MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017820	ATA	2	6	40	45	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017820	T	6	6	46	51	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017820	AAC	2	6	64	69	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017820	TAATA	2	10	81	90	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017820	TTC	2	6	115	120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017820	TA	5	10	203	212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017820	AT	3	6	220	225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017820	AAAAT	2	10	237	246	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017820	TAT	2	6	294	299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860120
10	NC_017820	CTC	2	6	320	325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386860120
11	NC_017820	TAA	2	6	343	348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860120
12	NC_017820	T	8	8	384	391	0 %	100 %	0 %	0 %	386860120
13	NC_017820	GCT	2	6	498	503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386860120
14	NC_017820	TCT	2	6	525	530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860120
15	NC_017820	CTT	2	6	588	593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860120
16	NC_017820	A	6	6	612	617	100 %	0 %	0 %	0 %	386860120
17	NC_017820	T	6	6	653	658	0 %	100 %	0 %	0 %	386860120
18	NC_017820	TTA	2	6	696	701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860120
19	NC_017820	TTC	2	6	721	726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860120
20	NC_017820	CAT	2	6	766	771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860120
21	NC_017820	CCAT	2	8	795	802	25 %	25 %	0 %	50 %	386860120
22	NC_017820	TCTT	2	8	822	829	0 %	75 %	0 %	25 %	386860120
23	NC_017820	ATT	2	6	830	835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860120
24	NC_017820	T	6	6	834	839	0 %	100 %	0 %	0 %	386860120
25	NC_017820	T	6	6	844	849	0 %	100 %	0 %	0 %	386860120
26	NC_017820	CCT	2	6	850	855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017820	T	6	6	867	872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017820	AT	3	6	943	948	50 %	50 %	0 %	0 %	386860121
29	NC_017820	ATTA	2	8	976	983	50 %	50 %	0 %	0 %	386860121
30	NC_017820	TTAA	2	8	1019	1026	50 %	50 %	0 %	0 %	386860121
31	NC_017820	T	6	6	1036	1041	0 %	100 %	0 %	0 %	386860121
32	NC_017820	AAT	3	9	1043	1051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860121
33	NC_017820	TCT	2	6	1052	1057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860121
34	NC_017820	T	6	6	1079	1084	0 %	100 %	0 %	0 %	386860121
35	NC_017820	TAT	2	6	1099	1104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860121
36	NC_017820	T	6	6	1116	1121	0 %	100 %	0 %	0 %	386860121
37	NC_017820	TTC	2	6	1139	1144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860122
38	NC_017820	TA	3	6	1234	1239	50 %	50 %	0 %	0 %	386860122
39	NC_017820	A	6	6	1242	1247	100 %	0 %	0 %	0 %	386860122
40	NC_017820	AGG	2	6	1256	1261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386860122
41	NC_017820	AAC	2	6	1323	1328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386860122
42	NC_017820	TC	3	6	1340	1345	0 %	50 %	0 %	50 %	386860122
43	NC_017820	TCT	2	6	1347	1352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860122
44	NC_017820	TATT	2	8	1402	1409	25 %	75 %	0 %	0 %	386860122
45	NC_017820	TTA	2	6	1410	1415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860122
46	NC_017820	ATA	2	6	1457	1462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860122
47	NC_017820	T	8	8	1480	1487	0 %	100 %	0 %	0 %	386860122
48	NC_017820	ATCA	2	8	1532	1539	50 %	25 %	0 %	25 %	386860122
49	NC_017820	T	6	6	1547	1552	0 %	100 %	0 %	0 %	386860122
50	NC_017820	AAT	2	6	1580	1585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860122
51	NC_017820	ATT	2	6	1632	1637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860122
52	NC_017820	CTT	2	6	1707	1712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860123
53	NC_017820	A	7	7	1730	1736	100 %	0 %	0 %	0 %	386860123
54	NC_017820	TTA	2	6	1742	1747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860123
55	NC_017820	TTTG	2	8	1754	1761	0 %	75 %	25 %	0 %	386860123
56	NC_017820	TCTT	2	8	1769	1776	0 %	75 %	0 %	25 %	386860123
