MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017802	ATT	2	6	10	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858807
2	NC_017802	TAA	2	6	53	58	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858807
3	NC_017802	TAT	2	6	63	68	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858807
4	NC_017802	A	6	6	124	129	100 %	0 %	0 %	0 %	386858807
5	NC_017802	TTG	2	6	130	135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858807
6	NC_017802	A	9	9	179	187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017802	A	7	7	198	204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017802	A	6	6	210	215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017802	CAA	3	9	216	224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017802	GA	3	6	225	230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017802	TC	3	6	233	238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017802	TTA	2	6	240	245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017802	TGT	2	6	270	275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017802	AAT	2	6	286	291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858808
15	NC_017802	T	6	6	338	343	0 %	100 %	0 %	0 %	386858808
16	NC_017802	ATT	2	6	358	363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858808
17	NC_017802	TCATT	2	10	383	392	20 %	60 %	0 %	20 %	386858808
18	NC_017802	AAG	2	6	405	410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858808
19	NC_017802	A	6	6	454	459	100 %	0 %	0 %	0 %	386858808
20	NC_017802	GAA	2	6	476	481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858808
21	NC_017802	TAT	2	6	487	492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858808
22	NC_017802	TA	3	6	521	526	50 %	50 %	0 %	0 %	386858808
23	NC_017802	A	6	6	539	544	100 %	0 %	0 %	0 %	386858808
24	NC_017802	TTAG	2	8	581	588	25 %	50 %	25 %	0 %	386858808
25	NC_017802	A	6	6	674	679	100 %	0 %	0 %	0 %	386858808
26	NC_017802	TAT	2	6	694	699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858808
27	NC_017802	A	7	7	700	706	100 %	0 %	0 %	0 %	386858808
28	NC_017802	A	6	6	715	720	100 %	0 %	0 %	0 %	386858808
29	NC_017802	TAA	2	6	728	733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858808
30	NC_017802	GTG	2	6	752	757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858809
31	NC_017802	TAT	2	6	856	861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858809
32	NC_017802	A	6	6	894	899	100 %	0 %	0 %	0 %	386858809
33	NC_017802	AT	4	8	905	912	50 %	50 %	0 %	0 %	386858809
34	NC_017802	TGA	2	6	960	965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858809
35	NC_017802	ATT	2	6	1035	1040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858809
36	NC_017802	TAA	2	6	1068	1073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858809
37	NC_017802	TA	3	6	1081	1086	50 %	50 %	0 %	0 %	386858809
38	NC_017802	TTA	2	6	1132	1137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858809
39	NC_017802	AGT	2	6	1138	1143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858809
40	NC_017802	TAT	2	6	1149	1154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858809
41	NC_017802	AAT	2	6	1161	1166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858809
42	NC_017802	ATTT	2	8	1196	1203	25 %	75 %	0 %	0 %	386858809
43	NC_017802	T	6	6	1206	1211	0 %	100 %	0 %	0 %	386858809
44	NC_017802	A	8	8	1264	1271	100 %	0 %	0 %	0 %	386858809
45	NC_017802	A	6	6	1311	1316	100 %	0 %	0 %	0 %	386858809
46	NC_017802	T	6	6	1317	1322	0 %	100 %	0 %	0 %	386858809
47	NC_017802	TAT	2	6	1326	1331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858809
48	NC_017802	AG	3	6	1339	1344	50 %	0 %	50 %	0 %	386858809
49	NC_017802	AGCA	2	8	1362	1369	50 %	0 %	25 %	25 %	386858809
50	NC_017802	A	7	7	1386	1392	100 %	0 %	0 %	0 %	386858809
51	NC_017802	TA	3	6	1396	1401	50 %	50 %	0 %	0 %	386858809
52	NC_017802	AAG	2	6	1456	1461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017802	T	6	6	1462	1467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017802	ATA	2	6	1502	1507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017802	AGTAAA	2	12	1548	1559	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386858810
56	NC_017802	AAT	2	6	1585	1590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858810
57	NC_017802	TAA	2	6	1629	1634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858810
58	NC_017802	ATT	2	6	1666	1671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858810
59	NC_017802	A	6	6	1743	1748	100 %	0 %	0 %	0 %	386858810
60	NC_017802	AGA	2	6	1803	1808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858810
61	NC_017802	ATT	2	6	1812	1817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858810
62	NC_017802	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858810
63	NC_017802	GA	3	6	1869	1874	50 %	0 %	50 %	0 %	386858810
64	NC_017802	A	6	6	1894	1899	100 %	0 %	0 %	0 %	386858810
65	NC_017802	A	8	8	1903	1910	100 %	0 %	0 %	0 %	386858810
66	NC_017802	A	8	8	1966	1973	100 %	0 %	0 %	0 %	386858810
67	NC_017802	T	6	6	1989	1994	0 %	100 %	0 %	0 %	386858810
68	NC_017802	ATT	2	6	2004	2009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858810
69	NC_017802	A	6	6	2017	2022	100 %	0 %	0 %	0 %	386858810
70	NC_017802	AGA	2	6	2031	2036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858810
71	NC_017802	TAA	2	6	2074	2079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017802	AAT	2	6	2089	2094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017802	AT	3	6	2098	2103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017802	ATTTT	2	10	2116	2125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017802	TAG	2	6	2154	2159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017802	TTAA	2	8	2242	2249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.