MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017815	ATT	2	6	6	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017815	TA	3	6	58	63	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017815	AAAT	2	8	68	75	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017815	A	7	7	83	89	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017815	A	7	7	106	112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017815	ATT	2	6	120	125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017815	ATA	2	6	133	138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017815	ATA	2	6	161	166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017815	ATA	2	6	228	233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017815	TAA	2	6	278	283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017815	TAAA	2	8	302	309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017815	ATT	2	6	335	340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017815	T	6	6	339	344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017815	AAT	2	6	345	350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017815	CAA	2	6	352	357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017815	ATT	2	6	359	364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017815	A	6	6	374	379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017815	CAT	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017815	CTT	2	6	456	461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017815	T	6	6	488	493	0 %	100 %	0 %	0 %	386860092
21	NC_017815	ACG	2	6	546	551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386860092
22	NC_017815	T	8	8	563	570	0 %	100 %	0 %	0 %	386860092
23	NC_017815	T	6	6	638	643	0 %	100 %	0 %	0 %	386860092
24	NC_017815	ATT	2	6	655	660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860092
25	NC_017815	A	7	7	668	674	100 %	0 %	0 %	0 %	386860092
26	NC_017815	A	7	7	704	710	100 %	0 %	0 %	0 %	386860092
27	NC_017815	TAT	2	6	879	884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860092
28	NC_017815	AT	3	6	883	888	50 %	50 %	0 %	0 %	386860092
29	NC_017815	T	6	6	968	973	0 %	100 %	0 %	0 %	386860092
30	NC_017815	TTTC	2	8	975	982	0 %	75 %	0 %	25 %	386860092
31	NC_017815	TTTATT	2	12	1001	1012	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386860092
32	NC_017815	TAAT	2	8	1023	1030	50 %	50 %	0 %	0 %	386860092
33	NC_017815	TA	3	6	1172	1177	50 %	50 %	0 %	0 %	386860093
34	NC_017815	TCT	2	6	1227	1232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860093
35	NC_017815	TGT	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386860093
36	NC_017815	TAA	2	6	1280	1285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860093
37	NC_017815	ATTTA	2	10	1346	1355	40 %	60 %	0 %	0 %	386860093
38	NC_017815	A	6	6	1361	1366	100 %	0 %	0 %	0 %	386860093
39	NC_017815	AAT	2	6	1371	1376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860093
40	NC_017815	CT	3	6	1383	1388	0 %	50 %	0 %	50 %	386860093
41	NC_017815	CTG	2	6	1402	1407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386860093
42	NC_017815	TAA	2	6	1432	1437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860093
43	NC_017815	T	6	6	1524	1529	0 %	100 %	0 %	0 %	386860093
44	NC_017815	TTC	2	6	1556	1561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860093
45	NC_017815	AATG	2	8	1566	1573	50 %	25 %	25 %	0 %	386860093
46	NC_017815	TAA	2	6	1592	1597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860093
47	NC_017815	CAT	2	6	1627	1632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860093
48	NC_017815	TTA	2	6	1633	1638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860093
49	NC_017815	AT	4	8	1661	1668	50 %	50 %	0 %	0 %	386860093
50	NC_017815	T	7	7	1668	1674	0 %	100 %	0 %	0 %	386860093
51	NC_017815	CAAAT	2	10	1679	1688	60 %	20 %	0 %	20 %	386860093
52	NC_017815	TCT	2	6	1692	1697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860093
53	NC_017815	T	7	7	1702	1708	0 %	100 %	0 %	0 %	386860093
54	NC_017815	ATA	2	6	1774	1779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860093
55	NC_017815	TAT	2	6	1790	1795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860093
56	NC_017815	TTA	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860093
57	NC_017815	T	6	6	1853	1858	0 %	100 %	0 %	0 %	386860093
58	NC_017815	TTTC	2	8	1894	1901	0 %	75 %	0 %	25 %	386860094
59	NC_017815	T	6	6	1981	1986	0 %	100 %	0 %	0 %	386860094
60	NC_017815	TAC	2	6	2022	2027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860094
61	NC_017815	T	6	6	2029	2034	0 %	100 %	0 %	0 %	386860094
62	NC_017815	TTC	2	6	2092	2097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860094
63	NC_017815	ATA	2	6	2137	2142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860094
64	NC_017815	CTT	2	6	2163	2168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860094
65	NC_017815	A	6	6	2175	2180	100 %	0 %	0 %	0 %	386860094
66	NC_017815	TTC	2	6	2200	2205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860094
67	NC_017815	A	7	7	2230	2236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017815	N	947	947	2278	3224	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017815	CAA	2	6	3228	3233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017815	CTT	2	6	3245	3250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017815	AAG	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017815	AGA	2	6	3278	3283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017815	TTTG	2	8	3303	3310	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017815	GATTT	2	10	3336	3345	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017815	TCT	2	6	3355	3360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017815	TTTTTA	2	12	3361	3372	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017815	TATT	2	8	3376	3383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017815	TTA	2	6	3418	3423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017815	T	6	6	3464	3469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017815	T	7	7	3471	3477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017815	TATT	2	8	3491	3498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017815	T	6	6	3513	3518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017815	ATA	2	6	3534	3539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017815	ATA	2	6	3573	3578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017815	TAG	2	6	3638	3643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017815	TTTC	2	8	3644	3651	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017815	TAA	2	6	3682	3687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017815	TTG	2	6	3737	3742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017815	TATT	2	8	3769	3776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017815	TTA	2	6	3796	3801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017815	TTA	2	6	3840	3845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017815	TAA	3	9	3850	3858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017815	ATT	2	6	3863	3868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017815	TAA	2	6	3871	3876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017815	A	6	6	3894	3899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017815	ATT	2	6	3905	3910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017815	TA	4	8	3913	3920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017815	ATA	2	6	3927	3932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017815	ATT	3	9	3960	3968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017815	ATT	2	6	3977	3982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017815	TA	3	6	3986	3991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017815	A	6	6	4018	4023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.