	1670	1675	50 %	50 %	0 %	0 %	387907366
68	NC_017925	AACA	2	8	1699	1706	75 %	0 %	0 %	25 %	387907366
69	NC_017925	AT	3	6	1732	1737	50 %	50 %	0 %	0 %	387907366
70	NC_017925	TAT	2	6	1739	1744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387907366
71	NC_017925	ATTT	2	8	1765	1772	25 %	75 %	0 %	0 %	387907366
72	NC_017925	T	7	7	1811	1817	0 %	100 %	0 %	0 %	387907366
73	NC_017925	AT	3	6	1831	1836	50 %	50 %	0 %	0 %	387907366
74	NC_017925	TCA	2	6	1858	1863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907366
75	NC_017925	TTC	2	6	1891	1896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907366
76	NC_017925	A	6	6	1921	1926	100 %	0 %	0 %	0 %	387907366
77	NC_017925	AAT	2	6	1948	1953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907366
78	NC_017925	GTT	2	6	1975	1980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907366
79	NC_017925	TTTTC	2	10	2012	2021	0 %	80 %	0 %	20 %	387907366
80	NC_017925	ATC	2	6	2049	2054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907367
81	NC_017925	TCTT	2	8	2094	2101	0 %	75 %	0 %	25 %	387907367
82	NC_017925	T	9	9	2125	2133	0 %	100 %	0 %	0 %	387907367
83	NC_017925	T	7	7	2143	2149	0 %	100 %	0 %	0 %	387907367
84	NC_017925	ATC	2	6	2150	2155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907367
85	NC_017925	CAAAA	2	10	2156	2165	80 %	0 %	0 %	20 %	387907367
86	NC_017925	A	7	7	2219	2225	100 %	0 %	0 %	0 %	387907367
87	NC_017925	TA	3	6	2252	2257	50 %	50 %	0 %	0 %	387907367
88	NC_017925	TTC	2	6	2363	2368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907367
89	NC_017925	TC	3	6	2367	2372	0 %	50 %	0 %	50 %	387907367
90	NC_017925	AATAAA	2	12	2411	2422	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387907367
91	NC_017925	T	6	6	2427	2432	0 %	100 %	0 %	0 %	387907367
92	NC_017925	TCCAT	2	10	2442	2451	20 %	40 %	0 %	40 %	387907367
93	NC_017925	AATA	2	8	2452	2459	75 %	25 %	0 %	0 %	387907367
94	NC_017925	T	6	6	2475	2480	0 %	100 %	0 %	0 %	387907367
95	NC_017925	CAT	2	6	2485	2490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907367
96	NC_017925	TTC	2	6	2492	2497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907367
97	NC_017925	A	6	6	2557	2562	100 %	0 %	0 %	0 %	387907367
98	NC_017925	TTG	2	6	2567	2572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907367
99	NC_017925	AAT	2	6	2610	2615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907367
100	NC_017925	AGA	2	6	2624	2629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387907367
101	NC_017925	CTG	2	6	2647	2652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387907367
102	NC_017925	CAG	2	6	2653	2658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387907367
103	NC_017925	TAT	2	6	2692	2697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387907367
104	NC_017925	TCT	2	6	2760	2765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907367
105	NC_017925	A	6	6	2766	2771	100 %	0 %	0 %	0 %	387907367
106	NC_017925	AATAAG	2	12	2806	2817	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387907367
107	NC_017925	CAT	2	6	2858	2863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907367
108	NC_017925	AAT	2	6	2908	2913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907367
109	NC_017925	AT	3	6	2950	2955	50 %	50 %	0 %	0 %	387907367
110	NC_017925	TTG	2	6	3050	3055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907367
111	NC_017925	TCT	3	9	3131	3139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017925	TCTA	2	8	3158	3165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017925	TAA	2	6	3170	3175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017925	A	6	6	3174	3179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017925	A	8	8	3198	3205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017925	ACAA	2	8	3208	3215	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017925	T	8	8	3234	3241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017925	A	7	7	3248	3254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017925	GTC	2	6	3274	3279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017925	C	7	7	3282	3288	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_017925	CG	5	10	3292	3301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017925	CATG	2	8	3302	3309	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017925	TGCG	2	8	3310	3317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017925	C	9	9	3340	3348	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_017925	AAT	2	6	3354	3359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017925	CTA	2	6	3391	3396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.