MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bi-07 chromosome

Total Repeats: 43429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_017867	CAT	2	6	1920852	1920857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823167
43002	NC_017867	CCG	2	6	1920913	1920918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43003	NC_017867	ACC	2	6	1920945	1920950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43004	NC_017867	AAT	2	6	1920981	1920986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823168
43005	NC_017867	GAA	2	6	1920996	1921001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823168
43006	NC_017867	TCG	2	6	1921080	1921085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823168
43007	NC_017867	CTGTTC	2	12	1921086	1921097	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387823168
43008	NC_017867	GGT	2	6	1921104	1921109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387823168
43009	NC_017867	GTG	2	6	1921152	1921157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387823168
43010	NC_017867	GCA	2	6	1921186	1921191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823168
43011	NC_017867	CG	3	6	1921225	1921230	0 %	0 %	50 %	50 %	387823168
43012	NC_017867	GTG	2	6	1921299	1921304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387823168
43013	NC_017867	CAC	2	6	1921343	1921348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823168
43014	NC_017867	GATG	2	8	1921421	1921428	25 %	25 %	50 %	0 %	387823168
43015	NC_017867	TGG	2	6	1921444	1921449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387823168
43016	NC_017867	AC	3	6	1921580	1921585	50 %	0 %	0 %	50 %	387823168
43017	NC_017867	CGCT	2	8	1921650	1921657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43018	NC_017867	CGG	2	6	1921659	1921664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43019	NC_017867	CGA	2	6	1921668	1921673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43020	NC_017867	GC	3	6	1921723	1921728	0 %	0 %	50 %	50 %	387823169
43021	NC_017867	CCA	2	6	1921835	1921840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823169
43022	NC_017867	TCG	2	6	1921876	1921881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823169
43023	NC_017867	TCC	2	6	1921912	1921917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387823169
43024	NC_017867	TCC	2	6	1921942	1921947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387823169
43025	NC_017867	CATC	2	8	1921952	1921959	25 %	25 %	0 %	50 %	387823169
43026	NC_017867	GTG	2	6	1921996	1922001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387823169
43027	NC_017867	GCG	2	6	1922061	1922066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387823169
43028	NC_017867	CGG	2	6	1922069	1922074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387823169
43029	NC_017867	CCA	2	6	1922144	1922149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823169
43030	NC_017867	TGG	2	6	1922152	1922157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387823169
43031	NC_017867	AGCGC	2	10	1922162	1922171	20 %	0 %	40 %	40 %	387823169
43032	NC_017867	CACC	2	8	1922198	1922205	25 %	0 %	0 %	75 %	387823169
43033	NC_017867	GTG	3	9	1922211	1922219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387823169
43034	NC_017867	GCC	2	6	1922284	1922289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387823169
43035	NC_017867	GCA	2	6	1922294	1922299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823169
43036	NC_017867	GGGC	2	8	1922309	1922316	0 %	0 %	75 %	25 %	387823169
43037	NC_017867	CG	3	6	1922349	1922354	0 %	0 %	50 %	50 %	387823169
43038	NC_017867	ATC	2	6	1922365	1922370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823169
43039	NC_017867	CCA	2	6	1922465	1922470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823169
43040	NC_017867	AGC	3	9	1922503	1922511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823169
43041	NC_017867	CGGT	2	8	1922557	1922564	0 %	25 %	50 %	25 %	387823169
43042	NC_017867	CGG	2	6	1922582	1922587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387823169
43043	NC_017867	CAT	2	6	1922637	1922642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823169
43044	NC_017867	TCG	2	6	1922656	1922661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823169
43045	NC_017867	GCA	2	6	1922690	1922695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823169
43046	NC_017867	TTG	2	6	1922701	1922706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387823169
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43049	NC_017867	GA	3	6	1922791	1922796	50 %	0 %	50 %	0 %	387823169
43050	NC_017867	GGT	2	6	1922868	1922873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387823169
43051	NC_017867	GC	3	6	1923000	1923005	0 %	0 %	50 %	50 %	387823169
43052	NC_017867	GCA	3	9	1923041	1923049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823169
43053	NC_017867	GCC	2	6	1923063	1923068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387823169
43054	NC_017867	CGC	2	6	1923146	1923151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387823169
43055	NC_017867	GCCC	2	8	1923165	1923172	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43056	NC_017867	GCG	2	6	1923221	1923226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43057	NC_017867	GCA	2	6	1923262	1923267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43058	NC_017867	GCAT	2	8	1923357	1923364	25 %	25 %	25 %	25 %	387823170
43059	NC_017867	CGA	2	6	1923397	1923402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823170
43060	NC_017867	ACC	2	6	1923452	1923457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823170
43061	NC_017867	CA	3	6	1923538	1923543	50 %	0 %	0 %	50 %	387823170
43062	NC_017867	CGG	2	6	1923564	1923569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387823170
43063	NC_017867	GC	3	6	1923647	1923652	0 %	0 %	50 %	50 %	387823170
43064	NC_017867	CGT	2	6	1923659	1923664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823170
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43067	NC_017867	ATG	2	6	1923710	1923715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823170
43068	NC_017867	ATG	2	6	1923839	1923844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823170
43069	NC_017867	GCG	2	6	1923850	1923855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387823170
43070	NC_017867	ACCG	2	8	1923860	1923867	25 %	0 %	25 %	50 %	387823170
43071	NC_017867	CTCG	2	8	1923883	1923890	0 %	25 %	25 %	50 %	387823170
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43084	NC_017867	CACCG	2	10	1924348	1924357	20 %	0 %	20 %	60 %	387823171
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43088	NC_017867	GCC	2	6	1924501	1924506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387823171
43089	NC_017867	TCC	2	6	1924558	1924563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387823171
43090	NC_017867	AAC	2	6	1924591	1924596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823171
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43093	NC_017867	GAG	2	6	1924792	1924797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387823171
43094	NC_017867	GC	3	6	1924862	1924867	0 %	0 %	50 %	50 %	387823171
43095	NC_017867	CGA	2	6	1924983	1924988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823171
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43101	NC_017867	CCG	2	6	1925444	1925449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387823171
43102	NC_017867	GGC	2	6	1925529	1925534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387823171
43103	NC_017867	AGG	2	6	1925552	1925557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387823171
43104	NC_017867	CCG	2	6	1925576	1925581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387823171
43105	NC_017867	CTG	2	6	1925650	1925655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823171
43106	NC_017867	CGC	2	6	1925691	1925696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387823171
43107	NC_017867	AGG	2	6	1925714	1925719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387823171
43108	NC_017867	GCG	2	6	1925777	1925782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387823171
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43111	NC_017867	ACA	2	6	1925836	1925841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823171
43112	NC_017867	CA	3	6	1925872	1925877	50 %	0 %	0 %	50 %	387823171
43113	NC_017867	TGC	2	6	1925909	1925914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823171
43114	NC_017867	GCA	2	6	1925924	1925929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823171
43115	NC_017867	CGGG	2	8	1925933	1925940	0 %	0 %	75 %	25 %	387823171
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43117	NC_017867	CGA	2	6	1926003	1926008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823171
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.