MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 363

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017780	CT	3	6	44	49	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017780	TTTC	2	8	55	62	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017780	CCT	2	6	64	69	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017780	T	7	7	72	78	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017780	T	6	6	88	93	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017780	CAAA	3	12	116	127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017780	AAAT	2	8	128	135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017780	TA	3	6	137	142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017780	GAAT	3	12	148	159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017780	TAG	2	6	212	217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017780	AT	3	6	225	230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017780	AGATA	2	10	249	258	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017780	CTTTA	2	10	281	290	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017780	TTATT	2	10	305	314	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017780	TAA	2	6	318	323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017780	ATT	2	6	334	339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017780	ACC	2	6	356	361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859193
18	NC_017780	ATTAGT	2	12	389	400	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386859193
19	NC_017780	CTG	2	6	493	498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859193
20	NC_017780	ATC	2	6	522	527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859193
21	NC_017780	AGC	2	6	528	533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859193
22	NC_017780	ACC	2	6	552	557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859194
23	NC_017780	TAGC	2	8	647	654	25 %	25 %	25 %	25 %	386859194
24	NC_017780	CTG	2	6	738	743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859194
25	NC_017780	CAG	2	6	756	761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859194
26	NC_017780	ATT	2	6	772	777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859194
27	NC_017780	T	6	6	847	852	0 %	100 %	0 %	0 %	386859194
28	NC_017780	ATC	2	6	853	858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859194
29	NC_017780	CTT	2	6	876	881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017780	CAG	2	6	936	941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017780	CCT	2	6	1008	1013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017780	TAT	2	6	1024	1029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017780	TAT	2	6	1132	1137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017780	AAT	2	6	1143	1148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017780	A	6	6	1167	1172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017780	GATTT	2	10	1214	1223	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017780	ATA	2	6	1229	1234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017780	TAA	2	6	1332	1337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017780	ATA	3	9	1346	1354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017780	TATC	2	8	1415	1422	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017780	T	6	6	1454	1459	0 %	100 %	0 %	0 %	386859195
42	NC_017780	TTC	2	6	1517	1522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859195
43	NC_017780	TCT	2	6	1529	1534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859195
44	NC_017780	CTG	2	6	1557	1562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
45	NC_017780	CTT	2	6	1581	1586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859195
46	NC_017780	CTG	2	6	1608	1613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
47	NC_017780	TGC	2	6	1675	1680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
48	NC_017780	GCT	2	6	1709	1714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
49	NC_017780	CCT	2	6	1718	1723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859195
50	NC_017780	GAAA	2	8	1729	1736	75 %	0 %	25 %	0 %	386859195
51	NC_017780	TTCC	2	8	1813	1820	0 %	50 %	0 %	50 %	386859195
52	NC_017780	CTG	2	6	1860	1865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
53	NC_017780	ACC	2	6	1876	1881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859195
54	NC_017780	TAG	2	6	1887	1892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859195
55	NC_017780	TTA	2	6	1913	1918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859195
56	NC_017780	TTTC	2	8	1971	1978	0 %	75 %	0 %	25 %	386859195
57	NC_017780	TAC	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859195
58	NC_017780	TAA	2	6	2010	2015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859195
59	NC_017780	CTG	2	6	2040	2045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
60	NC_017780	GCA	3	9	2054	2062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859195
61	NC_017780	CTA	2	6	2082	2087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859195
62	NC_017780	CTG	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859195
63	NC_017780	TTC	2	6	2239	2244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859195
64	NC_017780	TAC	2	6	2262	2267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859195
65	NC_017780	TTA	2	6	2273	2278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859195
66	NC_017780	CTT	2	6	2299	2304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859195
67	NC_017780	AGT	2	6	2305	2310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859195
68	NC_017780	A	6	6	2361	2366	100 %	0 %	0 %	0 %	386859195
69	NC_017780	CAG	2	6	2392	2397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859195
70	NC_017780	TCC	3	9	2431	2439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859195
71	NC_017780	TCC	2	6	2449	2454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859195
72	NC_017780	CAT	2	6	2485	2490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859195
73	NC_017780	CAC	2	6	2491	2496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017780	CAT	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017780	ATT	3	9	2507	2515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017780	CTT	2	6	2521	2526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017780	CT	3	6	2533	2538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017780	TC	3	6	2539	2544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017780	CT	3	6	2545	2550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017780	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017780	N	1215	1215	2573	3787	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017780	ACC	2	6	3900	3905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017780	ATC	2	6	3949	3954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017780	TTA	2	6	3988	3993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017780	A	6	6	4022	4027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017780	ATCA	2	8	4032	4039	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017780	TAA	2	6	4137	4142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017780	ATATT	2	10	4143	4152	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017780	AAC	2	6	4197	4202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017780	TAAG	2	8	4217	4224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017780	TAT	2	6	4254	4259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017780	CAAT	2	8	4314	4321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017780	TCAT	2	8	4367	4374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017780	TAA	2	6	4432	4437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017780	TTAC	2	8	4454	4461	25 %	50 %	0 %	25 %	386859196
