MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia garinii BgVir plasmid lp54

Total Repeats: 1763

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017804	ATCA	2	8	12	19	50 %	25 %	0 %	25 %	386853318
2	NC_017804	T	6	6	49	54	0 %	100 %	0 %	0 %	386853318
3	NC_017804	A	6	6	134	139	100 %	0 %	0 %	0 %	386853318
4	NC_017804	TAA	2	6	273	278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853318
5	NC_017804	ATT	2	6	289	294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853318
6	NC_017804	TA	3	6	321	326	50 %	50 %	0 %	0 %	386853318
7	NC_017804	TGA	2	6	410	415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386853318
8	NC_017804	TTTTA	2	10	418	427	20 %	80 %	0 %	0 %	386853318
9	NC_017804	CT	3	6	457	462	0 %	50 %	0 %	50 %	386853318
10	NC_017804	GGTT	2	8	467	474	0 %	50 %	50 %	0 %	386853318
11	NC_017804	TCT	3	9	500	508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386853318
12	NC_017804	AATA	2	8	598	605	75 %	25 %	0 %	0 %	386853318
13	NC_017804	ACC	2	6	632	637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386853318
14	NC_017804	TTA	2	6	666	671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853318
15	NC_017804	GCA	2	6	731	736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386853318
16	NC_017804	ATC	2	6	751	756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386853318
17	NC_017804	A	6	6	779	784	100 %	0 %	0 %	0 %	386853318
18	NC_017804	TTA	2	6	845	850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017804	A	6	6	933	938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017804	AT	3	6	1020	1025	50 %	50 %	0 %	0 %	386853319
21	NC_017804	AAC	2	6	1076	1081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853319
22	NC_017804	T	7	7	1106	1112	0 %	100 %	0 %	0 %	386853319
23	NC_017804	CTA	2	6	1114	1119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386853319
24	NC_017804	TTC	2	6	1247	1252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386853319
25	NC_017804	CAATTC	2	12	1259	1270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386853319
26	NC_017804	TTA	2	6	1272	1277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853319
27	NC_017804	ATTT	2	8	1285	1292	25 %	75 %	0 %	0 %	386853319
28	NC_017804	ATT	2	6	1296	1301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853319
29	NC_017804	CAA	2	6	1450	1455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853319
30	NC_017804	CAT	2	6	1519	1524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386853319
31	NC_017804	TTA	2	6	1569	1574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853319
32	NC_017804	T	8	8	1665	1672	0 %	100 %	0 %	0 %	386853319
33	NC_017804	ACA	2	6	1719	1724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853319
34	NC_017804	AAT	2	6	1794	1799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853319
35	NC_017804	ATT	2	6	1806	1811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853319
36	NC_017804	ATAA	2	8	1918	1925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017804	TTTAA	2	10	1934	1943	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017804	TAAA	2	8	1967	1974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017804	TAT	2	6	2039	2044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017804	ATC	2	6	2075	2080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017804	A	6	6	2084	2089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017804	TAA	2	6	2096	2101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017804	T	6	6	2107	2112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017804	TTGC	2	8	2156	2163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017804	T	8	8	2204	2211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017804	A	8	8	2212	2219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017804	TTTTA	2	10	2246	2255	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017804	AAAC	2	8	2282	2289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017804	AT	3	6	2294	2299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017804	T	6	6	2342	2347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017804	TCAA	2	8	2435	2442	50 %	25 %	0 %	25 %	386853320
52	NC_017804	GAA	2	6	2448	2453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386853320
53	NC_017804	CAA	2	6	2455	2460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853320
54	NC_017804	TAA	2	6	2501	2506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853320
55	NC_017804	AAC	2	6	2520	2525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853320
56	NC_017804	ACA	2	6	2528	2533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853320
57	NC_017804	AAT	2	6	2564	2569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853320
58	NC_017804	A	6	6	2571	2576	100 %	0 %	0 %	0 %	386853320
59	NC_017804	AAATGA	2	12	2591	2602	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386853320
60	NC_017804	AATT	2	8	2605	2612	50 %	50 %	0 %	0 %	386853320
61	NC_017804	A	6	6	2647	2652	100 %	0 %	0 %	0 %	386853320
62	NC_017804	A	6	6	2668	2673	100 %	0 %	0 %	0 %	386853320
63	NC_017804	AATA	2	8	2696	2703	75 %	25 %	0 %	0 %	386853320
64	NC_017804	A	6	6	2753	2758	100 %	0 %	0 %	0 %	386853320
65	NC_017804	AGA	2	6	2769	2774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386853320
66	NC_017804	TTATT	2	10	2775	2784	20 %	80 %	0 %	0 %	386853320
67	NC_017804	ATG	2	6	2797	2802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386853320
68	NC_017804	AAAAT	2	10	2803	2812	80 %	20 %	0 %	0 %	386853320
69	NC_017804	A	6	6	2814	2819	100 %	0 %	0 %	0 %	386853320
70	NC_017804	ATT	2	6	2871	2876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853320
71	NC_017804	T	7	7	2883	2889	0 %	100 %	0 %	0 %	386853320
