MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema chromosome

Total Repeats: 26302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017808	TTAC	2	8	25	32	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017808	CAT	3	9	34	42	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017808	TTA	2	6	58	63	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017808	TGA	2	6	80	85	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017808	TAA	2	6	114	119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017808	TAA	2	6	144	149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017808	ACA	2	6	172	177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017808	CTAT	2	8	188	195	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017808	TA	3	6	198	203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017808	ATT	2	6	214	219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017808	TTA	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017808	ATA	3	9	248	256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017808	A	7	7	256	262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017808	A	6	6	271	276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017808	ACTGT	2	10	307	316	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017808	AATT	2	8	365	372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017808	AATT	2	8	406	413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017808	TTA	2	6	420	425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017808	ATA	2	6	432	437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017808	AAT	2	6	458	463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017808	ATAA	2	8	472	479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017808	TTTTAC	2	12	498	509	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386859227
23	NC_017808	AAT	2	6	512	517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859227
24	NC_017808	TCA	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859227
25	NC_017808	TAT	2	6	581	586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859227
26	NC_017808	ATA	2	6	626	631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859227
27	NC_017808	ATC	2	6	713	718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859228
28	NC_017808	ACC	3	9	719	727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859228
29	NC_017808	CTC	2	6	778	783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859228
30	NC_017808	GAT	2	6	808	813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859228
31	NC_017808	ACT	2	6	830	835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859228
32	NC_017808	TTG	2	6	891	896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859228
33	NC_017808	CA	3	6	902	907	50 %	0 %	0 %	50 %	386859228
34	NC_017808	ATT	2	6	920	925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859228
35	NC_017808	T	6	6	924	929	0 %	100 %	0 %	0 %	386859228
36	NC_017808	TCT	2	6	959	964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859228
37	NC_017808	TTC	2	6	988	993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017808	T	9	9	1015	1023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017808	T	6	6	1035	1040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017808	A	7	7	1110	1116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017808	TA	3	6	1145	1150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017808	A	7	7	1152	1158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017808	CAT	2	6	1166	1171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017808	CAA	2	6	1180	1185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017808	ATT	2	6	1198	1203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017808	ATC	2	6	1226	1231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017808	TTA	2	6	1234	1239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017808	AGCA	2	8	1268	1275	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017808	CAATC	2	10	1338	1347	40 %	20 %	0 %	40 %	386859229
50	NC_017808	TCT	2	6	1372	1377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859229
51	NC_017808	TTC	2	6	1453	1458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017808	T	6	6	1496	1501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017808	CAG	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017808	CTT	2	6	1609	1614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859230
55	NC_017808	CTGT	2	8	1630	1637	0 %	50 %	25 %	25 %	386859230
56	NC_017808	CTT	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859230
57	NC_017808	TCACCA	2	12	1694	1705	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017808	CAT	2	6	1762	1767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017808	T	6	6	1786	1791	0 %	100 %	0 %	0 %	386859231
60	NC_017808	T	7	7	1835	1841	0 %	100 %	0 %	0 %	386859231
61	NC_017808	TGC	2	6	1926	1931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859231
62	NC_017808	ATC	2	6	1971	1976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859231
63	NC_017808	TAAA	2	8	1998	2005	75 %	25 %	0 %	0 %	386859231
