MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-10

Total Repeats: 757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017428	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017428	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	387826682
3	NC_017428	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	387826682
4	NC_017428	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826682
5	NC_017428	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826682
6	NC_017428	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826682
7	NC_017428	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826682
8	NC_017428	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826682
9	NC_017428	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	387826682
10	NC_017428	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	387826682
11	NC_017428	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387826682
12	NC_017428	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	387826682
13	NC_017428	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826682
14	NC_017428	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826682
15	NC_017428	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826682
16	NC_017428	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826682
17	NC_017428	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	387826682
18	NC_017428	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826682
19	NC_017428	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826682
20	NC_017428	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826682
21	NC_017428	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	387826682
22	NC_017428	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826682
23	NC_017428	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826682
24	NC_017428	T	6	6	1058	1063	0 %	100 %	0 %	0 %	387826682
25	NC_017428	GAA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826682
26	NC_017428	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826682
27	NC_017428	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826682
28	NC_017428	AGA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826683
29	NC_017428	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826683
30	NC_017428	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826683
31	NC_017428	GCA	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826683
32	NC_017428	AGCA	2	8	1424	1431	50 %	0 %	25 %	25 %	387826683
33	NC_017428	ATT	2	6	1530	1535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826683
34	NC_017428	AGG	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826683
35	NC_017428	TTGC	2	8	1612	1619	0 %	50 %	25 %	25 %	387826683
36	NC_017428	GTTC	2	8	1677	1684	0 %	50 %	25 %	25 %	387826683
37	NC_017428	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	387826683
38	NC_017428	A	6	6	1791	1796	100 %	0 %	0 %	0 %	387826683
39	NC_017428	TTC	3	9	1809	1817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826683
40	NC_017428	AGA	2	6	1854	1859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826683
41	NC_017428	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	387826683
42	NC_017428	AGA	2	6	2036	2041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826684
43	NC_017428	A	6	6	2049	2054	100 %	0 %	0 %	0 %	387826684
44	NC_017428	TAG	2	6	2171	2176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826684
45	NC_017428	ACA	2	6	2256	2261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826684
46	NC_017428	TGG	3	9	2279	2287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826684
47	NC_017428	TGGCA	2	10	2330	2339	20 %	20 %	40 %	20 %	387826684
48	NC_017428	AAATGG	2	12	2390	2401	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387826684
49	NC_017428	TGCT	2	8	2530	2537	0 %	50 %	25 %	25 %	387826684
50	NC_017428	AATTA	2	10	2568	2577	60 %	40 %	0 %	0 %	387826684
51	NC_017428	TGA	2	6	2618	2623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826685
52	NC_017428	GAA	2	6	2694	2699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826685
53	NC_017428	A	6	6	2763	2768	100 %	0 %	0 %	0 %	387826685
54	NC_017428	TAG	2	6	2807	2812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826685
55	NC_017428	GTT	2	6	2821	2826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826685
56	NC_017428	AGA	2	6	2891	2896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826685
57	NC_017428	TA	3	6	2966	2971	50 %	50 %	0 %	0 %	387826685
58	NC_017428	CTGATA	2	12	2986	2997	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387826685
59	NC_017428	ATGT	2	8	3016	3023	25 %	50 %	25 %	0 %	387826685
60	NC_017428	TAG	2	6	3029	3034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826685
61	NC_017428	GTAT	2	8	3041	3048	25 %	50 %	25 %	0 %	387826685
62	NC_017428	ATAA	2	8	3123	3130	75 %	25 %	0 %	0 %	387826685
63	NC_017428	TTA	2	6	3139	3144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826685
64	NC_017428	TGG	3	9	3152	3160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826685
65	NC_017428	CCA	2	6	3162	3167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826685
66	NC_017428	TAAT	2	8	3172	3179	50 %	50 %	0 %	0 %	387826685
67	NC_017428	CT	3	6	3189	3194	0 %	50 %	0 %	50 %	387826685
68	NC_017428	CAAT	2	8	3205	3212	50 %	25 %	0 %	25 %	387826685
69	NC_017428	ATCAAG	2	12	3232	3243	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387826685
70	NC_017428	TGG	2	6	3335	3340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826685
71	NC_017428	ATT	2	6	3390	3395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826686
72	NC_017428	T	6	6	3505	3510	0 %	100 %	0 %	0 %	387826686
73	NC_017428	ATC	2	6	3554	3559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826686
74	NC_017428	TGG	2	6	3651	3656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826686
75	NC_017428	GAT	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826686
76	NC_017428	AAT	2	6	3730	3735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826686
77	NC_017428	TAG	2	6	3749	3754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826686
78	NC_017428	TAA	2	6	3795	3800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826686
79	NC_017428	CAC	2	6	3830	3835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826686
80	NC_017428	TTTA	2	8	3896	3903	25 %	75 %	0 %	0 %	387826686
81	NC_017428	GTAA	2	8	3934	3941	50 %	25 %	25 %	0 %	387826686
82	NC_017428	GGA	2	6	3958	3963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017428	ATT	2	6	3975	3980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826687