72	NC_017804	AGA	2	6	3053	3058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386853320
73	NC_017804	TTA	2	6	3061	3066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853320
74	NC_017804	AAT	2	6	3107	3112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853320
75	NC_017804	AGA	2	6	3181	3186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386853320
76	NC_017804	TAC	2	6	3193	3198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386853320
77	NC_017804	TGT	2	6	3207	3212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386853320
78	NC_017804	ACT	2	6	3223	3228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386853320
79	NC_017804	GTAT	2	8	3239	3246	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017804	A	7	7	3269	3275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017804	AT	3	6	3334	3339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017804	A	7	7	3340	3346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017804	ACA	2	6	3438	3443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853321
84	NC_017804	TTG	2	6	3475	3480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386853321
85	NC_017804	AAC	2	6	3525	3530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853321
86	NC_017804	AATC	2	8	3543	3550	50 %	25 %	0 %	25 %	386853321
87	NC_017804	TCAAA	2	10	3567	3576	60 %	20 %	0 %	20 %	386853321
88	NC_017804	AGA	2	6	3590	3595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386853321
89	NC_017804	AAG	2	6	3624	3629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386853321
90	NC_017804	A	8	8	3643	3650	100 %	0 %	0 %	0 %	386853321
91	NC_017804	TGC	3	9	3674	3682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386853321
92	NC_017804	A	6	6	3742	3747	100 %	0 %	0 %	0 %	386853321
93	NC_017804	TAA	2	6	3751	3756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853321
94	NC_017804	A	7	7	3755	3761	100 %	0 %	0 %	0 %	386853321
95	NC_017804	ACA	2	6	3783	3788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017804	CA	3	6	3787	3792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017804	A	6	6	3792	3797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017804	AT	3	6	3835	3840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017804	T	6	6	3893	3898	0 %	100 %	0 %	0 %	386853322
100	NC_017804	GTT	2	6	3918	3923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386853322
101	NC_017804	A	7	7	4024	4030	100 %	0 %	0 %	0 %	386853322
102	NC_017804	ACA	2	6	4068	4073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853322
103	NC_017804	ACA	2	6	4087	4092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853322
104	NC_017804	AT	3	6	4106	4111	50 %	50 %	0 %	0 %	386853322
105	NC_017804	ATTG	2	8	4145	4152	25 %	50 %	25 %	0 %	386853322
106	NC_017804	TAA	2	6	4154	4159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853322
107	NC_017804	A	7	7	4164	4170	100 %	0 %	0 %	0 %	386853323
108	NC_017804	T	8	8	4187	4194	0 %	100 %	0 %	0 %	386853323
109	NC_017804	TTC	2	6	4208	4213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386853323
110	NC_017804	T	9	9	4216	4224	0 %	100 %	0 %	0 %	386853323
111	NC_017804	ACA	2	6	4253	4258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853323
112	NC_017804	TTTA	2	8	4271	4278	25 %	75 %	0 %	0 %	386853323
113	NC_017804	TTA	2	6	4283	4288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853323
114	NC_017804	CAAAA	2	10	4316	4325	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017804	TAT	3	9	4404	4412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017804	TAA	2	6	4426	4431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017804	TTAATT	2	12	4435	4446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017804	ACTAA	2	10	4471	4480	60 %	20 %	0 %	20 %	386853324
119	NC_017804	TTG	2	6	4499	4504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386853324
120	NC_017804	TAA	2	6	4505	4510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853324
121	NC_017804	A	7	7	4562	4568	100 %	0 %	0 %	0 %	386853324
122	NC_017804	AAAT	2	8	4581	4588	75 %	25 %	0 %	0 %	386853324
123	NC_017804	AAAGAA	2	12	4608	4619	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386853324
124	NC_017804	A	6	6	4622	4627	100 %	0 %	0 %	0 %	386853324
125	NC_017804	GCT	2	6	4651	4656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386853324
126	NC_017804	A	8	8	4673	4680	100 %	0 %	0 %	0 %	386853324
127	NC_017804	AT	3	6	4686	4691	50 %	50 %	0 %	0 %	386853324
128	NC_017804	AAAT	2	8	4694	4701	75 %	25 %	0 %	0 %	386853324
129	NC_017804	AATT	2	8	4719	4726	50 %	50 %	0 %	0 %	386853324
130	NC_017804	TGA	2	6	4746	4751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386853324
131	NC_017804	GAA	2	6	4774	4779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386853324
132	NC_017804	A	6	6	4826	4831	100 %	0 %	0 %	0 %	386853324
133	NC_017804	ACA	2	6	4865	4870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386853324
134	NC_017804	AGC	2	6	4914	4919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386853324
135	NC_017804	ATAG	2	8	4936	4943	50 %	25 %	25 %	0 %	386853324
136	NC_017804	TAA	2	6	4955	4960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853324
137	NC_017804	AAT	2	6	4968	4973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853324
138	NC_017804	AGACA	2	10	5042	5051	60 %	0 %	20 %	20 %	386853324
139	NC_017804	A	7	7	5061	5067	100 %	0 %	0 %	0 %	386853324
140	NC_017804	TGA	2	6	5082	5087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386853324
141	NC_017804	A	6	6	5103	5108	100 %	0 %	0 %	0 %	386853324
142	NC_017804	TAA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017804	A	8	8	5201	5208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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