64	NC_017808	A	7	7	2109	2115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017808	ATTA	2	8	2152	2159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017808	AAT	2	6	2176	2181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017808	CTA	2	6	2196	2201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017808	A	6	6	2249	2254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017808	ATTA	2	8	2277	2284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017808	AC	3	6	2367	2372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017808	TAA	2	6	2408	2413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017808	CA	3	6	2440	2445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017808	AAT	2	6	2446	2451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017808	ATT	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017808	GATTG	2	10	2572	2581	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017808	CAT	2	6	2589	2594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017808	CA	3	6	2612	2617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017808	TAT	2	6	2627	2632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017808	TA	3	6	2665	2670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017808	ATAAA	2	10	2678	2687	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017808	AT	3	6	2689	2694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017808	TAT	2	6	2700	2705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017808	ATT	2	6	2752	2757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859232
84	NC_017808	TAA	2	6	2763	2768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859232
85	NC_017808	CTTTT	2	10	2777	2786	0 %	80 %	0 %	20 %	386859232
86	NC_017808	TTTC	2	8	2800	2807	0 %	75 %	0 %	25 %	386859232
87	NC_017808	CAAT	2	8	2825	2832	50 %	25 %	0 %	25 %	386859232
88	NC_017808	TTC	2	6	2859	2864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859232
89	NC_017808	T	6	6	2880	2885	0 %	100 %	0 %	0 %	386859232
90	NC_017808	CAT	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859232
91	NC_017808	TA	3	6	2910	2915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017808	TCA	2	6	2922	2927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017808	TAT	2	6	2954	2959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017808	A	6	6	2960	2965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017808	TAA	2	6	2974	2979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017808	TAAA	2	8	3007	3014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017808	A	6	6	3022	3027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017808	TAT	2	6	3028	3033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859233
99	NC_017808	AAATTA	2	12	3118	3129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859233
100	NC_017808	CATAT	2	10	3144	3153	40 %	40 %	0 %	20 %	386859233
101	NC_017808	CTA	2	6	3203	3208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859233
102	NC_017808	TAC	2	6	3221	3226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859233
103	NC_017808	AGCA	2	8	3261	3268	50 %	0 %	25 %	25 %	386859233
104	NC_017808	CTT	2	6	3281	3286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859233
105	NC_017808	ATT	2	6	3309	3314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859233
106	NC_017808	A	6	6	3322	3327	100 %	0 %	0 %	0 %	386859233
107	NC_017808	CAA	2	6	3437	3442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859233
108	NC_017808	CATATT	2	12	3540	3551	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386859233
109	NC_017808	GTT	2	6	3569	3574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859233
110	NC_017808	TTTTCA	2	12	3664	3675	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386859233
111	NC_017808	CTA	2	6	3682	3687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859233
112	NC_017808	TCA	2	6	3703	3708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859233
113	NC_017808	T	7	7	3738	3744	0 %	100 %	0 %	0 %	386859233
114	NC_017808	AATT	2	8	3753	3760	50 %	50 %	0 %	0 %	386859233
115	NC_017808	T	6	6	3759	3764	0 %	100 %	0 %	0 %	386859233
116	NC_017808	ATAATC	2	12	3987	3998	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386859233
117	NC_017808	A	6	6	4032	4037	100 %	0 %	0 %	0 %	386859233
118	NC_017808	ATA	2	6	4049	4054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859233
119	NC_017808	T	6	6	4078	4083	0 %	100 %	0 %	0 %	386859233
120	NC_017808	ATT	2	6	4114	4119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859234
121	NC_017808	A	6	6	4150	4155	100 %	0 %	0 %	0 %	386859234
122	NC_017808	ATA	2	6	4190	4195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859234
123	NC_017808	TAA	2	6	4203	4208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859234
124	NC_017808	ATCT	2	8	4227	4234	25 %	50 %	0 %	25 %	386859234
125	NC_017808	ATT	2	6	4361	4366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859234
126	NC_017808	A	8	8	4420	4427	100 %	0 %	0 %	0 %	386859234
127	NC_017808	CCT	2	6	4433	4438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859234
128	NC_017808	ATT	2	6	4501	4506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859234
129	NC_017808	ATC	3	9	4507	4515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859234
130	NC_017808	TAAAAT	2	12	4516	4527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859234
131	NC_017808	CCCT	2	8	4528	4535	0 %	25 %	0 %	75 %	386859234
132	NC_017808	GTG	2	6	4545	4550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386859234
133	NC_017808	CAG	2	6	4572	4577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859234
134	NC_017808	AT	3	6	4649	4654	50 %	50 %	0 %	0 %	386859234
135	NC_017808	T	6	6	4660	4665	0 %	100 %	0 %	0 %	386859234
136	NC_017808	A	7	7	4739	4745	100 %	0 %	0 %	0 %	386859234
137	NC_017808	CTTT	2	8	4746	4753	0 %	75 %	0 %	25 %	386859234
138	NC_017808	ATT	2	6	4756	4761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859234
139	NC_017808	AAT	2	6	4860	4865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859234
140	NC_017808	ATT	2	6	4882	4887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859234
141	NC_017808	A	6	6	4904	4909	100 %	0 %	0 %	0 %	386859234
142	NC_017808	AATT	2	8	4915	4922	50 %	50 %	0 %	0 %	386859234
143	NC_017808	ATA	2	6	4984	4989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859234
144	NC_017808	A	6	6	5098	5103	100 %	0 %	0 %	0 %	386859234
145	NC_017808	A	6	6	5135	5140	100 %	0 %	0 %	0 %	386859234
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