MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017810	TCC	2	6	1	6	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858955
2	NC_017810	CAT	2	6	14	19	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858955
3	NC_017810	CTC	3	9	43	51	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858955
4	NC_017810	CAC	2	6	94	99	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858955
5	NC_017810	CAT	2	6	106	111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858955
6	NC_017810	TGT	2	6	149	154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858955
7	NC_017810	ATA	2	6	166	171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858955
8	NC_017810	AGTT	2	8	328	335	25 %	50 %	25 %	0 %	386858955
9	NC_017810	TGCTGG	3	18	395	412	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386858955
10	NC_017810	TGC	2	6	425	430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858955
11	NC_017810	TAA	2	6	431	436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858955
12	NC_017810	A	6	6	510	515	100 %	0 %	0 %	0 %	386858955
13	NC_017810	TGG	2	6	539	544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858955
14	NC_017810	CTG	2	6	559	564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858955
15	NC_017810	TTG	2	6	568	573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858955
16	NC_017810	TGC	3	9	584	592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858955
17	NC_017810	TGAT	2	8	655	662	25 %	50 %	25 %	0 %	386858955
18	NC_017810	TAA	2	6	710	715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858955
19	NC_017810	TACTGG	2	12	734	745	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386858955
20	NC_017810	AGC	3	9	782	790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858955
21	NC_017810	TGC	2	6	833	838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858955
22	NC_017810	AGC	2	6	860	865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858955
23	NC_017810	TAA	2	6	907	912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858955
24	NC_017810	AGTA	2	8	923	930	50 %	25 %	25 %	0 %	386858955
25	NC_017810	GTG	2	6	982	987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858955
26	NC_017810	TGT	2	6	1022	1027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858955
27	NC_017810	TAAA	2	8	1031	1038	75 %	25 %	0 %	0 %	386858955
28	NC_017810	TAA	2	6	1053	1058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017810	CTT	2	6	1076	1081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017810	AG	4	8	1098	1105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017810	TA	3	6	1135	1140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017810	TAT	2	6	1165	1170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017810	T	7	7	1213	1219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017810	ATA	2	6	1227	1232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017810	AG	3	6	1257	1262	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017810	ATA	2	6	1263	1268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017810	CAG	3	9	1290	1298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017810	AT	3	6	1332	1337	50 %	50 %	0 %	0 %	386858956
39	NC_017810	TAA	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858956
40	NC_017810	TGC	3	9	1402	1410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858956
41	NC_017810	ACT	2	6	1457	1462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858956
42	NC_017810	AAAG	2	8	1471	1478	75 %	0 %	25 %	0 %	386858956
43	NC_017810	AGC	2	6	1489	1494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858956
44	NC_017810	GAT	2	6	1544	1549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858956
45	NC_017810	AGC	2	6	1585	1590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858956
46	NC_017810	AGTA	2	8	1600	1607	50 %	25 %	25 %	0 %	386858956
47	NC_017810	TGA	2	6	1648	1653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858956
48	NC_017810	G	6	6	1681	1686	0 %	0 %	100 %	0 %	386858956
49	NC_017810	AGTT	2	8	1774	1781	25 %	50 %	25 %	0 %	386858957
50	NC_017810	CT	3	6	1798	1803	0 %	50 %	0 %	50 %	386858957
51	NC_017810	T	6	6	1803	1808	0 %	100 %	0 %	0 %	386858957
52	NC_017810	TA	3	6	1819	1824	50 %	50 %	0 %	0 %	386858957
53	NC_017810	T	6	6	1841	1846	0 %	100 %	0 %	0 %	386858957
54	NC_017810	A	7	7	1874	1880	100 %	0 %	0 %	0 %	386858957
55	NC_017810	ATA	2	6	1884	1889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858957
56	NC_017810	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858957
57	NC_017810	AGG	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858957
58	NC_017810	ATA	2	6	1924	1929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858957
59	NC_017810	GAGAA	2	10	1932	1941	60 %	0 %	40 %	0 %	386858957
60	NC_017810	AGGAG	2	10	1966	1975	40 %	0 %	60 %	0 %	386858957
61	NC_017810	AG	3	6	1974	1979	50 %	0 %	50 %	0 %	386858957
62	NC_017810	AG	3	6	1982	1987	50 %	0 %	50 %	0 %	386858957
63	NC_017810	GAA	2	6	1991	1996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858957
64	NC_017810	CAA	2	6	2017	2022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858957
65	NC_017810	A	6	6	2064	2069	100 %	0 %	0 %	0 %	386858957
66	NC_017810	TTC	2	6	2073	2078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858957
67	NC_017810	CTC	2	6	2101	2106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858957
68	NC_017810	CAT	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858957
69	NC_017810	CACCAT	2	12	2144	2155	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386858957
70	NC_017810	TC	3	6	2188	2193	0 %	50 %	0 %	50 %	386858957
71	NC_017810	CT	3	6	2194	2199	0 %	50 %	0 %	50 %	386858957
72	NC_017810	CT	4	8	2203	2210	0 %	50 %	0 %	50 %	386858957
73	NC_017810	TC	3	6	2214	2219	0 %	50 %	0 %	50 %	386858957
74	NC_017810	CT	4	8	2234	2241	0 %	50 %	0 %	50 %	386858957