57	NC_017820	ATA	2	6	1783	1788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860123
58	NC_017820	A	6	6	1806	1811	100 %	0 %	0 %	0 %	386860123
59	NC_017820	TA	3	6	1837	1842	50 %	50 %	0 %	0 %	386860123
60	NC_017820	ACA	2	6	1898	1903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386860123
61	NC_017820	T	6	6	1904	1909	0 %	100 %	0 %	0 %	386860123
62	NC_017820	TCT	2	6	1915	1920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860123
63	NC_017820	ATA	2	6	1927	1932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860123
64	NC_017820	TAA	2	6	1957	1962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860123
65	NC_017820	AAT	2	6	2011	2016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860123
66	NC_017820	TTC	2	6	2032	2037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860123
67	NC_017820	TAT	2	6	2094	2099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860123
68	NC_017820	T	8	8	2099	2106	0 %	100 %	0 %	0 %	386860123
69	NC_017820	A	7	7	2119	2125	100 %	0 %	0 %	0 %	386860123
70	NC_017820	T	7	7	2132	2138	0 %	100 %	0 %	0 %	386860123
71	NC_017820	T	6	6	2160	2165	0 %	100 %	0 %	0 %	386860123
72	NC_017820	T	8	8	2176	2183	0 %	100 %	0 %	0 %	386860123
73	NC_017820	TCT	2	6	2191	2196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860123
74	NC_017820	T	6	6	2232	2237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017820	TTC	2	6	2277	2282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860124
76	NC_017820	TCT	2	6	2337	2342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860124
77	NC_017820	T	6	6	2382	2387	0 %	100 %	0 %	0 %	386860124
78	NC_017820	TTTC	2	8	2411	2418	0 %	75 %	0 %	25 %	386860124
79	NC_017820	T	6	6	2426	2431	0 %	100 %	0 %	0 %	386860124
80	NC_017820	CTT	2	6	2434	2439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860124
81	NC_017820	T	6	6	2438	2443	0 %	100 %	0 %	0 %	386860124
82	NC_017820	T	8	8	2445	2452	0 %	100 %	0 %	0 %	386860124
83	NC_017820	ATT	2	6	2453	2458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860124
84	NC_017820	T	7	7	2461	2467	0 %	100 %	0 %	0 %	386860124
85	NC_017820	ATT	2	6	2468	2473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860124
86	NC_017820	TAT	2	6	2479	2484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860124
87	NC_017820	T	6	6	2535	2540	0 %	100 %	0 %	0 %	386860124
88	NC_017820	TGT	2	6	2553	2558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386860124
89	NC_017820	TTGCAT	2	12	2581	2592	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386860124
90	NC_017820	TTGT	2	8	2609	2616	0 %	75 %	25 %	0 %	386860124
91	NC_017820	TATT	2	8	2649	2656	25 %	75 %	0 %	0 %	386860124
92	NC_017820	TA	3	6	2669	2674	50 %	50 %	0 %	0 %	386860124
93	NC_017820	TAA	2	6	2699	2704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860124
94	NC_017820	T	7	7	2707	2713	0 %	100 %	0 %	0 %	386860124
95	NC_017820	AAT	2	6	2714	2719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860124
96	NC_017820	TTA	2	6	2724	2729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860124
97	NC_017820	ATT	2	6	2769	2774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860124
98	NC_017820	TGT	2	6	2887	2892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386860124
99	NC_017820	GA	3	6	2913	2918	50 %	0 %	50 %	0 %	386860124
100	NC_017820	ATT	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860124
101	NC_017820	A	6	6	3024	3029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017820	T	8	8	3031	3038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017820	A	6	6	3064	3069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017820	ATT	2	6	3079	3084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017820	TA	3	6	3090	3095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017820	TA	3	6	3097	3102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017820	TAA	2	6	3104	3109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017820	ATA	2	6	3142	3147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860125
109	NC_017820	TAA	2	6	3158	3163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860125
110	NC_017820	A	7	7	3170	3176	100 %	0 %	0 %	0 %	386860125
111	NC_017820	CAA	2	6	3183	3188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386860125

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.