84	NC_017428	TGA	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826687
85	NC_017428	ATT	2	6	3989	3994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826687
86	NC_017428	TAA	2	6	4293	4298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826687
87	NC_017428	TC	3	6	4313	4318	0 %	50 %	0 %	50 %	387826687
88	NC_017428	ATT	2	6	4345	4350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826687
89	NC_017428	TTA	2	6	4355	4360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826687
90	NC_017428	TTCAA	2	10	4386	4395	40 %	40 %	0 %	20 %	387826687
91	NC_017428	A	6	6	4404	4409	100 %	0 %	0 %	0 %	387826687
92	NC_017428	CTT	2	6	4441	4446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826687
93	NC_017428	AGA	2	6	4467	4472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826687
94	NC_017428	GTG	2	6	4481	4486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826687
95	NC_017428	A	6	6	4514	4519	100 %	0 %	0 %	0 %	387826687
96	NC_017428	ATG	2	6	4570	4575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826687
97	NC_017428	GCA	3	9	4621	4629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826687
98	NC_017428	GCA	2	6	4636	4641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826687
99	NC_017428	GGA	2	6	4659	4664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826687
100	NC_017428	TAA	2	6	4692	4697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826687
101	NC_017428	AGA	2	6	4701	4706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826687
102	NC_017428	TTA	2	6	4772	4777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826687
103	NC_017428	TCAT	2	8	4848	4855	25 %	50 %	0 %	25 %	387826687
104	NC_017428	AGG	2	6	4872	4877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826687
105	NC_017428	CTA	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826687
106	NC_017428	A	7	7	4959	4965	100 %	0 %	0 %	0 %	387826688
107	NC_017428	GAA	3	9	4988	4996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826688
108	NC_017428	TTAC	2	8	5156	5163	25 %	50 %	0 %	25 %	387826688
109	NC_017428	GTT	2	6	5201	5206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826688
110	NC_017428	GAATTT	2	12	5210	5221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387826688
111	NC_017428	A	6	6	5231	5236	100 %	0 %	0 %	0 %	387826688
112	NC_017428	TGAACT	2	12	5248	5259	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387826688
113	NC_017428	ATT	2	6	5262	5267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826688
114	NC_017428	TAG	2	6	5272	5277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826688
115	NC_017428	GAA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826688
116	NC_017428	GGC	2	6	5294	5299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387826688
117	NC_017428	G	6	6	5302	5307	0 %	0 %	100 %	0 %	387826688
118	NC_017428	TG	3	6	5387	5392	0 %	50 %	50 %	0 %	387826688
119	NC_017428	AATG	2	8	5403	5410	50 %	25 %	25 %	0 %	387826688
120	NC_017428	TGT	2	6	5496	5501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826689
121	NC_017428	TTC	2	6	5517	5522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826689
122	NC_017428	AG	3	6	5528	5533	50 %	0 %	50 %	0 %	387826689
123	NC_017428	TTA	2	6	5570	5575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826689
124	NC_017428	TGG	2	6	5819	5824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826690
125	NC_017428	TAG	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826690
126	NC_017428	AT	3	6	5921	5926	50 %	50 %	0 %	0 %	387826690
127	NC_017428	AAT	2	6	5928	5933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826690
128	NC_017428	TA	3	6	5937	5942	50 %	50 %	0 %	0 %	387826690
129	NC_017428	CTA	2	6	6021	6026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826690
130	NC_017428	AAGT	2	8	6068	6075	50 %	25 %	25 %	0 %	387826690
131	NC_017428	GTA	2	6	6085	6090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826690
132	NC_017428	GCA	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826690
133	NC_017428	TTG	2	6	6109	6114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826690
134	NC_017428	AAT	2	6	6236	6241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826691
135	NC_017428	ATC	2	6	6270	6275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826691
136	NC_017428	GCT	2	6	6296	6301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826691
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145	NC_017428	AATGGA	2	12	6897	6908	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387826692
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163	NC_017428	A	6	6	7508	7513	100 %	0 %	0 %	0 %	387826692
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165	NC_017428	TTA	2	6	7531	7536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826692
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241	NC_017428	GGCA	2	8	11214	11221	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
242	NC_017428	A	7	7	11475	11481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_017428	TAA	2	6	11501	11506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_017428	CA	3	6	11694	11699	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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255	NC_017428	A	6	6	12064	12069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_017428	TAC	2	6	12114	12119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_017428	TCAA	2	8	12121	12128	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
258	NC_017428	TA	3	6	12182	12187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_017428	AATCT	2	10	12215	12224	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
260	NC_017428	AAC	2	6	12274	12279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_017428	A	7	7	12342	12348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_017428	CCAG	2	8	12364	12371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
263	NC_017428	AATT	2	8	12393	12400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017428	TAAT	2	8	12445	12452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_017428	AAT	2	6	12474	12479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826698
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270	NC_017428	A	6	6	12653	12658	100 %	0 %	0 %	0 %	387826698
271	NC_017428	TAA	2	6	12697	12702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826698
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