MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 1182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017786	CTT	2	6	47	52	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858707
2	NC_017786	TCT	2	6	56	61	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858707
3	NC_017786	CCT	2	6	65	70	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858707
4	NC_017786	T	7	7	78	84	0 %	100 %	0 %	0 %	386858707
5	NC_017786	CTTTT	2	10	89	98	0 %	80 %	0 %	20 %	386858707
6	NC_017786	CA	4	8	107	114	50 %	0 %	0 %	50 %	386858707
7	NC_017786	AAT	2	6	118	123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858707
8	NC_017786	ATTTT	2	10	175	184	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017786	T	6	6	226	231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017786	AT	3	6	281	286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017786	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017786	ATT	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017786	T	6	6	371	376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017786	TCTT	2	8	385	392	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017786	A	6	6	393	398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017786	TAAA	2	8	461	468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017786	AAC	2	6	473	478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017786	TAAA	2	8	484	491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017786	TTA	2	6	522	527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017786	AGT	2	6	563	568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858708
21	NC_017786	TAG	2	6	577	582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858708
22	NC_017786	ACT	2	6	593	598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858708
23	NC_017786	T	6	6	634	639	0 %	100 %	0 %	0 %	386858708
24	NC_017786	ATT	2	6	666	671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858708
25	NC_017786	CTG	2	6	709	714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858708
26	NC_017786	AGC	3	9	740	748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858708
27	NC_017786	CTG	3	9	787	795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858708
28	NC_017786	TTA	2	6	825	830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858708
29	NC_017786	TAG	2	6	841	846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858708
30	NC_017786	ATT	3	9	863	871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858708
31	NC_017786	CAA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858708
32	NC_017786	ATCA	2	8	911	918	50 %	25 %	0 %	25 %	386858708
33	NC_017786	AGC	2	6	962	967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858708
34	NC_017786	GCA	2	6	981	986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858708
35	NC_017786	CAG	2	6	1000	1005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858708
36	NC_017786	CAG	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858708
37	NC_017786	CAC	2	6	1036	1041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858708
38	NC_017786	TAATCT	2	12	1093	1104	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386858708
39	NC_017786	CCT	2	6	1129	1134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858708
40	NC_017786	CAG	2	6	1135	1140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858708
41	NC_017786	GCA	3	9	1146	1154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858708
42	NC_017786	CAA	2	6	1183	1188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858708
43	NC_017786	TTA	2	6	1213	1218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858708
44	NC_017786	AAT	2	6	1226	1231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858708
45	NC_017786	TAA	2	6	1246	1251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858708
46	NC_017786	AT	3	6	1277	1282	50 %	50 %	0 %	0 %	386858708
47	NC_017786	AGA	2	6	1286	1291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858708
48	NC_017786	ATC	2	6	1382	1387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858708
49	NC_017786	TCC	2	6	1415	1420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858708
50	NC_017786	AAG	2	6	1435	1440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858708
51	NC_017786	ATTC	2	8	1456	1463	25 %	50 %	0 %	25 %	386858708
52	NC_017786	AAT	2	6	1472	1477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858708
53	NC_017786	CT	3	6	1503	1508	0 %	50 %	0 %	50 %	386858708
54	NC_017786	TCCT	2	8	1514	1521	0 %	50 %	0 %	50 %	386858708
55	NC_017786	CCA	2	6	1527	1532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858708
56	NC_017786	TCA	2	6	1543	1548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858708
57	NC_017786	CCATCA	2	12	1549	1560	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386858708
58	NC_017786	CCA	2	6	1561	1566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858708
59	NC_017786	TCA	4	12	1567	1578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858708
60	NC_017786	TAA	2	6	1595	1600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858709
61	NC_017786	ACAAAA	2	12	1613	1624	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386858709
62	NC_017786	ATGA	2	8	1636	1643	50 %	25 %	25 %	0 %	386858709
63	NC_017786	ATA	2	6	1648	1653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858709
64	NC_017786	AAATA	2	10	1670	1679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017786	TCT	2	6	1683	1688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017786	T	6	6	1732	1737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017786	CAA	2	6	1833	1838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017786	CT	3	6	1848	1853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017786	ATTA	2	8	1888	1895	50 %	50 %	0 %	0 %	386858710
70	NC_017786	ACT	2	6	1944	1949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858710
