MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017811	ATT	2	6	1	6	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858812
2	NC_017811	TGT	2	6	13	18	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858812
3	NC_017811	ATT	2	6	43	48	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858812
4	NC_017811	TA	3	6	89	94	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017811	AATA	2	8	95	102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017811	AATT	2	8	113	120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017811	TA	3	6	130	135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017811	ATT	2	6	149	154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017811	A	7	7	191	197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017811	CTT	2	6	215	220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017811	TTA	2	6	230	235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017811	ACC	2	6	259	264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017811	CAA	2	6	299	304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017811	TAC	3	9	305	313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017811	ATA	2	6	317	322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017811	TAA	2	6	329	334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017811	AT	4	8	352	359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017811	AAT	2	6	442	447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858813
19	NC_017811	A	6	6	457	462	100 %	0 %	0 %	0 %	386858813
20	NC_017811	TTTTG	2	10	541	550	0 %	80 %	20 %	0 %	386858813
21	NC_017811	T	6	6	553	558	0 %	100 %	0 %	0 %	386858813
22	NC_017811	T	6	6	610	615	0 %	100 %	0 %	0 %	386858813
23	NC_017811	TTC	3	9	624	632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858813
24	NC_017811	CTT	2	6	641	646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858813
25	NC_017811	T	6	6	807	812	0 %	100 %	0 %	0 %	386858813
26	NC_017811	AATT	2	8	815	822	50 %	50 %	0 %	0 %	386858813
27	NC_017811	TCA	2	6	862	867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858813
28	NC_017811	TAA	2	6	869	874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858813
29	NC_017811	ATT	2	6	952	957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017811	TAA	2	6	991	996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858814
31	NC_017811	T	6	6	1002	1007	0 %	100 %	0 %	0 %	386858814
32	NC_017811	A	8	8	1008	1015	100 %	0 %	0 %	0 %	386858814
33	NC_017811	TA	3	6	1041	1046	50 %	50 %	0 %	0 %	386858814
34	NC_017811	TCAAA	2	10	1055	1064	60 %	20 %	0 %	20 %	386858814
35	NC_017811	TAT	2	6	1067	1072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858814
36	NC_017811	TTC	2	6	1082	1087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858814
37	NC_017811	TCT	2	6	1096	1101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858814
38	NC_017811	T	7	7	1134	1140	0 %	100 %	0 %	0 %	386858814
39	NC_017811	TTC	2	6	1171	1176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858814
40	NC_017811	TTA	3	9	1187	1195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858814
41	NC_017811	AATTTT	2	12	1213	1224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858814
42	NC_017811	T	7	7	1221	1227	0 %	100 %	0 %	0 %	386858814
43	NC_017811	A	7	7	1230	1236	100 %	0 %	0 %	0 %	386858814
44	NC_017811	ATT	2	6	1285	1290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858814
45	NC_017811	TA	3	6	1356	1361	50 %	50 %	0 %	0 %	386858814
46	NC_017811	TCA	2	6	1426	1431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858814
47	NC_017811	ATA	2	6	1489	1494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858814
48	NC_017811	T	6	6	1571	1576	0 %	100 %	0 %	0 %	386858814
49	NC_017811	TAG	2	6	1589	1594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858814
50	NC_017811	TAA	2	6	1644	1649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858814
51	NC_017811	T	9	9	1722	1730	0 %	100 %	0 %	0 %	386858814
52	NC_017811	CCT	2	6	1749	1754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858815
53	NC_017811	T	6	6	1763	1768	0 %	100 %	0 %	0 %	386858815
54	NC_017811	TTCCT	2	10	1894	1903	0 %	60 %	0 %	40 %	386858815
55	NC_017811	TAA	2	6	1920	1925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858815
56	NC_017811	A	8	8	1933	1940	100 %	0 %	0 %	0 %	386858815
57	NC_017811	ATT	2	6	1950	1955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858815
58	NC_017811	TTC	2	6	1961	1966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858815
59	NC_017811	T	7	7	1970	1976	0 %	100 %	0 %	0 %	386858815
60	NC_017811	ATA	2	6	1977	1982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858815
61	NC_017811	GTC	2	6	2027	2032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858815
62	NC_017811	AAAT	2	8	2045	2052	75 %	25 %	0 %	0 %	386858815
63	NC_017811	T	9	9	2065	2073	0 %	100 %	0 %	0 %	386858815
64	NC_017811	A	6	6	2099	2104	100 %	0 %	0 %	0 %	386858815
65	NC_017811	TCAT	2	8	2145	2152	25 %	50 %	0 %	25 %	386858815
66	NC_017811	TCT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858815
67	NC_017811	TAA	2	6	2197	2202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858815
68	NC_017811	T	6	6	2226	2231	0 %	100 %	0 %	0 %	386858815
69	NC_017811	CAA	2	6	2275	2280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017811	CTC	2	6	2291	2296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017811	N	1290	1290	2320	3609	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017811	TTCTCT	2	12	3619	3630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017811	TCT	2	6	3638	3643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017811	TTC	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017811	T	6	6	3662	3667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017811	TGT	2	6	3682	3687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017811	AG	3	6	3703	3708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017811	ATC	2	6	3715	3720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017811	T	6	6	3734	3739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017811	TCTT	2	8	3766	3773	0 %	75 %	0 %	25 %	386858816
81	NC_017811	T	7	7	3772	3778	0 %	100 %	0 %	0 %	386858816
82	NC_017811	TTCT	2	8	3783	3790	0 %	75 %	0 %	25 %	386858816
83	NC_017811	TCT	3	9	3788	3796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858816
84	NC_017811	TAT	2	6	3800	3805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858816
85	NC_017811	TTA	3	9	3808	3816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858816
86	NC_017811	TAT	3	9	3818	3826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858816
87	NC_017811	ATT	2	6	3873	3878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858816
88	NC_017811	TGTT	2	8	3885	3892	0 %	75 %	25 %	0 %	386858816
89	NC_017811	GTT	2	6	3911	3916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858816
90	NC_017811	TCT	2	6	3925	3930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858816
91	NC_017811	T	6	6	3930	3935	0 %	100 %	0 %	0 %	386858816
92	NC_017811	T	6	6	3972	3977	0 %	100 %	0 %	0 %	386858816
93	NC_017811	TC	3	6	4016	4021	0 %	50 %	0 %	50 %	386858816
94	NC_017811	T	8	8	4104	4111	0 %	100 %	0 %	0 %	386858816
95	NC_017811	TTG	2	6	4117	4122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858816
96	NC_017811	TTA	3	9	4129	4137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858816

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.