96	NC_017780	A	7	7	4494	4500	100 %	0 %	0 %	0 %	386859196
97	NC_017780	ATA	2	6	4518	4523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859196
98	NC_017780	TAATTT	2	12	4544	4555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859196
99	NC_017780	TTA	2	6	4587	4592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859196
100	NC_017780	TCTAT	2	10	4614	4623	20 %	60 %	0 %	20 %	386859196
101	NC_017780	TAA	2	6	4624	4629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859196
102	NC_017780	TTC	2	6	4631	4636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859196
103	NC_017780	T	6	6	4651	4656	0 %	100 %	0 %	0 %	386859196
104	NC_017780	TAAG	2	8	4713	4720	50 %	25 %	25 %	0 %	386859196
105	NC_017780	TCA	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859196
106	NC_017780	TTA	2	6	4764	4769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859196
107	NC_017780	TAA	2	6	4780	4785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859196
108	NC_017780	AT	3	6	4830	4835	50 %	50 %	0 %	0 %	386859196
109	NC_017780	AAT	2	6	4898	4903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017780	ATTT	2	8	4914	4921	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017780	A	6	6	4929	4934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017780	TA	3	6	4973	4978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017780	ATA	3	9	4976	4984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017780	A	8	8	5039	5046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017780	AAAT	2	8	5106	5113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017780	ATA	2	6	5114	5119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017780	ATA	2	6	5160	5165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017780	AAT	2	6	5200	5205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017780	ACA	2	6	5223	5228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017780	AAT	2	6	5230	5235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017780	AATA	2	8	5251	5258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017780	CAAT	2	8	5279	5286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017780	N	1086	1086	5294	6379	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017780	TGA	2	6	6418	6423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017780	AGAAT	2	10	6453	6462	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017780	ATA	2	6	6465	6470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017780	CGC	2	6	6483	6488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017780	ACT	2	6	6524	6529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017780	AGATAA	2	12	6586	6597	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017780	GA	3	6	6621	6626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017780	TTTAG	2	10	6637	6646	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017780	TAA	2	6	6653	6658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017780	TAA	3	9	6671	6679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017780	ATT	2	6	6785	6790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017780	TTAT	2	8	6807	6814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017780	TA	3	6	6873	6878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017780	ATG	2	6	6887	6892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017780	TCTT	2	8	6906	6913	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017780	TAT	2	6	6925	6930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017780	ATT	2	6	6933	6938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017780	ATT	2	6	6942	6947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017780	TGTT	2	8	6962	6969	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017780	ATT	2	6	6975	6980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859197
144	NC_017780	T	6	6	7024	7029	0 %	100 %	0 %	0 %	386859197
145	NC_017780	AAC	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859197
146	NC_017780	TGA	2	6	7059	7064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859197
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292	NC_017780	TAT	2	6	11760	11765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_017780	ATA	2	6	11789	11794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_017780	A	7	7	11811	11817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_017780	TGC	2	6	11838	11843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_017780	TAA	2	6	11883	11888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_017780	GAT	2	6	11893	11898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
298	NC_017780	TAT	2	6	11932	11937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_017780	A	6	6	12016	12021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_017780	A	6	6	12120	12125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_017780	TTA	2	6	12166	12171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_017780	AAT	2	6	12181	12186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_017780	AGTA	2	8	12232	12239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
304	NC_017780	AGGA	2	8	12266	12273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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306	NC_017780	T	6	6	12375	12380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_017780	A	6	6	12414	12419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_017780	GT	3	6	12427	12432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
309	NC_017780	AGA	2	6	12465	12470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
310	NC_017780	GAA	2	6	12532	12537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
311	NC_017780	A	6	6	12547	12552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_017780	TCT	3	9	12583	12591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
313	NC_017780	ATG	2	6	12613	12618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
314	NC_017780	TTA	2	6	12672	12677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
315	NC_017780	AG	4	8	12717	12724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
316	NC_017780	TCGG	2	8	12852	12859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
317	NC_017780	TTA	2	6	12862	12867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_017780	A	8	8	12891	12898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
319	NC_017780	N	332	332	12925	13256	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_017780	TACG	2	8	13311	13318	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
322	NC_017780	AAG	2	6	13325	13330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
323	NC_017780	TATG	2	8	13349	13356	25 %	50 %	25 %	0 %	386859200
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.