71	NC_017786	CTT	2	6	1976	1981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858710
72	NC_017786	TACT	2	8	2000	2007	25 %	50 %	0 %	25 %	386858710
73	NC_017786	ATT	2	6	2017	2022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858710
74	NC_017786	GCT	3	9	2062	2070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858710
75	NC_017786	CTG	2	6	2141	2146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858710
76	NC_017786	ACC	2	6	2196	2201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858710
77	NC_017786	TAG	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858710
78	NC_017786	AGT	2	6	2250	2255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858710
79	NC_017786	ATCA	2	8	2271	2278	50 %	25 %	0 %	25 %	386858710
80	NC_017786	CTT	2	6	2303	2308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858710
81	NC_017786	AGC	2	6	2322	2327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858710
82	NC_017786	TAA	2	6	2355	2360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858710
83	NC_017786	CATTAG	2	12	2369	2380	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858710
84	NC_017786	CAC	2	6	2387	2392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858710
85	NC_017786	AAT	2	6	2439	2444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858710
86	NC_017786	CAC	2	6	2498	2503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858710
87	NC_017786	AATT	2	8	2571	2578	50 %	50 %	0 %	0 %	386858710
88	NC_017786	CAT	2	6	2588	2593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858710
89	NC_017786	TTC	2	6	2686	2691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858710
90	NC_017786	A	6	6	2807	2812	100 %	0 %	0 %	0 %	386858710
91	NC_017786	A	6	6	2851	2856	100 %	0 %	0 %	0 %	386858710
92	NC_017786	CCA	2	6	2896	2901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858710
93	NC_017786	CAT	2	6	2919	2924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858710
94	NC_017786	CAC	3	9	2925	2933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858710
95	NC_017786	TAT	2	6	2949	2954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858710
96	NC_017786	TCT	2	6	2955	2960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858710
97	NC_017786	TC	4	8	2963	2970	0 %	50 %	0 %	50 %	386858710
98	NC_017786	CT	3	6	2973	2978	0 %	50 %	0 %	50 %	386858710
99	NC_017786	TC	3	6	2979	2984	0 %	50 %	0 %	50 %	386858710
100	NC_017786	CT	3	6	2985	2990	0 %	50 %	0 %	50 %	386858710
101	NC_017786	TC	3	6	2999	3004	0 %	50 %	0 %	50 %	386858710
102	NC_017786	T	6	6	3012	3017	0 %	100 %	0 %	0 %	386858710
103	NC_017786	TTTC	2	8	3026	3033	0 %	75 %	0 %	25 %	386858710
104	NC_017786	CCT	2	6	3038	3043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017786	T	7	7	3046	3052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017786	CTTTT	2	10	3081	3090	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017786	A	7	7	3104	3110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017786	TA	3	6	3118	3123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017786	AC	3	6	3124	3129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017786	A	7	7	3145	3151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017786	A	6	6	3189	3194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017786	ATT	2	6	3213	3218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017786	ATTA	2	8	3228	3235	50 %	50 %	0 %	0 %	386858711
114	NC_017786	TC	3	6	3267	3272	0 %	50 %	0 %	50 %	386858711
115	NC_017786	TTA	2	6	3281	3286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858711
116	NC_017786	CCT	2	6	3419	3424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858711
117	NC_017786	CCT	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017786	TCTT	2	8	3467	3474	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017786	CTT	2	6	3496	3501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017786	ATC	2	6	3502	3507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017786	CTG	2	6	3531	3536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017786	AT	3	6	3604	3609	50 %	50 %	0 %	0 %	386858712
123	NC_017786	CTT	2	6	3658	3663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858712
124	NC_017786	AAC	2	6	3690	3695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858712
125	NC_017786	CTG	2	6	3721	3726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858712
126	NC_017786	TAG	2	6	3730	3735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858712
127	NC_017786	CAA	2	6	3772	3777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858712
128	NC_017786	AGC	2	6	3821	3826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858712
129	NC_017786	CAT	2	6	3868	3873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858712
130	NC_017786	TGC	2	6	3884	3889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858712
131	NC_017786	CTTA	2	8	3911	3918	25 %	50 %	0 %	25 %	386858712
132	NC_017786	TC	3	6	3994	3999	0 %	50 %	0 %	50 %	386858712
133	NC_017786	TTC	2	6	4053	4058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858712
134	NC_017786	ATC	3	9	4201	4209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858713
135	NC_017786	ATT	2	6	4213	4218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858713
136	NC_017786	CT	5	10	4241	4250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017786	TC	4	8	4252	4259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017786	CTT	2	6	4276	4281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017786	CCT	2	6	4306	4311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_017786	T	6	6	4314	4319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017786	TTAT	2	8	4344	4351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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