75	NC_017810	CCT	2	6	2254	2259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017810	T	6	6	2270	2275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017810	CTTTT	2	10	2280	2289	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017810	CA	4	8	2297	2304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017810	A	6	6	2304	2309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017810	CAA	2	6	2328	2333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017810	TGAA	2	8	2348	2355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017810	ATTTT	2	10	2365	2374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017810	AT	3	6	2470	2475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017810	AT	3	6	2477	2482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017810	ATG	2	6	2499	2504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017810	CA	3	6	2525	2530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017810	GTAA	2	8	2546	2553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017810	T	8	8	2566	2573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017810	TCTT	2	8	2583	2590	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017810	A	6	6	2591	2596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017810	AT	3	6	2652	2657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017810	AAC	2	6	2671	2676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017810	TAAA	2	8	2682	2689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017810	ATTT	2	8	2710	2717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017810	TTA	2	6	2724	2729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017810	ATTT	2	8	2742	2749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017810	AGT	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017810	TAG	2	6	2779	2784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017810	ATTT	2	8	2846	2853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017810	ATT	2	6	2870	2875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858958
101	NC_017810	CTG	2	6	2914	2919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858958
102	NC_017810	AGC	3	9	2945	2953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858958
103	NC_017810	TGC	3	9	2993	3001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858958
104	NC_017810	TTA	2	6	3030	3035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858958
105	NC_017810	TAG	2	6	3046	3051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858958
106	NC_017810	ATT	3	9	3068	3076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858958
107	NC_017810	CAA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858958
108	NC_017810	ATCA	2	8	3116	3123	50 %	25 %	0 %	25 %	386858958
109	NC_017810	AGC	2	6	3167	3172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017810	GCA	2	6	3186	3191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017810	CAG	2	6	3205	3210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017810	ACC	2	6	3244	3249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858959
113	NC_017810	TAATCT	2	12	3300	3311	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386858959
114	NC_017810	CAG	2	6	3342	3347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858959
115	NC_017810	GCA	5	15	3353	3367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858959
116	NC_017810	CAA	2	6	3390	3395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858959
117	NC_017810	CAA	2	6	3399	3404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858959
118	NC_017810	AAT	2	6	3433	3438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858959
119	NC_017810	TAA	2	6	3453	3458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858959
120	NC_017810	AGA	2	6	3493	3498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858959
121	NC_017810	TC	3	6	3583	3588	0 %	50 %	0 %	50 %	386858959
122	NC_017810	ATC	2	6	3589	3594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858959
123	NC_017810	TCC	2	6	3622	3627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858959
124	NC_017810	AAG	2	6	3642	3647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858959
125	NC_017810	ATTC	2	8	3663	3670	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017810	AAT	2	6	3679	3684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017810	CT	3	6	3715	3720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017810	TCT	3	9	3718	3726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017810	CAC	2	6	3740	3745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017810	CAT	2	6	3756	3761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017810	CAC	2	6	3762	3767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017810	AAT	2	6	3771	3776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017810	CT	3	6	3800	3805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017810	T	7	7	3829	3835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017810	T	8	8	3858	3865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017810	TTA	2	6	3868	3873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017810	A	6	6	3901	3906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017810	ATGA	2	8	3938	3945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017810	CA	3	6	3953	3958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017810	ATA	2	6	3959	3964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017810	A	6	6	3978	3983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017810	AAG	2	6	3994	3999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017810	ATT	2	6	4012	4017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017810	TAAT	2	8	4023	4030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017810	ATTAT	2	10	4035	4044	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017810	TATT	2	8	4056	4063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017810	ATT	2	6	4088	4093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858960
148	NC_017810	TCT	2	6	4129	4134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858960
149	NC_017810	T	6	6	4165	4170	0 %	100 %	0 %	0 %	386858960
150	NC_017810	TAT	2	6	4200	4205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858960
151	NC_017810	ATC	2	6	4269	4274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858960
152	NC_017810	ATT	2	6	4275	4280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858960
153	NC_017810	ATCTTT	2	12	4341	4352	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386858960
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155	NC_017810	T	6	6	4380	4385	0 %	100 %	0 %	0 %	386858960
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163	NC_017810	CAG	3	9	4538	4546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858960
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167	NC_017810	TAA	2	6	4658	4663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858960
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171	NC_017810	AAAT	2	8	4790	4797	75 %	25 %	0 %	0 %	386858960
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176	NC_017810	TTC	2	6	5102	5107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858960

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.